3fh6

Crystal structure of the resting state maltose transporter from E. coli

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 200.3 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Maltose transport system permease protein malF

Escherichia coli

UniProt P02916

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 36–514 未记录 Maltose transport system permease protein malG × 1 (P68183) Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK × 2 (P68187) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 4.50 Å R-free 0.363
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 36–514 未记录 Maltose transport system permease protein malG × 1 (P68183) Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK × 2 (P68187) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 4.50 Å R-free 0.363

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALF_ECOLI
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 2–480; UniProt 36–514 作者链 H; PDB构建体 2–480; UniProt 36–514

Maltose transport system permease protein malG

Escherichia coli

UniProt P68183

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–296 未记录 Maltose transport system permease protein malF × 1 (P02916) Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK × 2 (P68187) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 4.50 Å R-free 0.363
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 1–296 未记录 Maltose transport system permease protein malF × 1 (P02916) Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK × 2 (P68187) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 4.50 Å R-free 0.363

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALG_ECOLI
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–296; UniProt 1–296 作者链 I; PDB构建体 1–296; UniProt 1–296

Maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK

Escherichia coli

UniProt P68187

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–371 链 B; UniProt 1–371 未记录 Maltose transport system permease protein malF × 1 (P02916) Maltose transport system permease protein malG × 1 (P68183) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 4.50 Å R-free 0.363
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–371 链 D; UniProt 1–371 未记录 Maltose transport system permease protein malF × 1 (P02916) Maltose transport system permease protein malG × 1 (P68183) X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;11.5 % PEG 4000, 0.1M ADA pH 6.5, 0.1 M NaCl, 0.1 M Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K 分辨率 4.50 Å R-free 0.363

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 13 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MALK_ECOLI
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–371; UniProt 1–371 作者链 B; PDB构建体 1–371; UniProt 1–371 作者链 C; PDB构建体 1–371; UniProt 1–371 作者链 D; PDB构建体 1–371; UniProt 1–371

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3fh6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3fh6
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3fh6
沉积日期 deposition_date2008-12-08
结构标题 titleCrystal structure of the resting state maltose transporter from E. coli
关键词 keywords;maltose transporter, ground state, ABC transporter, membrane protein, Cell inner membrane, Cell membrane, Membrane, Sugar transport, Transmembrane, Transport, ATP-binding, Hydrolase, Nucleotide-binding, TRANSPORT PROTEIN ;; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier57.61
回转半径 Rg (电子) rg_electron57.77
零角强度 I(0) i01046330000.00
分子量 molecular_weight287240.0 kDa
排除体积 excluded_volume366610 ų
包络体积 envelope_volume567200 ų
水化壳体积 shell_volume82930 ų
包络直径 envelope_diameter209.5
壳层 Rg shell_rg58.11
包络 Rg envelope_rg56.22
形状 Rg shape_rg57.80
总 Rg total_rg57.66
总原子数 total_atoms20236
残基数 n_residues2626
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax200.3
Rg (实空间) rg_real57.75
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.90
I(0) (实空间) i0_real1.0460e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.9440e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal57.46
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1046000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8709
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary51.9
偏度 Skewness skewness0.316
峰度 Kurtosis kurtosis-0.494
角度范围 angular_range— – 0.1350 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha93900000.0000
实空间数据点数 n_real_points28
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.858; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.938; Smooth: 0.805

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)