Rattus norvegicus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CALCIUM ION × 3 PHOSPHATE ION × 1 ;[(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate ; × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | KPCA_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–137； UniProt 156–292 |
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| 条目编号 entry_id | 3gpe |
| 沉积日期 deposition_date | 2009-03-23 |
| 结构标题 title | Crystal Structure Analysis of PKC (alpha)-C2 domain complexed with Ca2+ and PtdIns(4,5)P2 |
| 关键词 keywords | ;CALCIUM/PHOSPHOLIPID BINDING DOMAIN, C2 domain, Phosphatidil serine, protein kinase, ATP-binding, Kinase, Metal-binding, Nucleotide-binding, Phorbol-ester binding, Phosphoprotein, Serine/threonine-protein kinase, Transferase, Zinc-finger, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.99 Å |
| Rg（电子密度） | 14.80 Å |
| 总 Rg | 16.05 Å |
| 原子数 | 1156 |
| 残基数 | 137 |
| 排除体积 | 20586 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3gpea_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.7 — C2 domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.7.1 — C2 domain (Calcium/lipid-binding domain, CaLB) |
| 家族 Family family | b.7.1.2 — Synaptotagmin-like (S variant) |
| 结构域编号 domain_id | 3gpeA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 150 — C2 domain |