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3hsm

Crystal structure of distal N-terminal beta-trefoil domain of Ryanodine Receptor type 1

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 83.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ryanodine receptor 1

Oryctolagus cuniculus

UniProt P11716

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–210 片段：sequence database residues 1-210 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M MES, 0.1M MgCl2, 24% PEG 3350, 5mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K 分辨率 2.50 Å R-free 0.276
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–210 片段：sequence database residues 1-210 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.1M MES, 0.1M MgCl2, 24% PEG 3350, 5mM DTT, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K 分辨率 2.50 Å R-free 0.276

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3HSM Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2BCX Crystal structure of calmodulin in complex with a ryanodine receptor peptide 提交 2005-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 3614–3643（30 aa） 片段：residues 3614-3643
未记录 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.7；293 K；23% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, 5 mM DTT, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.249
2XOA Crystal Structure of the N-terminal three domains of the skeletal muscle Ryanodine Receptor (RyR1) 提交 2010-08-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–559（559 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-559
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；pH 8
分辨率 2.50 Å R-free 0.234
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3ILA Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 N-terminal domain (9-205) 提交 2009-08-06 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 I 9–205（197 aa） 片段：N-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15-25% PEG 3350, 0.2M sodium chloride, 0.1M BisTris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.320
3J8H Structure of the rabbit ryanodine receptor RyR1 in complex with FKBP12 at 3.8 Angstrom resolution 提交 2014-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–1491（1491 aa）
链 A 1510–1976（467 aa）
链 A 2057–2460（404 aa）
链 A 2494–2562（69 aa）
链 A 2734–2940（207 aa）
链 A 3645–5037（1393 aa）
链 C 1–1491（1491 aa）
链 C 1510–1976（467 aa）
链 C 2057–2460（404 aa）
链 C 2494–2562（69 aa）
链 C 2734–2940（207 aa）
链 C 3645–5037（1393 aa）
链 E 1–1491（1491 aa）
链 E 1510–1976（467 aa）
链 E 2057–2460（404 aa）
链 E 2494–2562（69 aa）
链 E 2734–2940（207 aa）
链 E 3645–5037（1393 aa）
链 G 1–1491（1491 aa）
链 G 1510–1976（467 aa）
链 G 2057–2460（404 aa）
链 G 2494–2562（69 aa）
链 G 2734–2940（207 aa）
链 G 3645–5037（1393 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 mM MOPS sodium, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 2 mM EGTA, 0.015% Tween20, protein inhibitors；pH 7.4；20 mM MOPS sodium, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 2 mM EGTA, 0.015% Tween20, protein inhibitors
cryo-EM玻璃化条件 protein solution was applied to glow-discharged carbon coated grid and blotted for 2 seconds before plunging；冷冻剂 NITROGEN；Protein solution was applied to glow-discharged carbon coated grid and blotted for 2 seconds before plunging into liquid nitrogen (FEI VITROBOT MARK III)
分辨率 3.80 Å
3RQR Crystal structure of the RYR domain of the rabbit ryanodine receptor 提交 2011-04-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2733–2940（208 aa） 片段：Residues 2733-2940
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；291 K；1.2M Na Citrate, 100mM Tris pH8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.16 Å R-free 0.258
4ERT Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (2734-2940) 提交 2012-04-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2734–2940（207 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 K POTASSIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；19% PEG3350, 30% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.95 Å R-free 0.225
4ESU Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant S2776M 提交 2012-04-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2734–2940（207 aa）
突变：S2776M GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；25% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
分辨率 1.59 Å R-free 0.229
4ETT Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant E2764K 提交 2012-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2734–2940（207 aa）
突变：E2764K GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；25% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
分辨率 2.19 Å R-free 0.287
4ETU Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 mutant R2939S 提交 2012-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2734–2940（207 aa）
突变：R2939S GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG3350, 25% Glycerol, 0.1M HEPES, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
分辨率 2.19 Å R-free 0.262
4I0Y CRYSTAL STRUCTURE OF RABBIT RYANODINE RECEPTOR 1 (RESIDUES 1-536) DISEASE MUTANT C36R 提交 2012-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–536（536 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
突变：C36R GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 9.5；pH 9.5, EVAPORATION
分辨率 2.80 Å R-free 0.246
4I1E Crystal structure of Rabbit Ryanodine Receptor 1 (residues 1-536) disease mutant G249R 提交 2012-11-20 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–536（536 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
突变：G249R 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
分辨率 2.40 Å R-free 0.258
4I2S Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant I404M 提交 2012-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–536（536 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
突变：I404M GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
分辨率 2.50 Å R-free 0.249
4I37 Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant R402G 提交 2012-11-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–536（536 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
突变：R402G 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；pH 6.5, EVAPORATION
分辨率 2.95 Å R-free 0.289
4I3N Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant D61N 提交 2012-11-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–536（536 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
突变：D61N GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 9.5；pH 9.5, EVAPORATION
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
4I6I Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-559) disease mutant R45C 提交 2012-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–559（559 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-559
突变：R45C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7；pH 7.0, EVAPORATION
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
4I7I Crystal structure of rabbit ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant L14R 提交 2012-11-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–536（536 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
突变：L14R GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
4I8M Crystal structure of rabbit Ryanodine receptor 1 (residues 1-536) disease mutant V219I 提交 2012-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–536（536 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 1-536
突变：V219I GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 9；pH 9.0, EVAPORATION
分辨率 2.80 Å R-free 0.253
4I96 Crystal structure of the N-terminal two domains of the skeletal muscle ryanodine receptor (rabbit RyR1) residues 217-536 提交 2012-12-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 217–536（320 aa） 片段：N-TERMINAL DISEASE HOT SPOT, RESIDUES 217-536
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8；pH 8.0, EVAPORATION
分辨率 2.73 Å R-free 0.241
4P9J Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246) 提交 2014-04-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1070–1246（177 aa） 片段：UNP Residues 1070-1246
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；sodium citrate
分辨率 1.84 Å R-free 0.220
4P9J Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246) 提交 2014-04-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1070–1246（177 aa） 片段：UNP Residues 1070-1246
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；sodium citrate
分辨率 1.84 Å R-free 0.220
4P9J Crystal Structure of rabbit Ryanodine Receptor 1 SPRY2 Domain (1070-1246) 提交 2014-04-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1070–1246（177 aa） 片段：UNP Residues 1070-1246
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；sodium citrate
分辨率 1.84 Å R-free 0.220
4UWA Structure of the ryanodine receptor at resolution of 6.1 A in closed state 提交 2014-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–533（533 aa）
链 A 649–1571（923 aa）
链 A 2734–2939（206 aa）
链 B 1–533（533 aa）
链 B 649–1571（923 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 C 1–533（533 aa）
链 C 649–1571（923 aa）
链 C 2734–2939（206 aa）
链 D 1–533（533 aa）
链 D 649–1571（923 aa）
链 D 2734–2939（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM MOPS, 200MM NACL, 2MM DTT, 1MM EGTA；pH 7.4；10 MM MOPS, 200MM NACL, 2MM DTT, 1MM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 6.10 Å
4UWE Structure of the ryanodine receptor at resolution of 8.5 A in partially open state 提交 2014-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–533（533 aa）
链 A 649–1571（923 aa）
链 A 2734–2939（206 aa）
链 B 1–533（533 aa）
链 B 649–1571（923 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 C 1–533（533 aa）
链 C 649–1571（923 aa）
链 C 2734–2939（206 aa）
链 D 1–533（533 aa）
链 D 649–1571（923 aa）
链 D 2734–2939（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM MOPS, 200 MM NACL, 2 MM DTT AND 10 MM CACL2, 0.2% FLUORINATED OCTYL- MALTOSIDE；pH 7.4；10 MM MOPS, 200 MM NACL, 2 MM DTT AND 10 MM CACL2, 0.2% FLUORINATED OCTYL- MALTOSIDE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.50 Å
5C30 Crystal Structure of Rabbit Ryanodine Receptor 1 Repeat12 Domain 提交 2015-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 857–1054（198 aa） 片段：repeat12 domain (UNP residues 857-1054)
突变：C906A, C937A, C1040A IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.0, 19% w/v PEG20000
分辨率 1.55 Å R-free 0.165
5GKY Structure of RyR1 in a closed state (C1 conformer) 提交 2016-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 E 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5GKZ Structure of RyR1 in a closed state (C3 conformer) 提交 2016-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 E 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
5GL0 Structure of RyR1 in a closed state (C4 conformer) 提交 2016-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 E 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.015% Tween20 (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
5GL1 Structure of RyR1 in an open state 提交 2016-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 E 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM MOPS-Na, pH 7.4, 250 mM NaCl, 2 mM DTT, 0.5% CHAPS (w/v) (Sigma-Aldrich) and protease inhibitor cocktail including 2 mM PMSF, 2.6 ug/ml aprotinin, 1.4 ug/ml pepstatin, and 10 ug/ml leupeptin (Amresco),50 uM CaCl2 and 10 uM PCB95
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
5J8V Structure of rabbit ryanodine receptor RyR1 open state activated by calcium ion 提交 2016-04-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；1:1000 diluted protease inhibitor cocktail was also added in buffer
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2s before plunging.
分辨率 4.90 Å
5T15 Structural basis for gating and activation of RyR1 (30 uM Ca2+ dataset, all particles) 提交 2016-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–5037（1399 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–5037（1399 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–5037（1399 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–5037（1399 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 3.60 Å
5T9M Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 1) 提交 2016-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–5037（1399 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–5037（1399 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–5037（1399 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–5037（1399 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.00 Å
5T9N Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 2) 提交 2016-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–5037（1399 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–5037（1399 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–5037（1399 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–5037（1399 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 3.80 Å
5T9R Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 3) 提交 2016-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–5037（1399 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–5037（1399 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–5037（1399 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–5037（1399 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 5.80 Å
5T9S Structure of rabbit RyR1 (Ca2+-only dataset, class 4) 提交 2016-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–5037（1399 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–5037（1399 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–5037（1399 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–5037（1399 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.20 Å
5T9V Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1) 提交 2016-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4540–5037（498 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4540–5037（498 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4540–5037（498 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4540–5037（498 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TA3 Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 2) 提交 2016-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TAL Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 1&2) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TAM Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 4) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TAN Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TAP Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, all particles) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TAQ Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/Ca2+ dataset, class 3&4) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.10 Å
5TAS Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 1) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 6.20 Å
5TAT Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 2) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.80 Å
5TAU Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 3) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 6.20 Å
5TAV Structure of rabbit RyR1 (Caffeine/ATP/EGTA dataset, class 4) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.80 Å
5TAW Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, all particles) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TAX Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 1) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 6.60 Å
5TAY Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 2) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.60 Å
5TAZ Structure of rabbit RyR1 (ryanodine dataset, class 3) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.30 Å
5TB0 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, all particles) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.40 Å
5TB1 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 1) 提交 2016-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.60 Å
5TB2 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 2) 提交 2016-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.60 Å
5TB3 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 3) 提交 2016-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.70 Å
5TB4 Structure of rabbit RyR1 (EGTA-only dataset, class 4) 提交 2016-09-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 12–1275（1264 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–4253（615 aa）
链 B 4541–5037（497 aa）
链 E 12–1275（1264 aa）
链 E 1573–2479（907 aa）
链 E 2734–2939（206 aa）
链 E 3639–4253（615 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 12–1275（1264 aa）
链 G 1573–2479（907 aa）
链 G 2734–2939（206 aa）
链 G 3639–4253（615 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 I 12–1275（1264 aa）
链 I 1573–2479（907 aa）
链 I 2734–2939（206 aa）
链 I 3639–4253（615 aa）
链 I 4541–5037（497 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3-4 seconds on both sides with Whatman ashless filter paper, blot force 3, wait time 30 seconds
分辨率 4.50 Å
6FG3 Structure of Ryanodine receptor 1 in nanodiscs in the presence of calcium, ATP and ryanodine 提交 2018-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1275（1275 aa）
链 A 1573–2479（907 aa）
链 A 2734–2939（206 aa）
链 A 3639–5037（1399 aa）
链 B 1–1275（1275 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–5037（1399 aa）
链 C 1–1275（1275 aa）
链 C 1573–2479（907 aa）
链 C 2734–2939（206 aa）
链 C 3639–5037（1399 aa）
链 D 1–1275（1275 aa）
链 D 1573–2479（907 aa）
链 D 2734–2939（206 aa）
链 D 3639–5037（1399 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
6FOO Structure of Ryanodine Receptor 1 in nanodiscs in the presence of calcium and ATP 提交 2018-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1297（1297 aa）
链 A 1573–2479（907 aa）
链 A 2734–2939（206 aa）
链 A 3639–5037（1399 aa）
链 B 1–1297（1297 aa）
链 B 1573–2479（907 aa）
链 B 2734–2939（206 aa）
链 B 3639–5037（1399 aa）
链 C 1–1297（1297 aa）
链 C 1573–2479（907 aa）
链 C 2734–2939（206 aa）
链 C 3639–5037（1399 aa）
链 D 1–1297（1297 aa）
链 D 1573–2479（907 aa）
链 D 2734–2939（206 aa）
链 D 3639–5037（1399 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
6M2W Structure of RyR1 (Ca2+/Caffeine/ATP/CaM1234/CHL) 提交 2020-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–2634（2634 aa）
链 A 2741–2939（199 aa）
链 A 3623–4253（631 aa）
链 A 4541–5037（497 aa）
链 D 1–2634（2634 aa）
链 D 2741–2939（199 aa）
链 D 3623–4253（631 aa）
链 D 4541–5037（497 aa）
链 G 1–2634（2634 aa）
链 G 2741–2939（199 aa）
链 G 3623–4253（631 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
链 J 1–2634（2634 aa）
链 J 2741–2939（199 aa）
链 J 3623–4253（631 aa）
链 J 4541–5037（497 aa）
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6WOT Cryo-EM structure of recombinant rabbit Ryanodine Receptor type 1 mutant R164C in complex with FKBP12.6 提交 2020-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：R164C 突变：R164C 突变：R164C 突变：R164C ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
7CF9 Structure of RyR1 (Ca2+/CHL) 提交 2020-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–2634（2634 aa）
链 A 2741–2939（199 aa）
链 A 3623–4253（631 aa）
链 A 4541–5037（497 aa）
链 C 1–2634（2634 aa）
链 C 2741–2939（199 aa）
链 C 3623–4253（631 aa）
链 C 4541–5037（497 aa）
链 E 1–2634（2634 aa）
链 E 2741–2939（199 aa）
链 E 3623–4253（631 aa）
链 E 4541–5037（497 aa）
链 G 1–2634（2634 aa）
链 G 2741–2939（199 aa）
链 G 3623–4253（631 aa）
链 G 4541–5037（497 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
7M6A High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 I 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
7M6L High resolution structure of the membrane embedded skeletal muscle ryanodine receptor 提交 2021-03-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 I 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
7T64 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the closed state 提交 2021-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
分辨率 4.00 Å
7T65 Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6 embedded in lipidic nanodisc in the open state 提交 2021-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force 2; blot for 1.0s before plunging
分辨率 4.05 Å
7TDG Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in inactivated conformation (Dataset-A) 提交 2021-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1275（1275 aa）
链 A 1565–2486（922 aa）
链 A 2704–2941（238 aa）
链 A 3614–5037（1424 aa）
链 B 1–1275（1275 aa）
链 B 1565–2486（922 aa）
链 B 2704–2941（238 aa）
链 B 3614–5037（1424 aa）
链 C 1–1275（1275 aa）
链 C 1565–2486（922 aa）
链 C 2704–2941（238 aa）
链 C 3614–5037（1424 aa）
链 D 1–1275（1275 aa）
链 D 1565–2486（922 aa）
链 D 2704–2941（238 aa）
链 D 3614–5037（1424 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
分辨率 3.80 Å
7TDH Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in open conformation 提交 2021-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1275（1275 aa）
链 A 1565–2486（922 aa）
链 A 2704–2941（238 aa）
链 A 3614–5037（1424 aa）
链 B 1–1275（1275 aa）
链 B 1565–2486（922 aa）
链 B 2704–2941（238 aa）
链 B 3614–5037（1424 aa）
链 C 1–1275（1275 aa）
链 C 1565–2486（922 aa）
链 C 2704–2941（238 aa）
链 C 3614–5037（1424 aa）
链 D 1–1275（1275 aa）
链 D 1565–2486（922 aa）
链 D 2704–2941（238 aa）
链 D 3614–5037（1424 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
分辨率 4.00 Å
7TDI Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 2 (Dataset-A) 提交 2021-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1275（1275 aa）
链 A 1565–2486（922 aa）
链 A 2704–2941（238 aa）
链 A 3614–5037（1424 aa）
链 B 1–1275（1275 aa）
链 B 1565–2486（922 aa）
链 B 2704–2941（238 aa）
链 B 3614–5037（1424 aa）
链 C 1–1275（1275 aa）
链 C 1565–2486（922 aa）
链 C 2704–2941（238 aa）
链 C 3614–5037（1424 aa）
链 D 1–1275（1275 aa）
链 D 1565–2486（922 aa）
链 D 2704–2941（238 aa）
链 D 3614–5037（1424 aa）
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
分辨率 3.30 Å
7TDJ Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 1(Dataset-A) 提交 2021-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1275（1275 aa）
链 A 1565–2486（922 aa）
链 A 2704–2941（238 aa）
链 A 3614–5037（1424 aa）
链 B 1–1275（1275 aa）
链 B 1565–2486（922 aa）
链 B 2704–2941（238 aa）
链 B 3614–5037（1424 aa）
链 C 1–1275（1275 aa）
链 C 1565–2486（922 aa）
链 C 2704–2941（238 aa）
链 C 3614–5037（1424 aa）
链 D 1–1275（1275 aa）
链 D 1565–2486（922 aa）
链 D 2704–2941（238 aa）
链 D 3614–5037（1424 aa）
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
分辨率 3.70 Å
7TDK Rabbit RyR1 with AMP-PCP and high Ca2+ embedded in nanodisc in closed-inactivated conformation class 3 (Dataset-A) 提交 2021-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–1275（1275 aa）
链 A 1565–2486（922 aa）
链 A 2704–2941（238 aa）
链 A 3614–5037（1424 aa）
链 B 1–1275（1275 aa）
链 B 1565–2486（922 aa）
链 B 2704–2941（238 aa）
链 B 3614–5037（1424 aa）
链 C 1–1275（1275 aa）
链 C 1565–2486（922 aa）
链 C 2704–2941（238 aa）
链 C 3614–5037（1424 aa）
链 D 1–1275（1275 aa）
链 D 1565–2486（922 aa）
链 D 2704–2941（238 aa）
链 D 3614–5037（1424 aa）
未记录 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Sample was blotted for 1 second on both sides with Whatman hardened ashless filter paper with blot force 2.
分辨率 3.80 Å
7TZC A drug and ATP binding site in type 1 ryanodine receptor 提交 2022-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 I 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
8DRP Focus/local refined map in C4 of signal subtracted RyR1 particles 提交 2022-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 CFF CAFFEINE × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
8DTB Focus/local refined map in C1 of signal subtracted RyR1 particles in complex with ImperaCalcin 提交 2022-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 J 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
8DUJ Global map in C1 of RyR1 particles in complex with ImperaCalcin 提交 2022-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 J 1–5037（5037 aa）
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8DVE RyR1 in presence of IpCa-T26E phosphomimetic and activating ligands 提交 2022-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 J 1–5037（5037 aa）
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.84 Å
8RRT Structure of rabbit RyR1 reconstituted into lipid liposomes in open state in complex with FKBP and Nb9657 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 B 11–5037（5027 aa）
链 E 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8RRU Structure of RyR1 reconstituted into lipid liposomes in primed state in complex with FKBP and Nb9657. 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 B 11–5037（5027 aa）
链 E 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
8RRV Structure of RyR1 in detergent in close state in complex with FKBP and Nb9657. 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 B 1–5037（5037 aa）
链 E 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 J 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8RRW Structure of RyR1 in detergent in open state in complex with FKBP and Nb9657. 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 B 11–5037（5027 aa）
链 E 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8RRX Structure of RyR1 reconstituted into lipid nanodisc in primed state in complex with Ca2+, ATP, caffeine and Nb9657 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 11–5037（5027 aa）
链 D 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 I 11–5037（5027 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8RS0 Structure of RyR1 in detergent in primed state in complex with nanobody and FKBP 提交 2024-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 B 11–5037（5027 aa）
链 E 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SEN Cryo-EM Structure of RyR1 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8SEO Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.92 Å
8SEP Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
8SEQ Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8SER Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8SES Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ADE ADENINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.98 Å
8SET Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.42 Å
8SEU Cryo-EM Structure of RyR1 (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8SEV Cryo-EM Structure of RyR1 + ATP-gamma-S (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8SEW Cryo-EM Structure of RyR1 + ADP (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
8SEX Cryo-EM Structure of RyR1 + AMP (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.84 Å
8SEY Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenosine (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ADN ADENOSINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.99 Å
8SEZ Cryo-EM Structure of RyR1 + Adenine (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ADE ADENINE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.54 Å
8SF0 Cryo-EM Structure of RyR1 + cAMP (Local Refinement of TMD) 提交 2023-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8X48 Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (EGTA) 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8X49 Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (100 nM Ca2+) 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8X4A Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,100 nM Ca2+, closed state) 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8X4B Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,100 nM Ca2+, open state) 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8X4C Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (20 uM Ca2+, 2 mM ATP) 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8X4D Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0,20 uM Ca2+, 2 mM ATP) 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8X4E Cryo-EM structure of Ryanodine receptor 1 (TM helix S0, 5 mM Ca2+) 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8XJI Structure of chimeric RyR complex with flubendiamide 提交 2023-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S A1LVX Flubendiamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.91 Å
8XKH Structure of chimeric RyR Complex with tetraniliprole 提交 2023-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 A1LV1 tetraniliprole × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.87 Å
8XLF Structure of chimeric RyR 提交 2023-12-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S 突变：R4563K, F4564Y,C4657I, L4792S CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
8XLH Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E 提交 2023-12-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
8Y40 Structure of chimeric RyR-I4657M/G4819E complex with chlorantraniliprole 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E 突变：R4563K, F4564Y,C4657M, L4792S,G4819E F0U 5-bromanyl-N-[4-chloranyl-2-methyl-6-(methylcarbamoyl)phenyl]-2-(3-chloranylpyridin-2-yl)pyrazole-3-carboxamide × 4 ZN ZINC ION × 4 CA CALCIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
9CGP RyR1 disease mutant Y523S with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the absence of calcium with refined P1 domain 提交 2024-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 U1C Dantrolene × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.34 Å
9CGQ Rabbit RyR1 disease mutant Y523S in complex with FKBP12.6, nanodisc and inhibitor dantrolene in the presence of activating calcium 提交 2024-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S 突变：Y523S ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 U1C Dantrolene × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9E17 Structure of RyR1 in the primed state in the presence of caffeine (reprocessed/reanalyzed from EMPIAR-10997, 7TZC, EMD-26205) 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 I 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 8 ZN ZINC ION × 4 CFF CAFFEINE × 4 KVR 4-[(7-methoxy-2,3-dihydro-1,4-benzothiazepin-4(5H)-yl)methyl]benzoic acid × 4 L9R (2S)-3-(octadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.45 Å
9E18 Structure of RyR1 in the primed state in the presence of pentoxifylline 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 PNX 3,7-DIMETHYL-1-(5-OXOHEXYL)-3,7-DIHYDRO-1H-PURINE-2,6-DIONE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM pentoxifylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.68 Å
9E19 Structure of RyR1 in the open state in the presence of pentoxifylline 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 PNX 3,7-DIMETHYL-1-(5-OXOHEXYL)-3,7-DIHYDRO-1H-PURINE-2,6-DIONE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM pentoxifylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
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分辨率 4.04 Å
9E1A Structure of RyR1 in the primed state in the presence of dyphylline 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD2 dyphylline × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM dyphylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
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分辨率 3.35 Å
9E1B Structure of RyR1 in the open state in the presence of dyphylline 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD2 dyphylline × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM dyphylline was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
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分辨率 4.49 Å
9E1C Structure of RyR1 in the primed state in the presence of IBMX 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 IBM 3-ISOBUTYL-1-METHYLXANTHINE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM IBMX was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
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分辨率 2.63 Å
9E1D Structure of RyR1 in the primed state in the presence of enprofylline 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD3 enprofylline × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM enprofylline was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
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分辨率 2.76 Å
9E1E Structure of RyR1 in the primed state in the presence of uracil 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 URA URACIL × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM uracil was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
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分辨率 2.92 Å
9E1F Structure of RyR1 in the primed state in the presence of allopurinol 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD4 allopurinol × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM allopurinol was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
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分辨率 3.03 Å
9E1G Structure of RyR1 in the primed state in the presence of oxypurinol 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 141 Oxypurinol × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM oxypurinol was added to the final sample from a 100 mM stock solution in 100% DMSO.
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分辨率 3.17 Å
9E1H Structure of RyR1 in the primed state in the presence of oxopyricid 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD5 oxopyricid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM oxopyricid was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
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分辨率 3.26 Å
9E1I Structure of RyR1 in the open state in the presence of oxopyricid 提交 2024-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 B 1–5037（5037 aa）
链 C 1–5037（5037 aa）
链 D 1–5037（5037 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 A1BD5 oxopyricid × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；2 mM oxopyricid was added to the final sample from a 20 mM stock solution in buffer.
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分辨率 3.20 Å
9HEO Open-state RyR1 in 0.05% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP 提交 2024-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 11–5037（5027 aa）
链 C 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 72 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
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分辨率 3.40 Å
9HEQ Open-state RyR1 in 0.01% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP12 提交 2024-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 11–5037（5027 aa）
链 C 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 40 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9OL4 Cryo-EM Structure of Ryanodine Receptor 1: Drug Bound Open Conformation 提交 2025-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 M 1–5037（5037 aa）
链 S 1–5037（5037 aa）
未记录 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 12 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9OL5 Rabbit Ryanodine Receptor 1: Atorvastatin Bound Closed Conformation 提交 2025-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 M 1–5037（5037 aa）
链 S 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 117 7-[2-(4-FLUORO-PHENYL)-5-ISOPROPYL-3-PHENYL-4-PHENYLCARBAMOYL-PYRROL-1-YL]- 3,5-DIHYDROXY-HEPTANOIC ACID × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.56 Å
9OL6 Rabbit Ryanodine Receptor 1: DMSO Control Closed Conformation 提交 2025-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–5037（5037 aa）
链 G 1–5037（5037 aa）
链 M 1–5037（5037 aa）
链 S 1–5037（5037 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
9R8O Primed-state RyR1 in 0.05% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP 提交 2025-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 C 11–5037（5027 aa）
链 F 11–5037（5027 aa）
链 I 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 40 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9RCW Primed-state RyR1 in 0.01% POPC micelles, in complex with a nanobody and FKBP12 提交 2025-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric
链 A 11–5037（5027 aa）
链 C 11–5037（5027 aa）
链 G 11–5037（5027 aa）
链 J 11–5037（5027 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 CFF CAFFEINE × 4 CA CALCIUM ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 24 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å

共 124 个其他 PDB 条目、134 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RYR1_RABIT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–213； UniProt 1–210 作者链 B； PDB构建体 4–213； UniProt 1–210

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3hsm

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3hsm
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3hsm
沉积日期 deposition_date2009-06-10
结构标题 titleCrystal structure of distal N-terminal beta-trefoil domain of Ryanodine Receptor type 1
关键词 keywords;beta-trefoil, Calcium, Calcium channel, Calcium transport, Glycoprotein, Ion transport, Ionic channel, Membrane, Phosphoprotein, Receptor, S-nitrosylation, Transmembrane, Transport, SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier24.58 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.15 Å
零角强度 I(0) i023049900.00
分子量 molecular_weight36222.0 kDa
排除体积 excluded_volume45193 ų
包络体积 envelope_volume56275 ų
水化壳体积 shell_volume20411 ų
包络直径 envelope_diameter85.0 Å
壳层 Rg shell_rg29.69 Å
包络 Rg envelope_rg24.30 Å
形状 Rg shape_rg24.14 Å
总 Rg total_rg24.85 Å
总原子数 total_atoms2534
残基数 n_residues323
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax83.5 Å
Rg (实空间) rg_real24.80 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.62 Å
I(0) (实空间) i0_real2.3050e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.4670e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal24.75 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal23050000.0000
解质量估计 total_estimate0.8213
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary22.5 Å
偏度 Skewness skewness0.496
峰度 Kurtosis kurtosis-0.423
角度范围 angular_range— – 0.3250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha7727000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.663; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.719; Smooth: 0.962
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3hsma_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamilyb.42.6 — MIR domain
家族 Family familyb.42.6.2 — Ryanodine receptor N-terminal-like
结构域编号 domain_idd3hsmb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.42 — beta-Trefoil
超家族 Superfamily superfamilyb.42.6 — MIR domain
家族 Family familyb.42.6.2 — Ryanodine receptor N-terminal-like

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3hsmA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture80 — Trefoil
拓扑 Topology topology10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 —
结构域编号 domain_id3hsmB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture80 — Trefoil
拓扑 Topology topology10 — Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 —
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)