3ibr

Crystal Structure of P. aeruginosa Bacteriophytochrome Photosensory Core Module Mutant Q188L in the Mixed Pr/Pfr State

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Bacteriophytochrome

Pseudomonas aeruginosa

UniProt Q9HWR3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 BILIVERDINE IX ALPHA × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BPHY_PSEAE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–497; UniProt 1–497 作者链 B; PDB构建体 1–497; UniProt 1–497

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3ibr
沉积日期 deposition_date2009-07-16
结构标题 titleCrystal Structure of P. aeruginosa Bacteriophytochrome Photosensory Core Module Mutant Q188L in the Mixed Pr/Pfr State
关键词 keywords;phytochrome, red-light photoreceptor, photoconversion, chromophore, ATP-binding, Kinase, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Photoreceptor protein, Receptor, Sensory transduction, Transferase ;; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3ibr__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3ibr__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3ibr__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)35.06 Å
Rg(电子密度)34.34 Å
总 Rg34.82 Å
原子数7288
残基数892
排除体积129320 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3ibr__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd3ibra1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.110.3 — PYP-like sensor domain (PAS domain)
家族 Family familyd.110.3.9 — BphP N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3ibra2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.110.2 — GAF domain-like
家族 Family familyd.110.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3ibra3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.110.2 — GAF domain-like
家族 Family familyd.110.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3ibrb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.110.3 — PYP-like sensor domain (PAS domain)
家族 Family familyd.110.3.9 — BphP N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3ibrb2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.110.2 — GAF domain-like
家族 Family familyd.110.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3ibrb3
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.110 — Profilin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.110.2 — GAF domain-like
家族 Family familyd.110.2.0 — automated matches

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3ibrA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — GAF domain
结构域编号 domain_id3ibrA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — PAS domain
结构域编号 domain_id3ibrA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — PHY domain
结构域编号 domain_id3ibrB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — GAF domain
结构域编号 domain_id3ibrB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — PAS domain
结构域编号 domain_id3ibrB03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology450 — Beta-Lactamase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — PHY domain
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7. 引用文献 (1)