SAXSdb — 3iyp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	Polyprotein × 60 （Q6W9E5） Polyprotein × 60 （Q6W9E5） Polyprotein × 60 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 60 （P08174） LAURIC ACID × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Polyprotein × 5 （Q6W9E5） Polyprotein × 5 （Q6W9E5） Polyprotein × 5 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 5 （P08174） LAURIC ACID × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Polyprotein × 6 （Q6W9E5） Polyprotein × 6 （Q6W9E5） Polyprotein × 6 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 6 （P08174） LAURIC ACID × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9QP24_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–292； UniProt 1–292

Polyprotein

物种未注明

UniProt Q6W9E5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	Capsid protein × 60 （Q9QP24） Polyprotein × 60 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 60 （P08174） LAURIC ACID × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Capsid protein × 1 （Q9QP24） Polyprotein × 1 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Capsid protein × 5 （Q9QP24） Polyprotein × 5 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 5 （P08174） LAURIC ACID × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Capsid protein × 6 （Q9QP24） Polyprotein × 6 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 6 （P08174） LAURIC ACID × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Capsid protein × 1 （Q9QP24） Polyprotein × 1 （Q91QV1） Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6W9E5_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	2, 3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–238； UniProt 331–568 作者链 C； PDB构建体 1–260； UniProt 71–330

Polyprotein

物种未注明

UniProt Q91QV1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	Capsid protein × 60 （Q9QP24） Polyprotein × 60 （Q6W9E5） Polyprotein × 60 （Q6W9E5） Complement decay-accelerating factor × 60 （P08174） LAURIC ACID × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Capsid protein × 1 （Q9QP24） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Capsid protein × 5 （Q9QP24） Polyprotein × 5 （Q6W9E5） Polyprotein × 5 （Q6W9E5） Complement decay-accelerating factor × 5 （P08174） LAURIC ACID × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Capsid protein × 6 （Q9QP24） Polyprotein × 6 （Q6W9E5） Polyprotein × 6 （Q6W9E5） Complement decay-accelerating factor × 6 （P08174） LAURIC ACID × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Capsid protein × 1 （Q9QP24） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q91QV1_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

Complement decay-accelerating factor

物种未注明

UniProt P08174

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 300	Capsid protein × 60 （Q9QP24） Polyprotein × 60 （Q6W9E5） Polyprotein × 60 （Q6W9E5） Polyprotein × 60 （Q91QV1） LAURIC ACID × 60	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Capsid protein × 1 （Q9QP24） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q91QV1） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 25	Capsid protein × 5 （Q9QP24） Polyprotein × 5 （Q6W9E5） Polyprotein × 5 （Q6W9E5） Polyprotein × 5 （Q91QV1） LAURIC ACID × 5	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 30	Capsid protein × 6 （Q9QP24） Polyprotein × 6 （Q6W9E5） Polyprotein × 6 （Q6W9E5） Polyprotein × 6 （Q91QV1） LAURIC ACID × 6	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Capsid protein × 1 （Q9QP24） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q6W9E5） Polyprotein × 1 （Q91QV1） LAURIC ACID × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DAF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–381； UniProt 1–381

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3iyp
沉积日期 deposition_date	2010-04-07
结构标题 title	The Interaction of Decay-accelerating Factor with Echovirus 7
关键词 keywords	VIRUS, RECEPTOR, COMPLEX, ECHOVIRUS, DAF, icosahedral virus; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3iyp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3iyp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3iyp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	139.50 Å
总 Rg	139.50 Å
原子数	509700
残基数	64800
排除体积	9018100 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3iyp__assembly_1__model_1`	300-meric （300）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3iyp__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
3	1	`3iyp__assembly_3__model_1`	25-meric （25）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
4	1	`3iyp__assembly_4__model_1`	30-meric （30）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。
5	1	`3iyp__assembly_5__model_1`	pentameric （5）	排除	—	—
	排除原因：辅助对称表示，不是完整或代表性的 biological assembly。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Capsid protein
分子量 formula_weight	33313.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	8495

GDTETAIDNAIARVADTVASGPSNSTSIPALTAVETGHTSQVEPSDTMQTRHVKNYHSRSESTVENFLSRSACVYIEEYYTKDQDNVNRYMSWTINARRMVQLRRKFELFTYMRFDMEITFVITSRQLPGTSIAQDMPPLTHQIMYIPPGGPVPNSVTDFAWQTSTNPSIFWTEGNAPPRMSIPFISIGNAYSNFYDGWSHFSQNGVYGYNALNNMGKLYARHVNKDTPYQMSSTIRVYFKPKHIRVWVPRPPRLSPYIKSSNVNFNPTNLTDERSSITYVPDTIRPDVRTN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Polyprotein
分子量 formula_weight	26227.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GLPVLNTPGSNQFMTSDDFQSPSAMPQFDVTPHMDIPGEVHNLMEIAEVDSVVPVNNIKANLQSMDAYHIEVNTGNYQGEKIFAFQMQPGLESVFKRTLMGEILNYYAHWSGSIKLTFTFCGSAMATGKLLLAYSPPGADVPATRKQAMLGTHMIWDIGLQSSCVLCIPWISQTHYRLVQQDEYTSAGNVTCWYQTGIVVPPGTPNKCVVLCFASACNDFSVRMLRDTPFIGQTALLQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Polyprotein
分子量 formula_weight	29072.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

PSAEECGYSDRVRSLTLGNSTITTQESANVVVGYGRWPEYLRDDEATAEDQPTQPDVATCRFYTLESVQWEKNSAGWWWKFPEALKDMGLFGQNMLYHYLGRAGYTIHVQCNASKFHQGCLLVVCVPEAEMGCSQTDKEVAAMNLTKGEAAHKFEPTKTNGEHTVQSIVCNAGMGVGVGNLTIYPHQWINLRTNNCATIVMPYVNSVPMDNMFRHYNFTLMVIPFAPLDYAAQASEYVPVTVTIAPMCAEYNGLRLAYQQ

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Polyprotein
分子量 formula_weight	7599.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MGAQVSTQKTGAHETGLNASGNSIIHYTNINYYKDAASNSANRQDFTQDPGKFTEPVKDIMIKTMPALNS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Complement decay-accelerating factor
分子量 formula_weight	41511.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWQDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTVITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFPVGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGERDHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPTTVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTGLLGTLVTMGLLT

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	LAURIC ACID
分子量 formula_weight	200.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	7.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	common lines fourier method
颗粒数 num_particles	11430

The Interaction of Decay-accelerating Factor with Echovirus 7

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Complement decay-accelerating factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3iyp__assembly_1__model_1

3iyp__assembly_1__model_1 | I(q)

3iyp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

7. 引用文献 (1)

The Interaction of Decay-accelerating Factor with Echovirus 7

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Complement decay-accelerating factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3iyp__assembly_1__model_1

3iyp__assembly_1__model_1 | I(q)

3iyp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

7. 引用文献 (1)