3j8g

Electron cryo-microscopy structure of EngA bound with the 50S ribosomal subunit

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L28

OrganismNot specified

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	C9QUM4_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	3
Chains and sequence ranges	Author chain 0； PDBConstruct 1–78； UniProt 1–78

50S ribosomal protein L14

OrganismNot specified

UniProt C9QXH2

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	C9QXH2_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	4
Chains and sequence ranges	Author chain K； PDBConstruct 1–123； UniProt 1–123

50S ribosomal protein L15

OrganismNot specified

UniProt P02413

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL15_ECOLI
Isoform	—
PDB entities	5
Chains and sequence ranges	Author chain L； PDBConstruct 1–144； UniProt 1–144

50S ribosomal protein L29

OrganismNot specified

UniProt C9QXH0

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	C9QXH0_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	6
Chains and sequence ranges	Author chain 1； PDBConstruct 1–63； UniProt 1–63

50S ribosomal protein L16

OrganismNot specified

UniProt C9QXG9

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXG9_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	7
Chains and sequence ranges	Author chain M； PDBConstruct 1–136； UniProt 1–136

50S ribosomal protein L17

OrganismNot specified

UniProt C9QXI8

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXI8_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	8
Chains and sequence ranges	Author chain N； PDBConstruct 1–127； UniProt 1–127

50S ribosomal protein L18

OrganismNot specified

UniProt C9QXH8

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXH8_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	9
Chains and sequence ranges	Author chain O； PDBConstruct 1–117； UniProt 1–117

50S ribosomal protein L19

OrganismNot specified

UniProt C9R119

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9R119_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	10
Chains and sequence ranges	Author chain P； PDBConstruct 1–115； UniProt 1–115

50S ribosomal protein L20

OrganismNot specified

UniProt C9QTZ1

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QTZ1_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	11
Chains and sequence ranges	Author chain Q； PDBConstruct 1–118； UniProt 1–118

50S ribosomal protein L21

OrganismNot specified

UniProt C9QY61

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QY61_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	12
Chains and sequence ranges	Author chain R； PDBConstruct 1–103； UniProt 1–103

50S ribosomal protein L22

OrganismNot specified

UniProt C9QXG7

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXG7_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	13
Chains and sequence ranges	Author chain S； PDBConstruct 1–110； UniProt 1–110

50S ribosomal protein L3

OrganismNot specified

UniProt C9QXG2

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXG2_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	14
Chains and sequence ranges	Author chain D； PDBConstruct 1–209； UniProt 1–209

50S ribosomal protein L23

OrganismNot specified

UniProt B1X6G9

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	B1X6G9_ECODH
Isoform	—
PDB entities	15
Chains and sequence ranges	Author chain T； PDBConstruct 1–100； UniProt 1–100

50S ribosomal protein L30

OrganismNot specified

UniProt C9QXI0

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXI0_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	16
Chains and sequence ranges	Author chain 2； PDBConstruct 1–59； UniProt 1–59

50S ribosomal protein L24

OrganismNot specified

UniProt C9QXH3

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXH3_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	17
Chains and sequence ranges	Author chain U； PDBConstruct 1–104； UniProt 1–104

50S ribosomal protein L25

OrganismNot specified

UniProt C9QRC1

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QRC1_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	18
Chains and sequence ranges	Author chain W； PDBConstruct 1–94； UniProt 1–94

GTPase Der

Escherichia coli K12

UniProt C9QPR2

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QPR2_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	19
Chains and sequence ranges	Author chain X； PDBConstruct 1–490； UniProt 1–490

50S ribosomal protein L4

OrganismNot specified

UniProt C9QXG3

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXG3_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	20
Chains and sequence ranges	Author chain E； PDBConstruct 1–201； UniProt 1–201

50S ribosomal protein L27

OrganismNot specified

UniProt C9QY62

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QY62_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	21
Chains and sequence ranges	Author chain Y； PDBConstruct 1–85； UniProt 1–85

50S ribosomal protein L32

OrganismNot specified

UniProt C9QYM3

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QYM3_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	22
Chains and sequence ranges	Author chain 3； PDBConstruct 1–57； UniProt 1–57

50S ribosomal protein L1

OrganismNot specified

UniProt H0QFK1

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	H0QFK1_ECOLI
Isoform	—
PDB entities	23
Chains and sequence ranges	Author chain 5； PDBConstruct 1–234； UniProt 1–234

50S ribosomal protein L34

OrganismNot specified

UniProt C9QXD2

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXD2_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	24
Chains and sequence ranges	Author chain 6； PDBConstruct 1–46； UniProt 1–46

50S ribosomal protein L35

OrganismNot specified

UniProt C9QTZ0

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QTZ0_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	25
Chains and sequence ranges	Author chain 7； PDBConstruct 1–65； UniProt 1–65

50S ribosomal protein L36

OrganismNot specified

UniProt C9QXI3

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXI3_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	26
Chains and sequence ranges	Author chain 8； PDBConstruct 1–38； UniProt 1–38

50S ribosomal protein L2

OrganismNot specified

UniProt C9QXG5

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXG5_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	27
Chains and sequence ranges	Author chain C； PDBConstruct 1–273； UniProt 1–273

50S ribosomal protein L5

OrganismNot specified

UniProt C9QXH4

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXH4_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	28
Chains and sequence ranges	Author chain F； PDBConstruct 1–179； UniProt 1–179

50S ribosomal protein L6

OrganismNot specified

UniProt C9QXH7

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXH7_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	29
Chains and sequence ranges	Author chain G； PDBConstruct 1–177； UniProt 1–177

50S ribosomal protein L9

OrganismNot specified

UniProt C9QTM2

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QTM2_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	30
Chains and sequence ranges	Author chain H； PDBConstruct 1–149； UniProt 1–149

50S ribosomal protein L11

OrganismNot specified

UniProt C9QV94

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L13 × 1 （C9QXP2）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QV94_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	31
Chains and sequence ranges	Author chain I； PDBConstruct 1–142； UniProt 1–142

50S ribosomal protein L13

OrganismNot specified

UniProt C9QXP2

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 30 RNA 2	5S rRNA × 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L28 × 1 （C9QUM4） 50S ribosomal protein L14 × 1 （C9QXH2） 50S ribosomal protein L15 × 1 （P02413） 50S ribosomal protein L29 × 1 （C9QXH0） 50S ribosomal protein L16 × 1 （C9QXG9） 50S ribosomal protein L17 × 1 （C9QXI8） 50S ribosomal protein L18 × 1 （C9QXH8） 50S ribosomal protein L19 × 1 （C9R119） 50S ribosomal protein L20 × 1 （C9QTZ1） 50S ribosomal protein L21 × 1 （C9QY61） 50S ribosomal protein L22 × 1 （C9QXG7） 50S ribosomal protein L3 × 1 （C9QXG2） 50S ribosomal protein L23 × 1 （B1X6G9） 50S ribosomal protein L30 × 1 （C9QXI0） 50S ribosomal protein L24 × 1 （C9QXH3） 50S ribosomal protein L25 × 1 （C9QRC1） GTPase Der × 1 （C9QPR2） 50S ribosomal protein L4 × 1 （C9QXG3） 50S ribosomal protein L27 × 1 （C9QY62） 50S ribosomal protein L32 × 1 （C9QYM3） 50S ribosomal protein L1 × 1 （H0QFK1） 50S ribosomal protein L34 × 1 （C9QXD2） 50S ribosomal protein L35 × 1 （C9QTZ0） 50S ribosomal protein L36 × 1 （C9QXI3） 50S ribosomal protein L2 × 1 （C9QXG5） 50S ribosomal protein L5 × 1 （C9QXH4） 50S ribosomal protein L6 × 1 （C9QXH7） 50S ribosomal protein L9 × 1 （C9QTM2） 50S ribosomal protein L11 × 1 （C9QV94）	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	C9QXP2_ECOD1
Isoform	—
PDB entities	32
Chains and sequence ranges	Author chain J； PDBConstruct 1–142； UniProt 1–142

The page prioritizes protein identity, the current assembly, associated components, oligomeric state and cross-PDB links. Chain mapping and sequence ranges are retained as data evidence. Internal IDs, import timestamps and assembly operation expressions are maintenance fields and are not shown here.

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2. Structure Basics 2. Structure Basics

Entry ID entry_id	3j8g
Deposition date deposition_date	2014-10-24
Structure title title	Electron cryo-microscopy structure of EngA bound with the 50S ribosomal subunit
Keywords keywords	Ribosome assembly, EngA, Der, YphC, GTPase, RNA folding, Ribosome; RIBOSOME
Experimental Method method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

This page reads only the latest assembly calculations. Every curve maps to an explicit PDB entry, official biological assembly and coordinate model.

3j8g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

Download this curve (.dat)

3j8g__assembly_1__model_1 | I(q)

100 plotted points; both axes use logarithmic scales.

3j8g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) will be calculated and displayed separately for the same assembly/model.

Rg（Guinier）	71.37 Å
Rg (electron density)	72.18 Å
Total Rg	72.20 Å
Atom count	94855
Residues	6954
Excluded volume	1454200 Å³
Maximum q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	Structure unit	Oligomeric description	Status	CRYSOL	Actions
1	1	`3j8g__assembly_1__model_1`	32-meric （32）	Success	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	View Download

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4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

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5. Entities and Polymers Entities & Polymers (32)

Entity 1 Entity 1 polymer

Description description	5S rRNA
Molecular weight formula_weight	37848.6 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	A
Atom count atom_count	94855

GCCUGGCGGCCGUAGCGCGGUGGUCCCACCUGACCCCAUGCCGAACUCAGAAGUGAAACGCCGUAGCGCCGAUGGUAGUGUGGGGUCUCCCCAUGCGAGAGUAGGGAACUGCCAGGC

Entity 2 Entity 2 polymer

Description description	23S rRNA
Molecular weight formula_weight	941306.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	B

GGUUAAGCGACUAAGCGUACACGGUGGAUGCCCUGGCAGUCAGAGGCGAUGAAGGACGUGCUAAUCUGCGAUAAGCGUCGGUAAGGUGAUAUGAACCGUUAUAACCGGCGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGUGUGUUUCGACACACUAUCAUUAACUGAAUCCAUAGGUUAAUGAGGCGAACCGGGGGAACUGAAACAUCUAAGUACCCCGAGGAAAAGAAAUCAACCGAGAUUCCCCCAGUAGCGGCGAGCGAACGGGGAGCAGCCCAGAGCCUGAAUCAGUGUGUGUGUUAGUGGAAGCGUCUGGAAAGGCGCGCGAUACAGGGUGACAGCCCCGUACACAAAAAUGCACAUGCUGUGAGCUCGAUGAGUAGGGCGGGACACGUGGUAUCCUGUCUGAAUAUGGGGGGACCAUCCUCCAAGGCUAAAUACUCCUGACUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGCGAAAAGAACCCCGGCGAGGGGAGUGAAAAAGAACCUGAAACCGUGUACGUACAAGCAGUGGGAGCACGCUUAGGCGUGUGACUGCGUACCUUUUGUAUAAUGGGUCAGCGACUUAUAUUCUGUAGCAAGGUUAACCGAAUAGGGGAGCCGAAGGGAAACCGAGUCUUAACUGGGCGUUAAGUUGCAGGGUAUAGACCCGAAACCCGGUGAUCUAGCCAUGGGCAGGUUGAAGGUUGGGUAACACUAACUGGAGGACCGAACCGACUAAUGUUGAAAAAUUAGCGGAUGACUUGUGGCUGGGGGUGAAAGGCCAAUCAAACCGGGAGAUAGCUGGUUCUCCCCGAAAGCUAUUUAGGUAGCGCCUCGUGAAUUCAUCUCCGGGGGUAGAGCACUGUUUCGGCAAGGGGGUCAUCCCGACUUACCAACCCGAUGCAAACUGCGAAUACCGGAGAAUGUUAUCACGGGAGACACACGGCGGGUGCUAACGUCCGUCGUGAAGAGGGAAACAACCCAGACCGCCAGCUAAGGUCCCAAAGUCAUGGUUAAGUGGGAAACGAUGUGGGAAGGCCCAGACAGCCAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAAAGCGUAAUAGCUCACUGGUCGAGUCGGCCUGCGCGGAAGAUGUAACGGGGCUAAACCAUGCACCGAAGCUGCGGCAGCGACGCUUAUGCGUUGUUGGGUAGGGGAGCGUUCUGUAAGCCUGCGAAGGUGUGCUGUGAGGCAUGCUGGAGGUAUCAGAAGUGCGAAUGCUGACAUAAGUAACGAUAAAGCGGGUGAAAAGCCCGCUCGCCGGAAGACCAAGGGUUCCUGUCCAACGUUAAUCGGGGCAGGGUGAGUCGACCCCUAAGGCGAGGCCGAAAGGCGUAGUCGAUGGGAAACAGGUUAAUAUUCCUGUACUUGGUGUUACUGCGAAGGGGGGACGGAGAAGGCUAUGUUGGCCGGGCGACGGUUGUCCCGGUUUAAGCGUGUAGGCUGGUUUUCCAGGCAAAUCCGGAAAAUCAAGGCUGAGGCGUGAUGACGAGGCACUACGGUGCUGAAGCAACAAAUGCCCUGCUUCCAGGAAAAGCCUCUAAGCAUCAGGUAACAUCAAAUCGUACCCCAAACCGACACAGGUGGUCAGGUAGAGAAUACCAAGGCGCUUGAGAGAACUCGGGUGAAGGAACUAGGCAAAAUGGUGCCGUAACUUCGGGAGAAGGCACGCUGAUAUGUAGGUGAGGUCCCUCGCGGAUGGAGCUGAAAUCAGUCGAAGAUACCAGCUGGCUGCAACUGUUUAUUAAAAACACAGCACUGUGCAAACACGAAAGUGGACGUAUACGGUGUGACGCCUGCCCGGUGCCGGAAGGUUAAUUGAUGGGGUUAGCGCAAGCGAAGCUCUUGAUCGAAGCCCCGGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCUGCACGAAUGGCGUAAUGAUGGCCAGGCUGUCUCCACCCGAGACUCAGUGAAAUUGAACUCGCUGUGAAGAUGCAGUGUACCCGCGGCAAGACGGAAAGACCCCGUGAACCUUUACUAUAGCUUGACACUGAACAUUGAGCCUUGAUGUGUAGGAUAGGUGGGAGGCUUUGAAGUGUGGACGCCAGUCUGCAUGGAGCCGACCUUGAAAUACCACCCUUUAAUGUUUGAUGUUCUAACGUUGACCCGUAAUCCGGGUUGCGGACAGUGUCUGGUGGGUAGUUUGACUGGGGCGGUCUCCUCCUAAAGAGUAACGGAGGAGCACGAAGGUUGGCUAAUCCUGGUCGGACAUCAGGAGGUUAGUGCAAUGGCAUAAGCCAGCUUGACUGCGAGCGUGACGGCGCGAGCAGGUGCGAAAGCAGGUCAUAGUGAUCCGGUGGUUCUGAAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGGUACUCCGGGGAUAACAGGCUGAUACCGCCCAAGAGUUCAUAUCGACGGCGGUGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCACAUCCUGGGGCUGAAGUAGGUCCCAAGGGUAUGGCUGUUCGCCAUUUAAAGUGGUACGCGAGCUGGGUUUAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCUGCCGUGGGCGCUGGAGAACUGAGGGGGGCUGCUCCUAGUACGAGAGGACCGGAGUGGACGCAUCACUGGUGUUCGGGUUGUCAUGCCAAUGGCACUGCCCGGUAGCUAAAUGCGGAAGAGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCACGAAACUUGCCCCGAGAUGAGUUCUCCCUGACCCUUUAAGGGUCCUGAAGGAACGUUGAAGACGACGACGUUGAUAGGCCGGGUGUGUAAGCGCAGCGAUGCGUUGAGCUAACCGGUACUAAUGAACCGUGAGGCUUAACCU

Entity 3 Entity 3 polymer

Description description	50S ribosomal protein L28
Molecular weight formula_weight	9027.6 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	0

MSRVCQVTGKRPVTGNNRSHALNATKRRFLPNLHSHRFWVESEKRFVTLRVSAKGMRVIDKKGIDTVLAELRARGEKY

Entity 4 Entity 4 polymer

Description description	50S ribosomal protein L14
Molecular weight formula_weight	13565.1 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	K

MIQEQTMLNVADNSGARRVMCIKVLGGSHRRYAGVGDIIKITIKEAIPRGKVKKGDVLKAVVVRTKKGVRRPDGSVIRFDGNACVLLNNNSEQPIGTRIFGPVTRELRSEKFMKIISLAPEVL

Entity 5 Entity 5 polymer

Description description	50S ribosomal protein L15
Molecular weight formula_weight	15008.5 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	L

MRLNTLSPAEGSKKAGKRLGRGIGSGLGKTGGRGHKGQKSRSGGGVRRGFEGGQMPLYRRLPKFGFTSRKAAITAEIRLSDLAKVEGGVVDLNTLKAANIIGIQIEFAKVILAGEVTTPVTVRGLRVTKGARAAIEAAGGKIEE

Entity 6 Entity 6 polymer

Description description	50S ribosomal protein L29
Molecular weight formula_weight	7286.5 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	1

MKAKELREKSVEELNTELLNLLREQFNLRMQAASGQLQQSHLLKQVRRDVARVKTLLNEKAGA

Entity 7 Entity 7 polymer

Description description	50S ribosomal protein L16
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	M

MLQPKRTKFRKMHKGRNRGLAQGTDVSFGSFGLKAVGRGRLTARQIEAARRAMTRAVKRQGKIWIRVFPDKPITEKPLAVRMGKGKGNVEYWVALIQPGKVLYEMDGVPEELAREAFKLAAAKLPIKTTFVTKTVM

Entity 8 Entity 8 polymer

Description description	50S ribosomal protein L17
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	N

MRHRKSGRQLNRNSSHRQAMFRNMAGSLVRHEIIKTTLPKAKELRRVVEPLITLAKTDSVANRRLAFARTRDNEIVAKLFNELGPRFASRAGGYTRILKCGFRAGDNAPMAYIELVDRSEKAEAAAE

Entity 9 Entity 9 polymer

Description description	50S ribosomal protein L18
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
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MDKKSARIRRATRARRKLQELGATRLVVHRTPRHIYAQVIAPNGSEVLVAASTVEKAIAEQLKYTGNKDAAAAVGKAVAERALEKGIKDVSFDRSGFQYHGRVQALADAAREAGLQF

Entity 10 Entity 10 polymer

Description description	50S ribosomal protein L19
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	P

MSNIIKQLEQEQMKQDVPSFRPGDTVEVKVWVVEGSKKRLQAFEGVVIAIRNRGLHSAFTVRKISNGEGVERVFQTHSPVVDSISVKRRGAVRKAKLYYLRERTGKAARIKERLN

Entity 11 Entity 11 polymer

Description description	50S ribosomal protein L20
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Q

MARVKRGVIARARHKKILKQAKGYYGARSRVYRVAFQAVIKAGQYAYRDRRQRKRQFRQLWIARINAAARQNGISYSKFINGLKKASVEIDRKILADIAVFDKVAFTALVEKAKAALA

Entity 12 Entity 12 polymer

Description description	50S ribosomal protein L21
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	R

MYAVFQSGGKQHRVSEGQTVRLEKLDIATGETVEFAEVLMIANGEEVKIGVPFVDGGVIKAEVVAHGRGEKVKIVKFRRRKHYRKQQGHRQWFTDVKITGISA

Entity 13 Entity 13 polymer

Description description	50S ribosomal protein L22
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	S

METIAKHRHARSSAQKVRLVADLIRGKKVSQALDILTYTNKKAAVLVKKVLESAIANAEHNDGADIDDLKVTKIFVDEGPSMKRIMPRAKGRADRILKRTSHITVVVSDR

Entity 14 Entity 14 polymer

Description description	50S ribosomal protein L3
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	D

MIGLVGKKVGMTRIFTEDGVSIPVTVIEVEANRVTQVKDLANDGYRAIQVTTGAKKANRVTKPEAGHFAKAGVEAGRGLWEFRLAEGEEFTVGQSISVELFADVKKVDVTGTSKGKGFAGTVKRWNFRTQDATHGNSLSHRVPGSIGQNQTPGKVFKGKKMAGQMGNERVTVQSLDVVRVDAERNLLLVKGAVPGATGSDLIVKPAVKA

Entity 15 Entity 15 polymer

Description description	50S ribosomal protein L23
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	T

MIREERLLKVLRAPHVSEKASTAMEKSNTIVLKVAKDATKAEIKAAVQKLFEVEVEVVNTLVVKGKVKRHGQRIGRRSDWKKAYVTLKEGQNLDFVGGAE

Entity 16 Entity 16 polymer

Description description	50S ribosomal protein L30
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	2

MAKTIKITQTRSAIGRLPKHKATLLGLGLRRIGHTVEREDTPAIRGMINAVSFMVKVEE

Entity 17 Entity 17 polymer

Description description	50S ribosomal protein L24
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	U

MAAKIRRDDEVIVLTGKDKGKRGKVKNVLSSGKVIVEGINLVKKHQKPVPALNQPGGIVEKEAAIQVSNVAIFNAATGKADRVGFRFEDGKKVRFFKSNSETIK

Entity 18 Entity 18 polymer

Description description	50S ribosomal protein L25
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	W

MFTINAEVRKEQGKGASRRLRAANKFPAIIYGGKEAPLAIELDHDKVMNMQAKAEFYSEVLTIVVDGKEIKVKAQDVQRHPYKPKLQHIDFVRA

Entity 19 Entity 19 polymer

Description description	GTPase Der
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	X

MVPVVALVGRPNVGKSTLFNRLTRTRDALVADFPGLTRDRKYGRAEIEGREFICIDTGGIDGTEDGVETRMAEQSLLAIEEADVVLFMVDARAGLMPADEAIAKHLRSREKPTFLVANKTDGLDPDQAVVDFYSLGLGEIYPIAASHGRGVLSLLEHVLLPWMEDLAPQEEVDEDAEYWAQFEAEENGEEEEEDDFDPQSLPIKLAIVGRPNVGKSTLTNRILGEERVVVYDMPGTTRDSIYIPMERDGREYVLIDTAGVRKRGKITDAVEKFSVIKTLQAIEDANVVMLVIDAREGISDQDLSLLGFILNSGRSLVIVVNKWDGLSQEVKEQVKETLDFRLGFIDFARVHFISALHGSGVGNLFESVREAYDSSTRRVGTSMLTRIMTMAVEDHQPPLVRGRRVKLKYAHAGGYNPPIVVIHGNQVKDLPDSYKRYLMNYFRKSLDVMGSPIRIQFKEGENPYANKRNTLTPTQMRKRKRLMKHIKKNK

Source Source

Source organism organism	Escherichia coli K12
NCBI taxonomy ID ncbi_taxonomy_id	83333
Host organism host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

Entity 20 Entity 20 polymer

Description description	50S ribosomal protein L4
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	E

MELVLKDAQSALTVSETTFGRDFNEALVHQVVVAYAAGARQGTRAQKTRAEVTGSGKKPWRQKGTGRARSGSIKSPIWRSGGVTFAARPQDHSQKVNKKMYRGALKSILSELVRQDRLIVVEKFSVEAPKTKLLAQKLKDMALEDVLIITGELDENLFLAARNLHKVDVRDATGIDPVSLIAFDKVVMTADAVKQVEEMLA

Entity 21 Entity 21 polymer

Description description	50S ribosomal protein L27
Molecular weight formula_weight	9146.5 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Y

MAHKKAGGSTRNGRDSEAKRLGVKRFGGESVLAGSIIVRQRGTKFHAGANVGCGRDHTLFAKADGKVKFEVKGPKNRKFISIEAE

Entity 22 Entity 22 polymer

Description description	50S ribosomal protein L32
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
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MAVQQNKPTRSKRGMRRSHDALTAVTSLSVDKTSGEKHLRHHITADGYYRGRKVIAK

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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
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MAKLTKRMRVIREKVDATKQYDINEAIALLKELATAKFVESVDVAVNLGIDARKSDQNVRGATVLPHGTGRSVRVAVFTQGANAEAAKAAGAELVGMEDLADQIKKGEMNFDVVIASPDAMRVVGQLGQVLGPRGLMPNPKVGTVTPNVAEAVKNAKAGQVRYRNDKNGIIHTTIGKVDFDADKLKENLEALLVALKKAKPTQAKGVYIKKVSISTTMGAGVAVDQAGLSASVN

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Polymer Polymer

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MKRTFQPSVLKRNRSHGFRARMATKNGRQVLARRRAKGRARLTVSK

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Description description	50S ribosomal protein L35
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Polymer type type	polypeptide(L)
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MPKIKTVRGAAKRFKKTGKGGFKHKHANLRHILTKKATKRKRHLRPKAMVSKGDLGLVIACLPYA

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Description description	50S ribosomal protein L36
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Polymer type type	polypeptide(L)
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MKVRASVKKLCRNCKIVKRDGVIRVICSAEPKHKQRQG

Entity 27 Entity 27 polymer

Description description	50S ribosomal protein L2
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Polymer type type	polypeptide(L)
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MAVVKCKPTSPGRRHVVKVVNPELHKGKPFAPLLEKNSKSGGRNNNGRITTRHIGGGHKQAYRIVDFKRNKDGIPAVVERLEYDPNRSANIALVLYKDGERRYILAPKGLKAGDQIQSGVDAAIKPGNTLPMRNIPVGSTVHNVEMKPGKGGQLARSAGTYVQIVARDGAYVTLRLRSGEMRKVEADCRATLGEVGNAEHMLRVLGKAGAARWRGVRPTVRGTAMNPVDHPHGGGEGRNFGKHPVTPWGVQTKGKKTRSNKRTDKFIVRRRSK

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Description description	50S ribosomal protein L5
Molecular weight formula_weight	20333.6 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	F

MAKLHDYYKDEVVKKLMTEFNYNSVMQVPRVEKITLNMGVGEAIADKKLLDNAAADLAAISGQKPLITKARKSVAGFKIRQGYPIGCKVTLRGERMWEFFERLITIAVPRIRDFRGLSAKSFDGRGNYSMGVREQIIFPEIDYDKVDRVRGLDITITTTAKSDEEGRALLAAFDFPFRK

Entity 29 Entity 29 polymer

Description description	50S ribosomal protein L6
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	G

MSRVAKAPVVVPAGVDVKINGQVITIKGKNGELTRTLNDAVEVKHADNTLTFGPRDGYADGWAQAGTARALLNSMVIGVTEGFTKKLQLVGVGYRAAVKGNVINLSLGFSHPVDHQLPAGITAECPTQTEIVLKGADKQVIGQVAADLRAYRRPEPYKGKGVRYADEVVRTKEAKKK

Entity 30 Entity 30 polymer

Description description	50S ribosomal protein L9
Molecular weight formula_weight	15789.0 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
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MQVILLDKVANLGSLGDQVNVKAGYARNFLVPQGKAVPATKKNIEFFEARRAELEAKLAEVLAAANARAEKINALETVTIASKAGDEGKLFGSIGTRDIADAVTAAGVEVAKSEVRLPNGVLRTTGEHEVSFQVHSEVFAKVIVNVVAE

Entity 31 Entity 31 polymer

Description description	50S ribosomal protein L11
Molecular weight formula_weight	14894.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	I

MAKKVQAYVKLQVAAGMANPSPPVGPALGQQGVNIMEFCKAFNAKTDSIEKGLPIPVVITVYADRSFTFVTKTPPAAVLLKKAAGIKSGSGKPNKDKVGKISRAQLQEIAQTKAADMTGADIEAMTRSIEGTARSMGLVVED

Entity 32 Entity 32 polymer

Description description	50S ribosomal protein L13
Molecular weight formula_weight	16050.6 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	J

MKTFTAKPETVKRDWYVVDATGKTLGRLATELARRLRGKHKAEYTPHVDTGDYIIVLNADKVAVTGNKRTDKVYYHHTGHIGGIKQATFEEMIARRPERVIEIAVKGMLPKGPLGRAMFRKLKVYAGNEHNHAAQQPQVLDI

▶

Unit-cell length a length_a	1.000 Å
Unit-cell length b length_b	1.000 Å
Unit-cell length c length_c	1.000 Å
Unit-cell angle α angle_alpha	90.00 °
Unit-cell angle β angle_beta	90.00 °
Unit-cell angle γ angle_gamma	90.00 °
Molecules per unit cell Z z_pdb	1

Space group space_group	P 1
Space-group number int_tables_number	1
Crystal system crystal_system	—

Resolution resolution	5.00 Å
Resolution测定Method resolution_method	—
颗粒数 num_particles	189614

Electron cryo-microscopy structure of EngA bound with the 50S ribosomal subunit

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L28

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L14

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L15

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L29

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L16

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L17

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L18

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L19

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L20

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

50S ribosomal protein L21

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer