3j8h

Structure of the rabbit ryanodine receptor RyR1 in complex with FKBP12 at 3.8 Angstrom resolution

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ryanodine receptor 1

物种未注明

UniProt P11716

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A × 4 (P62943) ZINC ION × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RYR1_RABIT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–1491; UniProt 1–1491 作者链 A; PDB构建体 1497–1963; UniProt 1510–1976 作者链 A; PDB构建体 1979–2382; UniProt 2057–2460 作者链 A; PDB构建体 2397–2465; UniProt 2494–2562 作者链 A; PDB构建体 2590–2796; UniProt 2734–2940 作者链 A; PDB构建体 3207–4599; UniProt 3645–5037 作者链 C; PDB构建体 1–1491; UniProt 1–1491 作者链 C; PDB构建体 1497–1963; UniProt 1510–1976 作者链 C; PDB构建体 1979–2382; UniProt 2057–2460 作者链 C; PDB构建体 2397–2465; UniProt 2494–2562 作者链 C; PDB构建体 2590–2796; UniProt 2734–2940 作者链 C; PDB构建体 3207–4599; UniProt 3645–5037 作者链 E; PDB构建体 1–1491; UniProt 1–1491 作者链 E; PDB构建体 1497–1963; UniProt 1510–1976 作者链 E; PDB构建体 1979–2382; UniProt 2057–2460 作者链 E; PDB构建体 2397–2465; UniProt 2494–2562 作者链 E; PDB构建体 2590–2796; UniProt 2734–2940 作者链 E; PDB构建体 3207–4599; UniProt 3645–5037 作者链 G; PDB构建体 1–1491; UniProt 1–1491 作者链 G; PDB构建体 1497–1963; UniProt 1510–1976 作者链 G; PDB构建体 1979–2382; UniProt 2057–2460 作者链 G; PDB构建体 2397–2465; UniProt 2494–2562 作者链 G; PDB构建体 2590–2796; UniProt 2734–2940 作者链 G; PDB构建体 3207–4599; UniProt 3645–5037

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A

Oryctolagus cuniculus

UniProt P62943

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 8 Ryanodine receptor 1 × 4 (P11716) ZINC ION × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FKB1A_RABIT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–107; UniProt 2–108 作者链 D; PDB构建体 1–107; UniProt 2–108 作者链 F; PDB构建体 1–107; UniProt 2–108 作者链 H; PDB构建体 1–107; UniProt 2–108

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3j8h
沉积日期 deposition_date2014-10-26
结构标题 titleStructure of the rabbit ryanodine receptor RyR1 in complex with FKBP12 at 3.8 Angstrom resolution
关键词 keywords;rabbit ryanodine receptor RyR1, high-conductance intracellular Ca2+ channels, excitation-contraction coupling, TRANSPORT PROTEIN-ISOMERASE complex ;; TRANSPORT PROTEIN/ISOMERASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3j8h__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3j8h__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3j8h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)97.71 Å
Rg(电子密度)96.85 Å
总 Rg96.13 Å
原子数111124
残基数15068
排除体积1962000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3j8h__assembly_1__model_1 octameric (8) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 引用文献 (1)