3j92

Structure and assembly pathway of the ribosome quality control complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NEMF

Homo sapiens

UniProt O60524

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 51 RNA 4 uL2 × 1 uL3 × 1 uL4 × 1 uL18 × 1 eL6 × 1 eL30 × 1 eL8 × 1 uL6 × 1 uL16 × 1 uL5 × 1 eL13 × 1 eL14 × 1 eL15 × 1 uL13 × 1 uL22 × 1 eL18 × 1 eL19 × 1 eL20 × 1 eL21 × 1 eL22 × 1 uL14 × 1 eL24 × 1 uL23 × 1 uL24 × 1 eL27 × 1 uL15 × 1 eL29 × 1 eL30 × 1 eL31 × 1 eL32 × 1 eL33 × 1 eL34 × 1 uL29 × 1 eL36 × 1 eL37 × 1 eL38 × 1 eL39 × 1 eL40 × 1 eL42 × 1 eL43 × 1 eL28 × 1 uL10 × 1 uL11 × 1 Listerin × 3 (O94822) Listerin × 2 nascent chain × 1 tRNA × 1 28S rRNA × 1 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 159 ZINC ION × 5 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NEMF_HUMAN
Isoform —
PDB实体 44
链与序列区间 作者链 u; PDB构建体 1–501; UniProt 1–501 作者链 v; PDB构建体 1–501; UniProt 1–501

Listerin

Homo sapiens

UniProt O94822

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 51 RNA 4 uL2 × 1 uL3 × 1 uL4 × 1 uL18 × 1 eL6 × 1 eL30 × 1 eL8 × 1 uL6 × 1 uL16 × 1 uL5 × 1 eL13 × 1 eL14 × 1 eL15 × 1 uL13 × 1 uL22 × 1 eL18 × 1 eL19 × 1 eL20 × 1 eL21 × 1 eL22 × 1 uL14 × 1 eL24 × 1 uL23 × 1 uL24 × 1 eL27 × 1 uL15 × 1 eL29 × 1 eL30 × 1 eL31 × 1 eL32 × 1 eL33 × 1 eL34 × 1 uL29 × 1 eL36 × 1 eL37 × 1 eL38 × 1 eL39 × 1 eL40 × 1 eL42 × 1 eL43 × 1 eL28 × 1 uL10 × 1 uL11 × 1 NEMF × 2 (O60524) Listerin × 2 nascent chain × 1 tRNA × 1 28S rRNA × 1 5S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 MAGNESIUM ION × 159 ZINC ION × 5 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LTN1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 45
链与序列区间 作者链 0; PDB构建体 1–1766; UniProt 1–1766 作者链 w; PDB构建体 1–1766; UniProt 1–1766 作者链 z; PDB构建体 1–1766; UniProt 1–1766

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3j92
沉积日期 deposition_date2014-12-02
结构标题 titleStructure and assembly pathway of the ribosome quality control complex
关键词 keywordsRWD, RING, quality control, RIBOSOME-LIGASE complex; RIBOSOME/LIGASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3j92__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3j92__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3j92__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)80.61 Å
Rg(电子密度)81.65 Å
总 Rg81.54 Å
原子数146386
残基数11687
排除体积2295000 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3j92__assembly_1__model_1 55-meric (55) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (53)

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7. 引用文献 (1)