3l4q

Structural insights into phosphoinositide 3-kinase activation by the influenza A virus NS1 protein

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Non-structural protein 1

Influenza A virus

UniProt P03496

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit beta × 1 (P23726) GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit beta × 1 (P23726) GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NS1_I34A1
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 7–164; UniProt 73–230 作者链 B; PDB构建体 7–164; UniProt 73–230

Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit beta

Bos taurus

UniProt P23726

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Non-structural protein 1 × 1 (P03496) GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Non-structural protein 1 × 1 (P03496) GLYCEROL × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 P85B_BOVIN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–170; UniProt 424–593 作者链 D; PDB构建体 1–170; UniProt 424–593

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3l4q
沉积日期 deposition_date2009-12-21
结构标题 titleStructural insights into phosphoinositide 3-kinase activation by the influenza A virus NS1 protein
关键词 keywordsPI3K, PHOSPHOINOSITIDE-3-KINASE, INFLUENZA VIRUS, NS1, Kinase, VIRAL PROTEIN-PROTEIN BINDING complex; VIRAL PROTEIN/PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3l4q__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3l4q__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3l4q__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)33.81 Å
Rg(电子密度)34.38 Å
总 Rg34.38 Å
原子数2318
残基数282
排除体积41216 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3l4q__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3l4q__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3l4qa_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.299 — Ns1 effector domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.299.1 — Ns1 effector domain-like
家族 Family familyd.299.1.1 — Ns1 effector domain-like
结构域编号 domain_idd3l4qb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.299 — Ns1 effector domain-like
超家族 Superfamily superfamilyd.299.1 — Ns1 effector domain-like
家族 Family familyd.299.1.1 — Ns1 effector domain-like
结构域编号 domain_idd3l4qc_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.4.21 — Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit P85 inter-SH2 (iSH2) domain-like
家族 Family familyh.4.21.1 — Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit P85 inter-SH2 domain-like
结构域编号 domain_idd3l4qd_
类 Class classh — Coiled coil proteins
折叠类型 Fold foldh.4 — Antiparallel coiled-coil
超家族 Superfamily superfamilyh.4.21 — Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit P85 inter-SH2 (iSH2) domain-like
家族 Family familyh.4.21.1 — Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit P85 inter-SH2 domain-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3l4qA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily330 — Influenza virus non-structural protein, effector domain
结构域编号 domain_id3l4qB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily330 — Influenza virus non-structural protein, effector domain
结构域编号 domain_id3l4qC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1490 —
结构域编号 domain_id3l4qD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1490 —
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7. 引用文献 (1)