SAXSdb — 3lrh

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Huntingtin

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	anti-huntingtin VL domain × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HD_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18 作者链 D； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18 作者链 F； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18 作者链 H； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18 作者链 J； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18 作者链 L； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18 作者链 N； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18 作者链 P； PDB构建体 1–14； UniProt 5–18

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3lrh
沉积日期 deposition_date	2010-02-11
结构标题 title	Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide
关键词 keywords	;Huntington's disease, Huntingtin, Variable light chain domain, Intrabody, Immunoglobulin, IMMUNE SYSTEM ;; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3lrh__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3lrh__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3lrh__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	15.02 Å
Rg（电子密度）	13.77 Å
总 Rg	15.07 Å
原子数	925
残基数	123
排除体积	16284 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3lrh__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3lrh__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3lrh__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`3lrh__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`3lrh__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`3lrh__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`3lrh__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`3lrh__assembly_8__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	anti-huntingtin VL domain
分子量 formula_weight	12861.0 kDa
突变 mutation	G112A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O
原子数 atom_count	7652

MGSQPVLTQSPSVSAAPRQRVTISVSGSNSNIGSNTVNWIQQLPGRAPELLMYDDDLLAPGVSDRFSGSRSGTSASLTISGLQSEDEADYYAATWDDSLNGWVFGGGTKVTVLSAHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Huntingtin
分子量 formula_weight	1689.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P

EKLMKAFESLKSFQ

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	204

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3lrho_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	3lrhA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3lrhC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3lrhE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3lrhG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3lrhI00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3lrhK00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3lrhM00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3lrhO00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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晶胞边长 a length_a	53.090 Å
晶胞边长 b length_b	89.660 Å
晶胞边长 c length_c	95.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.45 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	19.860 Å
R 因子 r_factor	0.2188
R_work r_work	0.2156
R_free r_free	0.2780

Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Huntingtin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3lrh__assembly_4__model_1

3lrh__assembly_4__model_1 | I(q)

3lrh__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of anti-huntingtin VL domain in complex with huntingtin peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Huntingtin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3lrh__assembly_4__model_1

3lrh__assembly_4__model_1 | I(q)

3lrh__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)