Cytochrome b5 type B
Rattus norvegicus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 17–102 | 片段:UNP residues 17-102 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.8;277 K;30%PEG8K, 0.2M MgAc, 0.1M Hepes, pH 6.8, EVAPORATION, temperature 277K | 分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 2 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 B; UniProt 17–102 | 片段:UNP residues 17-102 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 6.8;277 K;30%PEG8K, 0.2M MgAc, 0.1M Hepes, pH 6.8, EVAPORATION, temperature 277K | 分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 3MUS | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1AWP RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 1997-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
13–103(91 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
链 B
13–103(91 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:V45L, V61L 突变:V45L, V61L | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.225 |
| 1B5M RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 1996-11-07 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
19–102(84 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
vapor diffusion with slow evaporation;pH 6.5;CRYSTALS WERE OBTAINED BY VAPOR DIFFUSION TOGETHER WITH SLOW EVAPORATION USING 20% PEG 8000 IN 0.1M SODIUM CACODYLATE (PH = 6.5 WITH 0.2 M MAGNESIUM ACETATE., vapor diffusion with slow evaporation
|
分辨率 2.70 Å |
| 1EUE RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2000-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
6–91(86 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:V45I, V61I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;277 K;20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate, 0.1 M PIPES, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 1EUE RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2000-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
6–91(86 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:V45I, V61I | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.8;277 K;20% PEG 8000, 0.2 M magnesium acetate, 0.1 M PIPES, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.232 |
| 1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
17–103(87 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:A18S, I32L, L47R | MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
17–103(87 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:A18S, I32L, L47R | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
17–103(87 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:A18S, I32L, L47R | MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
17–103(87 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:A18S, I32L, L47R | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 1ICC RAT OUTER MITOCHONDRIAL MEMBRANE CYTOCHROME B5 提交 2001-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
17–103(87 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
链 C
17–103(87 aa)
片段:WATER SOLUBLE DOMAIN
|
突变:A18S, I32L, L47R 突变:A18S, I32L, L47R | MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000 Magnesium Acetate PIPES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
链 B
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
|
突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S | MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
链 C
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
|
突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
链 D
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
|
突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S | MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
|
突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S | MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
链 C
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
|
突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S 突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 1LJ0 Structure of quintuple mutant of the rat outer mitocondrial cytochrome b5. 提交 2002-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
12–103(92 aa)
片段:water soluble domain
|
突变:A18S, I25L, I32L, L47R, L71S | MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;278 K;PEG 8000, MG ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.251 |
| 2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
12–103(92 aa)
片段:Water Soluble Domain
|
突变:R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S | MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.8;278 K;PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
12–103(92 aa)
片段:Water Soluble Domain
|
突变:R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S | MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.8;278 K;PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
12–103(92 aa)
片段:Water Soluble Domain
|
突变:R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S | MG MAGNESIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.8;278 K;PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
12–103(92 aa)
片段:Water Soluble Domain
|
突变:R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.8;278 K;PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 2I89 Structure of septuple mutant of Rat Outer Mitochondrial Membrane Cytochrome B5 提交 2006-09-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
12–103(92 aa)
片段:Water Soluble Domain
链 C
12–103(92 aa)
片段:Water Soluble Domain
|
突变:R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S 突变:R15H/A18S/E20S/I25L/I32L/L47R/L71S | MG MAGNESIUM ION × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.8;278 K;PEG8K 30%, O.2M MgAc, 0.1M Pipes, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K, pH 6.80
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.278 |
| 4HIL 1.25A Resolution Structure of Rat Type B Cytochrome b5 提交 2012-10-11 | 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
17–102(86 aa)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;30% (w/v) PEG 8000, 100 sodium cacodylate, 200 mM sodium acetate, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.152 |
| 4HIL 1.25A Resolution Structure of Rat Type B Cytochrome b5 提交 2012-10-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
17–102(86 aa)
|
未记录 | HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;293 K;30% (w/v) PEG 8000, 100 sodium cacodylate, 200 mM sodium acetate, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.25 Å R-free 0.152 |
共 7 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | CYB5B_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–86; UniProt 17–102 作者链 B; PDB构建体 1–86; UniProt 17–102 |