3oed

The structure of the complex between complement receptor CR2 and its ligand complement fragment C3d

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C3

Homo sapiens

UniProt P01024

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Complement receptor type 2 × 1 (P20023) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Complement receptor type 2 × 1 (P20023) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CO3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–310; UniProt 996–1303 作者链 B; PDB构建体 3–310; UniProt 996–1303

Complement receptor type 2

Homo sapiens

UniProt P20023

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Complement C3 × 1 (P01024) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Complement C3 × 1 (P01024) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CR2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 2–135; UniProt 20–153 作者链 D; PDB构建体 2–135; UniProt 20–153

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3oed
沉积日期 deposition_date2010-08-12
结构标题 titleThe structure of the complex between complement receptor CR2 and its ligand complement fragment C3d
关键词 keywordsComplement Receptor, Complement fragment C3d, B Cell, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3oed__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3oed__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3oed__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)21.91 Å
Rg(电子密度)20.68 Å
总 Rg21.68 Å
原子数3306
残基数424
排除体积59229 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3oed__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3oed__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd3oeda1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamilya.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family familya.102.4.4 — Complement components
结构域编号 domain_idd3oeda2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd3oedb1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.102 — alpha/alpha toroid
超家族 Superfamily superfamilya.102.4 — Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases
家族 Family familya.102.4.4 — Complement components
结构域编号 domain_idd3oedb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd3oedc1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamilyg.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family familyg.18.1.1 — Complement control module/SCR domain
结构域编号 domain_idd3oedc2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamilyg.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family familyg.18.1.1 — Complement control module/SCR domain
结构域编号 domain_idd3oedd1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamilyg.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family familyg.18.1.1 — Complement control module/SCR domain
结构域编号 domain_idd3oedd2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamilyg.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family familyg.18.1.1 — Complement control module/SCR domain

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3oedA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id3oedB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id3oedC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3oedC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3oedD01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3oedD02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
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7. 引用文献 (1)