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3own

Potent macrocyclic renin inhibitors

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Renin

物种未注明

UniProt P00797

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 ACETATE ION × 3 SODIUM ION × 2 ;(2S,4S)-4-hydroxy-2-(1-methylethyl)-4-[(4R,13S)-18-[methyl(methylsulfonyl)amino]-2,15-dioxo-4-phenyl-11-oxa-3,14-diazatricyclo[14.3.1.1~5,9~]henicosa-1(20),5(21),6,8,16,18-hexaen-13-yl]-N-(2-methylpropyl)butanamide ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 ;(2S,4S)-4-hydroxy-2-(1-methylethyl)-4-[(4S,13S)-18-[methyl(methylsulfonyl)amino]-2,15-dioxo-4-phenyl-11-oxa-3,14-diazatricyclo[14.3.1.1~5,9~]henicosa-1(20),5(21),6,8,16,18-hexaen-13-yl]-N-(2-methylpropyl)butanamide ; × 1 water × 1 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 ACETATE ION × 9 SODIUM ION × 6 ;(2S,4S)-4-hydroxy-2-(1-methylethyl)-4-[(4R,13S)-18-[methyl(methylsulfonyl)amino]-2,15-dioxo-4-phenyl-11-oxa-3,14-diazatricyclo[14.3.1.1~5,9~]henicosa-1(20),5(21),6,8,16,18-hexaen-13-yl]-N-(2-methylpropyl)butanamide ; × 3 water × 3 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 ;(2S,4S)-4-hydroxy-2-(1-methylethyl)-4-[(4S,13S)-18-[methyl(methylsulfonyl)amino]-2,15-dioxo-4-phenyl-11-oxa-3,14-diazatricyclo[14.3.1.1~5,9~]henicosa-1(20),5(21),6,8,16,18-hexaen-13-yl]-N-(2-methylpropyl)butanamide ; × 3 water × 3 与蛋白数一致
5 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 ACETATE ION × 9 SODIUM ION × 6 ;(2S,4S)-4-hydroxy-2-(1-methylethyl)-4-[(4R,13S)-18-[methyl(methylsulfonyl)amino]-2,15-dioxo-4-phenyl-11-oxa-3,14-diazatricyclo[14.3.1.1~5,9~]henicosa-1(20),5(21),6,8,16,18-hexaen-13-yl]-N-(2-methylpropyl)butanamide ; × 3 ;(2S,4S)-4-hydroxy-2-(1-methylethyl)-4-[(4S,13S)-18-[methyl(methylsulfonyl)amino]-2,15-dioxo-4-phenyl-11-oxa-3,14-diazatricyclo[14.3.1.1~5,9~]henicosa-1(20),5(21),6,8,16,18-hexaen-13-yl]-N-(2-methylpropyl)butanamide ; × 3 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1bbs 1bbs 2bks 2bks 2bkt 2bkt 2fs4 2fs4 2g1n 2g1n 2g1o 2g1o

共 139 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
1bil 1bim 1hrn 1rne 2i4q 2v12 2v12 3d91 3g6z 3g70 3g72 3k1w

共 21 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
1bbs 1bbs 2fs4 2fs4 2fs4 2g1o 2g1o 2g1o 2g1r 2g1y 2g1y 2g1y

共 57 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物
2x0b 2x0b 2x0b 2x0b 3gw5 3km4 3q3t 3q5h 4amt 5sxn 5sxn 5sy3

共 13 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RENI_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–340； UniProt 67–406 作者链 B； PDB构建体 1–340； UniProt 67–406

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3own
沉积日期 deposition_date2010-09-20
结构标题 titlePotent macrocyclic renin inhibitors
关键词 keywordsRENIN, PROTEASE, ASPARTYL PROTEASE, HYDROLASE, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3own__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3own__assembly_4__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3own__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）35.20 Å
Rg（电子密度）34.38 Å
总 Rg34.83 Å
原子数7869
残基数1002
排除体积140520 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3own__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3own__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 3own__assembly_3__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 3own__assembly_4__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 3own__assembly_5__model_1 hexameric （6） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3owna_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.50 — Acid proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.50.1 — Acid proteases
家族 Family familyb.50.1.2 — Pepsin-like
结构域编号 domain_idd3ownb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.50 — Acid proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.50.1 — Acid proteases
家族 Family familyb.50.1.2 — Pepsin-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3ownA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Acid Proteases
结构域编号 domain_id3ownA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Acid Proteases
结构域编号 domain_id3ownB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Acid Proteases
结构域编号 domain_id3ownB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin D, subunit A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Acid Proteases
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7. 引用文献 (1)