SAXSdb — 3q37

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TIM from Trypanosoma cruzi/ TIM from Trypanosoma brucei brucei chimera protein

Trypanosoma cruzi

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPIS_TRYBB
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–36； UniProt 2–35 作者链 A； PDB构建体 93–120； UniProt 92–119 作者链 B； PDB构建体 3–36； UniProt 2–35 作者链 B； PDB构建体 93–120； UniProt 92–119 作者链 C； PDB构建体 3–36； UniProt 2–35 作者链 C； PDB构建体 93–120； UniProt 92–119 作者链 D； PDB构建体 3–36； UniProt 2–35 作者链 D； PDB构建体 93–120； UniProt 92–119

TIM from Trypanosoma cruzi/ TIM from Trypanosoma brucei brucei chimera protein

Trypanosoma cruzi

UniProt P52270

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	同源多聚体	蛋白 2	water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPIS_TRYCR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 37–92； UniProt 35–90 作者链 A； PDB构建体 121–251； UniProt 121–251 作者链 B； PDB构建体 37–92； UniProt 35–90 作者链 B； PDB构建体 121–251； UniProt 121–251 作者链 C； PDB构建体 37–92； UniProt 35–90 作者链 C； PDB构建体 121–251； UniProt 121–251 作者链 D； PDB构建体 37–92； UniProt 35–90 作者链 D； PDB构建体 121–251； UniProt 121–251

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3q37
沉积日期 deposition_date	2010-12-21
结构标题 title	Identification of Amino Acids that Account for Long-Range Interactions in Proteins Using Two Triosephosphate Isomerases from Pathogenic Trypanosomes.
关键词 keywords	TIM barrel, ISOMERASE; ISOMERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3q37__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3q37__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3q37__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.72 Å
Rg（电子密度）	24.69 Å
总 Rg	25.57 Å
原子数	3736
残基数	485
排除体积	66617 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3q37__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3q37__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3q37a_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)
家族 Family family	c.1.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)

结构域编号 domain_id	d3q37b_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)
家族 Family family	c.1.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)

结构域编号 domain_id	d3q37c_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)
家族 Family family	c.1.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)

结构域编号 domain_id	d3q37d_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)
家族 Family family	c.1.1.1 — Triosephosphate isomerase (TIM)

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	3q37A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	3q37B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	3q37C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

结构域编号 domain_id	3q37D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	70 — Aldolase class I

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晶胞边长 a length_a	83.594 Å
晶胞边长 b length_b	77.258 Å
晶胞边长 c length_c	85.387 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	116.60 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.650 Å
最低分辨率 resolution_low	41.750 Å
R 因子 r_factor	0.1905
R_work r_work	0.1889
R_free r_free	0.2204

描述 description	TIM from Trypanosoma cruzi/ TIM from Trypanosoma brucei brucei chimera protein
分子量 formula_weight	27322.2 kDa
EC 编号 ec_number	5.3.1.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	8527

Identification of Amino Acids that Account for Long-Range Interactions in Proteins Using Two Triosephosphate Isomerases from Pathogenic Trypanosomes.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TIM from Trypanosoma cruzi/ TIM from Trypanosoma brucei brucei chimera protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

TIM from Trypanosoma cruzi/ TIM from Trypanosoma brucei brucei chimera protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3q37__assembly_1__model_1

3q37__assembly_1__model_1 | I(q)

3q37__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

来源生物 organism	Trypanosoma cruzi
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5693
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	987

Identification of Amino Acids that Account for Long-Range Interactions in Proteins Using Two Triosephosphate Isomerases from Pathogenic Trypanosomes.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

TIM from Trypanosoma cruzi/ TIM from Trypanosoma brucei brucei chimera protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

TIM from Trypanosoma cruzi/ TIM from Trypanosoma brucei brucei chimera protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3q37__assembly_1__model_1

3q37__assembly_1__model_1 | I(q)

3q37__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)