SAXSdb — 3qb7

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin 4

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 25–153	片段：UNP residues 25-153 突变：K117R, T118V, R121Q, E122S, Y124W, S125F, S128G, S129A	Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；100 mM (NH4)2SO4, 100 mM Cacodylate, 20% PEG-3350, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.292
2	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 25–153	片段：UNP residues 25-153 突变：K117R, T118V, R121Q, E122S, Y124W, S125F, S128G, S129A	Cytokine receptor common subunit gamma × 1 （P31785） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；100 mM (NH4)2SO4, 100 mM Cacodylate, 20% PEG-3350, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.292

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D4HNR6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–132； UniProt 25–153 作者链 B； PDB构建体 4–132； UniProt 25–153

Cytokine receptor common subunit gamma

Homo sapiens

UniProt P31785

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 55–254	片段：UNP residues 55-254 突变：N53Q	Interleukin 4 × 1 （D4HNR6） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；100 mM (NH4)2SO4, 100 mM Cacodylate, 20% PEG-3350, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.292
2	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 55–254	片段：UNP residues 55-254 突变：N53Q	Interleukin 4 × 1 （D4HNR6） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；298 K；100 mM (NH4)2SO4, 100 mM Cacodylate, 20% PEG-3350, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.25 Å R-free 0.292

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3QB7	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2B5I cytokine receptor complex 提交 2005-09-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 56–254（199 aa）	突变：N53Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；293 K；29% Pentaerythritol Ethoxylate 15/4; 50 mM Ammonium Sulfate; 50 mM Bis Tris, pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.269
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 23–255（233 aa）	突变：N58Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 3.00 Å R-free 0.263
2ERJ Crystal structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 提交 2005-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 23–255（233 aa）	突变：N58Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.1；295.5 K；MPEG 550, sodium acetate, sodium citrate, phenol, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 3.00 Å R-free 0.263
3BPL Crystal structure of the IL4-IL4R-Common Gamma ternary complex 提交 2007-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 56–254（199 aa）片段：Extracellular domain, residues 56-254	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；10% PEG8K, 8% ethylene glycol, 0.1M HEPES pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.93 Å R-free 0.297
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 d 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 g 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 j 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 L 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 O 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 U 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 X 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
3QAZ IL-2 mutant D10 ternary complex 提交 2011-01-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 a 56–254（199 aa）片段：unp residues 56-254	突变：N75Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；100 mM Bis-Tris, 200 mM NH4SO4, 25% PEG-3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.80 Å R-free 0.344
4GS7 Structure of the Interleukin-15 quaternary complex 提交 2012-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 55–254（200 aa）	突变：N75Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ACT ACETATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.75；298 K；22.5% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS propane, 0.2M sodium acetate, pH 8.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.35 Å R-free 0.227
5M5E Crystal structure of a interleukin-2 variant in complex with interleukin-2 receptor 提交 2016-10-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 23–262（240 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 4 CYS CYSTEINE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M HEPES, pH 7.0, 2M ammonium sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.235
6OEL Engineered Fab bound to IL-4 receptor 提交 2019-03-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 61–249（189 aa）片段：UNP residues 61-249	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295 K；22.5% PurePEG (Microlytic), 0.1 M sodium citrate, pH 5.5, 0.6 M ammonium nitrate	分辨率 3.10 Å R-free 0.256
7S2R nanobody bound to IL-2Rg 提交 2021-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 55–254（200 aa）片段：extracellular domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SO4 SULFATE ION × 8 GOL GLYCEROL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；295 K；2M ammonium sulfate, 0.2M BIS-Tris pH5.5	分辨率 2.49 Å R-free 0.271
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 55–254（200 aa）	突变：N53Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 55–254（200 aa）	突变：N53Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8ENT Interleukin-21 signaling complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2022-09-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 55–254（200 aa）	突变：N53Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；0.1M Tris pH 8, 20% PEG 6000	分辨率 2.83 Å R-free 0.300
8EPA Structure of interleukin receptor common gamma chain (IL2Rgamma) in complex with two antibodies 提交 2022-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 23–262（240 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 55–254（200 aa）片段：residues 55-254	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9E2T Structure of a de novo designed interleukin-21 mimetic complex with IL-21R and IL-2Rg 提交 2024-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 55–254（200 aa）片段：residues 55-254	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.2M Potassium thiocyanate, 0.1M Bis-Tris propane, pH 6.5, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.28 Å R-free 0.242
9JQT Structure of interleukin receptor common gamma chain (IL2Rgamma/CD132) in complex with 2D4 提交 2024-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–262（240 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
9KMC Cryo-EM structure of the heterotrimeric interleukin-2 receptor in complex with interleukin-2 and anti-CD25 Fab S417 提交 2024-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 23–255（233 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å

共 13 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IL2RG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 4–203； UniProt 55–254 作者链 D； PDB构建体 4–203； UniProt 55–254

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3qb7
沉积日期 deposition_date	2011-01-12
结构标题 title	Interleukin-4 mutant RGA bound to cytokine receptor common gamma
关键词 keywords	cytokine signaling, IL-4Ralpha, CYTOKINE-CYTOKINE RECEPTOR complex; CYTOKINE/CYTOKINE RECEPTOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.14 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	26.97 Å
零角强度 I(0) i0	96478700.00
分子量 molecular_weight	75499.0 kDa
排除体积 excluded_volume	93907 Å³
包络体积 envelope_volume	123560 Å³
水化壳体积 shell_volume	37002 Å³
包络直径 envelope_diameter	87.2 Å
壳层 Rg shell_rg	35.39 Å
包络 Rg envelope_rg	26.74 Å
形状 Rg shape_rg	26.95 Å
总 Rg total_rg	27.90 Å
总原子数 total_atoms	5316
残基数 n_residues	622
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	84.4 Å
Rg (实空间) rg_real	27.88 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.44 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.6480e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2880e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	27.96 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	96480000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9038
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	39.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.005
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.549
角度范围 angular_range	— – 0.2800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	20150000.0000
实空间数据点数 n_real_points	57
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.978; Smooth: 0.988

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Interleukin 4
分子量 formula_weight	15264.6 kDa
突变 mutation	K117R, T118V, R121Q, E122S, Y124W, S125F, S128G, S129A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5337

ADPHKCDITLQEIIKTLNSLTEQKTLCTELTVTDIFAASKNTTEKETFCRAATVLRQFYSHHEKDTRCLGATAQQFHRHKQLIRFLKRLDRNLWGLAGLNSCPVKEANQSTLENFLERLRVIMQSKWFKCGA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cytokine receptor common subunit gamma
分子量 formula_weight	24309.1 kDa
突变 mutation	N53Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

ADPLPLPEVQCFVFNVEYMNCTWQSSSEPQPTNLTLHYWYKNSDNDKVQKCSHYLFSEEITSGCQLQKKEIHLYQTFVVQLQDPREPRRQATQMLKLQNLVIPWAPENLTLHKLSESQLELNWNNRFLNHCLEHLVQYRTDWDHSWTEQSVDYRHKFSLPSVDGQKRYTFRVRSRFNPLCGSAQHWSEWSHPIHWGSNTSKEN

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	424.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	3qb7A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3qb7B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3qb7C01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3qb7C02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3qb7D01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3qb7D02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	75.969 Å
晶胞边长 b length_b	105.879 Å
晶胞边长 c length_c	121.093 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.245 Å
最低分辨率 resolution_low	48.507 Å
R 因子 r_factor	0.2339
R_work r_work	0.2309
R_free r_free	0.2922

fit	/app/data/saxs_computation/qb/3qb7/3qb7.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qb/3qb7/3qb7.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qb/3qb7/3qb7.dat

Interleukin-4 mutant RGA bound to cytokine receptor common gamma

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Interleukin 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Cytokine receptor common subunit gamma

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)