3qwz

Crystal structure of FAF1 UBX-p97N-domain complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transitional endoplasmic reticulum ATPase

Homo sapiens

UniProt P55072

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 FAS-associated factor 1 × 1 (Q9UNN5) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 FAS-associated factor 1 × 2 (Q9UNN5) water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TERA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–211; UniProt 1–208

FAS-associated factor 1

Homo sapiens

UniProt Q9UNN5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Transitional endoplasmic reticulum ATPase × 1 (P55072) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Transitional endoplasmic reticulum ATPase × 2 (P55072) water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FAF1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 5–84; UniProt 571–650

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3qwz
沉积日期 deposition_date2011-02-28
结构标题 titleCrystal structure of FAF1 UBX-p97N-domain complex
关键词 keywordsUBX, p97 Binding, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3qwz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3qwz__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3qwz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.11 Å
Rg(电子密度)19.12 Å
总 Rg20.06 Å
原子数2095
残基数254
排除体积37649 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3qwz__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3qwz__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3qwza1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.52 — Double psi beta-barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.52.2 — ADC-like
家族 Family familyb.52.2.3 — Cdc48 N-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3qwza2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.31 — Cdc48 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamilyd.31.1 — Cdc48 domain 2-like
家族 Family familyd.31.1.1 — Cdc48 domain 2-like
结构域编号 domain_idd3qwzb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family familyd.15.1.2 — UBX domain
结构域编号 domain_idd3qwzb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id3qwzA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id3qwzA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id3qwzB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
▶

7. 引用文献 (1)