HIV-1 M:B_ARV2/SF2
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Tyrosine-protein kinase HCK × 1 （P08631） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Tyrosine-protein kinase HCK × 1 （P08631） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | NEF_HV1A2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–166； UniProt 45–210 作者链 C； PDB构建体 1–166； UniProt 45–210 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein Nef × 1 （P03407） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Protein Nef × 1 （P03407） 1,2-ETHANEDIOL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HCK_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 2–61； UniProt 79–138 作者链 D； PDB构建体 2–61； UniProt 79–138 |
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| 条目编号 entry_id | 3rbb |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-03-29 |
| 结构标题 title | HIV-1 NEF protein in complex with engineered HCK SH3 domain |
| 关键词 keywords | HIV-1 Nef, dileucine motif, SH3 domain, receptor internalization, PXXP motif, PROTEIN BINDING, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN, PROTEIN BINDING |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 23.31 Å |
| Rg（电子密度） | 22.79 Å |
| 总 Rg | 23.56 Å |
| 原子数 | 1616 |
| 残基数 | 197 |
| 排除体积 | 28701 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3rbba_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.102 — Regulatory factor Nef |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.102.1 — Regulatory factor Nef |
| 家族 Family family | d.102.1.1 — Regulatory factor Nef |
| 结构域编号 domain_id | d3rbbb_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.2 — SH3-domain |
| 家族 Family family | b.34.2.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d3rbbc_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.102 — Regulatory factor Nef |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.102.1 — Regulatory factor Nef |
| 家族 Family family | d.102.1.1 — Regulatory factor Nef |
| 结构域编号 domain_id | d3rbbd_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.34 — SH3-like barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.34.2 — SH3-domain |
| 家族 Family family | b.34.2.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 3rbbA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |
| 结构域编号 domain_id | 3rbbB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — SH3 Domains |
| 结构域编号 domain_id | 3rbbC00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 62 — Nef Regulatory Factor |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Nef Regulatory Factor |
| 结构域编号 domain_id | 3rbbD00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 30 — SH3 type barrels. |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — SH3 Domains |