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2CP5
Solution structure of the 1st CAP-Gly domain in human CLIP-170/restin
提交 2005-05-19
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构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
1–128(128 aa)
片段:CAP-Gly domain
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 ambient
NMR样品组成
1mM protein, 20mM d-Tris-HCl, pH7.0, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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2CP6
Solution structure of the 2nd CAP-Gly domain in human CLIP-170/restin
提交 2005-05-19
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构建体不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
181–339(159 aa)
片段:CAP-Gly domain
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)120;压力 ambient
NMR样品组成
1mM protein, 20mM d-Tris-HCl, pH7.0, 100mM NaCl, 1mM d-DTT, 0.02% NaN3, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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2E3H
Crystal structure of the CLIP-170 CAP-Gly domain 2
提交 2006-11-26
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构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
211–300(90 aa)
片段:CAP-Gly domain 2
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.45 Å
R-free 0.215
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2E3I
Crystal structure of the CLIP-170 CAP-Gly domain 1
提交 2006-11-26
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构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
56–141(86 aa)
片段:CAP-Gly domain 1
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.259
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2E4H
Solution structure of cytoskeletal protein in complex with tubulin tail
提交 2006-12-08
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构建体不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
203–300(98 aa)
片段:CAP-Gly domain 2, residues 203-300
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未记录
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未记录非水小分子
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9;303 K;压力 ambient
NMR样品组成
0.9mM U-15N,13C CLIP: Nonlabel tubulin; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N CLIP: Nonlabel tubulin; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N,13C tubulin: Nonlabel CLIP; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.9mM U-15N tubulin: Nonlabel CLIP; 30mM BisTris buffer K; 1mM DTT; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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2HQH
Crystal structure of p150Glued and CLIP-170
提交 2006-07-18
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 E
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
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2HQH
Crystal structure of p150Glued and CLIP-170
提交 2006-07-18
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 F
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
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2HQH
Crystal structure of p150Glued and CLIP-170
提交 2006-07-18
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 G
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
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2HQH
Crystal structure of p150Glued and CLIP-170
提交 2006-07-18
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
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2HQH
Crystal structure of p150Glued and CLIP-170
提交 2006-07-18
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 5
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 16
PDB 声明:hexadecameric
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链 E
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
链 F
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
链 G
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
链 H
1405–1427(23 aa)
片段:second zinc finger domain, residues 1405-1427
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未记录
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ZN ZINC ION × 8
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;4M sodium formate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.80 Å
R-free 0.215
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2QK0
Structural Basis of Microtubule Plus End Tracking by XMAP215, CLIP-170 and EB1
提交 2007-07-09
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
57–128(72 aa)
片段:Cap-Gly domain 1
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突变:L124M
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 9;293 K;1.2 M Sodium malonate, 100 mM Glycine, 1.1 mM Lanthanum chloride, Protein concentration 15 mg/ml, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.00 Å
R-free 0.233
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3E2U
Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED)
提交 2008-08-06
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 E
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.238
|
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3E2U
Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED)
提交 2008-08-06
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 F
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.238
|
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3E2U
Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED)
提交 2008-08-06
|
构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 G
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.238
|
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3E2U
Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED)
提交 2008-08-06
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 4
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 H
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
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未记录
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ZN ZINC ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.238
|
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3E2U
Crystal structure of the zink-knuckle 2 domain of human CLIP-170 in complex with CAP-Gly domain of human dynactin-1 (p150-GLUED)
提交 2008-08-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 5
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 8
PDB 声明:octameric
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链 E
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
链 F
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
链 G
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
链 H
1388–1427(40 aa)
片段:Zn-knuckle 2
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未记录
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ZN ZINC ION × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;1.2M Trisodium Citrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.238
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