SAXSdb — 3rwh

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major histocompatibility complex class I

Macaca mulatta

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 24–299	片段：residues 24-297	Beta-2-microglobulin × 1 （Q6V7J5） Pol MF8 peptide from Pol protein × 1 （Q5QGH9）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.272
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 24–299	片段：residues 24-297	Beta-2-microglobulin × 1 （Q6V7J5） Pol MF8 peptide from Pol protein × 1 （Q5QGH9）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.272

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3RWH	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3RWC Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW9 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.249
3RWC Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW9 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.249
3RWD rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW11 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.277
3RWD rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW11 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.277
3RWE rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-FW9 提交 2011-05-09	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å R-free 0.251
3RWF Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-QW9 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.246
3RWG Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-MW9 提交 2011-05-09	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	XPE 3,6,9,12,15,18,21,24,27-NONAOXANONACOSANE-1,29-DIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.237
3RWI Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-GW10 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.01 Å R-free 0.210
3RWJ Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-HW8 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–299（276 aa）片段：residues 24-297	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.70 Å R-free 0.256

共 7 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9GJ77_MACMU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–276； UniProt 24–299 作者链 D； PDB构建体 1–276； UniProt 24–299

Beta-2-microglobulin

Macaca mulatta

UniProt Q6V7J5

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 21–119	未记录	Major histocompatibility complex class I × 1 （Q9GJ77） Pol MF8 peptide from Pol protein × 1 （Q5QGH9）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.272
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 21–119	未记录	Major histocompatibility complex class I × 1 （Q9GJ77） Pol MF8 peptide from Pol protein × 1 （Q5QGH9）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.272

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3RWH	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3JTT Cystal structure of Rhesus macaque MHC class I:Mamu-A*02 提交 2009-09-14	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 2 M ammonium sulfate , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
3JTT Cystal structure of Rhesus macaque MHC class I:Mamu-A*02 提交 2009-09-14	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 2 M ammonium sulfate , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
3JTT Cystal structure of Rhesus macaque MHC class I:Mamu-A*02 提交 2009-09-14	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 2 M ammonium sulfate , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.255
3RWC Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW9 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.249
3RWC Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW9 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å R-free 0.249
3RWD rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW11 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.277
3RWD rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-IW11 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.277
3RWE rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-FW9 提交 2011-05-09	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–119（99 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å R-free 0.251
3RWF Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-QW9 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.246
3RWG Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-MW9 提交 2011-05-09	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–119（99 aa）	未记录	XPE 3,6,9,12,15,18,21,24,27-NONAOXANONACOSANE-1,29-DIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.10 Å R-free 0.237
3RWI Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-GW10 提交 2011-05-09	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 21–119（99 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.01 Å R-free 0.210
4ZFZ Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with myristoylated 5-mer lipopeptide derived from SIV Nef protein 提交 2015-04-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；Zinc chloride, Tris-HCl, PEG6000	分辨率 1.76 Å R-free 0.228
4ZFZ Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with myristoylated 5-mer lipopeptide derived from SIV Nef protein 提交 2015-04-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 15 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；Zinc chloride, Tris-HCl, PEG6000	分辨率 1.76 Å R-free 0.228
4ZFZ Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with myristoylated 5-mer lipopeptide derived from SIV Nef protein 提交 2015-04-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 CL CHLORIDE ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；Zinc chloride, Tris-HCl, PEG6000	分辨率 1.76 Å R-free 0.228
4ZFZ Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with myristoylated 5-mer lipopeptide derived from SIV Nef protein 提交 2015-04-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 K 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 CL CHLORIDE ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；293 K；Zinc chloride, Tris-HCl, PEG6000	分辨率 1.76 Å R-free 0.228
6IWG Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*05104 complexed with N-myristoylated 4-mer lipopeptide derived from SIV nef protein 提交 2018-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 BO3 BORIC ACID × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；100mM MIB, 25% PEG 1500	分辨率 1.80 Å R-free 0.215
6IWH Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*05104 complexed with C14-GGGI lipopeptide 提交 2018-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；200mM Sodium fluoride, 100mM Bis-Tris propane, 20% PEG 3350	分辨率 1.95 Å R-free 0.217
6LAH Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with lysophosphatidylcholine 提交 2019-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293.15 K；Tris 0.1 M, 2 mM ZnCl2, PEG6000 13%	分辨率 1.87 Å R-free 0.230
6LAH Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with lysophosphatidylcholine 提交 2019-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293.15 K；Tris 0.1 M, 2 mM ZnCl2, PEG6000 13%	分辨率 1.87 Å R-free 0.230
6LAM Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with lysophosphatidylethanolamine 提交 2019-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.15；293.15 K；Tris 0.1 M, 2 mM ZnCl2, PEG6000 13%	分辨率 1.80 Å R-free 0.229
6LAM Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with lysophosphatidylethanolamine 提交 2019-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 16 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.15；293.15 K；Tris 0.1 M, 2 mM ZnCl2, PEG6000 13%	分辨率 1.80 Å R-free 0.229
6LB2 Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with mono-acyl glycerol 提交 2019-11-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293.15 K；Tris 0.1 M, 2 mM ZnCl2, PEG6000 13%	分辨率 1.69 Å R-free 0.227
6LB2 Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*098 complexed with mono-acyl glycerol 提交 2019-11-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 20–119（100 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293.15 K；Tris 0.1 M, 2 mM ZnCl2, PEG6000 13%	分辨率 1.69 Å R-free 0.227
6LT6 Crystal structure of rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*05104 complexed with lysophosphatidylcholine 提交 2020-01-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	EKG (2R)-2,3-dihydroxypropyl hexadecanoate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293.15 K；0.1M Bis-Tris propane, 0.2M Sodium malonate dibasic monohydrate, 20% PEG3350	分辨率 2.15 Å R-free 0.232
7BYD Crystal structure of SN45 TCR in complex with lipopeptide-bound Mamu-B*05104 提交 2020-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 20–119（100 aa）	未记录	IOD IODIDE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 CA CALCIUM ION × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M sodium iodide, 0.1 M Bis-Tris-propane pH 6.5 and 20% PEG3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.250
7BYD Crystal structure of SN45 TCR in complex with lipopeptide-bound Mamu-B*05104 提交 2020-04-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 20–119（100 aa）	未记录	IOD IODIDE ION × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MYR MYRISTIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.2 M sodium iodide, 0.1 M Bis-Tris-propane pH 6.5 and 20% PEG3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.250

共 15 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2MG_MACMU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 E； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119

Pol MF8 peptide from Pol protein

物种未注明

UniProt Q5QGH9

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 372–379	未记录	Major histocompatibility complex class I × 1 （Q9GJ77） Beta-2-microglobulin × 1 （Q6V7J5）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.272
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 372–379	未记录	Major histocompatibility complex class I × 1 （Q9GJ77） Beta-2-microglobulin × 1 （Q6V7J5）	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取环境条件	分辨率 2.60 Å R-free 0.272

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3RWH	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3RWE rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-FW9 提交 2011-05-09	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 435–443（9 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.40 Å R-free 0.251

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5QGH9_SIVCZ
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–8； UniProt 372–379 作者链 F； PDB构建体 1–8； UniProt 372–379

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3rwh
沉积日期 deposition_date	2011-05-09
结构标题 title	Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-MF8
关键词 keywords	antigenic peptides, T lymphocytes, immune response, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	32.23 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	31.32 Å
零角强度 I(0) i0	138132000.00
分子量 molecular_weight	89055.0 kDa
排除体积 excluded_volume	109390 Å³
包络体积 envelope_volume	143760 Å³
水化壳体积 shell_volume	38227 Å³
包络直径 envelope_diameter	99.1 Å
壳层 Rg shell_rg	38.55 Å
包络 Rg envelope_rg	30.64 Å
形状 Rg shape_rg	31.30 Å
总 Rg total_rg	31.97 Å
总原子数 total_atoms	6294
残基数 n_residues	764
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	93.4 Å
Rg (实空间) rg_real	32.17 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.60 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3810e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9060e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	32.20 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	138100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6538
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	36.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.220
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.636
角度范围 angular_range	— – 0.2450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	16590000.0000
实空间数据点数 n_real_points	50
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.995; Stabil: 0.999; Sysdev: 0.096; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.225

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Major histocompatibility complex class I
分子量 formula_weight	32025.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	6850

GSHSMKYFYTSVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAESPREEPRAPWVEQEGPEYWEEATRRAKEAAQTHRENLRTALRYYNQSEAGSHTIQKMYGCDLGPDGRLLRGYHQSAYDGKDYIALNGDLRSWTAADMAAQNTQRKWEGNRYAERFRAYLEGECLEWLRRYLENGKETLQRADPPKTHVTHHPVSDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEEQTQDTEFVETRPGGDGTFQKWGAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP

来源 Source

来源生物 organism	Macaca mulatta
通用名 common_name	rhesus macaque
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9544
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-2-microglobulin
分子量 formula_weight	11660.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

IQRTPKIQVYSRHPPENGKPNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGEKMGKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPNEKDEYACRVNHVTLSGPRTVKWDRDM

来源 Source

来源生物 organism	Macaca mulatta
通用名 common_name	rhesus macaque
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9544
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Pol MF8 peptide from Pol protein
分子量 formula_weight	1030.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

MRHVLEPF

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	536

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	3rwhA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	3rwhA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3rwhB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3rwhD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	3rwhD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3rwhE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	45.328 Å
晶胞边长 b length_b	68.636 Å
晶胞边长 c length_c	81.415 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	83.97 °
晶胞夹角 β angle_beta	88.86 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.07 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	26.983 Å
R 因子 r_factor	0.2292
R_work r_work	0.2269
R_free r_free	0.2718

fit	/app/data/saxs_computation/rw/3rwh/3rwh.fit
pddf	/app/data/pr_computation/rw/3rwh/3rwh.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/rw/3rwh/3rwh.dat

Rhesus macaque MHC class I molecule Mamu-B*17-MF8

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Major histocompatibility complex class I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Pol MF8 peptide from Pol protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)