Pyrococcus horikoshii
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | SULFATE ION × 1 ACETIC ACID × 2 (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | VATA_PYRHO |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240 作者链 A； PDB构建体 241–588； UniProt 617–964 |
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| 条目编号 entry_id | 3se0 |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-06-09 |
| 结构标题 title | Structural characterization of the subunit A mutant F508W of the A-ATP synthase from Pyrococcus horikoshii |
| 关键词 keywords | A-Type ATP synthase, Adenine-binding pocket, Phenylalanine mutant, HYDROLASE; HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.19 Å |
| Rg（电子密度） | 26.59 Å |
| 总 Rg | 27.35 Å |
| 原子数 | 4143 |
| 残基数 | 519 |
| 排除体积 | 74445 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3se0A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |
| 结构域编号 domain_id | 3se0A02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain |
| 结构域编号 domain_id | 3se0A03 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3 |