3ssi

PROTEINASE INHIBITOR SSI (STREPTOMYCES SUBTILISIN, INHIBITOR) FROM STREPTOMYCES ALBOGRISEOLUS

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 52.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

STREPTOMYCES SUBTILISIN INHIBITOR

物种未注明

UniProt P01006

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 32–144 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7;pH 7.0 分辨率 2.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SSI_STRAO
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–113; UniProt 32–144

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3ssi

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3ssi
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3ssi
沉积日期 deposition_date1996-03-01
结构标题 titlePROTEINASE INHIBITOR SSI (STREPTOMYCES SUBTILISIN, INHIBITOR) FROM STREPTOMYCES ALBOGRISEOLUS
关键词 keywordsSSI, SERINE PROTEASE INHIBITOR, SUBTILISIN BPN; SERINE PROTEASE INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier14.52
回转半径 Rg (电子) rg_electron13.63
零角强度 I(0) i02630080.00
分子量 molecular_weight11042.0 kDa
排除体积 excluded_volume13681 ų
包络体积 envelope_volume15580 ų
水化壳体积 shell_volume10232 ų
包络直径 envelope_diameter52.4
壳层 Rg shell_rg18.72
包络 Rg envelope_rg14.07
形状 Rg shape_rg13.59
总 Rg total_rg14.81
总原子数 total_atoms772
残基数 n_residues108
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax52.2
Rg (实空间) rg_real14.49
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.45
I(0) (实空间) i0_real2.6300e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.2320e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal14.49
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2630000.0000
解质量估计 total_estimate0.7697
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary17.8
偏度 Skewness skewness0.289
峰度 Kurtosis kurtosis-0.127
角度范围 angular_range— – 0.5000 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha356200.0000
实空间数据点数 n_real_points80
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.684; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.951; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd3ssia_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.84 — Subtilisin inhibitor
超家族 Superfamily superfamilyd.84.1 — Subtilisin inhibitor
家族 Family familyd.84.1.1 — Subtilisin inhibitor

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id3ssiA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology350 — Subtilisin Inhibitor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Subtilisin inhibitor-like

8. 引用文献 (14)

9. 文件与曲线 (10)