3tcx

Structure of Engineered Single Domain ICAM-1 D1 with High-Affinity aL Integrin I Domain of Native C-Terminal Helix Conformation

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 194.3 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Intercellular adhesion molecule 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
10	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 S； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
11	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 U； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
12	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 W； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
13	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 Y； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
14	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 M； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 O； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
9	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 Q； UniProt 29–112	片段：DOMAIN 1, unp residues 29-112 突变：T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A	Integrin alpha-L × 1 （P20701） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3TCX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1D3E CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 16 (HRV16) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-MERIC	链 1 28–212（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV16 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 16 HOURS AT 34 DEGREES CELSIUS (307 KELVIN) USING A SIXTEEN-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER	分辨率 28.00 Å
1D3E CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 16 (HRV16) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 1 28–212（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV16 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 16 HOURS AT 34 DEGREES CELSIUS (307 KELVIN) USING A SIXTEEN-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER	分辨率 28.00 Å
1D3E CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 16 (HRV16) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 1 28–212（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV16 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 16 HOURS AT 34 DEGREES CELSIUS (307 KELVIN) USING A SIXTEEN-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER	分辨率 28.00 Å
1D3E CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 16 (HRV16) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 1 28–212（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV16 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 16 HOURS AT 34 DEGREES CELSIUS (307 KELVIN) USING A SIXTEEN-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER	分辨率 28.00 Å
1D3E CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 16 (HRV16) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 1 28–212（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV16 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 16 HOURS AT 34 DEGREES CELSIUS (307 KELVIN) USING A SIXTEEN-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER	分辨率 28.00 Å
1D3I CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 14 (HRV14) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-MERIC	链 I 28–212（185 aa）片段：FIRST TWO DOMAINS, RESIDUES 1-185	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV14 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 30 MINUTES AT 4 DEGREES CELSIUS (277 KELVIN) USING AN EIGHT-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER.	分辨率 26.00 Å
1D3I CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 14 (HRV14) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 28–212（185 aa）片段：FIRST TWO DOMAINS, RESIDUES 1-185	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV14 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 30 MINUTES AT 4 DEGREES CELSIUS (277 KELVIN) USING AN EIGHT-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER.	分辨率 26.00 Å
1D3I CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 14 (HRV14) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric	链 I 28–212（185 aa）片段：FIRST TWO DOMAINS, RESIDUES 1-185	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV14 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 30 MINUTES AT 4 DEGREES CELSIUS (277 KELVIN) USING AN EIGHT-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER.	分辨率 26.00 Å
1D3I CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 14 (HRV14) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 I 28–212（185 aa）片段：FIRST TWO DOMAINS, RESIDUES 1-185	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV14 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 30 MINUTES AT 4 DEGREES CELSIUS (277 KELVIN) USING AN EIGHT-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER.	分辨率 26.00 Å
1D3I CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN RHINOVIRUS 14 (HRV14) COMPLEXED WITH A TWO-DOMAIN FRAGMENT OF ITS CELLULAR RECEPTOR, INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1 (D1D2-ICAM-1). IMPLICATIONS FOR VIRUS-RECEPTOR INTERACTIONS. ALPHA CARBONS ONLY 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 28–212（185 aa）片段：FIRST TWO DOMAINS, RESIDUES 1-185	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件 HRV14 WAS INCUBATED WITH D1D2-ICAM-1 FOR 30 MINUTES AT 4 DEGREES CELSIUS (277 KELVIN) USING AN EIGHT-FOLD EXCESS OF D1D2-ICAM-1 FOR EACH OF THE SIXTY POSSIBLE BINDING SITES PER VIRION. AFTER INCUBATION, SAMPLES WERE PREPARED AS THIN LAYERS OF VITREOUS ICE AND MAINTAINED AT NEAR LIQUID NITROGEN TEMPERATURE IN THE ELECTRON MICROSCOPE WITH A GATAN 626 CRYOTRANSFER HOLDER.	分辨率 26.00 Å
1D3L D1D2-ICAM-1 FULLY GLYCOSYLATED, VARIATION OF D1-D2 INTERDOMAIN ANGLE IN DIFFERENT CRYSTAL STRUCTURES. 提交 1999-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 28–212（185 aa）片段：FIRST TWO DOMAINS, RESIDUES 1-185	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN WAS DESIALATED WITH NEURAMINIDASE (8 HR AT 37 DEGREES IN 100 MM SODIUM ACETATE, PH 6.5, 10 MG/ML PROTEIN, 0.1 ENZYME UNIT/ML), DIALYZED AGAINST 10 MM TRIS, 25 MM NACL (PH 6.0), AND PASSED THROUGH MONO-Q COLUMN. DESIALATED MATERIAL WAS CRYSTALLIZED BY HANGING DROP METHODS: 17 MG/ML PROTEIN IN BUFFER: 10 MM TRIS,25 MM NACL,1 MM MGCL2,1 MM CACL2, WAS PRECIPITATED FROM 24-27% PEG 3350 IN SAME BUFFER.	分辨率 3.25 Å
1IAM STRUCTURE OF THE TWO AMINO-TERMINAL DOMAINS OF HUMAN INTERCELLULAR ADHESION MOLECULE-1, ICAM-1 提交 1998-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 28–212（185 aa）片段：TWO N-TERMINAL, IMMUNOGLOBULIN DOMAINS	突变：N103Q, N118Q, N156Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；PROTEIN IN 10 MM TRIS, PH 7.5, 25 MM NACL, WAS CRYSTALLIZED FROM 20% PEG 4000 IN 10 MM TRIS AS PRECIPITANT	分辨率 2.10 Å R-free 0.303
1IC1 THE CRYSTAL STRUCTURE FOR THE N-TERMINAL TWO DOMAINS OF ICAM-1 提交 1998-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 28–217（190 aa）片段：N-TERMINAL 190 RESIDUE DOMAIN	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；17% PEG 4000, NA CACODYLATE, PH 6.5, AND 100 MM B-OCTYL-GLUCOPYRANOSIDE.	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
1IC1 THE CRYSTAL STRUCTURE FOR THE N-TERMINAL TWO DOMAINS OF ICAM-1 提交 1998-03-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 28–217（190 aa）片段：N-TERMINAL 190 RESIDUE DOMAIN	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；17% PEG 4000, NA CACODYLATE, PH 6.5, AND 100 MM B-OCTYL-GLUCOPYRANOSIDE.	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
1MQ8 Crystal structure of alphaL I domain in complex with ICAM-1 提交 2002-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 28–318（291 aa）片段：domains 1 and 2	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.313
1MQ8 Crystal structure of alphaL I domain in complex with ICAM-1 提交 2002-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 28–318（291 aa）片段：domains 1 and 2	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.313
1P53 The Crystal Structure of ICAM-1 D3-D5 fragment 提交 2003-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 212–477（266 aa）片段：ICAM-1 extracellular Domain 3-5, ecto-fragment	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；15mg/ml protein, NH4H2PO4, 0.1 M Na-citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.06 Å R-free 0.252
1P53 The Crystal Structure of ICAM-1 D3-D5 fragment 提交 2003-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 212–477（266 aa）片段：ICAM-1 extracellular Domain 3-5, ecto-fragment	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；15mg/ml protein, NH4H2PO4, 0.1 M Na-citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.06 Å R-free 0.252
1Z7Z Cryo-em structure of human coxsackievirus A21 complexed with five domain icam-1kilifi 提交 2005-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 360 PDB 声明：360-MERIC	链 I 28–477（450 aa）片段：ICAM-1 EXTRACELLULAR DOMAIN 1-5	突变：K29M	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 480	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.2；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE AT LIQUID NITROGEN TEMPERATURE	分辨率 8.00 Å
1Z7Z Cryo-em structure of human coxsackievirus A21 complexed with five domain icam-1kilifi 提交 2005-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 28–477（450 aa）片段：ICAM-1 EXTRACELLULAR DOMAIN 1-5	突变：K29M	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.2；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE AT LIQUID NITROGEN TEMPERATURE	分辨率 8.00 Å
1Z7Z Cryo-em structure of human coxsackievirus A21 complexed with five domain icam-1kilifi 提交 2005-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 I 28–477（450 aa）片段：ICAM-1 EXTRACELLULAR DOMAIN 1-5	突变：K29M	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 40	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.2；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE AT LIQUID NITROGEN TEMPERATURE	分辨率 8.00 Å
1Z7Z Cryo-em structure of human coxsackievirus A21 complexed with five domain icam-1kilifi 提交 2005-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric	链 I 28–477（450 aa）片段：ICAM-1 EXTRACELLULAR DOMAIN 1-5	突变：K29M	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 48	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.2；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE AT LIQUID NITROGEN TEMPERATURE	分辨率 8.00 Å
1Z7Z Cryo-em structure of human coxsackievirus A21 complexed with five domain icam-1kilifi 提交 2005-03-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 I 28–477（450 aa）片段：ICAM-1 EXTRACELLULAR DOMAIN 1-5	突变：K29M	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 TRIS；pH 7.2；TRIS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；PLUNGED INTO ETHANE AT LIQUID NITROGEN TEMPERATURE	分辨率 8.00 Å
5MZA The DBLb domain of PF11_0521 PfEMP1 bound to human ICAM-1 提交 2017-01-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 28–212（185 aa）	未记录	3PO TRIPHOSPHATE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10% (w/v) PEG 20000, 20% (v/v) PEG 500 and 0.1M Tris-BICINE (pH 8.5)	分辨率 2.78 Å R-free 0.236
6EIT Coxsackievirus A24v in complex with the D1-D2 fragment of ICAM-1 提交 2017-09-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 240 PDB 声明：240-meric	链 4 28–112（85 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；TBS buffer (Coxsackievirus A24v) Phosphate buffer (ICAM-1 D1-D2) cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；On-grid binding of the receptor was performed by applying 3 microliters of ICAM-1 (9.85 mg/ml) to the pre-blotted, virus-containing grid, and leaving for 30 seconds before blotting and freezing	分辨率 3.90 Å
6S8U Structure of the PfEMP1 IT4var13 DBLbeta domain bound to ICAM-1 提交 2019-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 28–212（185 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1M Tris pH 8, 25% PEG 350 MME	分辨率 3.67 Å R-free 0.286
7BG7 HRV14 in complex with its receptor ICAM-1 提交 2021-01-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 300 PDB 声明：300-meric	链 B 28–480（453 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；PBS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.40 Å

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UniProt名称	ICAM1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 C； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 E； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 G； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 I； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 K； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 M； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 O； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 Q； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 S； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 U； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 W； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 Y； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112 作者链 a； PDB构建体 3–85； UniProt 29–112

Integrin alpha-L

Homo sapiens

UniProt P20701

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
10	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 T； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
11	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 V； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
12	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 X； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
13	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 Z； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
14	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 b； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
5	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
6	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
7	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 N； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
8	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234
9	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 R； UniProt 154–332	片段：I DOMAIN, unp residues 154-332 突变：F265S	Intercellular adhesion molecule 1 × 1 （P05362） MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：EVAPORATION；pH 6；277 K；pH 6.0, EVAPORATION, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.234

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 3TCX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1CQP CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE COMPLEX LFA-1 (CD11A) I-DOMAIN / LOVASTATIN AT 2.6 A RESOLUTION 提交 1999-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–334（182 aa）片段：I-DOMAIN, RESIDUES 153-334	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 803 LOVASTATIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, HEPES, MAGNESIUM SULFATE, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
1CQP CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF THE COMPLEX LFA-1 (CD11A) I-DOMAIN / LOVASTATIN AT 2.6 A RESOLUTION 提交 1999-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–334（182 aa）片段：I-DOMAIN, RESIDUES 153-334	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 803 LOVASTATIN × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, HEPES, MAGNESIUM SULFATE, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.257
1DGQ NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE INSERTED DOMAIN OF HUMAN LEUKOCYTE FUNCTION ASSOCIATED ANTIGEN-1 提交 1999-11-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 149–336（188 aa）片段：INSERTED DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；295 K；压力 AMBIENT NMR测量条件 pH 7.3；295 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.2 MM NMR SAMPLE OF PURIFIED AND UNIFORMLY 15N/13C ISOTOPICALLY LABELED LFA-1 I-DOMAIN NMR样品组成 1.2 MM 15N UNIFORMLY LABELED SAMPLE WAS ALSO PREPARED IN THE FOLLOWING CONDITIONS THAT WERE LESS AFFECTED BY LINE BROADENING	分辨率未提供
1LFA CD11A I-DOMAIN WITH BOUND MN++ 提交 1995-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 150–336（187 aa）链 B 150–336（187 aa）	未记录	MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；pH 5.2	分辨率 1.80 Å R-free 0.251
1MJN Crystal Structure of the intermediate affinity aL I domain mutant 提交 2002-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–331（179 aa）片段：Intermediate Affinity aL I Domain	突变：L161C, F299C	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 4000, MgCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.30 Å R-free 0.202
1MQ8 Crystal structure of alphaL I domain in complex with ICAM-1 提交 2002-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 155–331（177 aa）片段：Integrin alphaL I domain	突变：L186C, F324C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.313
1MQ8 Crystal structure of alphaL I domain in complex with ICAM-1 提交 2002-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 155–331（177 aa）片段：Integrin alphaL I domain	突变：L186C, F324C	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25% PEG 4000, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 3.30 Å R-free 0.313
1MQ9 Crystal structure of high affinity alphaL I domain with ligand mimetic crystal contact 提交 2002-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–331（179 aa）片段：Integrin alphaL I domain	突变：K287C, K294C	MN MANGANESE (II) ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 2000 MME, 25 mM MnCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.265
1MQA Crystal structure of high affinity alphaL I domain in the absence of ligand or metal 提交 2002-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–331（179 aa）片段：Integrin alphaL I domain	突变：K287C, K294C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；1.2 M ammonium phosphate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.283
1RD4 An allosteric inhibitor of LFA-1 bound to its I-domain 提交 2003-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 150–336（187 aa）片段：I Domain, residues 125-311	未记录	L08 1-ACETYL-4-(4-{4-[(2-ETHOXYPHENYL)THIO]-3-NITROPHENYL}PYRIDIN-2-YL)PIPERAZINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；30% (w/v) PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, pH 4.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1RD4 An allosteric inhibitor of LFA-1 bound to its I-domain 提交 2003-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 150–336（187 aa）片段：I Domain, residues 125-311	未记录	L08 1-ACETYL-4-(4-{4-[(2-ETHOXYPHENYL)THIO]-3-NITROPHENYL}PYRIDIN-2-YL)PIPERAZINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；30% (w/v) PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, pH 4.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1RD4 An allosteric inhibitor of LFA-1 bound to its I-domain 提交 2003-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 150–336（187 aa）片段：I Domain, residues 125-311	未记录	L08 1-ACETYL-4-(4-{4-[(2-ETHOXYPHENYL)THIO]-3-NITROPHENYL}PYRIDIN-2-YL)PIPERAZINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；30% (w/v) PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, pH 4.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1RD4 An allosteric inhibitor of LFA-1 bound to its I-domain 提交 2003-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 150–336（187 aa）片段：I Domain, residues 125-311	未记录	L08 1-ACETYL-4-(4-{4-[(2-ETHOXYPHENYL)THIO]-3-NITROPHENYL}PYRIDIN-2-YL)PIPERAZINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；30% (w/v) PEG 4000, 0.2M ammonium acetate, 0.1M sodium acetate, pH 4.6	分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1T0P Structural Basis of ICAM recognition by integrin alpahLbeta2 revealed in the complex structure of binding domains of ICAM-3 and alphaLbeta2 at 1.65 A 提交 2004-04-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 153–326（174 aa）片段：I domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；298 K；PEG MME 5000, (NH4)2SO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.66 Å R-free 0.241
1XDD X-ray structure of LFA-1 I-domain in complex with LFA703 at 2.2A resolution 提交 2004-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 152–336（185 aa）片段：I-domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AAY 8-[2-((2S)-4-HYDROXY-1-{[5-(HYDROXYMETHYL)-6-METHOXY-2-NAPHTHYL]METHYL}-6-OXOPIPERIDIN-2-YL)ETHYL]-3,7-DIMETHYL-1,2,3,7,8,8A-HEXAHYDRONAPHTHALEN-1-YL 2-METHYLBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium acetate, sodium acetate, glycerol, PEG4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.206
1XDD X-ray structure of LFA-1 I-domain in complex with LFA703 at 2.2A resolution 提交 2004-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 152–336（185 aa）片段：I-domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AAY 8-[2-((2S)-4-HYDROXY-1-{[5-(HYDROXYMETHYL)-6-METHOXY-2-NAPHTHYL]METHYL}-6-OXOPIPERIDIN-2-YL)ETHYL]-3,7-DIMETHYL-1,2,3,7,8,8A-HEXAHYDRONAPHTHALEN-1-YL 2-METHYLBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；ammonium acetate, sodium acetate, glycerol, PEG4000, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.20 Å R-free 0.206
1XDG X-ray structure of LFA-1 I-domain in complex with LFA878 at 2.1A resolution 提交 2004-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 152–336（185 aa）片段：I-domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AB8 (1S,3R,8AS)-8-(2-{(4S,6S)-3-(4-HYDROXY-3-METHOXYBENZYL)-4-[2-(METHYLAMINO)-2-OXOETHYL]-2-OXO-1,3-OXAZINAN-6-YL}ETHYL)-3 ,7-DIMETHYL-1,2,3,7,8,8A-HEXAHYDRONAPHTHALEN-1-YL (2R)-2-METHYLBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, glycerol, PEG4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.213
1XDG X-ray structure of LFA-1 I-domain in complex with LFA878 at 2.1A resolution 提交 2004-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 152–336（185 aa）片段：I-domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 AB8 (1S,3R,8AS)-8-(2-{(4S,6S)-3-(4-HYDROXY-3-METHOXYBENZYL)-4-[2-(METHYLAMINO)-2-OXOETHYL]-2-OXO-1,3-OXAZINAN-6-YL}ETHYL)-3 ,7-DIMETHYL-1,2,3,7,8,8A-HEXAHYDRONAPHTHALEN-1-YL (2R)-2-METHYLBUTANOATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；sodium citrate, ammonium acetate, glycerol, PEG4000, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.213
1XUO X-ray structure of LFA-1 I-domain bound to a 1,4-diazepane-2,5-dione inhibitor at 1.8A resolution 提交 2004-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 152–336（185 aa）片段：I-domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 LA1 (2R)-2-[3-ISOBUTYL-2,5-DIOXO-4-(QUINOLIN-3-YLMETHYL)-1,4-DIAZEPAN-1-YL]-N-METHYL-3-(2-NAPHTHYL)PROPANAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.214
1XUO X-ray structure of LFA-1 I-domain bound to a 1,4-diazepane-2,5-dione inhibitor at 1.8A resolution 提交 2004-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 152–336（185 aa）片段：I-domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.80 Å R-free 0.214
1ZON CD11A I-DOMAIN WITHOUT BOUND CATION 提交 1996-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 150–336（187 aa）片段：I-DOMAIN FRAGMENT OF LFA-1	突变：W189R, MIGHT BE ISOFORM	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.243
1ZOO CD11A I-DOMAIN WITH BOUND MAGNESIUM ION 提交 1996-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 150–336（187 aa）片段：I-DOMAIN FRAGMENT OF LFA-1 链 B 150–336（187 aa）片段：I-DOMAIN FRAGMENT OF LFA-1	突变：W189R, MIGHT BE ISOFORM 突变：W189R, MIGHT BE ISOFORM	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；pH 5.2	分辨率 3.00 Å R-free 0.264
1ZOP CD11A I-DOMAIN WITH BOUND MAGNESIUM ION 提交 1996-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 150–336（187 aa）链 B 150–336（187 aa）	突变：W189R, MIGHT BE ISOFORM 突变：W189R, MIGHT BE ISOFORM	MN MANGANESE (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.2；pH 5.2	分辨率 2.00 Å R-free 0.263
2ICA CD11a (LFA1) I-domain complexed with BMS-587101 aka 5-[(5S, 9R)-9-(4-cyanophenyl)-3-(3,5-dichlorophenyl)-1-methyl-2,4-dioxo-1,3,7-triazaspiro [4.4]non-7-yl]methyl]-3-thiophenecarboxylicacid 提交 2006-09-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 154–332（179 aa）片段：VWFA domain, residues 154-332	未记录	2IC 5-[(5S,9R)-9-(4-CYANOPHENYL)-3-(3,5-DICHLOROPHENYL)-1-METHYL-2,4-DIOXO-1,3,7-TRIAZASPIRO [4.4]NON-7-YL]METHYL]-3-THIOPHENECARBOXYLICACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.9；293 K；80% (w/v) sodium citrate, 5% (v/v) glycerol, measured pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K	分辨率 1.56 Å R-free 0.223
2K8O Solution structure of integrin Alpha L 提交 2008-09-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1113–1170（58 aa）片段：Cytoplasmic	突变：M14I	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.2；298 K NMR样品组成 0.5 mM [U-15N;U-13C] aL, % NaCl, % TCEP, % Phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2M3E The Integrin Alpha L Transmembrane Domain in Bicelles: Structure and Interaction with Integrin Beta 2 提交 2013-01-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1082–1128（47 aa）片段：Transmembrane Domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] integrin aL TM domain, 50 mM potassium phosphate, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2O7N CD11A (LFA1) I-domain complexed with 7A-[(4-cyanophenyl)methyl]-6-(3,5-dichlorophenyl)-5-oxo-2,3,5,7A-tetrahydro-1H-pyrrolo[1,2-A]pyrrole-7-carbonitrile 提交 2006-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 154–332（179 aa）片段：VWFA DOMAIN, RESIDUES 154-332	未记录	2O7 7A-[(4-cyanophenyl)methyl]-6-(3,5-dichlorophenyl)-5-oxo-2,3,5,7A-tetrahydro-1H-pyrrolo[1,2-A]pyrrole-7-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.9；293 K；78% (W/V) SODIUM CITRATE, 3% (V/V) ETHYLENE GLYCOL, 0.1 M SODIUM CITRATE, PH 5.6 (FINAL PH 8.9), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K, pH 8.90	分辨率 1.75 Å R-free 0.234
3BN3 crystal structure of ICAM-5 in complex with aL I domain 提交 2007-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 154–332（179 aa）片段：I domain	突变：F265S, F292G	MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M HEPES pH7.5, 7.5%PEG8000, 10%glycerol, 5mM magnesium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
3BQM LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–334（182 aa）片段：VWFA domain	未记录	BQM 3-({4-[(1E)-3-morpholin-4-yl-3-oxoprop-1-en-1-yl]-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl}sulfanyl)aniline × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；273 K；5% Peg400, 20% Peg3350, 50mM K2HPO4 pH 4.5, 10mM MgCl, 1mM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 1.95 Å R-free 0.284
3BQM LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 153–334（182 aa）片段：VWFA domain	未记录	BQM 3-({4-[(1E)-3-morpholin-4-yl-3-oxoprop-1-en-1-yl]-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl}sulfanyl)aniline × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；273 K；5% Peg400, 20% Peg3350, 50mM K2HPO4 pH 4.5, 10mM MgCl, 1mM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 1.95 Å R-free 0.284
3BQM LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 153–334（182 aa）片段：VWFA domain 链 C 153–334（182 aa）片段：VWFA domain	未记录	BQM 3-({4-[(1E)-3-morpholin-4-yl-3-oxoprop-1-en-1-yl]-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl}sulfanyl)aniline × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；273 K；5% Peg400, 20% Peg3350, 50mM K2HPO4 pH 4.5, 10mM MgCl, 1mM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 273K	分辨率 1.95 Å R-free 0.284
3BQN LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–334（182 aa）片段：VWFA DOMAIN	未记录	BQN 4-{(2E)-3-[4-{[2-(pyridin-3-ylmethoxy)phenyl]sulfanyl}-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl]prop-2-enoyl}morpholine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；5% Peg400, 20% Peg3350, 50mM K2HPO4 pH 4.5, 10mM MgCl2, 1mM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.252
3BQN LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 153–334（182 aa）片段：VWFA DOMAIN	未记录	BQN 4-{(2E)-3-[4-{[2-(pyridin-3-ylmethoxy)phenyl]sulfanyl}-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl]prop-2-enoyl}morpholine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；5% Peg400, 20% Peg3350, 50mM K2HPO4 pH 4.5, 10mM MgCl2, 1mM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.252
3BQN LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2007-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 153–334（182 aa）片段：VWFA DOMAIN 链 C 153–334（182 aa）片段：VWFA DOMAIN	未记录	BQN 4-{(2E)-3-[4-{[2-(pyridin-3-ylmethoxy)phenyl]sulfanyl}-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl]prop-2-enoyl}morpholine × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；5% Peg400, 20% Peg3350, 50mM K2HPO4 pH 4.5, 10mM MgCl2, 1mM inhibitor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.80 Å R-free 0.252
3E2M LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2008-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 152–334（183 aa）片段：VWFA DOMAIN 链 B 152–334（183 aa）片段：VWFA DOMAIN	未记录	E2M cis-4-{[2-({4-[(1E)-3-morpholin-4-yl-3-oxoprop-1-en-1-yl]-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl}sulfanyl)phenoxy]methyl}cyclohexanecarboxylic acid × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；5% PEG400, 20% PEG3350, 50MM K2HPO4 PH 4.5, 10MM MGCL2, 1MM INHIBITOR, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.287
3E2M LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2008-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 152–334（183 aa）片段：VWFA DOMAIN	未记录	E2M cis-4-{[2-({4-[(1E)-3-morpholin-4-yl-3-oxoprop-1-en-1-yl]-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl}sulfanyl)phenoxy]methyl}cyclohexanecarboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；5% PEG400, 20% PEG3350, 50MM K2HPO4 PH 4.5, 10MM MGCL2, 1MM INHIBITOR, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.287
3E2M LFA-1 I domain bound to inhibitors 提交 2008-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 152–334（183 aa）片段：VWFA DOMAIN	未记录	E2M cis-4-{[2-({4-[(1E)-3-morpholin-4-yl-3-oxoprop-1-en-1-yl]-2,3-bis(trifluoromethyl)phenyl}sulfanyl)phenoxy]methyl}cyclohexanecarboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；5% PEG400, 20% PEG3350, 50MM K2HPO4 PH 4.5, 10MM MGCL2, 1MM INHIBITOR, pH 4.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.00 Å R-free 0.287
3EOA Crystal structure the Fab fragment of Efalizumab in complex with LFA-1 I domain, Form I 提交 2008-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 153–333（181 aa）片段：I domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；277 K；0.1M sodium citric, 0.2M sodium potassium tartrate, 1.6M ammonium sulfate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264
3EOA Crystal structure the Fab fragment of Efalizumab in complex with LFA-1 I domain, Form I 提交 2008-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 153–333（181 aa）片段：I domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；277 K；0.1M sodium citric, 0.2M sodium potassium tartrate, 1.6M ammonium sulfate, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264
3EOB Crystal structure the Fab fragment of Efalizumab in complex with LFA-1 I domain, Form II 提交 2008-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 I 153–333（181 aa）片段：I domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；277 K；0.1M sodium cacodylate, 0.2M zinc acetate, 11% w/v PEG 8000, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.333
3EOB Crystal structure the Fab fragment of Efalizumab in complex with LFA-1 I domain, Form II 提交 2008-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 J 153–333（181 aa）片段：I domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；277 K；0.1M sodium cacodylate, 0.2M zinc acetate, 11% w/v PEG 8000, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.60 Å R-free 0.333
3F74 Crystal structure of wild type LFA1 I domain 提交 2008-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332, VWFA domain, I domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；o.1M sodium acetate, pH7.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.178
3F74 Crystal structure of wild type LFA1 I domain 提交 2008-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332, VWFA domain, I domain	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；o.1M sodium acetate, pH7.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.178
3F74 Crystal structure of wild type LFA1 I domain 提交 2008-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332, VWFA domain, I domain	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；o.1M sodium acetate, pH7.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.70 Å R-free 0.178
3F78 Crystal structure of wild type LFA1 I domain complexed with isoflurane 提交 2008-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332, VWFA domain, I domain	未记录	ICF 1-CHLORO-2,2,2-TRIFLUOROETHYL DIFLUOROMETHYL ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M sodium acetate pH7.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG3350, 10mM isoflurane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.60 Å R-free 0.181
3F78 Crystal structure of wild type LFA1 I domain complexed with isoflurane 提交 2008-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332, VWFA domain, I domain	未记录	ICF 1-CHLORO-2,2,2-TRIFLUOROETHYL DIFLUOROMETHYL ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M sodium acetate pH7.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG3350, 10mM isoflurane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.60 Å R-free 0.181
3F78 Crystal structure of wild type LFA1 I domain complexed with isoflurane 提交 2008-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332, VWFA domain, I domain	未记录	GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M sodium acetate pH7.5, 0.2M ammonium acetate, 25% PEG3350, 10mM isoflurane, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.60 Å R-free 0.181
3HI6 Crystal structure of intermediate affinity I domain of integrin LFA-1 with the Fab fragment of its antibody AL-57 提交 2009-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332	突变：L186C, F324C	MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2M (NH4)2SO4, 0.1M NaAc, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
3HI6 Crystal structure of intermediate affinity I domain of integrin LFA-1 with the Fab fragment of its antibody AL-57 提交 2009-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332	突变：L186C, F324C	MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2M (NH4)2SO4, 0.1M NaAc, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
3HI6 Crystal structure of intermediate affinity I domain of integrin LFA-1 with the Fab fragment of its antibody AL-57 提交 2009-05-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332 链 B 153–332（180 aa）片段：UNP residues 153-332	突变：L186C, F324C 突变：L186C, F324C	MN MANGANESE (II) ION × 2 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2M (NH4)2SO4, 0.1M NaAc, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.226
3M6F CD11A I-domain complexed with 6-((5S,9R)-9-(4-CYANOPHENYL)-3-(3,5-DICHLOROPHENYL)-1-METHYL-2,4-DIOXO-1,3,7- TRIAZASPIRO[4.4]NON-7-YL)NICOTINIC ACID 提交 2010-03-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 154–332（179 aa）片段：UNP residues 154-332	未记录	BJZ 6-[(5S,9R)-9-(4-cyanophenyl)-3-(3,5-dichlorophenyl)-1-methyl-2,4-dioxo-1,3,7-triazaspiro[4.4]non-7-yl]pyridine-3-carboxylic acid × 1 NO3 NITRATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.85 Å R-free 0.227
4IXD X-ray structure of lfa-1 i-domain in complex with ibe-667 at 1.8a resolution 提交 2013-01-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 152–336（185 aa）片段：I-DOMAIN, UNP residues 152-336	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 1HV 4-(3-{4-[(3-aminopropyl)carbamoyl]phenyl}-1H-indazol-1-yl)-N-methylbenzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；0.085M sodium acetate, pH4.6, 0.17M ammonium acetate, 15% glycerol and 25.5% (w/v) PEG4000 , VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.199
4IXD X-ray structure of lfa-1 i-domain in complex with ibe-667 at 1.8a resolution 提交 2013-01-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 152–336（185 aa）片段：I-DOMAIN, UNP residues 152-336	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 1HV 4-(3-{4-[(3-aminopropyl)carbamoyl]phenyl}-1H-indazol-1-yl)-N-methylbenzamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；0.085M sodium acetate, pH4.6, 0.17M ammonium acetate, 15% glycerol and 25.5% (w/v) PEG4000 , VAPOR DIFFUSION, temperature 293.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.199
5E6R Structures of leukocyte integrin aLb2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-615	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M MES pH 6.5, 15% PEG 3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.229
5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-770	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000	分辨率 2.15 Å R-free 0.234
5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-770	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000	分辨率 2.15 Å R-free 0.234
5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-770	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000	分辨率 2.15 Å R-free 0.234
5E6S Structures of leukocyte integrin aLB2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-770 链 C 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-770 链 E 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-770	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 CA CALCIUM ION × 15 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；0.1 M Tris, pH 8, 0.1 M NaCl, and 8% polyethylene glycol (PEG) 20,000	分辨率 2.15 Å R-free 0.234
5E6U Structures of leukocyte integrin aLb2: The aI domain, the headpiece, and the pocket for the internal ligand 提交 2015-10-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 26–770（745 aa）片段：UNP residues 26-770	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M Mg-formate dehydrate and 15% PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.226
6BXB Crystal structure of an extended b3 integrin P33 提交 2017-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–329（177 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% PEG 6000, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5)	分辨率 2.39 Å R-free 0.268
6BXB Crystal structure of an extended b3 integrin P33 提交 2017-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–329（177 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20% PEG 6000, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5)	分辨率 2.39 Å R-free 0.268
6BXF Crystal structure of an extended b3 integrin L33 提交 2017-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–329（177 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；12% PEG 8000, 0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 3.20 Å R-free 0.335
6BXF Crystal structure of an extended b3 integrin L33 提交 2017-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–329（177 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；12% PEG 8000, 0.2 M NaCl, 0.1 M HEPES (pH 7.5)	分辨率 3.20 Å R-free 0.335
6BXJ Structure of a single-chain beta3 integrin 提交 2017-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–329（177 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% PEG 8000, 20% 1,5-pentanediol, 4 mM alkalis, 66 mM Gly-Gly, 33 mM AMPD, pH 8.5.	分辨率 2.09 Å R-free 0.234
6CKB Crystal structure of an extended beta3 integrin P33 提交 2018-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–329（177 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% PEG 6000, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5)	分辨率 2.80 Å R-free 0.296
6CKB Crystal structure of an extended beta3 integrin P33 提交 2018-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 153–329（177 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；20% PEG 6000, 0.1 M Tris-HCl (pH 8.5)	分辨率 2.80 Å R-free 0.296
7KC3 X-ray structure of Lfa-1 I domain collected at 273 K 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 149–341（193 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；30% (w/v) PEG 3350 and 0.1 M potassium phosphate dibasic	分辨率 1.80 Å R-free 0.212
7KC5 X-ray structure of Lfa-1 I domain in complex with BMS-68852 collected at 273 K 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–334（182 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BJZ 6-[(5S,9R)-9-(4-cyanophenyl)-3-(3,5-dichlorophenyl)-1-methyl-2,4-dioxo-1,3,7-triazaspiro[4.4]non-7-yl]pyridine-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris pH 8.5, 10 mM MgSO4, 1 mM TCEP and 1 mM BMS-68852	分辨率 1.86 Å R-free 0.216
7KC5 X-ray structure of Lfa-1 I domain in complex with BMS-68852 collected at 273 K 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 153–334（182 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 BJZ 6-[(5S,9R)-9-(4-cyanophenyl)-3-(3,5-dichlorophenyl)-1-methyl-2,4-dioxo-1,3,7-triazaspiro[4.4]non-7-yl]pyridine-3-carboxylic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50 mM Tris pH 8.5, 10 mM MgSO4, 1 mM TCEP and 1 mM BMS-68852	分辨率 1.86 Å R-free 0.216
7KC6 X-ray structure of Lfa-1 I domain in complex with Lovastatin collected at 273 K 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 153–334（182 aa）	未记录	803 LOVASTATIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M NH4NO3 and 20%(w/v) PEG 3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.225
7KC6 X-ray structure of Lfa-1 I domain in complex with Lovastatin collected at 273 K 提交 2020-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 153–334（182 aa）	未记录	803 LOVASTATIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M NH4NO3 and 20%(w/v) PEG 3350	分辨率 1.85 Å R-free 0.225

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	ITAL_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 D； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 F； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 H； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 J； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 L； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 N； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 P； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 R； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 T； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 V； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 X； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 Z； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332 作者链 b； PDB构建体 2–180； UniProt 154–332

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3tcx
沉积日期 deposition_date	2011-08-09
结构标题 title	Structure of Engineered Single Domain ICAM-1 D1 with High-Affinity aL Integrin I Domain of Native C-Terminal Helix Conformation
关键词 keywords	Rossmann Fold, Immunoglobulin-Like Fold, Cell Adhesion, Membrane; CELL ADHESION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	58.62 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	58.22 Å
零角强度 I(0) i0	2283410000.00
分子量 molecular_weight	417290.0 kDa
排除体积 excluded_volume	528850 Å³
包络体积 envelope_volume	810430 Å³
水化壳体积 shell_volume	116630 Å³
包络直径 envelope_diameter	194.1 Å
壳层 Rg shell_rg	60.86 Å
包络 Rg envelope_rg	56.02 Å
形状 Rg shape_rg	58.20 Å
总 Rg total_rg	58.37 Å
总原子数 total_atoms	29330
残基数 n_residues	3710
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	194.3 Å
Rg (实空间) rg_real	58.36 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.82 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.2830e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.0490e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	58.81 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2285000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8862
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	72.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.130
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.497
角度范围 angular_range	— – 0.1350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	119800000.0000
实空间数据点数 n_real_points	28
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.877; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.896

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Intercellular adhesion molecule 1
分子量 formula_weight	9214.6 kDa
突变 mutation	T2V, I10T, T23A, P38V, P63V, S67A, T78A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O,Q,S,U,W,Y,a
原子数 atom_count	29330

MVSVSPSKVTLPRGGSVLVTCSASCDQPKLLGIETPLVKKELLLPGNNRKVYELSNVQEDSQVMCYANCPDGQSTAKAFLTVYWT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Integrin alpha-L
分子量 formula_weight	20622.6 kDa
突变 mutation	F265S
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	14

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P,R,T,V,X,Z,b

MNVDLVFLFDGSMSLQPDEFQKILDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTSYKTEFDFSDYVKWKDPDALLKHVKHMLLLTNTFGAINYVATEVFREELGARPDATKVLIIITDGEATDSGNIDAAKDIIRYIIGIGKHSQTKESQETLHKFASKPASEFVKILDTFEKLKDLFTELQKKIY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 28 domains

CATH v4.4 (28 domains)

结构域编号 domain_id	3tcxA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxI00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxK00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxM00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxN00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxO00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxQ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxR00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxS00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxT00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxU00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxV00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxW00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxX00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxY00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxZ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

结构域编号 domain_id	3tcxa00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3tcxb00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	410 — von Willebrand factor, type A domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	104.041 Å
晶胞边长 b length_b	166.334 Å
晶胞边长 c length_c	299.372 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	56

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.600 Å
最低分辨率 resolution_low	49.540 Å
R 因子 r_factor	0.2185
R_work r_work	0.2176
R_free r_free	0.2336

fit	/app/data/saxs_computation/tc/3tcx/3tcx.fit
pddf	/app/data/pr_computation/tc/3tcx/3tcx.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/tc/3tcx/3tcx.dat

Structure of Engineered Single Domain ICAM-1 D1 with High-Affinity aL Integrin I Domain of Native C-Terminal Helix Conformation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Intercellular adhesion molecule 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Integrin alpha-L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 28 domains

CATH v4.4 (28 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)