Bacillus thuringiensis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 异源复合物 | 蛋白 4 DNA 2 | C-terminus heptapeptide from PapR protein × 2 （B7IR02） 5'-D(P*CP*TP*AP*TP*GP*CP*AP*AP*TP*AP*TP*TP*TP*CP*AP*TP*AP*T)-3' × 1 5'-D(P*AP*TP*AP*TP*GP*AP*AP*AP*TP*AP*TP*TP*GP*CP*AP*TP*AP*G)-3' × 1 CALCIUM ION × 2 water × 6 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | Q45782_BACTU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–285； UniProt 1–285 作者链 B； PDB构建体 1–285； UniProt 1–285 |
物种未注明
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 异源复合物 | 蛋白 4 DNA 2 | Transcriptional activator PlcR protein × 2 （Q45782） 5'-D(P*CP*TP*AP*TP*GP*CP*AP*AP*TP*AP*TP*TP*TP*CP*AP*TP*AP*T)-3' × 1 5'-D(P*AP*TP*AP*TP*GP*AP*AP*AP*TP*AP*TP*TP*GP*CP*AP*TP*AP*G)-3' × 1 CALCIUM ION × 2 water × 6 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | B7IR02_BACC2 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 P； PDB构建体 1–7； UniProt 42–48 作者链 Q； PDB构建体 1–7； UniProt 42–48 |
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| 条目编号 entry_id | 3u3w |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-10-06 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of Bacillus thuringiensis PlcR in complex with the peptide PapR7 and DNA |
| 关键词 keywords | ;ternary complex, PlcR-PAPR7-DNA, HTH DNA-binding domain, Quorum Sensing, HTH_3 (Helix-turn-helix) domain, TPR_1 (tetratricopeptide repeats), Pleiotropic regulator, TRANSCRIPTION ACTIVATOR-DNA complex ;; TRANSCRIPTION ACTIVATOR/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 30.22 Å |
| Rg（电子密度） | 28.41 Å |
| 总 Rg | 29.25 Å |
| 原子数 | 5562 |
| 残基数 | 610 |
| 排除体积 | 97755 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3u3wA01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 3u3wA02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 25 — Alpha Horseshoe |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Tetratricopeptide repeat domain |
| 结构域编号 domain_id | 3u3wB01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 260 — 434 Repressor (Amino-terminal Domain) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 40 — lambda repressor-like DNA-binding domains |
| 结构域编号 domain_id | 3u3wB02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 25 — Alpha Horseshoe |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Tetratricopeptide repeat domain |