SAXSdb — 3u3z

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microcephalin

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 640–835	片段：Tandem BRCT domains (BRCT2-BRCT3, UNP residues 640-835)	Histone H2A.X peptide × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；295 K；22% PEG3350, 0.03 M citric acid, 0.07 M Bis-Tris-propane, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.50 Å R-free 0.171

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3U3Z	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2WT8 Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (Mcph1) 提交 2009-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–95（95 aa）片段：N-TERMINAL BRCT DOMAIN, RESIDUES 1-95	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM MES, PH 6.0, 18% PEG 6000, 200 MM NH4CL	分辨率 1.60 Å R-free 0.222
2WT8 Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (Mcph1) 提交 2009-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–95（95 aa）片段：N-TERMINAL BRCT DOMAIN, RESIDUES 1-95	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM MES, PH 6.0, 18% PEG 6000, 200 MM NH4CL	分辨率 1.60 Å R-free 0.222
2WT8 Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (Mcph1) 提交 2009-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–95（95 aa）片段：N-TERMINAL BRCT DOMAIN, RESIDUES 1-95	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM MES, PH 6.0, 18% PEG 6000, 200 MM NH4CL	分辨率 1.60 Å R-free 0.222
2WT8 Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (Mcph1) 提交 2009-09-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–95（95 aa）片段：N-TERMINAL BRCT DOMAIN, RESIDUES 1-95	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 100 MM MES, PH 6.0, 18% PEG 6000, 200 MM NH4CL	分辨率 1.60 Å R-free 0.222
3KTF Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (MCPH1). 提交 2009-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–101（101 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M sodium succinate, 15% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.60 Å R-free 0.195
3KTF Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (MCPH1). 提交 2009-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–101（101 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M sodium succinate, 15% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.60 Å R-free 0.195
3KTF Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (MCPH1). 提交 2009-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–101（101 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M sodium succinate, 15% PEG 3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.60 Å R-free 0.195
3PA6 Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (MCPH1) 提交 2010-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–105（105 aa）片段：BRCT DOMAIN, UNP residues 1-105	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M sodium succinate, 15% PEG 3350, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
3PA6 Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (MCPH1) 提交 2010-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–105（105 aa）片段：BRCT DOMAIN, UNP residues 1-105	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M sodium succinate, 15% PEG 3350, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
3PA6 Structure of the N-terminal BRCT domain of human microcephalin (MCPH1) 提交 2010-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–105（105 aa）片段：BRCT DOMAIN, UNP residues 1-105	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M sodium succinate, 15% PEG 3350, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
3SHT Crystal structure of human MCPH1 tandem BRCT domains 提交 2011-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 639–835（197 aa）片段：residues 639-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；281 K；100mM HEPES, 10% PEG6000, 5% MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
3SHT Crystal structure of human MCPH1 tandem BRCT domains 提交 2011-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 639–835（197 aa）片段：residues 639-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；281 K；100mM HEPES, 10% PEG6000, 5% MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
3SHT Crystal structure of human MCPH1 tandem BRCT domains 提交 2011-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 639–835（197 aa）片段：residues 639-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；281 K；100mM HEPES, 10% PEG6000, 5% MPD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 281K	分辨率 1.95 Å R-free 0.242
3SHV Crystal structure of human MCPH1 tandem BRCT domains-gamma H2AX complex 提交 2011-06-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 639–835（197 aa）片段：residues 639-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M Sodium acetate trihydrate, 100mM TRIS hydrochloride(pH 8.5), 30%(w/v) PEG4000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.242
3SHV Crystal structure of human MCPH1 tandem BRCT domains-gamma H2AX complex 提交 2011-06-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 639–835（197 aa）片段：residues 639-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2M Sodium acetate trihydrate, 100mM TRIS hydrochloride(pH 8.5), 30%(w/v) PEG4000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.10 Å R-free 0.242
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3SZM STRUCTURE OF HUMAN MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT DOMAINS IN COMPLEX WITH A GAMMA-H2AX PHOSPHOPEPTIDE 提交 2011-07-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；20% PEG 4000, 0.1M (NH4)H2PO4, 0.1M BIS-TRIS-PROPANE , PH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K	分辨率 2.63 Å R-free 0.252
3T1N Structure of human MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT domains in complex with a CDC27 phosphopeptide 提交 2011-07-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, UNP RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；30% PEG 3350, 0.3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS, PH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.262
3T1N Structure of human MICROCEPHALIN (MCPH1) TANDEM BRCT domains in complex with a CDC27 phosphopeptide 提交 2011-07-22	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 640–835（196 aa）片段：C-TERMINAL TANDEM BRCT DOMAINS, UNP RESIDUES 640-835	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；30% PEG 3350, 0.3 M NACL, 0.1 M BIS-TRIS, PH 7.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 2.60 Å R-free 0.262
7C5D Crystal structure of TRF2 TRFH domain in complex with a MCPH1 peptide 提交 2020-05-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 322–342（21 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；30% PEG400, 100 mM CHES-NaOH, pH 9.5	分辨率 2.15 Å R-free 0.235
7C5D Crystal structure of TRF2 TRFH domain in complex with a MCPH1 peptide 提交 2020-05-19	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 322–342（21 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；293 K；30% PEG400, 100 mM CHES-NaOH, pH 9.5	分辨率 2.15 Å R-free 0.235

共 8 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MCPH1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–199； UniProt 640–835

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3u3z
沉积日期 deposition_date	2011-10-06
结构标题 title	Structure of human microcephalin (MCPH1) tandem BRCT domains in complex with an H2A.X peptide phosphorylated at Ser139 and Tyr142
关键词 keywords	DNA repair, cell cycle regulation, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	18.69 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.25 Å
零角强度 I(0) i0	8437270.00
分子量 molecular_weight	21709.0 kDa
排除体积 excluded_volume	27352 Å³
包络体积 envelope_volume	31481 Å³
水化壳体积 shell_volume	15288 Å³
包络直径 envelope_diameter	69.8 Å
壳层 Rg shell_rg	23.38 Å
包络 Rg envelope_rg	18.76 Å
形状 Rg shape_rg	18.26 Å
总 Rg total_rg	19.08 Å
总原子数 total_atoms	3017
残基数 n_residues	191
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	70.2 Å
Rg (实空间) rg_real	18.77 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.43 Å
I(0) (实空间) i0_real	8.4370e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.8560e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	18.76 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	8437000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7956
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	20.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.557
峰度 Kurtosis kurtosis	0.070
角度范围 angular_range	— – 0.4250 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	3005000.0000
实空间数据点数 n_real_points	74
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.511; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.806; Smooth: 1.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Microcephalin
分子量 formula_weight	21949.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3430

GHMSGRGKKPTRTLVMTSMPSEKQNVVIQVVDKLKGFSIAPDVCETTTHVLSGKPLRTLNVLLGIARGCWVLSYDWVLWSLELGHWISEEPFELSHHFPAAPLCRSECHLSAGPYRGTLFADQPVMFVSPASSPPVAKLCELVHLCGGRVSQVPRQASIVIGPYSGKKKATVKYLSEKWVLDSITQHKVCAPENYLLSQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone H2A.X peptide
分子量 formula_weight	685.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SQEY

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	279

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3u3zA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10190 — BRCT domain

结构域编号 domain_id	3u3zA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10190 — BRCT domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	37.689 Å
晶胞边长 b length_b	46.537 Å
晶胞边长 c length_c	55.778 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.07 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.500 Å
最低分辨率 resolution_low	23.790 Å
R 因子 r_factor	0.1290
R_work r_work	0.1290
R_free r_free	0.1710

fit	/app/data/saxs_computation/u3/3u3z/3u3z.fit
pddf	/app/data/pr_computation/u3/3u3z/3u3z.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/u3/3u3z/3u3z.dat

Structure of human microcephalin (MCPH1) tandem BRCT domains in complex with an H2A.X peptide phosphorylated at Ser139 and Tyr142

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Microcephalin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)