Actin, cytoplasmic 1
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–375 | 未记录 | Profilin-1 × 1 (P02584) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.3;277 K;1.3M KPO4, 0.5 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K | 分辨率 2.40 Å R-free 0.331 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 3U4L | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1HLU STRUCTURE OF BOVINE BETA-ACTIN-PROFILIN COMPLEX WITH ACTIN BOUND ATP PHOSPHATES SOLVENT ACCESSIBLE 提交 1997-05-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–375(374 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;pH 7.5
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.330 |
| 2BTF THE STRUCTURE OF CRYSTALLINE PROFILIN-BETA-ACTIN 提交 1994-01-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–375(374 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SR STRONTIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.55 Å |
| 2OAN Structure of oxidized beta-actin 提交 2006-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–375(375 aa)
链 D
1–375(375 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 3 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES, 0.1 M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.288 |
| 2OAN Structure of oxidized beta-actin 提交 2006-12-16 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–375(375 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES, 0.1 M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.288 |
| 2OAN Structure of oxidized beta-actin 提交 2006-12-16 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–375(375 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;277 K;1.6 M (NH4)2SO4, 0.1 M HEPES, 0.1 M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.61 Å R-free 0.288 |
| 3UB5 Profilin:actin with a wide open nucleotide cleft 提交 2011-10-23 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–375(374 aa)
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未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;277 K;1.3M potassium phosphate pH 7.3, 0.5M ATP, 0.2M CaCl2, 1mM DTT, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
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分辨率 2.20 Å R-free 0.290 |
| 7PDZ Structure of capping protein bound to the barbed end of a cytoplasmic actin filament 提交 2021-08-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric |
链 I
1–375(375 aa)
链 J
1–375(375 aa)
链 K
1–375(375 aa)
链 L
1–375(375 aa)
链 N
1–375(375 aa)
链 O
1–375(375 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 PO4 PHOSPHATE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7;KMEI buffer
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.80 Å |
| 8OI6 Cryo-EM structure of the undecorated barbed end of filamentous beta/gamma actin 提交 2023-03-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric |
链 A
1–375(375 aa)
链 B
1–375(375 aa)
链 C
1–375(375 aa)
链 D
1–375(375 aa)
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非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.1;10 mM imidazole pH 7.1, 100 mM KCl, 2 mM MgCl2 and 1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
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分辨率 3.59 Å |
| 9FJU Structure of the DNase I- and phalloidin-bound pointed end of F-actin (conformer 1) 提交 2024-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
2–375(374 aa)
链 B
2–375(374 aa)
链 C
2–375(374 aa)
链 D
2–375(374 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7;1xKMEI plus phalloidin
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3 seconds, force 0.
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分辨率 3.84 Å |
| 9FJY Structure of the DNase I- and phalloidin-bound pointed end of F-actin (conformer 2). 提交 2024-05-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
2–375(374 aa)
链 B
2–375(374 aa)
链 C
2–375(374 aa)
链 D
2–375(374 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 PO4 PHOSPHATE ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7;1xKMEI plus phalloidin
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;3 seconds, force 0.
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分辨率 3.79 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | ACTB_BOVIN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 |