3u6x

Phage TP901-1 baseplate tripod

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BPP

Lactococcus phage TP901-1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ORF48 × 3 （Q9AZ56） BROMIDE ION × 10 water × 12	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	ORF48 × 3 （Q9AZ56） BROMIDE ION × 8 water × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9G096_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 B； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 C； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 D； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 E； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 F； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 G； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 H； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 I； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 J； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 K； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 L； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 M； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 N； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 O； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 P； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 Q； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163 作者链 R； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163

ORF48

Lactococcus phage TP901-1

UniProt Q9AZ56

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	BPP × 9 （Q9G096） BROMIDE ION × 10 water × 12	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	BPP × 9 （Q9G096） BROMIDE ION × 8 water × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9AZ56_9CAUD
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–105； UniProt 195–299 作者链 T； PDB构建体 1–105； UniProt 195–299 作者链 U； PDB构建体 1–105； UniProt 195–299 作者链 X； PDB构建体 1–105； UniProt 195–299 作者链 Y； PDB构建体 1–105； UniProt 195–299 作者链 Z； PDB构建体 1–105； UniProt 195–299

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3u6x
沉积日期 deposition_date	2011-10-13
结构标题 title	Phage TP901-1 baseplate tripod
关键词 keywords	helix/beta, receptor binding complex, phage tail baseplate, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3u6x__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3u6x__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3u6x__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.38 Å
Rg（电子密度）	45.10 Å
总 Rg	45.39 Å
原子数	13291
残基数	1782
排除体积	235170 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3u6x__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3u6x__assembly_2__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BPP
分子量 formula_weight	17303.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R
原子数 atom_count	30080

MASIKKVYRGMKNGAETINDDLEAINSELTSGGNVVHKTGDETIAGKKTFTGNVEVNGSLTLPTKSWSGELGGGIILSLRKKGTTVEYSIGGEISSSILANSNLVNRSVPNEFCPRNRCSLVGHMVGGWNAFHIDIPSSGVCQWFGPTASSGTPRGTGTYPIDH

来源 Source

来源生物 organism	Lactococcus phage TP901-1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	35345
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ORF48
分子量 formula_weight	11610.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,T,U,X,Y,Z

GFKFVLEHDSEYQPEVKVTSYKNAIGTETDGFDSGPVFGGGTIYNVPVSLSYDRQKVYVEMPKSYTLAGDIILIDDGTLLVIKETQVLCFKMSDAKITKGYVFVA

来源 Source

来源生物 organism	Lactococcus phage TP901-1
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	35345
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	BROMIDE ION
分子量 formula_weight	79.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3492

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 96 domains

SCOP 2.08 (54 domains)

结构域编号 domain_id	d3u6xa1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xa2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xa3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xb3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xc1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xc2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xc3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xd1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xd2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xd3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xe1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xe2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xe3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xf1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xf2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xf3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xg1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xg2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xg3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xh1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xh2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xh3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xi1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xi2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xi3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xj1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xj2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xj3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xk1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xk2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xk3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xl1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xl2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xl3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xm1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xm2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xm3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xn1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xn2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xn3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xo1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xo2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xo3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xp1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xp2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xp3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xq1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xq2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xq3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3u6xr1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.108 — Triple-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.108.1 — Phage fibre proteins
家族 Family family	b.108.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3u6xr2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.21 — Virus attachment protein globular domain
超家族 Superfamily superfamily	b.21.1 — Virus attachment protein globular domain
家族 Family family	b.21.1.3 — Lactophage receptor-binding protein head domain

结构域编号 domain_id	d3u6xr3
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (42 domains)

结构域编号 domain_id	3u6xA01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xB01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xC01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xD01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xE01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xF01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xF02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xG01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xG02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xH01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xI01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xI02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xJ01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xJ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xK01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xK02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xL01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xL02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xM01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xM02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xN01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xN02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xO01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xO02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xP01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xP02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xQ01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xQ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xR01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2190 —

结构域编号 domain_id	3u6xR02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1830 — Phage tail base-plate Siphoviridae RBP, head domain

结构域编号 domain_id	3u6xS00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3320 —

结构域编号 domain_id	3u6xT00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3320 —

结构域编号 domain_id	3u6xU00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3320 —

结构域编号 domain_id	3u6xX00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3320 —

结构域编号 domain_id	3u6xY00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3320 —

结构域编号 domain_id	3u6xZ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3320 —

▶

晶胞边长 a length_a	149.960 Å
晶胞边长 b length_b	237.420 Å
晶胞边长 c length_c	152.210 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	115.67 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	49.740 Å
R 因子 r_factor	0.1812
R_work r_work	0.1784
R_free r_free	0.2064

Phage TP901-1 baseplate tripod

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BPP

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ORF48

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3u6x__assembly_2__model_1

3u6x__assembly_2__model_1 | I(q)

3u6x__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 96 domains

SCOP 2.08 (54 domains)

CATH v4.4 (42 domains)

7. 引用文献 (1)

Phage TP901-1 baseplate tripod

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BPP

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ORF48

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3u6x__assembly_2__model_1

3u6x__assembly_2__model_1 | I(q)

3u6x__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 96 domains

SCOP 2.08 (54 domains)

CATH v4.4 (42 domains)

7. 引用文献 (1)