SAXSdb — 3uan

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	;2-acetamido-2-deoxy-6-O-sulfo-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranuronic acid ; × 1 ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	;2-acetamido-2-deoxy-6-O-sulfo-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose ; × 1 ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE × 1 beta-D-glucopyranuronic acid × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HS3S1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–269； UniProt 48–311 作者链 B； PDB构建体 6–269； UniProt 48–311

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3uan
沉积日期 deposition_date	2011-10-21
结构标题 title	Crystal structure of 3-O-sulfotransferase (3-OST-1) with bound PAP and heptasaccharide substrate
关键词 keywords	;sulfotransferase, heparan sulfate, alpha/beta motif, co-factor PAPS/PAP, heparan sulfate oligosaccharides, Golgi-localized, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3uan__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3uan__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3uan__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.00 Å
Rg（电子密度）	18.09 Å
总 Rg	18.90 Å
原子数	2177
残基数	256
排除体积	38546 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3uan__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3uan__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1
分子量 formula_weight	31403.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.8.2.23
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	4678

GSPNSGTASNGSTQQLPQTIIIGVRKGGTRALLEMLSLHPDVAAAENEVHFFDWEEHYSQGLGWYLTQMPFSSPHQLTVEKTPAYFTSPKVPERIHSMNPTIRLLLILRDPSERVLSDYTQVLYNHLQKHKPYPPIEDLLMRDGRLNLDYKALNRSLYHAHMLNWLRFFPLGHIHIVDGDRLIRDPFPEIQKVERFLKLSPQINASNFYFNKTKGFYCLRDSGKDRCLHESKGRAHPQVDPKLLDKLHEYFHEPNKKFFKLVGRTFDWH

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	;2-acetamido-2-deoxy-6-O-sulfo-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranuronic acid ;
分子量 formula_weight	1552.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;2-acetamido-2-deoxy-6-O-sulfo-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose-(1-4)-2-O-sulfo-alpha-L-idopyranuronic acid-(1-4)-2-deoxy-6-O-sulfo-2-(sulfoamino)-alpha-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1376.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-3'-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	beta-D-glucopyranuronic acid
分子量 formula_weight	194.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	266

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3uana_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.5 — PAPS sulfotransferase

结构域编号 domain_id	d3uanb_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.5 — PAPS sulfotransferase

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3uanA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3uanB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

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晶胞边长 a length_a	52.883 Å
晶胞边长 b length_b	62.168 Å
晶胞边长 c length_c	86.373 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	95.16 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.844 Å
最低分辨率 resolution_low	24.570 Å
R 因子 r_factor	0.1750
R_work r_work	0.1742
R_free r_free	0.2023

Crystal structure of 3-O-sulfotransferase (3-OST-1) with bound PAP and heptasaccharide substrate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3uan__assembly_1__model_1

3uan__assembly_1__model_1 | I(q)

3uan__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of 3-O-sulfotransferase (3-OST-1) with bound PAP and heptasaccharide substrate

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3uan__assembly_1__model_1

3uan__assembly_1__model_1 | I(q)

3uan__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)