|
2BRQ
Crystal structure of the filamin A repeat 21 complexed with the integrin beta7 cytoplasmic tail peptide
提交 2005-05-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 C
768–798(31 aa)
片段:RESIDUES 768-798
链 D
768–798(31 aa)
片段:RESIDUES 768-798
|
未记录
|
GSH Glutathione × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5;1.26 M SODIUM CITRATE, 0.1 M CITRIC ACID PH 5.5
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.243
|
|
3V4V
crystal structure of a4b7 headpiece complexed with Fab ACT-1 and RO0505376
提交 2011-12-15
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
20–512(493 aa)
片段:unp residues 20-512
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 5
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6
TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
0DU N-(2,6-dichlorobenzoyl)-4-[1,6-dimethyl-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,2-dihydropyridin-3-yl]-L-phenylalanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.1 M NaCl, 8-10% PEG 20,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.231
|
|
3V4V
crystal structure of a4b7 headpiece complexed with Fab ACT-1 and RO0505376
提交 2011-12-15
|
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
其他组合
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 D
20–512(493 aa)
片段:unp residues 20-512
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 5
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5
MG MAGNESIUM ION × 1
0DU N-(2,6-dichlorobenzoyl)-4-[1,6-dimethyl-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,2-dihydropyridin-3-yl]-L-phenylalanine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;277 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.1 M NaCl, 8-10% PEG 20,000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.231
|
|
8ZJF
Cryo-EM structure of human integrin alpha-E beta-7
提交 2024-05-14
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
2–798(797 aa)
|
未记录
|
MG MAGNESIUM ION × 1
CA CALCIUM ION × 2
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.70 Å
|
|
9P95
CryoEM structure of integrin alpha4beta7 bound to MAdCAM-1
提交 2025-06-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–723(723 aa)
|
未记录
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3
CA CALCIUM ION × 3
MN MANGANESE (II) ION × 3
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;0.05% CHAPS added immediately before vitrification
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.05 Å
|
|
9P96
CryoEM structure of the apo integrin alpha4beta7
提交 2025-06-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
101–473(373 aa)
|
未记录
|
CA CALCIUM ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å
|
|
9P97
CryoEM structure of the closed integrin alphaEbeta7 bound to fab LF61
提交 2025-06-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–723(723 aa)
|
未记录
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3
CA CALCIUM ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.92 Å
|
|
9P98
CryoEM structure of the open integrin alphaEbeta7 bound to fab LF61
提交 2025-06-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 B
1–723(723 aa)
|
未记录
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3
CA CALCIUM ION × 6
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.93 Å
|
|
9P99
CryoEM structure of integrin alphaEbeta7 bound to E-cadherin
提交 2025-06-24
|
构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
|
链 B
1–723(723 aa)
|
未记录
|
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3
CA CALCIUM ION × 3
MN MANGANESE (II) ION × 4
|
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.37 Å
|