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4a2x

Structure of duck RIG-I C-terminal domain (CTD) with 14-mer dSRNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

RETINOIC ACID INDUCIBLE PROTEIN I

ANAS PLATYRHYNCHOS

UniProt D3TI84

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 2 RNA 2 5'-R(*GP*GP*GP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*AP*CP*GP*CP*GP)-3' × 1 5'-R(*CP*GP*CP*GP*UP*UP*GP*UP*UP*CP*UP*CP*CP*CP)-3' × 1 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致
2 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 2 RNA 2 5'-R(*GP*GP*GP*AP*GP*AP*AP*CP*AP*AP*CP*GP*CP*GP)-3' × 1 5'-R(*CP*GP*CP*GP*UP*UP*GP*UP*UP*CP*UP*CP*CP*CP)-3' × 1 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
4a2p 4a2q 4a2q 4a2q 4a2q 4a2v 4a2w 4a2w

共 8 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
4a2x 4a2x 4a36 4a36 9tkv 9tl1 9tm6

共 7 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 D3TI84_ANAPL
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–131； UniProt 806–933 作者链 B； PDB构建体 4–131； UniProt 806–933 作者链 C； PDB构建体 4–131； UniProt 806–933 作者链 D； PDB构建体 4–131； UniProt 806–933

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4a2x
沉积日期 deposition_date2011-09-29
结构标题 titleStructure of duck RIG-I C-terminal domain (CTD) with 14-mer dSRNA
关键词 keywordsRNA BINDING PROTEIN-RNA COMPLEX, SUPERFAMILY 2 RNA HELICASE, ATP AND DSRNA BINDING, ANTIVIRAL SIGNALLING PATHWAY; RNA BINDING PROTEIN/RNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4a2x__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4a2x__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4a2x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）24.60 Å
Rg（电子密度）25.46 Å
总 Rg25.84 Å
原子数2575
残基数268
排除体积43947 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4a2x__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4a2x__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id4a2xA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain
结构域编号 domain_id4a2xB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain
结构域编号 domain_id4a2xC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain
结构域编号 domain_id4a2xD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RIG-I-like receptor, C-terminal regulatory domain
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7. 引用文献 (1)