BACILLUS SUBTILIS SUBSP. SUBTILIS STR. 168
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | (5R)-5-[(1S,2R)-1-formyl-2-hydroxypropyl]-3-[(2-{[(E)-iminomethyl]amino}ethyl)sulfanyl]-4,5-dihydro-1H-pyrrole-2-carbox ylic acid × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | YKUD_BACSU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–167； UniProt 2–164 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
| 条目编号 entry_id | 4a52 |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-10-24 |
| 结构标题 title | NMR structure of the imipenem-acylated L,D-transpeptidase from Bacillus subtilis |
| 关键词 keywords | TRANSFERASE, PEPTIDOGLYCAN, ANTIBIOTIC RESISTANCE, CYSTEINE PROTEASE; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 14 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.04 Å |
| Rg（电子密度） | 15.79 Å |
| 总 Rg | 16.96 Å |
| 原子数 | 2498 |
| 残基数 | 169 |
| 排除体积 | 23249 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 4a52__assembly_1__model_1 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 4a52__assembly_1__model_2 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 4a52__assembly_1__model_3 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 4a52__assembly_1__model_4 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 4a52__assembly_1__model_5 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 4a52__assembly_1__model_6 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 4a52__assembly_1__model_7 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 4a52__assembly_1__model_8 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 4a52__assembly_1__model_9 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 4a52__assembly_1__model_10 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 11 | 4a52__assembly_1__model_11 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 12 | 4a52__assembly_1__model_12 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 13 | 4a52__assembly_1__model_13 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 14 | 4a52__assembly_1__model_14 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 15 | 4a52__assembly_1__model_15 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 16 | 4a52__assembly_1__model_16 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 17 | 4a52__assembly_1__model_17 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 18 | 4a52__assembly_1__model_18 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 19 | 4a52__assembly_1__model_19 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 20 | 4a52__assembly_1__model_20 |
monomeric （1） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | d4a52a1 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.7 — LysM domain |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.7.1 — LysM domain |
| 家族 Family family | d.7.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d4a52a2 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.160 — L,D-transpeptidase catalytic domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.160.1 — L,D-transpeptidase catalytic domain-like |
| 家族 Family family | b.160.1.1 — L,D-transpeptidase catalytic domain-like |
| 结构域编号 domain_id | d4a52a3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d4a52a4 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 4a52A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 350 — Membrane-bound Lytic Murein Transglycosylase D; Chain A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — LysM domain |
| 结构域编号 domain_id | 4a52A02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 440 — L,D-transpeptidase catalytic domain-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — L,D-transpeptidase catalytic domain-like |