4a79

Crystal structure of human monoamine oxidase B (MAO B) in complex with pioglitazone

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AMINE OXIDASE [FLAVIN-CONTAINING] B

HOMO SAPIENS

UniProt P27338

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 (5R)-5-{4-[2-(5-ethylpyridin-2-yl)ethoxy]benzyl}-1,3-thiazolidine-2,4-dione × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AOFB_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–520; UniProt 1–520 作者链 B; PDB构建体 1–520; UniProt 1–520

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4a79
沉积日期 deposition_date2011-11-11
结构标题 titleCrystal structure of human monoamine oxidase B (MAO B) in complex with pioglitazone
关键词 keywords;OXIDOREDUCTASE, ANTI-DIABETES DRUG, PARKINSON'S DISEASE, NEURODEGENERATION ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4a79__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4a79__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4a79__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)30.40 Å
Rg(电子密度)29.72 Å
总 Rg30.44 Å
原子数8070
残基数993
排除体积144130 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4a79__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd4a79a1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyc.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family familyc.3.1.2 — FAD-linked reductases, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd4a79a2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.16 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyd.16.1 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
家族 Family familyd.16.1.5 — L-aminoacid/polyamine oxidase
结构域编号 domain_idd4a79b1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.3 — FAD/NAD(P)-binding domain
超家族 Superfamily superfamilyc.3.1 — FAD/NAD(P)-binding domain
家族 Family familyc.3.1.2 — FAD-linked reductases, N-terminal domain
结构域编号 domain_idd4a79b2
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.16 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamilyd.16.1 — FAD-linked reductases, C-terminal domain
家族 Family familyd.16.1.5 — L-aminoacid/polyamine oxidase

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id4a79A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — FAD/NAD(P)-binding domain
结构域编号 domain_id4a79A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology660 — Polyamine Oxidase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id4a79A03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology405 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor, domain 1
结构域编号 domain_id4a79B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — FAD/NAD(P)-binding domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — FAD/NAD(P)-binding domain
结构域编号 domain_id4a79B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology660 — Polyamine Oxidase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id4a79B03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology405 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Guanine Nucleotide Dissociation Inhibitor, domain 1

7. 引用文献 (1)