SAXSdb — 4bcl

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BACTERIOCHLOROPHYLL A PROTEIN

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	BACTERIOCHLOROPHYLL A × 21 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BCPA_PROAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–366； UniProt 1–366

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4bcl
沉积日期 deposition_date	1998-04-17
结构标题 title	FMO protein from Prosthecochloris aestuarii 2K at Room Temperature
关键词 keywords	ELECTRON TRANSPORT, EXCITATION ENERGY TRANSFER, REACTION CENTER; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4bcl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4bcl__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4bcl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	31.37 Å
Rg（电子密度）	29.58 Å
总 Rg	30.55 Å
原子数	9546
残基数	1050
排除体积	172830 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4bcl__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BACTERIOCHLOROPHYLL A PROTEIN
分子量 formula_weight	40282.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3304

ALFGTKDTTTAHSDYEIILEGGSSSWGQVKGRAKVNVPAAIPLLPTDCNIRIDAKPLDAQKGVVRFTTKIESVVDSVKNTLNVEVDIANETKDRRIAVGEGSLSVGDFSHSFSFEGSVVNMYYYRSDAVRRNIPNPIYMQGRQFHDILMKVPLDNNDLVDTWEGFQQSISGGGANFGDWIREFWFIGPAFAAINEGGQRISPIVVNSSNVEGGEKGPVGVTRWKFSHAGSGVVDSISRWTELFPVEQLNKPASIEGGFRSDSQGIEVKVDGNLPGVSRDAGGGLRRILNHPLIPLVHHGMVGKFNDFTVDTQLKIVLPKGYKIRYAAPQFRSQNLEEYRWSGGAYARWVEHVCKGGTGQFEVLYAQ

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	BACTERIOCHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	911.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	122

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4bcla_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.75 — Bacteriochlorophyll A protein
超家族 Superfamily superfamily	b.75.1 — Bacteriochlorophyll A protein
家族 Family family	b.75.1.1 — Bacteriochlorophyll A protein

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4bclA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	50 — Clam
拓扑 Topology topology	10 — Bacteriochlorophyll-a Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Bacteriochlorophyll A

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7. 引用文献 (11)

;Refinement of the Structure of a Water-Soluble Antenna Complex from Green Photosynthetic Bacteria by Incorporation of the Chemically Determined Amino Acid Sequence ;

Photosynthetic Reaction Center (1993)

PMID: -1 PRIMARY

;Structure and X-Ray Amino Acid Sequence of a Bacteriochlorophyll a Protein from Prosthecochloris Aestuarii Refined at 1.9 A Resolution ;

J.Mol.Biol. (1986)

Structural Studies of a Bacteriochlorophyll-Containing Protein

Chem.Scr. (1983)

Lipid-Protein Interactions in a Bacteriochlorophyll-Containing Protein

Lipid-Protein Interactions (1982)

Structure of a Green Bacteriochlorophyll Protein

Acc.Chem.Res. (1980)

Structure of a Bacteriochlorophyll A-Protein from the Green Photosynthetic Bacterium Prosthecochloris Aestuarii

J.Mol.Biol. (1979)

Bacteriochlorophyll A-Protein from Green Bacteria

The Photosynthetic Bacteria (1978)

Atomic Coordinates for the Chlorophyll Core of a Bacteriochlorophyll A-Protein from Green Photosynthetic Bacteria

Biochem.Biophys.Res.Commun. (1977)

;An Evaluation of Electron Micrographs of Bacteriochlorophyll A-Protein Crystals in Terms of the Structure Determined by X-Ray Crystallography ;

J.Ultrastruct.Res. (1977)

Structure of a Bacteriochlorophyll A-Protein from Prosthecochloris Aestuarii

BROOKHAVEN SYMP.BIOL. (1976)

Chlorophyll Arrangement in a Bacteriochlorophyll Protein from Chlorobium Limicola

Nature (1975)

晶胞边长 a length_a	111.900 Å
晶胞边长 b length_b	111.900 Å
晶胞边长 c length_c	98.300 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 63
空间群编号 int_tables_number	173
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1780
R_work r_work	—
R_free r_free	—

FMO protein from Prosthecochloris aestuarii 2K at Room Temperature

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BACTERIOCHLOROPHYLL A PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4bcl__assembly_1__model_1

4bcl__assembly_1__model_1 | I(q)

4bcl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (11)

FMO protein from Prosthecochloris aestuarii 2K at Room Temperature

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BACTERIOCHLOROPHYLL A PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4bcl__assembly_1__model_1

4bcl__assembly_1__model_1 | I(q)

4bcl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (11)