4bd8

Bax domain swapped dimer induced by BimBH3 with CHAPS

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 90.6 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

APOPTOSIS REGULATOR BAX

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–171 链 B； UniProt 1–171	片段：RESIDUES 1-171 突变：YES	PR PRASEODYMIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.22 Å R-free 0.256
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–171 链 D； UniProt 1–171	片段：RESIDUES 1-171 突变：YES	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.22 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4BD8	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1F16 SOLUTION STRUCTURE OF A PRO-APOPTOTIC PROTEIN BAX 提交 2000-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 AMBIENT NMR样品组成 1MM BAX U-15N,13C; 10mM TRIS-ACETATE PH 6.0 2MM DTT	分辨率未提供
2K7W BAX Activation is Initiated at a Novel Interaction Site 提交 2008-08-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.1-0.2 mM [U-99% 15N] protein, 0.1-0.2 mM peptide, 90% H2O/10%D20 \| 90% H2O/10%D20	分辨率未提供
2LR1 Structural Mechanism for Bax Inhibition by Cytomegalovirus Protein vMIA 提交 2012-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.2；310 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient NMR样品组成 0.1 mM protein_1, 0.1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_2, 20 mM potassium phosphate, 5 M [U-100% 2H] D2O, 50 M H2O, DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.1 mM [U-100% 15N] protein_1, 0.1 mM protein_2, 20 mM potassium phosphate, 5 M [U-100% 2H] D2O, 50 M H2O, DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3PK1 Crystal structure of Mcl-1 in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 48–81（34 aa）片段：BH3 domain, UNP residues 48-81	未记录	CD CADMIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M Sodium Acetate, 0.1M Hepes, 25mM Cadmium Sulfate, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.49 Å R-free 0.245
3PK1 Crystal structure of Mcl-1 in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 48–81（34 aa）片段：BH3 domain, UNP residues 48-81	未记录	CD CADMIUM ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；1M Sodium Acetate, 0.1M Hepes, 25mM Cadmium Sulfate, 5mM TCEP, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.49 Å R-free 0.245
3PL7 Crystal structure of Bcl-xL in complex with the BaxBH3 domain 提交 2010-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 48–81（34 aa）片段：BH3 domain, UNP residues 48-81	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；13% Peg 6000, 0.2M CaCl2, 0.1M Tris, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.61 Å R-free 0.249
4BD2 Bax domain swapped dimer in complex with BidBH3 提交 2012-10-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.4 M SODIUM CITRATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 5.75	分辨率 2.21 Å R-free 0.227
4BD6 Bax domain swapped dimer in complex with BaxBH3 提交 2012-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 C 48–81（34 aa）片段：RESIDUES 48-81	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.4 M SODIUM CITRATE, 0.1 M SODIUM CACODYLATE PH 5.75	分辨率 2.49 Å R-free 0.285
4BD7 Bax domain swapped dimer induced by octylmaltoside 提交 2012-10-05	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 B 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES 突变：YES	PR PRASEODYMIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
4BD7 Bax domain swapped dimer induced by octylmaltoside 提交 2012-10-05	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171 链 D 1–171（171 aa）片段：RESIDUES 1-171	突变：YES 突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.8 M NH4SO4, 0.1 M HEPES PH 6.5, 10 MM PRCL3	分辨率 2.80 Å R-free 0.274
4BDU Bax BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2012-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128 链 B 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10% PEG3350, 20% MPD, 0.5% CHAPS, 0.1 M TRIS PH 8.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.246
4BDU Bax BH3-in-Groove dimer (GFP) 提交 2012-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128 链 D 53–128（76 aa）片段：BAX RESIDUES 53-128	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 10% PEG3350, 20% MPD, 0.5% CHAPS, 0.1 M TRIS PH 8.0	分辨率 3.00 Å R-free 0.246
4S0O Crystal Structure of the Autoinhibited Dimer of Pro-apoptotic BAX (I) 提交 2015-01-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）链 B 1–192（192 aa）	突变：P168G 突变：P168G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；1.6 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS , PH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 293K	分辨率 1.90 Å R-free 0.265
4S0P Crystal Structure of the Autoinhibited Dimer of Pro-apoptotic BAX (II) 提交 2015-01-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：G67R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；1.6 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.25 Å R-free 0.270
4S0P Crystal Structure of the Autoinhibited Dimer of Pro-apoptotic BAX (II) 提交 2015-01-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–192（192 aa）	突变：G67R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；1.6 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M BIS-TRIS, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.25 Å R-free 0.270
4UF2 Deerpox virus DPV022 in complex with Bax BH3 提交 2014-12-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 50–77（28 aa）片段：BH3, UNP RESIDUES 50-77	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；20% PEG 6000, 0.2M MES PH 6.0, 0,2M AMMONIUM SULPHATE.	分辨率 3.00 Å R-free 0.274
4ZIE Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BimBH3 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–166（166 aa）	突变：C62S C126S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；PEG6000, bicine	分辨率 1.80 Å R-free 0.229
4ZIF Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BimBH3mini 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–166（166 aa）	突变：C62S C126S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate	分辨率 2.40 Å R-free 0.255
4ZIG Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BidBH3mini 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–166（166 aa）	突变：C62S, C126S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate	分辨率 2.20 Å R-free 0.229
4ZIH Crystal Structure of core/latch dimer of Bax in complex with BimBH3mini 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–164（164 aa）	突变：C62S, C126S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, Sodium cacodylate	分辨率 2.50 Å R-free 0.233
4ZII Crystal Structure of core/latch dimer of BaxI66A in complex with BidBH3 提交 2015-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–170（170 aa）	突变：C62S, C126S	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；Tri-sodium citrate, sodium cacodylate	分辨率 2.19 Å R-free 0.223
5W5X Crystal structure of BAXP168G in complex with an activating antibody 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000, HEPES	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
5W5X Crystal structure of BAXP168G in complex with an activating antibody 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 4000, HEPES	分辨率 2.50 Å R-free 0.243
5W5Z Crystal structure of BAXP168G in complex with an activating antibody at high resolution 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 32–192（161 aa）片段：UNP residues 32-192	突变：C62S C126S P168G	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Peg4000, MES	分辨率 2.00 Å R-free 0.268
5W60 Crystal structure of BAXP168G monomer cryo-protected with ethylene glycol 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium sulfate, TRIS	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
5W61 Crystal structure of BAXP168G monomer co-crystallized with glycerol 提交 2017-06-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：C62S C126S P168G	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium sulfate, bis-TRIS, glycerol	分辨率 2.30 Å R-free 0.252
6EB6 Crystal structure of BAX W139A monomer 提交 2018-08-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–192（192 aa）	突变：W139A	FMT FORMIC ACID × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Sodium formate, TCEP	分辨率 2.02 Å R-free 0.201
6L8V membrane-bound Bax helix2-helix5 domain 提交 2019-11-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	突变：C62S, C126S 突变：C62S, C126S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM U-98% 15N;U-98% 13C;U-98% 2H human Bax core domain, 100 mM DMPC, 140 mM DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM U-98% 15N;U-98% 13C Bax a_2_a_5, 100 mM [U-2H] DMPC, 160 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM U-98% 15N;U-2H Bax a_2_a_5, 120 mM [U-2H] DMPC, 200 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM U-98% 15N;U-2H Bax a_2_a_5, 100 mM DMPC, 160 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM U-98% 15N;U-15% 13C Bax a_2_a_5, 80 mM DMPC, 140 mM DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM U-98% 13C Bax a_2_a_5, 120 mM [U-2H] DMPC, 200 mM [U-2H] DHPC, 10 mM MES, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6L95 transmembrane-domain of Bax 提交 2019-11-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 166–192（27 aa）链 B 166–192（27 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 1 NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 15N;U-98% 13C;U-98% 2H] human bax helix9, 0.1 % DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.6 mM [U-98% 15N;U-98% 13C] human bax helix9, 0.1 % [U-2H] DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3 mM [U-98% 15N;U-2H] human bax helix9, 0.1 % [U-2H] DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.4 mM [U-98% 15N;U-15% 13C] human bax helix9, 0.1 % DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.3 mM [U-98% 13C] human bax helix9, 0.1 % [U-2H] DPC, 25 mM HEPES, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
6TRR Structural insight into tanapoxvirus mediated inhibition of apoptosis 提交 2019-12-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 50–77（28 aa）	未记录	NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium Chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0 20% PEG 6000	分辨率 2.12 Å R-free 0.254
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 J 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
6XY6 Structural insight into sheep-pox virus mediated inhibition of apoptosis 提交 2020-01-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 P 50–77（28 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；1.0 M Lithium chloride, 0.1 M Citrate pH 4.0, 20% w/vPEG 6000	分辨率 2.91 Å R-free 0.288
7ADT Orf virus Apoptosis inhibitor ORFV125 提交 2020-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 50–77（28 aa）链 U 50–77（28 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 41	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2 M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 25% PEG 3350	分辨率 2.21 Å R-free 0.259
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 53–128（76 aa）链 F 53–128（76 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8G1T Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P21 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 53–128（76 aa）链 H 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.44 M sodium citrate, 0.01 M TCEP	分辨率 2.09 Å R-free 0.248
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 53–128（76 aa）链 R 53–128（76 aa）链 S 53–128（76 aa）链 T 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 53–128（76 aa）链 H 53–128（76 aa）链 U 53–128（76 aa）链 V 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 53–128（76 aa）链 F 53–128（76 aa）链 I 53–128（76 aa）链 J 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 53–128（76 aa）链 L 53–128（76 aa）链 M 53–128（76 aa）链 N 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 O 53–128（76 aa）链 P 53–128（76 aa）链 W 53–128（76 aa）链 X 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Y 53–128（76 aa）链 Z 53–128（76 aa）链 a 53–128（76 aa）链 b 53–128（76 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 c 53–128（76 aa）链 d 53–128（76 aa）链 e 53–128（76 aa）链 f 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPE Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - tetrameric fraction P31 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 g 53–128（76 aa）链 h 53–128（76 aa）链 i 53–128（76 aa）链 j 53–128（76 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M NaMES pH 5.6, 27% PEG MME550, 0.01 M Zinc sulfate	分辨率 2.30 Å R-free 0.256
8SPF Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - hexameric fraction with 2-stearoyl lysoPC 提交 2023-05-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）链 E 53–128（76 aa）链 F 53–128（76 aa）	未记录	1GP SN-GLYCEROL-1-PHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 OCT N-OCTANE × 1 D12 DODECANE × 1 DD9 nonane × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M Hepes pH 7.5, 1.4 M trisodium citrate	分辨率 2.20 Å R-free 0.305
8SPZ Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - hexameric fraction with dioctanoyl phosphatidylserine 提交 2023-05-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.09 M DL maleate-MES-Tris pH 7, 2.25 M ammonium sulfate, 0.1 M trisodium citrate	分辨率 2.40 Å R-free 0.341
8SPZ Crystal structure of Bax core domain BH3-groove dimer - hexameric fraction with dioctanoyl phosphatidylserine 提交 2023-05-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.09 M DL maleate-MES-Tris pH 7, 2.25 M ammonium sulfate, 0.1 M trisodium citrate	分辨率 2.40 Å R-free 0.341
8SRX Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with lysoPC 提交 2023-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	K6G [(2~{R})-2-oxidanyl-3-[oxidanyl-[2-(trimethyl-$l^{4}-azanyl)ethoxy]phosphoryl]oxy-propyl] hexadecanoate × 3 ZN ZINC ION × 1 NA SODIUM ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；0.1 M Bis-tris chloride pH 5.5, 25% PEG 3350, 200 mM sodium acetate	分辨率 2.09 Å R-free 0.265
8SRY Crystal structure of BAK-BAX heterodimer with C12E8 提交 2023-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	未记录	PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 N8E 3,6,9,12,15-PENTAOXATRICOSAN-1-OL × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；281 K；30% PEG MME 2000, 0.1 M potassium thiocyanate, 0.01% C12E8	分辨率 2.40 Å R-free 0.248
8SVK Crystal structure of Bax D71N core domain BH3-groove dimer 提交 2023-05-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 53–128（76 aa）链 B 53–128（76 aa）	突变：C62S, D71N, C126S 突变：C62S, D71N, C126S	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.287
8SVK Crystal structure of Bax D71N core domain BH3-groove dimer 提交 2023-05-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 53–128（76 aa）链 D 53–128（76 aa）	突变：C62S, D71N, C126S 突变：C62S, D71N, C126S	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M sodium citrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.287
9IXU Overall reconstruction of the Bax line 提交 2024-07-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–192（192 aa）链 B 1–192（192 aa）链 C 1–192（192 aa）链 D 1–192（192 aa）链 E 1–192（192 aa）链 F 1–192（192 aa）链 G 1–192（192 aa）链 H 1–192（192 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å

共 35 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BAX_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171 作者链 B； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171 作者链 C； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171 作者链 D； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4bd8
沉积日期 deposition_date	2012-10-05
结构标题 title	Bax domain swapped dimer induced by BimBH3 with CHAPS
关键词 keywords	APOPTOSIS, PROGRAMMED CELL DEATH; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	32.11 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	30.90 Å
零角强度 I(0) i0	61457000.00
分子量 molecular_weight	63138.0 kDa
排除体积 excluded_volume	79505 Å³
包络体积 envelope_volume	107180 Å³
水化壳体积 shell_volume	29805 Å³
包络直径 envelope_diameter	98.0 Å
壳层 Rg shell_rg	37.31 Å
包络 Rg envelope_rg	29.62 Å
形状 Rg shape_rg	30.92 Å
总 Rg total_rg	31.43 Å
总原子数 total_atoms	4438
残基数 n_residues	566
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	90.6 Å
Rg (实空间) rg_real	31.92 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.65 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.1460e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0700e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	32.01 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	61460000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8885
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	49.9 Å
偏度 Skewness skewness	-0.055
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.828
角度范围 angular_range	— – 0.2450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	52530000.0000
实空间数据点数 n_real_points	50
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.898; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.866

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	APOPTOSIS REGULATOR BAX
分子量 formula_weight	19182.7 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	4664

MDGSGEQPRGGGPTSSEQIMKTGALLLQGFIQDRAGRMGGEAPELALDPVPQDASTKKLSESLKRIGDELDSNMELQRMIAAVDTDSPREVFFRVAADMFSDGNFNWGRVVALFYFASKLVLKALSTKVPELIRTIMGWTLDFLRERLLGWIQDQGGWDGLLSYFGTPTWQGSS

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PRASEODYMIUM ION
分子量 formula_weight	140.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	226

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d4bd8a_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4bd8b_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4bd8c_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d4bd8d_
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.1 — Toxins' membrane translocation domains
超家族 Superfamily superfamily	f.1.4 — Bcl-2 inhibitors of programmed cell death
家族 Family family	f.1.4.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4bd8A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	4bd8B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	4bd8C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

结构域编号 domain_id	4bd8D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	437 — Apoptosis Regulator Bcl-x
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Blc2-like

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	142.947 Å
晶胞边长 b length_b	142.947 Å
晶胞边长 c length_c	86.712 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	H 3
空间群编号 int_tables_number	146
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.220 Å
最低分辨率 resolution_low	19.823 Å
R 因子 r_factor	0.2003
R_work r_work	0.1972
R_free r_free	0.2555

fit	/app/data/saxs_computation/bd/4bd8/4bd8.fit
pddf	/app/data/pr_computation/bd/4bd8/4bd8.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/bd/4bd8/4bd8.dat