4d10

Crystal structure of the COP9 signalosome

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSN1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–480； UniProt 12–487 作者链 I； PDB构建体 5–480； UniProt 12–487

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2

HOMO SAPIENS

UniProt P61201

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSN2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 5–447； UniProt 1–443 作者链 J； PDB构建体 5–447； UniProt 1–443

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3

HOMO SAPIENS

UniProt Q9UNS2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSN3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–423； UniProt 1–423 作者链 K； PDB构建体 1–423； UniProt 1–423

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4

HOMO SAPIENS

UniProt Q9BT78

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSN4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 5–410； UniProt 1–406 作者链 L； PDB构建体 5–410； UniProt 1–406

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5

HOMO SAPIENS

UniProt Q92905

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSN5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334 作者链 M； PDB构建体 1–334； UniProt 1–334

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6

HOMO SAPIENS

UniProt Q7L5N1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSN6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 5–331； UniProt 1–327 作者链 N； PDB构建体 5–331； UniProt 1–327

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A

HOMO SAPIENS

UniProt Q9UBW8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8 × 1 （Q99627） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CSN7A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 5–222； UniProt 1–218 作者链 O； PDB构建体 5–222； UniProt 1–218

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8

HOMO SAPIENS

UniProt Q99627

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） ZINC ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1 × 1 （Q13098） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2 × 1 （P61201） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3 × 1 （Q9UNS2） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4 × 1 （Q9BT78） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5 × 1 （Q92905） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6 × 1 （Q7L5N1） COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A × 1 （Q9UBW8） ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CSN8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 5–212； UniProt 2–209 作者链 P； PDB构建体 5–212； UniProt 2–209

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4d10
沉积日期 deposition_date	2014-04-30
结构标题 title	Crystal structure of the COP9 signalosome
关键词 keywords	SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4d10__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4d10__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4d10__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	51.95 Å
Rg（电子密度）	51.99 Å
总 Rg	52.08 Å
原子数	19265
残基数	2408
排除体积	344630 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4d10__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4d10__assembly_2__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1
分子量 formula_weight	54222.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,I
原子数 atom_count	39976

GGGRGAVEPMQIDVDPQEDPQNAPDVNYVVENPSLDLEQYAASYSGLMRIERLQFIADHCPTLRVEALKMALSFVQRTFNVDMYEEIHRKLSEATRELQNAPDAIPESGVEPPALDTAWVEATRKKALLKLEKLDTDLKNYKGNSIKESIRRGHDDLGDHYLDCGDLSNALKCYSRARDYCTSAKHVINMCLNVIKVSVYLQNWSHVLSYVSKAESTPEIAEQRGERDSQTQAILTKLKCAAGLAELAARKYKQAAKCLLLASFDHCDFPELLSPSNVAIYGGLCALATFDRQELQRNVISSSSFKLFLELEPQVRDIIFKFYESKYASCLKMLDEMKDNLLLDMYLAPHVRTLYTQIRNRALIQYFSPYVSADMHRMAAAFNTTVAALEDELTQLILEGLISARVDSHSKILYARDVDQRSTTFEKSLLMGKEFQRRAKAMMLRAAVLRNQIHVKSPPREGSQGELTPANSQSRMSTNM

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	51992.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,J

GGGRMSDMEDDFMCDDEEDYDLEYSEDSNSEPNVDLENQYYNSKALKEDDPKAALSSFQKVLELEGEKGEWGFKALKQMIKINFKLTNFPEMMNRYKQLLTYIRSAVTRNYSEKSINSILDYISTSKQMDLLQEFYETTLEALKDAKNDRLWFKTNTKLGKLYLEREEYGKLQKILRQLHQSCQTDDGEDDLKKGTQLLEIYALEIQMYTAQKNNKKLKALYEQSLHIKSAIPHPLIMGVIRECGGKMHLREGEFEKAHTDFFEAFKNYDESGSPRRTTCLKYLVLANMLMKSGINPFDSQEAKPYKNDPEILAMTNLVSAYQNNDITEFEKILKTNHSNIMDDPFIREHIEELLRNIRTQVLIKLIKPYTRIHIPFISKELNIDVADVESLLVQCILDNTIHGRIDQVNQLLELDHQKRGGARYTALDKWTNQLNSLNQAVVSKLA

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3
分子量 formula_weight	47924.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,K

MASALEQFVNSVRQLSAQGQMTQLCELINKSGELLAKNLSHLDTVLGALDVQEHSLGVLAVLFVKFSMPSVPDFETLFSQVQLFISTCNGEHIRYATDTFAGLCHQLTNALVERKQPLRGIGILKQAIDKMQMNTNQLTSIHADLCQLCLLAKCFKPALPYLDVDMMDICKENGAYDAKHFLCYYYYGGMIYTGLKNFERALYFYEQAITTPAMAVSHIMLESYKKYILVSLILLGKVQQLPKYTSQIVGRFIKPLSNAYHELAQVYSTNNPSELRNLVNKHSETFTRDNNMGLVKQCLSSLYKKNIQRLTKTFLTLSLQDMASRVQLSGPQEAEKYVLHMIEDGEIFASINQKDGMVSFHDNPEKYNNPAMLHNIDQEMLKCIELDERLKAMDQEITVNPQFVQKSMGSQEDDSGNKPSSYS

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4
分子量 formula_weight	46651.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,L

GGGRMAAAVRQDLAQLMNSSGSHKDLAGKYRQILEKAIQLSGAEQLEALKAFVEAMVNENVSLVISRQLLTDFCTHLPNLPDSTAKEIYHFTLEKIQPRVISFEEQVASIRQHLASIYEKEEDWRNAAQVLVGIPLETGQKQYNVDYKLETYLKIARLYLEDDDPVQAEAYINRASLLQNESTNEQLQIHYKVCYARVLDYRRKFIEAAQRYNELSYKTIVHESERLEALKHALHCTILASAGQQRSRMLATLFKDERCQQLAAYGILEKMYLDRIIRGNQLQEFAAMLMPHQKATTADGSSILDRAVIEHNLLSASKLYNNITFEELGALLEIPAAKAEKIASQMITEGRMNGFIDQIDGIVHFETREALPTWDKQIQSLCFQVNNLLEKISQTAPEWTAQAMEAQMAQ

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5
分子量 formula_weight	37621.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,M

MAASGSGMAQKTWELANNMQEAQSIDEIYKYDKKQQQEILAAKPWTKDHHYFKYCKISALALLKMVMHARSGGNLEVMGLMLGKVDGETMIIMDSFALPVEGTETRVNAQAAAYEYMAAYIENAKQVGRLENAIGWYHSHPGYGCWLSGIDVSTQMLNQQFQEPFVAVVIDPTRTISAGKVNLGAFRTYPKGYKPPDEGPSEYQTIPLNKIEDFGVHCKQYYALEVSYFKSSLDRKLLELLWNKYWVNTLSSSSLLTNADYTTGQVFDLSEKLEQSEAQLGRGSFMLGLETHDRKSEDKLAKATRDSCKTTIEAIHGLMSQVIKDKLFNQINIS

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6
分子量 formula_weight	36531.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,N

GGGRMAAAAAAAAATNGTGGSSGMEVDAAVVPSVMACGVTGSVSVALHPLVILNISDHWIRMRSQEGRPVQVIGALIGKQEGRNIEVMNSFELLSHTVEEKIIIDKEYYYTKEEQFKQVFKELEFLGWYTTGGPPDPSDIHVHKQVCEIIESPLFLKLNPMTKHTDLPVSVFESVIDIINGEATMLFAELTYTLATEEAERIGVDHVARMTATGSGENSTVAEHLIAQHSAIKMLHSRVKLILEYVKASEAGEVPFNHEILREAYALCHCLPVLSTDKFKTDFYDQCNDVGLMAYLGTITKTCNTMNQFVNKFNVLYDRQGIGRRMRGLFF

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A
分子量 formula_weight	24649.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,O

GGGRMSAEVKVTGQNQEQFLLLAKSAKGAALATLIHQVLEAPGVYVFGELLDMPNVRELAESDFASTFRLLTVFAYGTYADYLAEARNLPPLTEAQKNKLRHLSVVTLAAKVKCIPYAVLLEALALRNVRQLEDLVIEAVYADVLRGSLDQRNQRLEVDYSIGRDIQRQDLSAIARTLQEWCVGCEVVLSGIEEQVSRANQHKEQQLGLKQQIESEVANLKK

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8
分子量 formula_weight	23442.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,P

GGGRPVAVMAESAFSFKKLLDQCENQELEAPGGIATPPVYGQLLALYLLHNDMNNARYLWKRIPPAIKSANSELGGIWSVGQRIWQRDFPGIYTTINAHQWSETVQPIMEALRDATRRRAFALVSQAYTSIIADDFAAFVGLPVEEAVKGILEQGWQADSTTRMVLPRKPVAGALDVSFNKFIPLSEPAPVPPIPNEQQLARLTDYVAFLEN

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	4d10D02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain

结构域编号 domain_id	4d10F01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	140 — Cytidine Deaminase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytidine Deaminase, domain 2

结构域编号 domain_id	4d10N01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	140 — Cytidine Deaminase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytidine Deaminase, domain 2

▶

晶胞边长 a length_a	151.615 Å
晶胞边长 b length_b	151.615 Å
晶胞边长 c length_c	343.069 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31
空间群编号 int_tables_number	144
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.800 Å
最低分辨率 resolution_low	50.870 Å
R 因子 r_factor	0.1999
R_work r_work	0.1994
R_free r_free	0.2275

Crystal structure of the COP9 signalosome

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 7A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

COP9 SIGNALOSOME COMPLEX SUBUNIT 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4d10__assembly_1__model_1

4d10__assembly_1__model_1 | I(q)

4d10__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source