Plastocyanin A, chloroplastic
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 | 链 X； UniProt 70–168 | 片段：UNP residues 70-168 | CU1 COPPER (I) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium phosphate buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K | 分辨率 1.05 Å R-free 0.155 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 4DPA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1JXG The 1.6 A Resolution Crystal Structure of a Mutant Poplar Plastocyanin Bearing a 21-25 Engeneered Disulfide Bridge 提交 2001-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
突变：I21C, E25C | CU1 COPPER (I) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；ammonium sulfate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.205 |
| 1JXG The 1.6 A Resolution Crystal Structure of a Mutant Poplar Plastocyanin Bearing a 21-25 Engeneered Disulfide Bridge 提交 2001-09-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
70–168（99 aa）
|
突变：I21C, E25C | CU1 COPPER (I) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；ammonium sulfate, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.205 |
| 1PLC ACCURACY AND PRECISION IN PROTEIN CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS: RESTRAINED LEAST-SQUARES REFINEMENT OF THE CRYSTAL STRUCTURE OF POPLAR PLASTOCYANIN AT 1.33 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-03-11 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.33 Å |
| 1PNC ACCURACY AND PRECISION IN PROTEIN CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS: TWO INDEPENDENT REFINEMENTS OF THE STRUCTURE OF POPLAR PLASTOCYANIN AT 173K 提交 1993-09-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å |
| 1PND ACCURACY AND PRECISION IN PROTEIN CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS: TWO INDEPENDENT REFINEMENTS OF THE STRUCTURE OF POPLAR PLASTOCYANIN AT 173K 提交 1993-09-22 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å |
| 1TKW The transient complex of poplar plastocyanin with turnip cytochrome f determined with paramagnetic NMR 提交 2004-06-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 HEC HEME C × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）10 mM；压力 1
NMR测量条件
pH 6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）11 mM；压力 1
NMR样品组成
0.5 mM Cd-substituted poplar plastocyanin + 0.35 mM soluble fragment of turnip cytochrome f in oxidized state
in 10 mM sodium phosphate pH 6.0 | 94% H2O, 6% D2O
NMR样品组成
0.5 mM Cd-substituted poplar plastocyanin + 0.35 mM soluble fragment of turnip cytochrome f in reduced state
in 10 mM sodium phosphate pH 6.0 + 1 mM sodium ascorbate | 94% H2O, 6% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2PCY THE CRYSTAL STRUCTURE OF POPLAR APOPLASTOCYANIN AT 1.8-ANGSTROMS RESOLUTION. THE GEOMETRY OF THE COPPER-BINDING SITE IS CREATED BY THE POLYPEPTIDE 提交 1983-11-03 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 3PCY THE CRYSTAL STRUCTURE OF MERCURY-SUBSTITUTED POPLAR PLASTOCYANIN AT 1.9-ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1985-12-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | HG MERCURY (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 4DP7 The 1.08 Angstrom crystal structure of oxidized (CuII) poplar plastocyanin A at pH 4.0 提交 2012-02-13 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 X
70–168（99 aa）
片段：UNP residues 70-168
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium phosphate buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.08 Å R-free 0.142 |
| 4DP8 The 1.07 Angstrom crystal structure of reduced (CuI) poplar plastocyanin A at pH 4.0 提交 2012-02-13 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 X
70–168（99 aa）
片段：UNP residues 70-168
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；277 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium phosphate buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.07 Å R-free 0.165 |
| 4DP9 The 1.00 Angstrom crystal structure of oxidized (CuII) poplar plastocyanin A at pH 6.0 提交 2012-02-13 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 X
70–168（99 aa）
片段：UNP residues 70-168
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium phosphate buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.144 |
| 4DPB The 1.00 Angstrom crystal structure of oxidized (CuII) poplar plastocyanin A at pH 8.0 提交 2012-02-13 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 X
70–168（99 aa）
片段：UNP residues 70-168
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium phosphate buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.136 |
| 4DPC The 1.06 Angstrom crystal structure of reduced (CuI) poplar plastocyanin A at pH 8.0 提交 2012-02-13 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 X
70–168（99 aa）
片段：UNP residues 70-168
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；2.6 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium phosphate buffer, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.06 Å R-free 0.155 |
| 4PCY CRYSTAL STRUCTURE ANALYSES OF REDUCED (CUI) POPLAR PLASTOCYANIN AT SIX PH VALUES 提交 1986-09-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.15 Å |
| 5PCY CRYSTAL STRUCTURE ANALYSES OF REDUCED (CUI) POPLAR PLASTOCYANIN AT SIX PH VALUES 提交 1986-09-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å |
| 6PCY CRYSTAL STRUCTURE ANALYSES OF REDUCED (CUI) POPLAR PLASTOCYANIN AT SIX PH VALUES 提交 1986-09-02 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
70–168（99 aa）
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | PLAS1_POPNI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 X； PDB构建体 1–99； UniProt 70–168 |
