4dx8

ICAP1 in complex with KRIT1 N-terminus

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 119.4 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin beta-1-binding protein 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 49–200	片段：PTB domain	Krev interaction trapped protein 1 × 1 （O00522） BR BROMIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 49–200	片段：PTB domain	Krev interaction trapped protein 1 × 1 （O00522） BR BROMIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 49–200	片段：PTB domain	Krev interaction trapped protein 1 × 1 （O00522） BR BROMIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 49–200	片段：PTB domain	Krev interaction trapped protein 1 × 1 （O00522） BR BROMIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4DX8	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 S 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 U 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 W 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 13 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Y 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 14 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 a 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 15 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 c 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 16 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 e 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 17 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 g 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 18 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 i 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 19 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 k 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 20 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 m 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 21 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 o 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 22 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 2 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 23 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 s 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 24 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 u 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 25 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 1 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 26 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 y 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 27 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 3 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 28 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 5 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 29 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 0 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 30 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 4 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 31 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 q 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 32 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 w 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4DX9 ICAP1 in complex with integrin beta 1 cytoplasmic tail 提交 2012-02-27	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 Q 49–200（152 aa）片段：PTB domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2M sodium citrate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.99 Å R-free 0.312
4JIF Co-crystal structure of ICAP1 PTB domain in complex with a KRIT1 peptide 提交 2013-03-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 49–200（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；18-20%PEG3350, 0.2M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
4JIF Co-crystal structure of ICAP1 PTB domain in complex with a KRIT1 peptide 提交 2013-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 49–200（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；18-20%PEG3350, 0.2M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.226

共 2 个其他 PDB 条目、34 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ITBP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–154； UniProt 49–200 作者链 B； PDB构建体 3–154； UniProt 49–200 作者链 D； PDB构建体 3–154； UniProt 49–200 作者链 E； PDB构建体 3–154； UniProt 49–200

Krev interaction trapped protein 1

Homo sapiens

UniProt O00522

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 J； UniProt 1–198	片段：Nudix domain	Integrin beta-1-binding protein 1 × 1 （O14713） BR BROMIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 1–198	片段：Nudix domain	Integrin beta-1-binding protein 1 × 1 （O14713） BR BROMIDE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 1–198	片段：Nudix domain	Integrin beta-1-binding protein 1 × 1 （O14713） BR BROMIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252
4	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 K； UniProt 1–198	片段：Nudix domain	Integrin beta-1-binding protein 1 × 1 （O14713） BR BROMIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.06M AmSO4, 0.2M Ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.54 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4DX8	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3U7D Crystal structure of the KRIT1/CCM1 FERM domain in complex with the heart of glass (HEG1) cytoplasmic tail 提交 2011-10-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 417–736（320 aa）片段：FERM domain, residues 417-736	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；10% PEG 4000 and 100mM Citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.49 Å R-free 0.309
3U7D Crystal structure of the KRIT1/CCM1 FERM domain in complex with the heart of glass (HEG1) cytoplasmic tail 提交 2011-10-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 417–736（320 aa）片段：FERM domain, residues 417-736	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；293 K；10% PEG 4000 and 100mM Citrate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.49 Å R-free 0.309
4DXA Co-crystal structure of Rap1 in complex with KRIT1 提交 2012-02-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 420–736（317 aa）片段：FERM domain	未记录	GSP 5'-GUANOSINE-DIPHOSPHATE-MONOTHIOPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.2M KNO3, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.95 Å R-free 0.239
4HDO Crystal structure of the binary Complex of KRIT1 bound to the Rap1 GTPase 提交 2012-10-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 417–736（320 aa）片段：FERM domain (UNP residues 417-736)	未记录	GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；15% PEG2000 MME, 100 mM Tris, 100 mM potassium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 1.67 Å R-free 0.231
4HDQ Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and the Heart of Glass (HEG1) cytoplasmic tail 提交 2012-10-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 417–736（320 aa）片段：FERM domain (UNP residues 417-736)	未记录	GOL GLYCEROL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；278 K；15% PEG2000 MME, 100 mM Tris, 100 mM potassium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K	分辨率 1.95 Å R-free 0.263
4JIF Co-crystal structure of ICAP1 PTB domain in complex with a KRIT1 peptide 提交 2013-03-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 170–198（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；18-20%PEG3350, 0.2M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
4JIF Co-crystal structure of ICAP1 PTB domain in complex with a KRIT1 peptide 提交 2013-03-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 170–198（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；18-20%PEG3350, 0.2M MgCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.226
4TKN Structure of the SNX17 FERM domain bound to the second NPxF motif of KRIT1 提交 2014-05-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 225–237（13 aa）片段：UNP residues 225-237	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.9 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 5% PEG 400	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
4TKN Structure of the SNX17 FERM domain bound to the second NPxF motif of KRIT1 提交 2014-05-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 225–237（13 aa）片段：UNP residues 225-237	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.9 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 5% PEG 400	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
4TKN Structure of the SNX17 FERM domain bound to the second NPxF motif of KRIT1 提交 2014-05-27	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 225–237（13 aa）片段：UNP residues 225-237	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；1.9 M Ammonium Sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 5% PEG 400	分辨率 3.00 Å R-free 0.268
5D68 Crystal structure of KRIT1 ARD-FERM 提交 2015-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 52–529（478 aa）片段：ARD-FERM domain (UNP residues 52-529)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；0.05 M HEPES, pH 7.3, 8% ethylene glycol, 8% PEG8000	分辨率 2.91 Å R-free 0.246
5D68 Crystal structure of KRIT1 ARD-FERM 提交 2015-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 52–529（478 aa）片段：ARD-FERM domain (UNP residues 52-529)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；0.05 M HEPES, pH 7.3, 8% ethylene glycol, 8% PEG8000	分辨率 2.91 Å R-free 0.246
5D68 Crystal structure of KRIT1 ARD-FERM 提交 2015-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 52–529（478 aa）片段：ARD-FERM domain (UNP residues 52-529)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.3；298 K；0.05 M HEPES, pH 7.3, 8% ethylene glycol, 8% PEG8000	分辨率 2.91 Å R-free 0.246
6OQ3 Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and HKi2 提交 2019-04-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 417–736（320 aa）片段：FERM domain	未记录	7WO 2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20-25% PEG 3,350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl	分辨率 1.85 Å R-free 0.292
6OQ4 Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and HKi1 提交 2019-04-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 417–736（320 aa）片段：FERM domain	未记录	N0G 2-{(Z)-[(2-hydroxynaphthalen-1-yl)methylidene]amino}-N-[(1S)-1-phenylethyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20-25% PEG 3,350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl	分辨率 1.75 Å R-free 0.264
6UZK Crystal Structure of the Ternary Complex of KRIT1 bound to both the Rap1 GTPase and HKi6 提交 2019-11-15	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 417–736（320 aa）	未记录	QMA 2-hydroxy-6-methoxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20-25% PEG 3,350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl	分辨率 1.92 Å R-free 0.286
8SU8 Co-crystal structure of KRIT1 with a 1-hydroxy 2-naphthaldehyde derivative (6-(furan-2-yl)-2-hydroxy-1-naphthaldehyde). 提交 2023-05-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 419–736（318 aa）片段：FERM domain	未记录	XE2 (6P)-6-(furan-2-yl)-2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 3350, 100 mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl	分辨率 2.01 Å R-free 0.238
8T09 Co-crystal structure of KRIT1 with a 1-hydroxy 2-naphthaldehyde derivative (6-ethynyl-2-hydroxy-1-naphthaldehyde) 提交 2023-05-31	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 419–736（318 aa）片段：FERM domain	未记录	XHZ 6-ethynyl-2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20% PEG 3350, 100mM Tris, pH 8.5, 100 mM KCl	分辨率 2.15 Å R-free 0.247
8T7V Co-crystal structure of KRIT1 with a 1-hydroxy 2-naphthaldehyde derivative (6-(furan-2-yl)-2-hydroxy-1-naphthaldehyde) 提交 2023-06-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 417–736（320 aa）片段：FERM domain	未记录	ZTA (7M)-7-(furan-2-yl)-2-hydroxynaphthalene-1-carbaldehyde × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；20% PEG 3350, 100mM Tris, pH 8.5, 100mM KCl	分辨率 2.25 Å R-free 0.250
9PVG Co-crystal structure of two CCM2 PTB domains bound to a KRIT1 peptide encompassing NPxF2 and NPxF3 提交 2025-08-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 227–255（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M TrisHCl pH 7, 20% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.297
9PVG Co-crystal structure of two CCM2 PTB domains bound to a KRIT1 peptide encompassing NPxF2 and NPxF3 提交 2025-08-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 227–255（29 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M TrisHCl pH 7, 20% PEG3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.297

共 14 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KRIT1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 6–203； UniProt 1–198 作者链 I； PDB构建体 6–203； UniProt 1–198 作者链 J； PDB构建体 6–203； UniProt 1–198 作者链 K； PDB构建体 6–203； UniProt 1–198

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4dx8
沉积日期 deposition_date	2012-02-27
结构标题 title	ICAP1 in complex with KRIT1 N-terminus
关键词 keywords	Protein-protein complex, PTB domain, Nudix fold, Protein-protein interaction, Membrane, nucleus, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.02 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	36.74 Å
零角强度 I(0) i0	198299000.00
分子量 molecular_weight	116360.0 kDa
排除体积 excluded_volume	146660 Å³
包络体积 envelope_volume	207330 Å³
水化壳体积 shell_volume	47398 Å³
包络直径 envelope_diameter	133.1 Å
壳层 Rg shell_rg	42.71 Å
包络 Rg envelope_rg	36.63 Å
形状 Rg shape_rg	36.74 Å
总 Rg total_rg	37.17 Å
总原子数 total_atoms	8114
残基数 n_residues	1019
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	119.4 Å
Rg (实空间) rg_real	37.03 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.07 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.9830e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.6680e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	37.03 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	198300000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8983
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	41.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.291
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.555
角度范围 angular_range	— – 0.2150 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	35270000.0000
实空间数据点数 n_real_points	44
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.930; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.976; Smooth: 0.907

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Integrin beta-1-binding protein 1
分子量 formula_weight	16909.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,D,E
原子数 atom_count	8128

GSSSGQSNNNSDTCAEFRIKYVGAIEKLKLSEGKGLEGPLDLINYIDVAQQDGKLPFVPPEEEFIMGVSKYGIKVSTSDQYDVLHRHALYLIIRMVCYDDGLGAGKSLLALKTTDASNEEYSLWVYQCNSLEQAQAICKVLSTAFDSVLTSEKP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Krev interaction trapped protein 1
分子量 formula_weight	22911.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,I,J,K

GPLGSMGNPENIEDAYVAVIRPKNTASLNSREYRAKSYEILLHEVPIEGQKKKRKKVLLETKLQGNSEITQGILDYVVETTKPISPANQGIRGKRVVLMKKFPLDGEKMGREASLFIVPSVVKDNTKYTYTPGCPIFYCLQDIMRVCSESSTHFATLTARMLIALDKWLDERHAQSHFIPALFRPSPLERIKTNVINPAYATE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	BROMIDE ION
分子量 formula_weight	79.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	14

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	4dx8A00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	4dx8B00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	4dx8D00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	4dx8E00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

结构域编号 domain_id	4dx8H01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2240 — KRIT, N-terminal Nudix domain, NPxY motif-rich region

结构域编号 domain_id	4dx8I01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2240 — KRIT, N-terminal Nudix domain, NPxY motif-rich region

结构域编号 domain_id	4dx8J01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2240 — KRIT, N-terminal Nudix domain, NPxY motif-rich region

结构域编号 domain_id	4dx8K01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2240 — KRIT, N-terminal Nudix domain, NPxY motif-rich region

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	153.898 Å
晶胞边长 b length_b	157.977 Å
晶胞边长 c length_c	152.006 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.540 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2216
R_work r_work	0.2200
R_free r_free	0.2517

fit	/app/data/saxs_computation/dx/4dx8/4dx8.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dx/4dx8/4dx8.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dx/4dx8/4dx8.dat

ICAP1 in complex with KRIT1 N-terminus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Integrin beta-1-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Krev interaction trapped protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)