4f0u

X-Ray Crystal Structure of Allophycocyanin from Synechococcus elongatus PCC 7942

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Allophycocyanin alpha chain

物种未注明

UniProt Q31RG0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Allophycocyanin, beta subunit × 3 (Q31RG1) PHYCOCYANOBILIN × 6 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q31RG0_SYNE7
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–160; UniProt 2–161 作者链 C; PDB构建体 1–160; UniProt 2–161 作者链 E; PDB构建体 1–160; UniProt 2–161

Allophycocyanin, beta subunit

物种未注明

UniProt Q31RG1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Allophycocyanin alpha chain × 3 (Q31RG0) PHYCOCYANOBILIN × 6 water × 6 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q31RG1_SYNE7
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 D; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161 作者链 F; PDB构建体 1–161; UniProt 1–161

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4f0u
沉积日期 deposition_date2012-05-05
结构标题 titleX-Ray Crystal Structure of Allophycocyanin from Synechococcus elongatus PCC 7942
关键词 keywordsComponent of the phycobilisome, photosynthetic antenna complex, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4f0u__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4f0u__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4f0u__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)39.32 Å
Rg(电子密度)38.55 Å
总 Rg39.01 Å
原子数7572
残基数960
排除体积135270 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4f0u__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_idd4f0ua_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins
结构域编号 domain_idd4f0ub_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins
结构域编号 domain_idd4f0uc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins
结构域编号 domain_idd4f0ud_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins
结构域编号 domain_idd4f0ue_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins
结构域编号 domain_idd4f0uf_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.3 — Phycocyanin-like phycobilisome proteins

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id4f0uA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phycocyanins
结构域编号 domain_id4f0uB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phycocyanins
结构域编号 domain_id4f0uC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phycocyanins
结构域编号 domain_id4f0uD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phycocyanins
结构域编号 domain_id4f0uE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phycocyanins
结构域编号 domain_id4f0uF00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Phycocyanins
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7. 引用文献 (1)