4fao

Specificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Growth/differentiation factor 2

Homo sapiens

UniProt Q9UK05

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GDF2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 B; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 G; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 H; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 M; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 N; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 S; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 T; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 a; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 b; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 g; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429 作者链 h; PDB构建体 1–110; UniProt 320–429

Serine/threonine-protein kinase receptor R3

Homo sapiens

UniProt P37023

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Activin receptor type-2B × 2 (Q13705) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACVL1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 D; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 I; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 J; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 O; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 P; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 U; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 V; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 c; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 d; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 i; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118 作者链 j; PDB构建体 3–99; UniProt 22–118

Activin receptor type-2B

Homo sapiens

UniProt Q13705

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Growth/differentiation factor 2 × 2 (Q9UK05) Serine/threonine-protein kinase receptor R3 × 2 (P37023) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AVR2B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 F; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 K; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 L; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 Q; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 R; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 W; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 X; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 e; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 f; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 k; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134 作者链 l; PDB构建体 3–118; UniProt 19–134

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4fao
沉积日期 deposition_date2012-05-22
结构标题 titleSpecificity and Structure of a high affinity Activin-like 1 (ALK1) signaling complex
关键词 keywordstgf-beta, CTK, cystine knot, extracellular domain, receptor, SIGNALING PROTEIN-SIGNALING PROTEIN complex; SIGNALING PROTEIN/SIGNALING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4fao__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4fao__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4fao__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)30.08 Å
Rg(电子密度)29.45 Å
总 Rg29.95 Å
原子数4267
残基数539
排除体积74847 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4fao__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4fao__assembly_2__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 4fao__assembly_3__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 4fao__assembly_4__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 4fao__assembly_5__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 4fao__assembly_6__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 36 domains

CATH v4.4 (36 domains)

结构域编号 domain_id4faoA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoE00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoF00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoG00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoH00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoI00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoJ00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoK00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoL00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoM00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoN00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoO00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoP00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoQ00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoR00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoS00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoT00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoU00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoV00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoW00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoX00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoa00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faob00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoc00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faod00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoe00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faof00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faog00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoh00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology90 — Cystine Knot Cytokines, subunit B
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cystine-knot cytokines
结构域编号 domain_id4faoi00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faoj00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faok00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
结构域编号 domain_id4faol00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology60 — CD59
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CD59
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7. 引用文献 (1)