SAXSdb — 4g5o

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CITRIC ACID × 2 SULFATE ION × 4 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SULFATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CITRIC ACID × 1 SULFATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	G-protein-signaling modulator 2 × 1 （Q8VDU0） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CITRIC ACID × 1 SULFATE ION × 5 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GNAI3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354 作者链 B； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354 作者链 C； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354 作者链 D； PDB构建体 1–330； UniProt 25–354

G-protein-signaling modulator 2

物种未注明

UniProt Q8VDU0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CITRIC ACID × 2 SULFATE ION × 4 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 SULFATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CITRIC ACID × 1 SULFATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha × 1 （P08754） GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CITRIC ACID × 1 SULFATE ION × 5 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GPSM2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653 作者链 F； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653 作者链 G； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653 作者链 H； PDB构建体 1–26； UniProt 628–653

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4g5o
沉积日期 deposition_date	2012-07-18
结构标题 title	Structure of LGN GL4/Galphai3(Q147L) complex
关键词 keywords	Galphai, GoLoco, Galpha signaling, asymmetric cell division, CELL CYCLE-SIGNALING PROTEIN complex; CELL CYCLE/SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4g5o__assembly_4__model_1

Assembly 4 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4g5o__assembly_4__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4g5o__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.08 Å
Rg（电子密度）	21.13 Å
总 Rg	21.98 Å
原子数	2831
残基数	347
排除体积	50196 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4g5o__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4g5o__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4g5o__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4g5o__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha
分子量 formula_weight	37888.1 kDa
突变 mutation	Q147L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	11190

EDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGVMTPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYLLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEEMNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEAAAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	G-protein-signaling modulator 2
分子量 formula_weight	3214.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

DEDFFSLILRSQAKRMDEQRVLLQRD

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	CITRIC ACID
分子量 formula_weight	192.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	4g5oA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	4g5oB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	4g5oC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	4g5oD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4g5oD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

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晶胞边长 a length_a	207.326 Å
晶胞边长 b length_b	207.326 Å
晶胞边长 c length_c	236.545 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	P 61 2 2
空间群编号 int_tables_number	178
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.900 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.2097
R_work r_work	0.2079
R_free r_free	0.2436

Structure of LGN GL4/Galphai3(Q147L) complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

G-protein-signaling modulator 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4g5o__assembly_4__model_1

4g5o__assembly_4__model_1 | I(q)

4g5o__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of LGN GL4/Galphai3(Q147L) complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(k) subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

G-protein-signaling modulator 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4g5o__assembly_4__model_1

4g5o__assembly_4__model_1 | I(q)

4g5o__assembly_4__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)