SAXSdb — 4gdo

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Plectin

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1492–1530 链 B； UniProt 1492–1530	片段：FRAGMENT OF THE ROD DOMAIN, UNP residues 1492-1530	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M sodium acetate, 2.2M sodium chloride, 0.2M lithium sulfate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.248
2	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1492–1530 链 D； UniProt 1492–1530	片段：FRAGMENT OF THE ROD DOMAIN, UNP residues 1492-1530	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M sodium acetate, 2.2M sodium chloride, 0.2M lithium sulfate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.248
3	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1492–1530 链 F； UniProt 1492–1530	片段：FRAGMENT OF THE ROD DOMAIN, UNP residues 1492-1530	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；298 K；0.1M sodium acetate, 2.2M sodium chloride, 0.2M lithium sulfate, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 1.70 Å R-free 0.248

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4GDO	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1MB8 Crystal Structure of the actin binding domain of plectin 提交 2002-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 59–293（235 aa）片段：Residues 59-293	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.15 Å R-free 0.261
2N03 Solution NMR Structure plectin repeat domain 6 (4403-4606) of Plectin from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) Target HR6354E 提交 2015-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 4403–4606（204 aa）片段：residues 4403-4606	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N; U-2H; ILV-1H] protein, 20 mM MES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 10 mM DTT, 0.02 mM NaN3, 50 uM DSS, 1 ratio protease inhibitor, 90/10 % H2O/D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 20 mM MES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 10 mM DTT, 0.02 mM NaN3, 50 uM DSS, 1 ratio protease inhibitor, 90/10 % H2O/D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-5% 13C; U-100% 15N] protein, 20 mM MES, 100 mM NaCl, 5 mM CaCl2, 10 mM DTT, 0.02 mM NaN3, 50 uM DSS, 1 ratio protease inhibitor, 90/10 % H2O/D2O, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3F7P Crystal structure of a complex between integrin beta4 and plectin 提交 2008-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–293（293 aa）片段：Actin-binding domain, residues 1-293	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；298 K；0.1M Sodium Acetate, 0.2M CaCl2, 10% PEG 6000, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.75 Å R-free 0.257
3F7P Crystal structure of a complex between integrin beta4 and plectin 提交 2008-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–293（293 aa）片段：Actin-binding domain, residues 1-293	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.8；298 K；0.1M Sodium Acetate, 0.2M CaCl2, 10% PEG 6000, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K	分辨率 2.75 Å R-free 0.257
3PDY Structure of the third and fourth spectrin repeats of the plakin domain of plectin 提交 2010-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 653–858（206 aa）片段：SPECTRIN REPEATS 3 AND 4 (UNP Residues 653-848)	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.1M HEPES, 17% PEG 4000, 8% ISOPROPANOL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 2.22 Å R-free 0.248
3PDY Structure of the third and fourth spectrin repeats of the plakin domain of plectin 提交 2010-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 653–858（206 aa）片段：SPECTRIN REPEATS 3 AND 4 (UNP Residues 653-848)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.1M HEPES, 17% PEG 4000, 8% ISOPROPANOL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 2.22 Å R-free 0.248
3PDY Structure of the third and fourth spectrin repeats of the plakin domain of plectin 提交 2010-10-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 653–858（206 aa）片段：SPECTRIN REPEATS 3 AND 4 (UNP Residues 653-848) 链 B 653–858（206 aa）片段：SPECTRIN REPEATS 3 AND 4 (UNP Residues 653-848)	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；297 K；0.1M HEPES, 17% PEG 4000, 8% ISOPROPANOL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 297K	分辨率 2.22 Å R-free 0.248
3PE0 Structure of the central region of the plakin domain of plectin 提交 2010-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 750–1028（279 aa）片段：SPECTRIN REPEATS 4 AND 5, SH3 (UNP Residues 747-918)	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M calcium acetate, 9% PEG 8000, 2 mM DTT, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.95 Å R-free 0.265
3PE0 Structure of the central region of the plakin domain of plectin 提交 2010-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 750–1028（279 aa）片段：SPECTRIN REPEATS 4 AND 5, SH3 (UNP Residues 747-918)	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.2；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M calcium acetate, 9% PEG 8000, 2 mM DTT, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.95 Å R-free 0.265
4Q58 Crystal structure of the plectin 1a actin-binding domain/integrin beta 4 fragment complex 提交 2014-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 175–400（226 aa）片段：actin-binding domain (UNP residues 175-400)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；20 mM HEPES, pH 6.5, 150 mM sodium formate, 7.5% PEG550 MME, 3% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 4.00 Å R-free 0.287
4Q58 Crystal structure of the plectin 1a actin-binding domain/integrin beta 4 fragment complex 提交 2014-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 175–400（226 aa）片段：actin-binding domain (UNP residues 175-400)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；20 mM HEPES, pH 6.5, 150 mM sodium formate, 7.5% PEG550 MME, 3% sucrose, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K	分辨率 4.00 Å R-free 0.287
4Q59 Crystal structure of plectin 1a actin-binding domain 提交 2014-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 175–400（226 aa）片段：actin-binding domain (UNP residues 175-400)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.05 M potassium phosphate monobasic, 20% PEG8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.245
4Q59 Crystal structure of plectin 1a actin-binding domain 提交 2014-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 175–400（226 aa）片段：actin-binding domain (UNP residues 175-400)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.05 M potassium phosphate monobasic, 20% PEG8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K	分辨率 2.30 Å R-free 0.245
5J1F Structure of the spectrin repeats 5 and 6 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 860–928（69 aa）链 A 999–1116（118 aa）	突变：F752A,F752A 突变：F752A,F752A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；A protein solution at 30 mg/ml in 10 mM Tris-Hcl (pH 7.5), 50 mM NaCl, 1 mM DTT was mixed with an equal volume of crystallization solution 0.1 M Bis-Tris-Propane (pH 6.0), 18% PEG 3350, 0.2 Na malonate	分辨率 3.00 Å R-free 0.277
5J1F Structure of the spectrin repeats 5 and 6 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 860–928（69 aa）链 B 999–1116（118 aa）	突变：F752A,F752A 突变：F752A,F752A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；A protein solution at 30 mg/ml in 10 mM Tris-Hcl (pH 7.5), 50 mM NaCl, 1 mM DTT was mixed with an equal volume of crystallization solution 0.1 M Bis-Tris-Propane (pH 6.0), 18% PEG 3350, 0.2 Na malonate	分辨率 3.00 Å R-free 0.277
5J1G Structure of the spectrin repeats 7 and 8 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1004–1233（230 aa）片段：UNP residues 1004-1233	未记录	1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；298 K；A protein solution at 27 mg/ml in 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM NaCl was mixed with an equal volume of crystallization solution 50 mM Tris-HCl (pH 7.7), 0.2 M NaF, 18% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.218
5J1G Structure of the spectrin repeats 7 and 8 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1004–1233（230 aa）片段：UNP residues 1004-1233	未记录	1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；298 K；A protein solution at 27 mg/ml in 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM NaCl was mixed with an equal volume of crystallization solution 50 mM Tris-HCl (pH 7.7), 0.2 M NaF, 18% PEG 3350	分辨率 1.80 Å R-free 0.218
5J1H Structure of the spectrin repeats 5 and 6 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 860–928（69 aa）链 A 999–1116（118 aa）	突变：F752A,F752A 突变：F752A,F752A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；Protein at 30 mg/ml in 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM NaCl, 1 mM DTT was mixed with an equal volume of the crystallization solution 0.2 M Na/K tartrate, 20% PEG3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
5J1H Structure of the spectrin repeats 5 and 6 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 860–928（69 aa）链 B 999–1116（118 aa）	突变：F752A,F752A 突变：F752A,F752A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；Protein at 30 mg/ml in 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM NaCl, 1 mM DTT was mixed with an equal volume of the crystallization solution 0.2 M Na/K tartrate, 20% PEG3350	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
5J1I Structure of the spectrin repeats 7, 8, and 9 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1004–1372（369 aa）片段：UNP residues 1104-1372	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Protein solution at 12 mg/ml in 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM NaCl, 1 mM DTT was mixed with crystallization solution 0.1 M Bis-Tris-propane (pH 8.0), 16% PEG 3350, 0.3 M Na/K tartrate	分辨率 2.80 Å R-free 0.322
5J1I Structure of the spectrin repeats 7, 8, and 9 of the plakin domain of plectin 提交 2016-03-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1004–1372（369 aa）片段：UNP residues 1104-1372	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Protein solution at 12 mg/ml in 10 mM Tris-HCl (pH 7.5), 50 mM NaCl, 1 mM DTT was mixed with crystallization solution 0.1 M Bis-Tris-propane (pH 8.0), 16% PEG 3350, 0.3 M Na/K tartrate	分辨率 2.80 Å R-free 0.322

共 11 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PLEC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–43； UniProt 1492–1530 作者链 B； PDB构建体 5–43； UniProt 1492–1530 作者链 C； PDB构建体 5–43； UniProt 1492–1530 作者链 D； PDB构建体 5–43； UniProt 1492–1530 作者链 E； PDB构建体 5–43； UniProt 1492–1530 作者链 F； PDB构建体 5–43； UniProt 1492–1530

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4gdo
沉积日期 deposition_date	2012-08-01
结构标题 title	Structure of a fragment of the rod domain of plectin
关键词 keywords	COILED-COIL, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	27.88 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.83 Å
零角强度 I(0) i0	11853800.00
分子量 molecular_weight	23532.0 kDa
排除体积 excluded_volume	28496 Å³
包络体积 envelope_volume	40239 Å³
水化壳体积 shell_volume	14860 Å³
包络直径 envelope_diameter	119.6 Å
壳层 Rg shell_rg	28.17 Å
包络 Rg envelope_rg	30.20 Å
形状 Rg shape_rg	28.84 Å
总 Rg total_rg	28.73 Å
总原子数 total_atoms	3247
残基数 n_residues	223
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	113.9 Å
Rg (实空间) rg_real	28.87 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.65 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1850e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.9860e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.56 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	11850000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6573
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	20.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.859
峰度 Kurtosis kurtosis	0.302
角度范围 angular_range	— – 0.2850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	915200.0000
实空间数据点数 n_real_points	58
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.190; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.020; Smooth: 0.951

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4gdoA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	580 — Single Helix bin

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	90.620 Å
晶胞边长 b length_b	35.870 Å
晶胞边长 c length_c	75.690 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	94.11 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.700 Å
最低分辨率 resolution_low	45.194 Å
R 因子 r_factor	0.2148
R_work r_work	0.2127
R_free r_free	0.2484

描述 description	Plectin
分子量 formula_weight	4880.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	3410

Structure of a fragment of the rod domain of plectin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Plectin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	163

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