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1BQS
THE CRYSTAL STRUCTURE OF MUCOSAL ADDRESSIN CELL ADHESION MOLECULE-1 (MADCAM-1)
提交 1998-08-18
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构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
23–231(209 aa)
片段:EXTRACELLULAR REGION WITH TWO IG-LIKE DOMAINS
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未记录
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;PROTEIN SOLUTION:17 MG/ML. CRYSTALLIZATION SOLUTION: 10% PEG 400,
0.5M LI2SO4, PH 7.5-8.0., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
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分辨率 2.20 Å
R-free 0.280
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1GSM
A reassessment of the MAdCAM-1 structure and its role in integrin recognition.
提交 2002-01-08
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
19–224(206 aa)
片段:EXTRACELLULAR REGION WITH TWO IG-LIKE DOMAINS
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8;PROTEIN SOLUTION:10 MG/ML. CRYSTALLIZATION SOLUTION: 16% PEG 4000, 0.5M LI2SO4, PH 7.75.
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分辨率 1.90 Å
R-free 0.250
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4HBQ
Crystal structure of a loop deleted mutant of Human MAdCAM-1 D1D2
提交 2012-09-28
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
23–224(202 aa)
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 12% polyethylene glycol (PEG) 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.178
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4HBQ
Crystal structure of a loop deleted mutant of Human MAdCAM-1 D1D2
提交 2012-09-28
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聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 B
23–224(202 aa)
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 1
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 12% polyethylene glycol (PEG) 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.178
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4HBQ
Crystal structure of a loop deleted mutant of Human MAdCAM-1 D1D2
提交 2012-09-28
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
23–224(202 aa)
链 B
23–224(202 aa)
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;293 K;0.1 M Tris pH 8.5, 0.2 M (NH4)2SO4, 12% polyethylene glycol (PEG) 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.40 Å
R-free 0.178
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4HCR
Crystal structure of human MAdCAM-1 D1D2 complexed with Fab PF-547659
提交 2012-10-01
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 A
23–225(203 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1 M Citrate pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 12% (w/v) myo-inositol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.208
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4HCR
Crystal structure of human MAdCAM-1 D1D2 complexed with Fab PF-547659
提交 2012-10-01
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构建体不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 B
23–225(203 aa)
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1 M Citrate pH 6.0, 18% (w/v) PEG 3350, 12% (w/v) myo-inositol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.208
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4HD9
Crystal structure of native human MAdCAM-1 D1D2 domain
提交 2012-10-02
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构建体不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
23–225(203 aa)
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未记录
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;293 K;10% PEG4K, 0.5M Li2SO4, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
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分辨率 1.70 Å
R-free 0.214
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9P95
CryoEM structure of integrin alpha4beta7 bound to MAdCAM-1
提交 2025-06-24
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
1–317(317 aa)
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未记录
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NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3
CA CALCIUM ION × 3
MN MANGANESE (II) ION × 3
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4;0.05% CHAPS added immediately before vitrification
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.05 Å
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