4icg

N-terminal dimerization domain of H-NS in complex with Hha (Salmonella Typhimurium)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-binding protein H-NS

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2

UniProt P0A1S2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Hemolysin expression modulating protein (Involved in environmental regulation of virulence factors) × 2 (Q7CR17) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HNS_SALTY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–46; UniProt 3–46 作者链 B; PDB构建体 3–46; UniProt 3–46

Hemolysin expression modulating protein (Involved in environmental regulation of virulence factors)

Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2

UniProt Q7CR17

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 DNA-binding protein H-NS × 2 (P0A1S2) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7CR17_SALTY
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 5–75; UniProt 2–72 作者链 D; PDB构建体 5–75; UniProt 2–72

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4icg
沉积日期 deposition_date2012-12-10
结构标题 titleN-terminal dimerization domain of H-NS in complex with Hha (Salmonella Typhimurium)
关键词 keywordsDNA binding protein, Hha; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4icg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4icg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4icg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.07 Å
Rg(电子密度)19.23 Å
总 Rg20.06 Å
原子数1688
残基数217
排除体积29883 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4icg__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd4icgc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.23 — Open three-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamilya.23.5 — Hemolysin expression modulating protein HHA
家族 Family familya.23.5.1 — Hemolysin expression modulating protein HHA
结构域编号 domain_idd4icgd_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.23 — Open three-helical up-and-down bundle
超家族 Superfamily superfamilya.23.5 — Hemolysin expression modulating protein HHA
家族 Family familya.23.5.1 — Hemolysin expression modulating protein HHA

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id4icgA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1050 — H-NS histone-like proteins
结构域编号 domain_id4icgB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1050 — H-NS histone-like proteins
结构域编号 domain_id4icgC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — HHA
结构域编号 domain_id4icgD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1280 — Monooxygenase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — HHA
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7. 引用文献 (1)