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4ig0

HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the 507 site

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 111.9 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Reverse transcriptase/ribonuclease H

Human immunodeficiency virus type 1

UniProt P03366

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 600–1154 链 B； UniProt 600–1027 片段：P66 (unp residues 600-1154) 突变：K771A, K772A, C879S 片段：P51 (unp residues 600-1027) 突变：C879S 1FG 2-({[2-(3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl)-2-oxoethyl](methyl)amino}methyl)quinazolin-4(1H)-one × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE,AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K 分辨率 2.50 Å R-free 0.243

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 4IG0 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AJV HIV-1 PROTEASE IN COMPLEX WITH THE CYCLIC SULFAMIDE INHIBITOR AHA006 提交 1997-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 NMB 2,7-DIBENZYL-1,1-DIOXO-3,6-BIS-PHENOXYMETHYL-[1,2,7]THIADIAZEPANE-4,5-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED BY VAPOR DIFFUSION. PROTEASE (2 MG/ML) AND INHIBITOR (40 MM IN DMSO) WAS MIXED IN A RATIO OF 1:1 AND SUBJECTED TO COCRYSTALLIZATION. DROPS CONSISTING OF 5 MICROLITERS OF THE PROTEASE-INHIBITOR MIXTURE PLUS 5 MICROLITERS OF THE CRYSTALLIZATION BUFFER (50 MM MES PH 5.5, 0.4 M NACL AND 0.02% (W/V) NAN3) WERE EQUILIBRATED AGAINST THE SAME BUFFER AT 4 DEGREES C., vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.247
1AJX HIV-1 PROTEASE IN COMPLEX WITH THE CYCLIC UREA INHIBITOR AHA001 提交 1997-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 AH1 AHA001 × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；277 K；CRYSTALLIZATION WAS PERFORMED BY VAPOR DIFFUSION. PROTEASE (2 MG/ML) AND INHIBITOR (40 MM IN DMSO) WAS MIXED IN A RATIO OF 1:1 AND SUBJECTED TO COCRYSTALLIZATION. DROPS CONSISTING OF 5 MICROLITERS OF THE PROTEASE-INHIBITOR MIXTURE PLUS 5 MICROLITERS OF THE CRYSTALLIZATION BUFFER (50 MM MES PH 5.5, 0.4 M NACL AND 0.02% (W/V) NAN3) WERE EQUILIBRATED AGAINST THE SAME BUFFER AT 4 DEGREES C., vapor diffusion, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.237
1AXA ACTIVE-SITE MOBILITY IN HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 PROTEASE AS DEMONSTRATED BY CRYSTAL STRUCTURE OF A28S MUTANT 提交 1997-10-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
突变：A28S 突变：A28S U0E N-[[1-[N-ACETAMIDYL]-[1-CYCLOHEXYLMETHYL-2-HYDROXY-4-ISOPROPYL]-BUT-4-YL]-CARBONYL]-GLUTAMINYL-ARGINYL-AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8
分辨率 2.00 Å
1BQM HIV-1 RT/HBY 097 提交 1998-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1154（556 aa）
链 B 599–1028（430 aa）
突变：C280S 突变：C280S HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8
分辨率 3.10 Å R-free 0.362
1BQN TYR 188 LEU HIV-1 RT/HBY 097 提交 1998-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1028（430 aa）
突变：Y188L, C280S 突变：Y188L, C280S HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.8
分辨率 3.30 Å R-free 0.362
1D4H HIV-1 Protease in complex with the inhibitor BEA435 提交 1999-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 BEH 2,5-DIBENZYLOXY-3,4-DIHYDROXY-HEXANEDIOIC ACID BENZYLAMIDE (2-HYDROXY-INDAN-1-YL)-AMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.231
1D4I HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA425 提交 1999-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 BEG 2,5-DIBENZYLOXY-3-HYDROXY-HEXANEDIOIC ACID BIS-[(2-HYDROXY-INDAN-1-YL)-AMIDE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.228
1D4J HIV-1 protease in complex with the inhibitor MSL370 提交 1999-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 MSC 2,5-DIBENZYLOXY-3,4-DIHYDROXY-HEXANEDIOIC ACID 2-CHLORO-6-FLUORO-BENZYLAMIDE (2-HYDROXY-INDAN-1- YL)-AMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；sodium chloride, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.229
1DLO HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1996-04-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1154（556 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
突变：C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.336
1DW6 Structural and kinetic analysis of drug resistant mutants of HIV-1 protease 提交 2000-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 501–599（99 aa）
链 D 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHAT25-50%, PROTEIN 2-5 MG/MLE , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.88 Å R-free 0.249
1EBK Structural and kinetic analysis of drug resistant mutants of HIV-1 protease 提交 2000-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 D 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHATE (25-50%), PROTEIN 2-5 MG/ML, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.06 Å R-free 0.306
1EBK Structural and kinetic analysis of drug resistant mutants of HIV-1 protease 提交 2000-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 F 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, R8Q, L33I, L63I, C67A, C95A 0Q4 N-[(2R)-2-({N~5~-[amino(iminio)methyl]-L-ornithyl-L-valyl}amino)-4-methylpentyl]-L-phenylalanyl-L-alpha-glutamyl-L-alanyl-L-norleucinamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；CITRATE/PHOSPHATE BUFFER 0.05M, DTT 10MM, DMSO 10%, SATURATED AMMONIUM SULPHATE (25-50%), PROTEIN 2-5 MG/ML, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.06 Å R-free 0.306
1EBW HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA322 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEI N,N-[2,5-O-[DIBENZYL]-GLUCARYL]-DI-[ISOLEUCYL-AMIDO-METHANE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.81 Å R-free 0.219
1EBY HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA369 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEB N,N-[2,5-O-DIBENZYL-GLUCARYL]-DI-[1-AMINO-INDAN-2-OL] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.29 Å R-free 0.205
1EBZ HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA388 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEC [5-(2-HYDROXY-INDAN-1-YLCARBAMOYL)-3,4-DIHYDROXY-2,5-[DIBENZYL-OXY]-PENTANOYL]-VALINYL-AMIDO-METHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.01 Å R-free 0.208
1EC0 HIV-1 protease in complex with the inhibitor bea403 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BED N,N-[2,5-O-DI-2-FLUORO-BENZYL-GLUCARYL]-DI-[1-AMINO-INDAN-2-OL] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.79 Å R-free 0.222
1EC1 HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA409 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEE N,N-[2,5-O-[DI-4-THIOPHEN-3-YL-BENZYL]-GLUCARYL]-DI-[VALYL-AMIDO-METHANE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.236
1EC2 HIV-1 protease in complex with the inhibitor BEA428 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 BEJ N,N-[2,5-O-[DI-4-PYRIDIN-3-YL-BENZYL]-GLUCARYL]-DI-[VALYL-AMIDO-METHANE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02 % (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1EC3 HIV-1 protease in complex with the inhibitor MSA367 提交 2000-01-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：FRAGMENT 69-167
未记录 MS3 N,N-[2,5-O-DIBENZYL-GLUCARYL]-DI-[VALINYL-AMINOMETHANYL-PYRIDINE] × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.4 M Sodium chloride, 0.05 M MES, 0.02% (W/V) sodium azide, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.260
1EET HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR MSC204 提交 2000-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1155（557 aa） 片段：RESIDUES 1-557
链 B 599–1025（427 aa） 片段：RESIDUES 1001-1427
突变：E478Q BFU 1-(5-BROMO-PYRIDIN-2-YL)-3-[2-(6-FLUORO-2-HYDROXY-3-PROPIONYL-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulfate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride , pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.73 Å R-free 0.271
1EET HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH THE INHIBITOR MSC204 提交 2000-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 599–1155（557 aa） 片段：RESIDUES 1-557
链 B 599–1025（427 aa） 片段：RESIDUES 1001-1427
突变：E478Q BFU 1-(5-BROMO-PYRIDIN-2-YL)-3-[2-(6-FLUORO-2-HYDROXY-3-PROPIONYL-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-UREA × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulfate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride , pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 2.73 Å R-free 0.271
1HBV A CHECK ON RATIONAL DRUG DESIGN. CRYSTAL STRUCTURE OF A COMPLEX OF HIV-1 PROTEASE WITH A NOVEL GAMMA-TURN MIMETIC 提交 1995-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 GAN 2-[3-BENZYL-5-(1-ALANYL-AMINOETHYL)-2,3,6,7-TETRAHYDRO-1H-AZEPIN-1-YL]-1-OXOPROPYL-VALINYL-VALINE-METHYLESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1HEF The crystal structures at 2.2 angstroms resolution of hydroxyethylene-based inhibitors bound to human immunodeficiency virus type 1 protease show that the inhibitors are present in two distinct orientations 提交 1992-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 69–167（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HEG The crystal structures at 2.2 angstroms resolution of hydroxyethylene-based inhibitors bound to human immunodeficiency virus type 1 protease show that the inhibitors are present in two distinct orientations 提交 1992-09-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 69–167（99 aa）
未记录 PSI methyl N-{(4S,5S)-5-[(L-alanyl-L-alanyl)amino]-4-hydroxy-6-phenylhexanoyl}-L-valyl-L-valinate × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HIH COMPARATIVE ANALYSIS OF THE X-RAY STRUCTURES OF HIV-1 AND HIV-2 PROTEASES IN COMPLEX WITH CGP 53820, A NOVEL PSEUDOSYMMETRIC INHIBITOR 提交 1995-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 C20 ACETYL-NH-VAL-CYCLOHEXYL-CH2[NCH2CHOH]CH2-BENZYL-VAL-NH-ACETYL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 168–727（560 aa）
链 D 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 168–727（560 aa）
链 F 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HMV THE STRUCTURE OF UNLIGANDED REVERSE TRANSCRIPTASE FROM THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 1994-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 168–727（560 aa）
链 H 168–607（440 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.297
1HNI STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN A COMPLEX WITH THE NONNUCLEOSIDE INHIBITOR ALPHA-APA R 95845 AT 2.8 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1995-02-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
未记录 AAA (2-ACETYL-5-METHYLANILINO)(2,6-DIBROMOPHENYL)ACETAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1HNV STRUCTURE OF HIV-1 RT(SLASH)TIBO R 86183 COMPLEX REVEALS SIMILARITY IN THE BINDING OF DIVERSE NONNUCLEOSIDE INHIBITORS 提交 1995-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
未记录 TBO 5-CHLORO-8-METHYL-7-(3-METHYL-BUT-2-ENYL)-6,7,8,9-TETRAHYDRO-2H-2,7,9A-TRIAZA-BENZO[CD]AZULENE-1-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.356
1HOS INHIBITION OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS-1 PROTEASE BY A C2-SYMMETRIC PHOSPHINATE SYNTHESIS AND CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS 提交 1993-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 PHP (2-PHENYL-1-CARBOBENZYL-OXYVALYL-AMINO)-ETHYL-PHOSPHINIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1HPS RATIONAL DESIGN, SYNTHESIS AND CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSIS OF A HYDROXYETHYLENE-BASED HIV-1 PROTEASE INHIBITOR CONTAINING A HETEROCYCLIC P1'-P2' AMIDE BOND ISOSTERE 提交 1994-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 RUN 2-[(1R,3S,4S)-1-BENZYL-4-[N-(BENZYLOXYCARBONYL)-L-VALYL]AMINO-3-PHENYLPENTYL]-4(5)-(2-METHYLPROPIONYL)IMIDAZOLE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1HPZ HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 2000-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 599–1028（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N, C280S 突变：K103N, C280S AAP ALPHA-(2,6-DICHLOROPHENYL)-ALPHA-(2-ACETYL-5-METHYLANILINO)ACETAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；Bis-Tris.propane, ammoniun sulfate, glycerol, PEG 8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.343
1HQE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 2000-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N, C280S 突变：K103N, C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；Bis-Tris.propane, ammoniun sulfate, glycerol, PEG 8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.331
1HQU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 提交 2000-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N, C280S 突变：K103N, C280S HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；BIS-TRIS.PROPANE, AMMONIUN SULFATE, GLYCEROL, PEG 8000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.345
1HRH CRYSTAL STRUCTURE OF THE RIBONUCLEASE H DOMAIN OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE 提交 1991-03-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 594–729（136 aa）
链 B 594–729（136 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.40 Å
1HTE X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A SERIES OF PENICILLIN-DERIVED ASYMMETRIC INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 G23 (2R,4S)-2-[(R)-BENZYLCARBAMOYL-PHENYLACETYL-METHYL]-5,5-DIMETHYL-THIAZOLIDINE-4-CARBOXYLIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1HTF X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A SERIES OF PENICILLIN-DERIVED ASYMMETRIC INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 G26 2-(BENZYLCARBAMOYL-PHENYLACETYLAMINO-METHYL)-5,5-DIMETHYL-THIAZOLIDINE-4-CARBOXYLIC ACID (HYDROXYMETHYL-2-PHENYLETHYL)AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å
1HTG X-RAY CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF A SERIES OF PENICILLIN-DERIVED ASYMMETRIC INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-04-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 G37 2-(BENZYLCARBAMOYL-PHENYLACETYLAMINO-METHYL)-5,5-DIMETHYL-THIAZOLIDINE-4-CARBOXYLIC ACID 3-[(1H-BENZIMIDAZOL-2-YLMETHYLCARBAMOYL)-1-BENZYL-2-HYDROXYPROPYL]-AMIDE × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.00 Å
1HVK INFLUENCE OF STEREOCHEMISTRY ON ACTIVITY AND BINDING MODES FOR C2 SYMMETRY-BASED DIOL INHIBITORS OF HIV-1 PROTEASE 提交 1994-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
链 B 69–167（99 aa）
未记录 A79 N-{1-BENZYL-(2S,3S)-2,3-DIHYDROXY-4-[3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRYLAMINO]-5-PHENYL-PENTYL}-3-METHYL-2-(3-METHYL-3-PYRIDIN-2-YLMETHYL-UREIDO)-BUTYRAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 599–1152（554 aa）
链 B 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 D 599–1152（554 aa）
链 E 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 G 599–1152（554 aa）
链 H 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HVU HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEXED WITH A 33-BASE NUCLEOTIDE RNA PSEUDOKNOT 提交 1998-06-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 J 599–1152（554 aa）
链 K 603–1025（423 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.75 Å R-free 0.413
1HYS CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH A POLYPURINE TRACT RNA:DNA 提交 2001-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–720（553 aa） 片段：P66
链 B 168–592（425 aa） 片段：P51
突变：C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；297 K；ammonium sulfate, cacodylate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 3.00 Å R-free 0.316
1IKV K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efivarenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K103N EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1IKV K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efivarenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K103N EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1IKW Wild Type HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efavirenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：E478Q EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.272
1IKW Wild Type HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Efavirenz 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：E478Q EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.272
1IKX K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor PNU142721 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N PNU 6-CHLORO-2-(1-FURO[2,3-C]PYRIDIN-5-YL-ETHYLSULFANYL)-PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；Ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
1IKX K103N Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor PNU142721 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N PNU 6-CHLORO-2-(1-FURO[2,3-C]PYRIDIN-5-YL-ETHYLSULFANYL)-PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；295 K；Ammonium sulphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.274
1IKY HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor MSC194 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N MSD 1-[2-(3-ACETYL-2-HYDROXY-6-METHOXY-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-3-(5-CYANO-PYRIDIN-2-YL)-THIOUREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulphate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1IKY HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with the Inhibitor MSC194 提交 2001-05-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–594（427 aa）
突变：K103N, E478Q 突变：K1103N MSD 1-[2-(3-ACETYL-2-HYDROXY-6-METHOXY-PHENYL)-CYCLOPROPYL]-3-(5-CYANO-PYRIDIN-2-YL)-THIOUREA × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294 K；Ammonium Sulphate, Potassium chloride, HEPES, Magnesium Chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1J5O CRYSTAL STRUCTURE OF MET184ILE MUTANT OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE IN COMPLEX WITH DOUBLE STRANDED DNA TEMPLATE-PRIMER 提交 2002-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa）
链 B 168–597（430 aa）
突变：M184I,C280S 突变：M184I,C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；30 % SATURATED AMMONIUM SULFATE, 100 MM CACODYLATE PH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.338
1MER HIV-1 MUTANT (I84V) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP450 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：I84V 突变：I84V DMQ [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-1,3-BIS([(3-AMINO)PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHENYLMETHYL)-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1MES HIV-1 MUTANT (I84V) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP323 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：I84V 突变：I84V DMP [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-[1,3-BIS([4-HYDROXYMETHYL-PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHEN YLMETHYL)]-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1MET HIV-1 MUTANT (V82F) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP323 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：V82F 突变：V82F DMP [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-[1,3-BIS([4-HYDROXYMETHYL-PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHEN YLMETHYL)]-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å
1MEU HIV-1 MUTANT (V82F, I84V) PROTEASE COMPLEXED WITH DMP323 提交 1997-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 57–155（99 aa）
链 B 57–155（99 aa）
突变：V82F, I84V 突变：V82F, I84V DMP [4-R-(-4-ALPHA,5-ALPHA,6-BETA,7-BETA)]-HEXAHYDRO-5,6-BIS(HYDROXY)-[1,3-BIS([4-HYDROXYMETHYL-PHENYL]METHYL)-4,7-BIS(PHEN YLMETHYL)]-2H-1,3-DIAZEPINONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.193
1N5Y HIV-1 Reverse Transcriptase Crosslinked to Post-Translocation AZTMP-Terminated DNA (Complex P) 提交 2002-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa）
链 B 168–597（430 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；cacodylate, SAS, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.285
1N6Q HIV-1 Reverse Transcriptase Crosslinked to pre-translocation AZTMP-terminated DNA (complex N) 提交 2002-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa）
链 B 168–597（430 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280C MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；ammonium sulfate, cacodylate , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.284
1QE1 CRYSTAL STRUCTURE OF 3TC-RESISTANT M184I MUTANT OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE 提交 1999-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–725（558 aa） 片段：SUBUNIT A (P66), RESIDUES 168-725
链 B 168–594（427 aa） 片段：SUBUNIT B (P51), RESIDUES 168-594
突变：M184I,C280S 突变：M184I,C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, GLYCEROL, BIS-TRIS, AMMONIUM SULFATE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.346
1QMC C-terminal DNA-binding domain of HIV-1 integrase, NMR, 42 structures 提交 1999-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 947–997（51 aa） 片段：C-TERMINAL DNA-BINDING DOMAIN
链 B 947–997（51 aa） 片段：C-TERMINAL DNA-BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.7；298 K
分辨率未提供
1R0A Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase covalently tethered to DNA template-primer solved to 2.8 angstroms 提交 2003-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa） 片段：HIV-1 RT
链 B 168–596（429 aa） 片段：HIV-1 RT
未记录 GOL GLYCEROL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GLC alpha-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100 mM cacodylatic acid pH, 5.6; 33% ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.272
1RDH CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSES OF AN ACTIVE HIV-1 RIBONUCLEASE H DOMAIN SHOW STRUCTURAL FEATURES THAT DISTINGUISH IT FROM THE INACTIVE FORM 提交 1993-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 594–727（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1RDH CRYSTALLOGRAPHIC ANALYSES OF AN ACTIVE HIV-1 RIBONUCLEASE H DOMAIN SHOW STRUCTURAL FEATURES THAT DISTINGUISH IT FROM THE INACTIVE FORM 提交 1993-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 594–727（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å
1RTD STRUCTURE OF A CATALYTIC COMPLEX OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE: IMPLICATIONS FOR NUCLEOSIDE ANALOG DRUG RESISTANCE 提交 1998-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–721（554 aa） 片段：P61
突变：P1K, Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 4 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1RTD STRUCTURE OF A CATALYTIC COMPLEX OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE: IMPLICATIONS FOR NUCLEOSIDE ANALOG DRUG RESISTANCE 提交 1998-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 168–721（554 aa） 片段：P61
突变：P1K, Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 2 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5
分辨率 3.20 Å R-free 0.298
1S6P CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R100943 提交 2004-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES MG MAGNESIUM ION × 1 IET 1-(4-CYANO-PHENYL)-3-[2-(2,6-DICHLORO-PHENYL)-1-IMINO-ETHYL]-THIOUREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 2.90 Å R-free 0.312
1S6Q CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R147681 提交 2004-01-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES TPB 4-[4-(2,4,6-TRIMETHYL-PHENYLAMINO)-PYRIMIDIN-2-YLAMINO]-BENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 3.00 Å R-free 0.294
1S9E CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R129385 提交 2004-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES ADB 4-[4-AMINO-6-(2,6-DICHLORO-PHENOXY)-[1,3,5]TRIAZIN-2-YLAMINO]-BENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；300 K；PEG 8000, ammonium sulfate, glycerol, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 2.60 Å R-free 0.316
1S9G CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R120394. 提交 2004-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：YES 突变：YES ABZ 4-[4-AMINO-6-(5-CHLORO-1H-INDOL-4-YLMETHYL)-[1,3,5]TRIAZIN-2-YLAMINO]-BENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；280 K；PEG 8000, Ammonium Sulfate, Glycerol, Tris, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 280K
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
1SBG AN ORALLY-BIOAVAILABLE HIV-1 PROTEASE INHIBITOR CONTAINING AN IMIDAZOLE-DERIVED PEPTIDE BOND REPLACEMENT. CRYSTALLOGRAPHIC AND PHARMACOKINETIC ANALYSIS 提交 1994-05-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 24–122（99 aa）
链 B 24–122（99 aa）
未记录 IM1 (2R,4S,5S,1'S)-2-PHENYLMETHYL-4-HYDROXY-5-(TERT-BUTOXYCARBONYL)AMINO-6-PHENYL HEXANOYL-N-(1'-IMIDAZO-2-YL)-2'-METHYLPROPANAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å
1SUQ CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R185545 提交 2004-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：L31V, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 185 (6-[4-(AMINOMETHYL)-2,6-DIMETHYLPHENOXY]-2-{[4-(AMINOMETHYL)PHENYL]AMINO}-5-BROMOPYRIMIDIN-4-YL)METHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 3.00 Å R-free 0.325
1SV5 CRYSTAL STRUCTURE OF K103N MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH JANSSEN-R165335 提交 2004-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa） 片段：P66 SUBUNIT
链 B 168–597（430 aa） 片段：P51 SUBUNIT
突变：K103N,C280S 突变：K103N,C280S 65B 4-({6-AMINO-5-BROMO-2-[(4-CYANOPHENYL)AMINO]PYRIMIDIN-4-YL}OXY)-3,5-DIMETHYLBENZONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；pH 6.80
分辨率 2.90 Å R-free 0.326
1T03 HIV-1 reverse transcriptase crosslinked to tenofovir terminated template-primer (complex P) 提交 2004-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 168–725（558 aa） 片段：Reverse transcriptase, p66 subunit
链 B 168–596（429 aa） 片段：Reverse transcriptase, p51 subunit
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；277 K；100 mM cacodylate, 33% ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.295
1T05 HIV-1 reverse transcriptase crosslinked to template-primer with tenofovir-diphosphate bound as the incoming nucleotide substrate 提交 2004-04-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 168–725（558 aa） 片段：HIV-1 reverse transcriptase p66 subunit
突变：Q258C, C280S MG MAGNESIUM ION × 2 TNV [2-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-1-METHYLETHOXY]METHYL-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM MES, pH 6.4, 100 mM ammonium sulfate, 5% sucrose, 5% glycerol, 10% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
1TV6 HIV-1 Reverse Transcriptase Complexed with CP-94,707 提交 2004-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 168–727（560 aa）
链 B 168–607（440 aa）
未记录 CP9 3-[4-(2-METHYL-IMIDAZO[4,5-C]PYRIDIN-1-YL)BENZYL]-3H-BENZOTHIAZOL-2-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；50 mM bis-Tris-propane, 100 mM ammonium sulfate, 0.2% (w/v) beta-octylglucoside, 10% (v/v) glycerol, 14% (w/v) PEG-8000, pH 7.0
分辨率 2.80 Å R-free 0.312
1TVR HIV-1 RT/9-CL TIBO 提交 1996-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
突变：C280S 突变：C280S TB9 4-CHLORO-8-METHYL-7-(3-METHYL-BUT-2-ENYL)-6,7,8,9-TETRAHYDRO-2H-2,7,9A-TRIAZA-BENZO[CD]AZULENE-1-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
1UWB TYR 181 CYS HIV-1 RT/8-CL TIBO 提交 1996-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1025（427 aa）
突变：Y181C, C280S 突变：Y181C, C280S TBO 5-CHLORO-8-METHYL-7-(3-METHYL-BUT-2-ENYL)-6,7,8,9-TETRAHYDRO-2H-2,7,9A-TRIAZA-BENZO[CD]AZULENE-1-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.360
1W5V HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE3 N,N-[2,5-O-DI-3-FLUORO-BENZYL-GLUCARYL]-DI-[1-AMINO-INDAN-2-OL] × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.215
1W5W HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE4 (2R,3R,4R,5R)-2,5-BIS[(2,4-DIFLUOROBENZYL)OXY]-3,4-DIHYDROXY-N,N'-BIS[(1R,2S)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]HEXAN EDIAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.213
1W5X HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE5 (2R,3R,4R,5R)-2,5-BIS[(2,3-DIFLUOROBENZYL)OXY]-3,4-DIHYDROXY-N,N'-BIS[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]HEXAN EDIAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.216
1W5Y HIV-1 protease in complex with fluoro substituted diol-based C2- symmetric inhibitor 提交 2004-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
链 B 58–167（110 aa） 片段：RESIDUES 58-167
未记录 BE6 (2R,3R,4R,5R)-2,5-BIS[(2,5-DIFLUOROBENZYL)OXY]-3,4-DIHYDROXY-N,N'-BIS[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]HEXANEDIAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.218
2AQU Structure of HIV-1 protease bound to atazanavir 提交 2005-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 Protease, residues 69-167
链 B 69–167（99 aa） 片段：HIV-1 Protease, residues 69-167
未记录 DR7 (3S,8S,9S,12S)-3,12-BIS(1,1-DIMETHYLETHYL)-8-HYDROXY-4,11-DIOXO-9-(PHENYLMETHYL)-6-[[4-(2-PYRIDINYL)PHENYL]METHYL]-2,5, 6,10,13-PENTAAZATETRADECANEDIOIC ACID DIMETHYL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；298 K；0.17M Ammonium Sulfate, 0.085M Sodium Cacodylate, 25.5% PEG 8000, 15% v/v Glycerol anhydrous, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 298 K
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
2B5J Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with JANSSEN-R165481 提交 2005-09-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：RESIDUES 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：RESIDUES 599-1028
突变：C447S 突变：C447S MN MANGANESE (II) ION × 1 3AC (2E)-3-{3-[(5-ETHYL-3-IODO-6-METHYL-2-OXO-1,2-DIHYDROPYRIDIN-4-YL)OXY]PHENYL}ACRYLONITRILE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG8000, AMMINIUM SULPHATE, SODIUM CHLORIDE, Manganese Chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
2B6A Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with THR-50 提交 2005-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：RESIDUES 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：RESIDUES 599-1028
突变：C280S 突变：C280S T50 1-(2,6-DIFLUOROBENZYL)-2-(2,6-DIFLUOROPHENYL)-4-METHYL-1H-BENZIMIDAZOLE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；296 K；PEG8000, AMMINIUM SULPHATE, SODIUM CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 296K
分辨率 2.65 Å R-free 0.277
2BAN Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with JANSSEN-R157208 提交 2005-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：RESIDUES 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：RESIDUES 599-1028
突变：C447S 突变：C447S MN MANGANESE (II) ION × 1 357 5-ETHYL-3-[(2-METHOXYETHYL)METHYLAMINO]-6-METHYL-4-(3-METHYLBENZYL)PYRIDIN-2(1H)-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG8000, AMMINIUM SULPHATE, SODIUM, CHLORID, MANGANESE CHLORIDE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.95 Å R-free 0.305
2BE2 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with R221239 提交 2005-10-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：residues 599-1158
链 B 599–1028（430 aa） 片段：residues 599-1028
突变：C447S 突变：C447S GOL GLYCEROL × 2 MN MANGANESE (II) ION × 1 R22 4-(3,5-DIMETHYLPHENOXY)-5-(FURAN-2-YLMETHYLSULFANYLMETHYL)-3-IODO-6-METHYLPYRIDIN-2(1H)-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；277 K；50mM bisTris Propane, 100mM Ammonium Sulfate, 12% PEG 8000, 10% Glycerol, pH 6.8, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, pH 6.80
分辨率 2.43 Å R-free 0.265
2HB3 Wild-type HIV-1 Protease in complex with potent inhibitor GRL06579 提交 2006-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 500–598（99 aa） 片段：residues 500-598
链 B 500–598（99 aa） 片段：residues 500-598
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A,C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A,C95A CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 2 GRL (3AS,5R,6AR)-HEXAHYDRO-2H-CYCLOPENTA[B]FURAN-5-YL (2S,3S)-3-HYDROXY-4-(4-(HYDROXYMETHYL)-N-ISOBUTYLPHENYLSULFONAMIDO)-1-PHENYLBUTAN-2-YLCARBAMATE × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；295 K；reservior contained 0.1M NaOAc buffer (pH=4.2) and 1.4M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.35 Å R-free 0.192
2HMI HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE/FRAGMENT OF FAB 28/DNA COMPLEX 提交 1998-04-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 599–1156（558 aa）
链 B 599–1028（430 aa）
突变：C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.352
2I5J Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with DHBNH, an RNASE H inhibitor 提交 2006-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1150（552 aa） 片段：residues 599-1150
链 B 599–1027（429 aa） 片段：residues 599-1027
突变：C280S 突变：C280S GLC alpha-D-glucopyranose × 3 K05 (E)-3,4-DIHYDROXY-N'-[(2-METHOXYNAPHTHALEN-1-YL)METHYLENE]BENZOHYDRAZIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM Imidazole pH 6.4, 100 mM Ammonium Sulfate, 15 mM Magnesium Sulfate, 0.6 mM DHBNH, 4% Glucose, 10.5% PEG 8000, 2 mM NaN3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.15 Å R-free 0.269
2IAJ Crystal Structure of K103N/Y181C Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with ATP 提交 2006-09-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：p66
链 B 599–1045（447 aa） 片段：p51
突变：K103N, Y181C, C280S 突变：K103N, Y181C, C280S MN MANGANESE (II) ION × 3 NA SODIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, Bis_Tris propane, ammonium sulfate, glycerol, MnCL2, ATP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K, pH 6.8
分辨率 2.50 Å R-free 0.284
2IC3 Crystal Structure of K103N/Y181C Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with Nonnucleoside Inhibitor HBY 097 提交 2006-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1158（560 aa） 片段：p66
链 B 599–1045（447 aa） 片段：p51
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 1 HBY (S)-4-ISOPROPOXYCARBONYL-6-METHOXY-3-METHYLTHIOMETHYL-3,4-DIHYDROQUINOXALIN-2(1H)-THIONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, BIS_TRIS PROPANE, AMMONIUM SULFATE, GLYCEROL, MNCL2, HBY 097, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.310
2UXZ Two-Carbon-Elongated HIV-1 Protease Inhibitors with a Tertiary- Alcohol-Containing Transition-State Mimic 提交 2007-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
未记录 HI1 METHYL [(1S)-1-({2-[(4R)-4-BENZYL-4-HYDROXY-5-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-5-OXOPENTYL]-2-(4-BROMOBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；0.7 M NACL, 100 MM MES PH5.0
分辨率 1.75 Å R-free 0.213
2UY0 Two-Carbon-Elongated HIV-1 Protease Inhibitors with a Tertiary- Alcohol-Containing Transition-State Mimic 提交 2007-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
未记录 HV1 METHYL [(1S)-1-({2-[(4R)-4-BENZYL-4-HYDROXY-5-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-5-OXOPENTANOYL]-2-(4-BROMOBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；0.7 M NACL, 100 MM MES PH 5.0
分辨率 1.76 Å R-free 0.220
2VG5 Crystal structures of HIV-1 reverse transcriptase complexes with thiocarbamate non-nucleoside inhibitors 提交 2007-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P66 SUBUNIT, RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P51 SUBUNIT, RESIDUES 600-1027
未记录 NNC O-[2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)ethyl] (4-chlorophenyl)thiocarbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.297
2VG6 Crystal structures of HIV-1 reverse transcriptase complexes with thiocarbamate non-nucleoside inhibitors 提交 2007-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P66 SUBUNIT, RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P51 SUBUNIT, RESIDUES 600-1027
未记录 NNB O-[2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)ethyl] (4-bromophenyl)thiocarbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.01 Å R-free 0.335
2VG7 Crystal structures of HIV-1 reverse transcriptase complexes with thiocarbamate non-nucleoside inhibitors 提交 2007-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P66 SUBUNIT, RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：GAG-POL POLYPROTEIN P51 SUBUNIT, RESIDUES 600-1027
未记录 NNI O-[2-(1,3-dioxo-1,3-dihydro-2H-isoindol-2-yl)ethyl] (4-iodophenyl)thiocarbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.82 Å R-free 0.333
2WKZ HIV-1 Protease Inhibitors Containing a Tertiary Alcohol in the Transition-State Mimic with Improved Cell-Based Antiviral Activity 提交 2009-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
未记录 5AH METHYL [(1S)-1-({2-[(3S)-3-BENZYL-3-HYDROXY-4-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-4-OXOBUTYL]-2-(4-PYRIDIN-2-YLBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；PROTEASE 2 MG/ML PRECIPITANT 0.7 M NACL, 100 MM MES PH 5.5
分辨率 1.70 Å R-free 0.252
2WL0 HIV-1 Protease Inhibitors Containing a Tertiary Alcohol in the Transition-State Mimic with Improved Cell-Based Antiviral Activity 提交 2009-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES 5AH METHYL [(1S)-1-({2-[(3S)-3-BENZYL-3-HYDROXY-4-{[(1S,2R)-2-HYDROXY-2,3-DIHYDRO-1H-INDEN-1-YL]AMINO}-4-OXOBUTYL]-2-(4-PYRIDIN-2-YLBENZYL)HYDRAZINO}CARBONYL)-2,2-DIMETHYLPROPYL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.5；2 MG/ML PROTEASE, 0.7 M NACL, 100 MM MES PH5.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.244
2X4U Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 Peptide RT468-476 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 F 908–916（9 aa） 片段：REVERSE TRANSCRIPTASE, RESIDUES 908-916
未记录 GOL GLYCEROL × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
2X4U Crystal structure of MHC CLass I HLA-A2.1 bound to HIV-1 Peptide RT468-476 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 908–916（9 aa） 片段：REVERSE TRANSCRIPTASE, RESIDUES 908-916
未记录 GOL GLYCEROL × 4 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；100 MM MES PH 5.5, 20% PEG 1500. CRYSTALS WERE FROZEN IN 100 MM MES, 30% PEG 1500, 10% GLYCEROL
分辨率 2.10 Å R-free 0.234
2XYE HIV-1 Inhibitors with a Tertiary-Alcohol-containing Transition-State Mimic and various P2 and P1 prime Substituents 提交 2010-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CXG METHYL N-[(2S)-1-[2-[(4R)-5-[[(2S)-3,3-DIMETHYL-1-METHYLAMINO-1-OXO-BUTAN-2-YL]AMINO]-4-HYDROXY-5-OXO-4-(PHENYLMETHYL)PENTYL]-2-[(4-PHENYLPHENYL)METHYL]HYDRAZINYL]-3,3-DIMETHYL-1-OXO-BUTAN-2-YL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；PROTEASE 2MG/ML. PRECIPITANT 0.7M NACL, 100MM MES PH5.5
分辨率 2.00 Å R-free 0.257
2XYF HIV-1 Inhibitors with a Tertiary-Alcohol-containing Transition-State Mimic and various P2 and P1 prime Substituents 提交 2010-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES G40 METHYL N-[(2S)-1-[2-[(4R)-5-[[(2S)-3,3-DIMETHYL-1-METHYLAMINO-1-OXO-BUTAN-2-YL]AMINO]-4-HYDROXY-5-OXO-4-(PHENYLMETHYL)PENTYL]-2-[(4-THIOPHEN-3-YLPHENYL)METHYL]HYDRAZINYL]-3,3-DIMETHYL-1-OXO-BUTAN-2-YL]CARBAMATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5；PROTEASE 2 MG/ML PRECIPITANT 0.7 M NACL, 100 MM MES PH 5.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.250
2YKM Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with a Difluoromethylbenzoxazole (DFMB) Pyrimidine Thioether derivative, a non-nucleoside RT inhibitor (NNRTI) 提交 2011-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：RESIDUES 600-1027
突变：YES YKN 2-[DIFLUORO-[(4-METHYL-PYRIMIDINYL)-THIO]METHYL]-BENZOXAZOLE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å R-free 0.290
2YKN Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with a Difluoromethylbenzoxazole (DFMB) Pyrimidine Thioether derivative, a non-nucleoside RT inhibitor (NNRTI) 提交 2011-05-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa） 片段：RESIDUES 600-1156
链 B 600–1027（428 aa） 片段：RESIDUES 600-1027
突变：YES YKN 2-[DIFLUORO-[(4-METHYL-PYRIMIDINYL)-THIO]METHYL]-BENZOXAZOLE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.12 Å R-free 0.279
2ZD1 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with TMC278 (Rilpivirine), A Non-nucleoside RT Inhibitor 提交 2007-11-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, MgCl2, imidazole, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.248
2ZE2 Crystal structure of L100I/K103N mutant HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with TMC278 (rilpivirine), a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2007-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51
突变：L100I, K103N, K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.299
3BGR Crystal structure of K103N/Y181C mutant HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with TMC278 (Rilpivirine), a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2007-11-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE, pH 6.80, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.269
3DLK Crystal Structure of an engineered form of the HIV-1 Reverse Transcriptase, RT69A 提交 2008-06-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1153（555 aa） 片段：p66 (UNP residues 599 to 1153)
链 B 605–1027（423 aa） 片段：p51 (UNP residues 605 to 1027)
突变：K172A, K173A, C258Q SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；279.15 K；vapor diffusion, temperature 279.15K
分辨率 1.85 Å R-free 0.250
3HVT STRUCTURAL BASIS OF ASYMMETRY IN THE HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS TYPE 1 REVERSE TRANSCRIPTASE HETERODIMER 提交 1994-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 599–1154（556 aa）
链 B 599–1026（428 aa）
未记录 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å
3IG1 HIV-1 Reverse Transcriptase with the Inhibitor beta-Thujaplicinol Bound at the RNase H Active Site 提交 2009-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, residues 600-1027
突变：F759S, C879S 突变：C879S JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；277 K；50 mM Bicine pH 8.2, 45 mM Ammonium Sulfate, 15 mM Manganese Sulfate, 10 mM Spermine, 5 mM Taurine, 2% PEG 400, 10% PEG 8000 Combined with equal volume of: 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 3.5% DMSO, 0.86 mM b-Thujaplicinol, 0.17 mM Reverse Transcriptase, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.255
3IRX Crystal Structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with the Non-nucleoside RT Inhibitor (E)-S-Methyl 5-(1-(3,7-Dimethyl-2-oxo-2,3-dihydrobenzo[d]oxazol-5-yl)-5-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl)-2-methoxy-3-methylbenzothioate. 提交 2009-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K771A, K772A 突变：C879S UDR (E)-S-Methyl 5-(1-(3,7-Dimethyl-2-oxo-2,3-dihydrobenzo[d]oxazol-5-yl)-5-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)pent-1-enyl)-2-methoxy-3-methy lbenzothioate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM immidazole pH 6.4, 10% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 10 mM spermine and 30 mM magnesium sulfate. , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.289
3IS9 Crystal structure of the HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with the alkenyldiarylmethane (ADAM) Non-nucleoside RT Inhibitor dimethyl 3,3'-(6-methoxy-6-oxohex-1-ene-1,1-diyl)bis(5-cyano-6-methoxybenzoate). 提交 2009-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K771A, K772A 突变：C879S AC7 dimethyl 3,3'-(6-methoxy-6-oxohex-1-ene-1,1-diyl)bis(5-cyano-6-methoxybenzoate) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；277 K；11% PEG8000, 15 mM MgSO4, 10 mM Spermine, 100 mM Ammonium sulphate, 50 mM imidazole pH 6.4., temperature 277K
分辨率 2.55 Å R-free 0.282
3ISN Crystal structure of HIV-1 RT bound to A 6-vinylpyrimidine inhibitor 提交 2009-08-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1159（560 aa）
链 D 600–1026（427 aa）
未记录 EDM 6-ethenyl-N,N-dimethyl-2-(methylsulfonyl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；100mM Bis-Tris , 25% PEG 3350, 200mM ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.281
3ITH Crystal structure of the HIV-1 reverse transcriptase bound to a 6-vinylpyrimidine inhibitor 提交 2009-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1026（427 aa）
未记录 EDM 6-ethenyl-N,N-dimethyl-2-(methylsulfonyl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；25% PEG 3350, 100mM Hepes, 200mM ammonium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.270
3ITH Crystal structure of the HIV-1 reverse transcriptase bound to a 6-vinylpyrimidine inhibitor 提交 2009-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1159（560 aa）
链 D 600–1026（427 aa）
未记录 EDM 6-ethenyl-N,N-dimethyl-2-(methylsulfonyl)pyrimidin-4-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；25% PEG 3350, 100mM Hepes, 200mM ammonium acetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.270
3JSM K65R mutant HIV-1 reverse transcriptase cross-linked to DS-DNA and complexed with tenofovir-diphosphate as the incoming nucleotide substrate 提交 2009-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1157（558 aa）
链 B 600–1028（429 aa）
突变：K65R, Q258C, C280S 突变：C280S TNV [2-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-1-METHYLETHOXY]METHYL-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；10% PEG 8000, 100 MM AMMONIUM SULFATE, 20 MM MGCL2, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
3JYT K65R mutant HIV-1 reverse transcriptase cross-linked to DS-DNA and complexed with DATP as the incoming nucleotide substrate 提交 2009-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1157（558 aa）
链 B 600–1028（429 aa）
突变：K65R, Q258C, C280S 突变：C280S DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；10% PEG 8000, 100 MM AMMONIUM SULFATE, 20 MM MGCL2, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.287
3K2P HIV-1 Reverse Transcriptase Isolated RnaseH Domain with the Inhibitor beta-thujaplicinol Bound at the Active Site 提交 2009-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1026–1159（134 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M Formate pH 7.0, 10% PEG 3350, 10mM MnCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.04 Å R-free 0.241
3K2P HIV-1 Reverse Transcriptase Isolated RnaseH Domain with the Inhibitor beta-thujaplicinol Bound at the Active Site 提交 2009-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1026–1159（134 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M Formate pH 7.0, 10% PEG 3350, 10mM MnCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.04 Å R-free 0.241
3K2P HIV-1 Reverse Transcriptase Isolated RnaseH Domain with the Inhibitor beta-thujaplicinol Bound at the Active Site 提交 2009-09-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1026–1159（134 aa）
链 B 1026–1159（134 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 JTH 2,7-dihydroxy-4-(propan-2-yl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；295 K；0.2M Formate pH 7.0, 10% PEG 3350, 10mM MnCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.04 Å R-free 0.241
3K4V New crystal form of HIV-1 Protease/Saquinavir structure reveals carbamylation of N-terminal proline 提交 2009-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K L33I L63I C67A C95A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：Q7K L33I L63I C67A C95A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.39 Å R-free 0.227
3K4V New crystal form of HIV-1 Protease/Saquinavir structure reveals carbamylation of N-terminal proline 提交 2009-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 501–599（99 aa）
链 D 501–599（99 aa）
突变：Q7K L33I L63I C67A C95A 突变：Q7K L33I L63I C67A C95A DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.39 Å R-free 0.227
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 600–1159（560 aa）
链 F 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 I 600–1159（560 aa）
链 J 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLE Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 M 600–1159（560 aa）
链 N 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 6.8, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, 5 MM SPERMIDINE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.20 Å R-free 0.308
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 600–1154（555 aa）
链 F 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 I 600–1154（555 aa）
链 J 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLF Crystal structure of wild-type HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to a DSDNA with a bound excision product, AZTPPPPA 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 M 600–1154（555 aa）
链 N 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 ZP4 [[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl]oxy-hydroxy-phosphoryl] [(2S,3S,5R)-3-azido-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH6.4, 10-11% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, AND 5 MM SPERMIDINE, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.15 Å R-free 0.288
3KLG Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to pre-translocation AZTMP-Terminated DNA (COMPLEX N) 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 5.6, 10% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.65 Å R-free 0.350
3KLG Crystal structure of AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to pre-translocation AZTMP-Terminated DNA (COMPLEX N) 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 600–1159（560 aa）
链 F 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.4；50 MM BIS-TRIS PROPANE PH 5.6, 10% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 3.65 Å R-free 0.350
3KLH Crystal structure of AZT-Resistant HIV-1 Reverse Transcriptase crosslinked to post-translocation AZTMP-Terminated DNA (COMPLEX P) 提交 2009-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 600–1161（562 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；100 MM CACODYLATE PH 6.0, 31-34% SATURATED AMMONIUM SULFATE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
3KLI Crystal structure of unliganded AZT-resistant HIV-1 Reverse Transcriptase 提交 2009-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q, Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；50 MM BIS-TRIS PROPANE, 10% PEG8000, 0.3 M (NH4)2SO4, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE, 20 MM MGCL2, PH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.294
3NDT HIV-1 Protease Saquinavir:Ritonavir 1:1 complex structure 提交 2010-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–99（99 aa）
链 B 1–99（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 CL CHLORIDE ION × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.72 Å R-free 0.229
3NDT HIV-1 Protease Saquinavir:Ritonavir 1:1 complex structure 提交 2010-06-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–99（99 aa）
链 D 1–99（99 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；AMMONIUM SULFATE, DMSO, SODIUM CITRATE, pH 6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.72 Å R-free 0.229
3NU3 Wild Type HIV-1 Protease with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 5.6 with 0.1M MES and 0.6-0.8M sodium chloride. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.02 Å R-free 0.142
3NU4 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant V32I with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, V32I, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, V32I, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；The vapour diffusion, hanging drop method is applied. Amprenvir was dissolved in DMSO. Protein concentration is 2.2 mg/ml. The ratio of inhibitor to protein is 5:1 in 0.1 M sodium acetate buffer (ph=5.4), with 0.4M NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.20 Å R-free 0.200
3NU5 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I50V with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, I50V, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, I50V, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 7 ACT ACETATE ION × 2 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 3.5 mg/ml protein solution at pH 5.4 with 1M NaCl, 0.2M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 10:1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.29 Å R-free 0.193
3NU6 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I54M with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, I54M, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, I54M, L63I, C67A, C95A CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 2 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 4.6 with 0.1M sodium acetate, 0.67M sodium chloride. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.16 Å R-free 0.188
3NU9 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I84V with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, I84V, C95A 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 IOD IODIDE ION × 30 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 4.0 with 0.13M NaI, 0.1M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.85 Å R-free 0.236
3NUJ Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant I54V with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, I54V, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, I54V, L63I, C67A, C95A IOD IODIDE ION × 19 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 2.2 mg/ml protein solution at pH 5.4 with 0.13M NaCl, 0.1M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.50 Å R-free 0.197
3NUO Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant L90M with Antiviral Drug Amprenavir 提交 2010-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, L90M, C95A IOD IODIDE ION × 19 478 {3-[(4-AMINO-BENZENESULFONYL)-ISOBUTYL-AMINO]-1-BENZYL-2-HYDROXY-PROPYL}-CARBAMIC ACID TETRAHYDRO-FURAN-3-YL ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；Crystal was grown by the hanging-drop vapor-diffusion method at room temperature, from a 3.7 mg/ml protein solution at pH 4.8 with 0.2M NaI, 0.1M NaOAc. The inhibitor was mixed with protease in a ratio 5:1 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.35 Å R-free 0.199
3OK9 Crystal structure of wild-type HIV-1 protease with new oxatricyclic designed inhibitor GRL-0519A 提交 2010-08-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q507K, L533I, L563I, C567A, C595A 突变：Q507K, L533I, L563I, C567A, C595A G52 (3R,3aS,3bR,6aS,7aS)-octahydrodifuro[2,3-b:3',2'-d]furan-3-yl [(1S,2R)-1-benzyl-2-hydroxy-3-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}propyl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 6 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.18 M NaCl, 0.1 M Acetate, pH 4.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.27 Å R-free 0.189
3QAA HIV-1 wild type protease with a substituted bis-Tetrahydrofuran inhibitor, GRL-044-10A 提交 2011-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A G04 (3R,3aS,4R,6aR)-4-methoxyhexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；pH 5.5, 0.1 M Sodium Citrate, 1.2 M Sodium Chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.40 Å R-free 0.230
3QLH HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with Manicol at the RNase H Active Site and TMC278 (Rilpivirine) at the NNRTI Binding Pocket 提交 2011-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：P66 (UNP residues 600-1153)
链 B 605–1027（423 aa） 片段：P51 (UNP residues 605-1027)
未记录 MNK (2S)-5,7-dihydroxy-9-methyl-2-(prop-1-en-2-yl)-1,2,3,4-tetrahydro-6H-benzo[7]annulen-6-one × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；277 K；Protein solution (20 mg/mL in 9.2 mM Tris pH 8.0, 68.7 mM NaCl, 3.6 mM manganese sulfate, 0.7 mM TCEP, 0.9 mM Manicol, 0.7 mM TMC278, 0.27% BOG, 7% DMSO) Mother Liquor (50 mM HEPES pH 7.5, 100 mM ammonium sulfate, 15 m manganese sulfate, 10 mM spermine, 5 mM TCEP, 11% PEG8000) Cryoprotectant (50 mM HEPES pH 7.5, 50 mM NaCl, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM manganese sulfate, 10 mM spermine, 0.69 mM Manicol, 0.34 mM TMC278, 15% PEG8000, 5% PEG400, 10% DMSO, 11% ethylene glycol, 6.5% trimethylamine N-oxide), flash-cooled in LN2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.251
3QO9 Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with TSAO-T, a non-nucleoside RT inhibitor (NNRTI) 提交 2011-02-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：F160S, C280S 突变：C280S QO9 1-[(5R,6R,8R,9R)-4-amino-9-{[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}-6-({[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy}methyl)-2,2-dioxido-1,7-dioxa-2-thiaspiro[4.4]non-3-en-8-yl]-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；279 K；PEG8000, 50mM imidazole pH 6.8 and 0.1M ammonium sulfate, EVAPORATION, temperature 279K
分辨率 2.60 Å R-free 0.286
3TLH STRUCTURAL STUDIES OF HIV AND FIV PROTEASES COMPLEXED WITHAN EFFICIENT INHIBITOR OF FIV PR 提交 1998-12-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 69–167（99 aa）
未记录 3TL benzyl [(1S,4S,7S,8R,9R,10S,13S,16S)-7,10-dibenzyl-8,9-dihydroxy-1,16-dimethyl-4,13-bis(1-methylethyl)-2,5,12,15,18-pentaoxo-20-phenyl-19-oxa-3,6,11,14,17-pentaazaicos-1-yl]carbamate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 5.4；SAMPLE: 3.0MG/ML HIVPR IN 25MM NAACETATE WITH 1MM EDTA AND 10MM DTT AT PH 5.5. WELL SOLUTION: 1.3M AMMONIUM SULFATE IN SODIUM ACETATE BUFFER AT PH 5.3 MIXING SAMPLE AND WELL SOLLUTION 1:1, pH 5.4
分辨率 2.00 Å R-free 0.281
3V4I Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and AZTTP 提交 2011-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE, pH 7.2, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.262
3V4I Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and AZTTP 提交 2011-12-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE, pH 7.2, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 2.80 Å R-free 0.262
3V6D Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) cross-linked with AZT-terminated DNA 提交 2011-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3V6D Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) cross-linked with AZT-terminated DNA 提交 2011-12-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
3V81 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and the nonnucleoside inhibitor nevirapine 提交 2011-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, Bis-Tris propane , pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.298
3V81 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and the nonnucleoside inhibitor nevirapine 提交 2011-12-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP Residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP Residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.8；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, sucrose, glycerol, magnesium chloride, Bis-Tris propane , pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.298
3ZPS Design and Synthesis of P1-P3 Macrocyclic Tertiary Alcohol Comprising HIV-1 Protease Inhibitors 提交 2013-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 EQM methyl N-[(2S)-1-[2-[(4-bromophenyl)methyl]-2-[(4R)-5-[[(2S)-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-1-(prop-2-enylamino)butan-2-yl]amino]-4-oxidanyl-5-oxidanylidene-4-(phenylmethyl)pentyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.55 Å R-free 0.210
3ZPT Design and Synthesis of P1-P3 Macrocyclic Tertiary Alcohol Comprising HIV-1 Protease Inhibitors 提交 2013-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 M8Y methyl N-[(2S)-1-[2-[(4-bromophenyl)methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),3,13(17),14-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.54 Å R-free 0.242
3ZPU Design and Synthesis of P1-P3 Macrocyclic Tertiary Alcohol Comprising HIV-1 Protease Inhibitors 提交 2013-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 3 M8B methyl N-[(2S)-1-[2-[(4-bromophenyl)methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-8-tert-butyl-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(15),3,13,16-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 0.7 M NACL, 100 MM MES PH5.0
分辨率 1.80 Å R-free 0.224
4COE Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 M17 methyl {(2S)-1-[2-(biphenyl-4-ylmethyl)-2-{(4R)-4-hydroxy-5-{[(2S)-3-methyl-1-oxo-1-(prop-2-en-1-ylamino)butan-2-yl]amino}-5-oxo-4-[4-(prop-2-en-1-yl)benzyl]pentyl}hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.45 Å R-free 0.261
4CP7 Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-01-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 9MW methyl [(2S)-1-(2-{(4R)-4-hydroxy-5-{[(2S)-3-methyl-1-oxo-1-(prop-2-en-1-ylamino)butan-2-yl]amino}-5-oxo-4-[4-(prop-2-en-1-yl)benzyl]pentyl}-2-[4-(pyridin-4-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.206
4CPQ Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 9MW methyl [(2S)-1-(2-{(4R)-4-hydroxy-5-{[(2S)-3-methyl-1-oxo-1-(prop-2-en-1-ylamino)butan-2-yl]amino}-5-oxo-4-[4-(prop-2-en-1-yl)benzyl]pentyl}-2-[4-(pyridin-4-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.35 Å R-free 0.273
4CPR Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 378 methyl ~{N}-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[2-[(4~{R})-5-[[(2~{S})-3-methyl-1-oxidanylidene-1-(prop-2-enylamino)butan-2-yl]amino]-4-oxidanyl-5-oxidanylidene-4-[(4-prop-2-enylphenyl)methyl]pentyl]-2-[(4-thiophen-2-ylphenyl)methyl]hydrazinyl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.212
4CPS Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 1T8 methyl [(2S)-1-(2-{3-[(3R,6S,10Z)-3-hydroxy-4,7-dioxo-6-(propan-2-yl)-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(15),10,13,16-tetraen-3-yl]propyl}-2-[4-(pyridin-3-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.55 Å R-free 0.202
4CPT Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 1T8 methyl [(2S)-1-(2-{3-[(3R,6S,10Z)-3-hydroxy-4,7-dioxo-6-(propan-2-yl)-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(15),10,13,16-tetraen-3-yl]propyl}-2-[4-(pyridin-3-yl)benzyl]hydrazinyl)-3,3-dimethyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.70 Å R-free 0.203
4CPU Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 V78 methyl N-[(2S)-1-[2-[[4-[(3S)-3,4-dihydrothiophen-3-yl]phenyl]methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),3,13(17),14-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.82 Å R-free 0.317
4CPW Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 V78 methyl N-[(2S)-1-[2-[[4-[(3S)-3,4-dihydrothiophen-3-yl]phenyl]methyl]-2-[3-[(3Z,8S,11R)-11-oxidanyl-7,10-bis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-6,9-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),3,13(17),14-tetraen-11-yl]propyl]hydrazinyl]-3,3-dimethyl-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.70 Å R-free 0.197
4CPX Macrocyclic Transition-State Mimicking HIV-1 Protease Inhibitors Encompassing a Tertiary Alcohol 提交 2014-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 J3W methyl ~{N}-[(2~{S})-3,3-dimethyl-1-[2-[3-[(3~{R},6~{S},10~{Z})-3-oxidanyl-4,7-bis(oxidanylidene)-6-propan-2-yl-5,8-diazabicyclo[11.2.2]heptadeca-1(16),10,13(17),14-tetraen-3-yl]propyl]-2-[(4-thiophen-2-ylphenyl)methyl]hydrazinyl]-1-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.85 Å R-free 0.335
4DG1 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with polymorphism mutation K172A and K173A 提交 2012-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1148（549 aa）
链 B 600–1026（427 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；50 mM bis-tris, 100 mM ammonium sulfate, 10% glycerol, 12% PEG 8000, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.15 Å R-free 0.247
4G1Q Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with Rilpivirine (TMC278, Edurant), a non-nucleoside rt-inhibiting drug 提交 2012-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51, UNP residues 600-1027
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2,IMIDAZOLE, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.51 Å R-free 0.193
4H4M Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4- dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ494), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2012-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p66 Subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p55 Subunit
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 494 (2E)-3-(3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, 50 mM HEPES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.85 Å R-free 0.273
4H4O Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with (E)-3-(3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)- 4-fluorophenoxy)-5-fluorophenyl)acrylonitrile (JLJ506), A Non-nucleoside inhibitor 提交 2012-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p66 Subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：HIV-1 Reverse Transcriptase, p51 Subunit
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 506 (2E)-3-(3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-5-fluorophenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, 50 mM HEPES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.265
4I2P Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with rilpivirine (TMC278) based analogue 提交 2012-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 (UNP Residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 (UNP Residues 600-1077)
突变：C879S, K771A, K772A 突变：C879S G73 (2E)-3-[4-({6-[(4-methoxyphenyl)amino]-7H-purin-2-yl}amino)-3,5-dimethylphenyl]prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；301 K；50 mM imidazole pH 6.6, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM manganese sulfate, 10 mM spermine, 5 mM TCEP, 11% (w/w) PEG 8000, and 5% PEG 400, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 301K
分辨率 2.30 Å R-free 0.260
4I2Q Crystal structure of K103N/Y181C mutant of HIV-1 reverse transcriptase in complex with rilpivirine (TMC278) analogue 提交 2012-11-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 (UNP Residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 (UNP Residues 600-1077)
突变：K702N, K771A, K772A, Y780C, C879S 突变：C879S 1BT (2E)-3-(4-{[6-(1,3-benzothiazol-5-ylamino)-9H-purin-2-yl]amino}-3,5-dimethylphenyl)prop-2-enenitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.277
4ICL HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the incoming dNTP binding site 提交 2012-12-10 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 14N 4-(4-methylpiperazin-1-yl)benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, TEMPERATURE 277.0K , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.80 Å R-free 0.199
4ID5 HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the RNase H primer grip site 提交 2012-12-11 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 17 1FF 1-methyl-5-phenyl-1H-pyrazole-4-carboxylic acid × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.7；pH 6.7
分辨率 1.95 Å R-free 0.209
4IDK HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the 428 site 提交 2012-12-12 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 1FE N-(2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-5-yl)glycinamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE,AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
4IFV Detecting Allosteric Sites of HIV-1 Reverse Transcriptase by X-Ray Crystallographic Fragment Screening 提交 2012-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 FMQ [1-(4-fluorophenyl)-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl]methanol × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.219
4IFY HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the Knuckles site 提交 2012-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 16 1FD 1-[4-(trifluoromethoxy)phenyl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.213
4IG3 HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment near Knuckles site 提交 2012-12-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：P66 (unp residues 600-1154)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 (unp residues 600-1027)
突变：K771A, K772A, C879S 突变：C879S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 15 J94 (5S)-6,6-dimethyl-5-[(6R)-8-oxo-6,8-dihydrofuro[3,4-e][1,3]benzodioxol-6-yl]-5,6,7,8-tetrahydro[1,3]dioxolo[4,5-g]isoquinolin-6-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, PH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.203
4KFB HIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at NNRTI adjacent site 提交 2013-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 604–1027（424 aa） 片段：p51 RT
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 1QP ethyl pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxylate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；11% PEG 8000, 4% PEG 400, 50 MM IMIDAZOLE, 10 MM SPERMINE, 15 MM MGSO4, 100 MM AMMONIUM SULFATE, AND 5 MM TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.85 Å R-free 0.214
4KKO Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 4-((4-methoxy-6-(2-morpholinoethoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)-2-((3-methylbut-2-en-1-yl)oxy)benzonitrile (JLJ513), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-05-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 1RE 4-({4-methoxy-6-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)-2-(3-methylbutoxy)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；17.5% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.289
4KO0 CRYSTAL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) IN COMPLEX WITH an anilinylpyrimidine derivative (JLJ-135) 提交 2013-05-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S JLJ 4-[(4-methoxypyrimidin-2-yl)amino]-2-[(3-methylbut-2-en-1-yl)oxy]benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE , pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 1.95 Å R-free 0.275
4LSL Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ476), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 1YQ (2E)-3-(3-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；15% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.69 Å R-free 0.270
4LSN Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-bromo-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ518), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-07-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 1YR (2E)-3-(3-bromo-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；15% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.301
4MFB Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-08-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：HIV-1 reverse transcriptase, p66 subunit (chain A)
链 B 600–1027（428 aa） 片段：HIV-1 reverse transcriptase, p51 subunit (chain B)
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；12.5% (w/v) PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM MES pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.88 Å R-free 0.269
4O44 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with 4-((4-(mesitylamino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ529), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 2RS 4-({4-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-6-[(2,4,6-trimethylphenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20.0% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, and 50 mM citric acid pH 5.5 or 50 mM HEPES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.290
4O4G Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with 4-((4-(mesitylamino)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ527), a non-nucleoside inhibitor 提交 2013-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 2RT 4-({4-[(2,4,6-trimethylphenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；20.0% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine-HCl, and 50 mM citric acid pH 5.5 or 50 mM HEPES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.71 Å R-free 0.299
4OJR Crystal Structure of the HIV-1 Integrase catalytic domain with GSK1264 提交 2014-01-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1209–1371（163 aa） 片段：UNP residues 1209-1371
突变：F185K 2SQ (2S)-tert-butoxy[4-(8-fluoro-5-methyl-3,4-dihydro-2H-chromen-6-yl)-2-methyl-1-oxo-1,2-dihydroisoquinolin-3-yl]ethanoic acid × 2 CAC CACODYLATE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；7% Peg 8K, 0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M sodiium cacodylate pH 6.5, 5mM MgCl2, 5mM MnCl2, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.82 Å R-free 0.201
4PQU Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with RNA/DNA and dATP 提交 2014-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C,C280S,D498N 突变：C280S DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG8000, Bis-tris propane, magnesium chloride, ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.51 Å R-free 0.266
4PQU Crystal structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with RNA/DNA and dATP 提交 2014-03-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C,C280S,D498N 突变：C280S DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG8000, Bis-tris propane, magnesium chloride, ammonium sulfate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.51 Å R-free 0.266
4PUO Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
4PUO Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.285
4PWD Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with bulge-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2-7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.291
4PWD Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with bulge-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mM magnesium chloride, pH 7.2-7.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.291
4Q0B Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with gap-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mm magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.317
4Q0B Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with gap-RNA/DNA and Nevirapine 提交 2014-04-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：pentameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；9-11% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose, 20 mm magnesium chloride, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 3.30 Å R-free 0.317
4QAG Structure of a dihydroxycoumarin active-site inhibitor in complex with the RNASE H domain of HIV-1 reverse transcriptase 提交 2014-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；100 mM Bicine pH 8.2, 10 mM Manganese Sulfate, 1 mM Sodium Azide, 9% PEG 3350, combined with equal volume of 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 20 mg/mL (1.34 mM) RNase H, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.71 Å R-free 0.190
4QAG Structure of a dihydroxycoumarin active-site inhibitor in complex with the RNASE H domain of HIV-1 reverse transcriptase 提交 2014-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；100 mM Bicine pH 8.2, 10 mM Manganese Sulfate, 1 mM Sodium Azide, 9% PEG 3350, combined with equal volume of 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 20 mg/mL (1.34 mM) RNase H, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.71 Å R-free 0.190
4QAG Structure of a dihydroxycoumarin active-site inhibitor in complex with the RNASE H domain of HIV-1 reverse transcriptase 提交 2014-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
链 B 1024–1156（133 aa） 片段：UNP residues 1024-1156
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；100 mM Bicine pH 8.2, 10 mM Manganese Sulfate, 1 mM Sodium Azide, 9% PEG 3350, combined with equal volume of 10 mM Tris pH 8.0, 75 mM NaCl, 20 mg/mL (1.34 mM) RNase H, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.71 Å R-free 0.190
4R5P Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and a nucleoside triphosphate mimic alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；10% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% w/v sucrose, 5% w/v glycerol, 20 mM magnesium chloride, 50 mM Bis-Tris propane, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.251
4R5P Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) with DNA and a nucleoside triphosphate mimic alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor 提交 2014-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa） 片段：UNP residues 600-1153
链 D 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.2；277 K；10% PEG8000, 100 mM ammonium sulfate, 5% w/v sucrose, 5% w/v glycerol, 20 mM magnesium chloride, 50 mM Bis-Tris propane, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.89 Å R-free 0.251
4RW4 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N,Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4- dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ494), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 494 (2E)-3-(3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16-20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid (pH 7.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.67 Å R-free 0.278
4RW6 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(2,4-dioxo-3,4- dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ494), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 494 (2E)-3-(3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；16-20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 6.0-6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.63 Å R-free 0.280
4RW7 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N, Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ532), a non-nucleoside inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 3X6 (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.01 Å R-free 0.266
4RW8 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ532), a non-nucleoside inhibitor' 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 3X6 (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.88 Å R-free 0.282
4RW9 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) variant in complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ532), a non-nucleoside inhibitor 提交 2014-12-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S 3X6 (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；16-20% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid pH 6.0 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.99 Å R-free 0.280
4U8W HIV-1 wild Type protease with GRL-050-10A (a Gem-difluoro-bis-Tetrahydrofuran as P2-Ligand) 提交 2014-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A G10 (3R,3aS,6aS)-4,4-difluorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 ACT ACETATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；1M NaCl, 0.1 M Na Acetate, pH 4.8
分辨率 1.30 Å R-free 0.188
4WE1 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600) 提交 2014-09-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；18% w/v PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 50 mM Imidazole (pH 6.5), and 5 mM spermine-HCl
分辨率 2.49 Å R-free 0.287
4YE3 Crystal Structure of Multidrug Resistant HIV-1 Protease Clinical Isolate PR20 with Inhibitor GRL-4410A 提交 2015-02-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,C95A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M 突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,C95A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M Y1 YTTRIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 2 G04 (3R,3aS,4R,6aR)-4-methoxyhexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.2M Sodium Chloride, 0.1M Sodium Acetate pH 5.5, 0.01M Yittrium Chloride
分辨率 1.35 Å R-free 0.200
4YHQ Crystal structure of multidrug resistant clinical isolate PR20 with GRL-5010A 提交 2015-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M,C95A 突变：Q7K,L10F,I13V,I15V,D30N,V32I,L33F,E35D,M36I,S37N,I47V,I54L,Q58E,I62V,L63P,C67A,A71V,I84V,N88D,L89T,L90M,C95A G10 (3R,3aS,6aS)-4,4-difluorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 Y1 YTTRIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 5 NA SODIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.15M sodium chloride, 0.1M sodium acetate pH 5.5 and 0.01M Yittrium chloride
分辨率 1.30 Å R-free 0.210
4ZIP HIV-1 wild Type protease with GRL-0648A (a isophthalamide-derived P2-Ligand) 提交 2015-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 3 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 G64 N-[(2,5-dimethyl-1,3-oxazol-4-yl)methyl]-N'-[(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]-N,5-dimethylbenzene-1,3-dicarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；0.95 M NaCl, 0.1 M Sodium Acetate, pH 5
分辨率 1.11 Å R-free 0.154
4ZLS HIV-1 wild Type protease with GRL-096-13A (a Boc-derivative P2-Ligand, 3,-5-dimethylbiphenyl P1-Ligand) 提交 2015-05-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 G61 tert-butyl [(2S,3R)-1-(3',5'-dimethoxybiphenyl-3-yl)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}butan-2-yl]carbamate × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；1.4M NaCl, 0.1 M Na Acetate, pH 4.8
分辨率 1.53 Å R-free 0.251
5AGZ Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 QHA (3R,3aS,4R,6aR)-4-[(2-fluoroprop-2-en-1-yl)oxy]hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[2-(methylamino)-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.20 Å R-free 0.221
5AH6 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7U (3R,3aS,4R,6aS)-4-chlorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[2-(methylamino)-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.225
5AH7 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7J (3R,3aS,4R,6aS)-4-chlorohexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.55 Å R-free 0.238
5AH8 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7W (3R,3aS,4R,6aR)-4-(3,3,3-trifluoropropoxy)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[2-(methylamino)-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.26 Å R-free 0.221
5AH9 Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 C7L (3R,3aS,4R,6aR)-4-(2-methoxyethoxy)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.44 Å R-free 0.215
5AHA Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 ZLP (3R,3aS,4R,6aR)-4-(2-methoxyethoxy)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[(2Z)-2-(methylimino)-2,3-dihydro-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.35 Å R-free 0.225
5AHB Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 J5L (3R,3aS,4R,6aR)-4-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl {(2S,3R)-3-hydroxy-4-[{[(2Z)-2-(methylimino)-2,3-dihydro-1,3-benzoxazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.220
5AHC Disubstituted bis-THF moieties as new P2 ligands in non-peptidal HIV- 1 Protease Inhibitors (II) 提交 2015-02-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
链 B 501–599（99 aa） 片段：ASPARTYL PROTEASE, RESIDUES 501-599
突变：YES 突变：YES CL CHLORIDE ION × 3 VXL (3R,3aS,4R,6aR)-4-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.50 Å R-free 0.229
5BRY HIV-1 wild Type protease with GRL-011-11A (a methylamine bis-Tetrahydrofuran P2-Ligand, sulfonamide isostere derivate) 提交 2015-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 3 4UY (3R,3aS,4R,6aR)-4-(methylamino)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-3-hydroxy-4-{[(4-methoxyphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；1.4 M NaCl, 0.1 M sodium Acetate, pH 4.6
分辨率 1.34 Å R-free 0.205
5BS4 HIV-1 wild Type protease with GRL-047-11A (a methylamine bis-Tetrahydrofuran P2-Ligand, 4-amino sulfonamide derivative) 提交 2015-06-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 突变：Q7K, L33I, L63I, C67A, C95A 4UX (3R,3aS,4R,6aR)-4-(methylamino)hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-aminophenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 ACT ACETATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；1.0M NaCl, 0.1M NaAcetate, pH=5.0
分辨率 1.29 Å R-free 0.210
5C24 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-((4-((4-cyanophenyl)amino)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)-6,8-dimethylindolizine-2-carbonitrile (JLJ605), a non-nucleoside inhibitor 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1144（545 aa） 片段：UNP residues 604-1144
链 B 604–1027（424 aa） 片段：UNP residues 604-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 4XO 6-({4-[(4-cyanophenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)-5,7-dimethylindolizine-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；20% v/v PEG 8000, 50 mM HEPES (pH 7.0),100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine-HCl using hanging drop vaporization
分辨率 2.60 Å R-free 0.258
5C25 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 6-((4-((4-cyanophenyl)amino)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)-5,7-dimethyl-2-naphthonitrile (JLJ639), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 639 6-({4-[(4-cyanophenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}amino)-5,7- dimethyl-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；14% PEG 8000, 100 mM Ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, 15 mM HEPES pH 7.0
分辨率 2.84 Å R-free 0.263
5C42 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K101P) Variant in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2015-06-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：K101P, K172A, K173A, C280S 突变：C280S 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；co-crystallization; 15% PEG 8000 (50% (w/v)), in pH 7.0 solution (0.125 M HEPES, 0.0125 M spermine-HCl, 0.04 M magnesium sulfate, 0.04 M ammonium sulfate)
分辨率 3.50 Å R-free 0.282
5CYM HIV-1 reverse transcriptase complexed with 4-iodopyrazole 提交 2015-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 IOD IODIDE ION × 14 PYZ 4-IODOPYRAZOLE × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；50 mM Imidazole pH 6.6, 10% PEG 8k, 5%PEG400, 100 mM A/S, 15 mM MgSO4, 10 mM Spermine, 5 mM TCEP
分辨率 2.10 Å R-free 0.229
5CYQ HIV-1 reverse transcriptase complexed with 4-bromopyrazole 提交 2015-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 BYZ 4-bromo-1H-pyrazole × 15 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 10 BR BROMIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；277 K；50 mM Imidazole pH 6.6, 10% PEG 8k, 5% PEG400, 100 mM A/S, 15 mM MgSO4, 10 mM Spermine, 5 mM TCEP
分辨率 2.15 Å R-free 0.224
5D3G Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Bound to a Novel 38-mer Hairpin Template-Primer DNA Aptamer 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；278 K；7% PEG 8000, 25 mM BisTris-Propane pH 6.8, 75 mM BisTris-Propane pH 7.4, 50 mM Ammonium Sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose
分辨率 2.30 Å R-free 0.225
5D3G Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Bound to a Novel 38-mer Hairpin Template-Primer DNA Aptamer 提交 2015-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；278 K；7% PEG 8000, 25 mM BisTris-Propane pH 6.8, 75 mM BisTris-Propane pH 7.4, 50 mM Ammonium Sulfate, 5% glycerol, 5% sucrose
分辨率 2.30 Å R-free 0.225
5FDL Crystal Structure of K103N/Y181C Mutant HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in Complex with IDX899 提交 2015-12-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1156（557 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：YES 突变：YES 5DV methyl (R)-(2-carbamoyl-5-chloro-1H-indol-3-yl)[3-(2-cyanoethyl)-5-methylphenyl]phosphinate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Protein was concentrated to 14 mg/ml in the presence of 0.5 mM inhibitor A051606P then used in successive crystal micro-seeding experiments to yield protein crystals of 0.3 mm x 0.3 mm x 0.2 mm in 1.4 M Sodium Malonate.
分辨率 3.10 Å R-free 0.299
5HBM Crystal Structure of a Dihydroxycoumarin RNase H Active-Site Inhibitor in Complex with HIV-1 Reverse Transcriptase 提交 2015-12-31 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain, residues 600-1153
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain, residues 604-1027
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 F95 (7,8-dihydroxy-2-oxo-2H-chromen-4-yl)acetic acid × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；PEG 8000, (NH4)2SO4, GLYCEROL, BIS TRIS PROPANE
分辨率 3.04 Å R-free 0.274
5HLF STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A 38-MER HAIRPIN TEMPLATE-PRIMER DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXYPHOSPHONATE INHIBITOR 提交 2016-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 2 64A {[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}propanedioic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH, 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
5HLF STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A 38-MER HAIRPIN TEMPLATE-PRIMER DNA APTAMER AND AN ALPHA-CARBOXYPHOSPHONATE INHIBITOR 提交 2016-01-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：D498N MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH, 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
5HP1 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and FOSCARNET, a Pyrophosphate analog 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 PPF PHOSPHONOFORMIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ATM 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25mM, BISTRIS-PROPANE, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
5HP1 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and FOSCARNET, a Pyrophosphate analog 提交 2016-01-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 4 PPF PHOSPHONOFORMIC ACID × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATM 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25mM, BISTRIS-PROPANE, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
5HRO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and an Alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor (alpha-CNP) 提交 2016-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；7% PEG 8000, 100 MM BISTRIS-PROPANE, AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
5HRO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE In COMPLEX WITH A DNA aptamer and an Alpha-carboxy nucleoside phosphonate inhibitor (alpha-CNP) 提交 2016-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 3JY [(1R)-2-methoxy-1-{[(1S,3R)-3-(5-methyl-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)cyclopentyl]oxy}-2-oxoethyl]phosphonic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；7% PEG 8000, 100 MM BISTRIS-PROPANE, AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.75 Å R-free 0.265
5I3U STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE N-SITE COMPLEX; CATALYTIC INCORPORATION OF AZTMP to A DNA aptamer in CRYSTAL 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
5I3U STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE N-SITE COMPLEX; CATALYTIC INCORPORATION OF AZTMP to A DNA aptamer in CRYSTAL 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.00 Å R-free 0.254
5I42 Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with a DNA aptamer, AZTTP, and CA(2+) ion 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.30 Å R-free 0.247
5I42 Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with a DNA aptamer, AZTTP, and CA(2+) ion 提交 2016-02-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 AZT 3'-AZIDO-3'-DEOXYTHYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；7% PEG 8000, 25 MM BISTRIS-PROPANE PH 6.8, 75 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.4, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.30 Å R-free 0.247
5J1E Crystal Structure of a Hydroxypyridone Carboxylic Acid Active-Site RNase H Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2016-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain, residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain, residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.1；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, MES
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
5J1E Crystal Structure of a Hydroxypyridone Carboxylic Acid Active-Site RNase H Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2016-03-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain, residues 600-1154
链 D 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain, residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 6FT 5-hydroxy-4-oxo-1-[(4'-sulfamoyl[1,1'-biphenyl]-4-yl)methyl]-1,4-dihydropyridine-3-carboxylic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.1；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, MES
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
5TER Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ651), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2016-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7AY 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.70 Å R-free 0.267
5TUQ Crystal Structure of a 6-Cyclohexylmethyl-3-hydroxypyrimidine-2,4-dione Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2016-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S J63 1-[(benzyloxy)methyl]-6-(cyclohexylmethyl)-3-hydroxy-5-(propan-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.1；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, MES
分辨率 2.71 Å R-free 0.265
5TW3 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2016-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.85 Å R-free 0.273
5TXL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.50 Å R-free 0.225
5TXL STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.50 Å R-free 0.225
5TXM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE,
分辨率 2.70 Å R-free 0.223
5TXM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE,
分辨率 2.70 Å R-free 0.223
5TXN STRUCTURE OF Q151M MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.226
5TXN STRUCTURE OF Q151M MUTANT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.226
5TXO STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.228
5TXO STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.55 Å R-free 0.228
5TXP STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.239
5TXP STRUCTURE OF Q151M complex (A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M) mutant HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING DDATP 提交 2016-11-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 DDS 2',3'-dideoxyadenosine triphosphate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.239
5UV5 Crystal Structure of a 2-Hydroxyisoquinoline-1,3-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 Y55 7-(furan-2-yl)-2-hydroxyisoquinoline-1,3(2H,4H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
5UV5 Crystal Structure of a 2-Hydroxyisoquinoline-1,3-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-02-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 600-1154
链 D 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 600-1027
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 Y55 7-(furan-2-yl)-2-hydroxyisoquinoline-1,3(2H,4H)-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 3.00 Å R-free 0.287
5VQQ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide (JLJ683), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9JP N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 20% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.55 Å R-free 0.255
5VQR Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacrylamide (JLJ684), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9KG N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylprop-2-enamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 14% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.55 Å R-free 0.250
5VQS Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acrylamide (JLJ685), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9KD N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)prop-2-enamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.50 Å R-free 0.242
5VQT Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 2-chloro-N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide (JLJ686), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 9K7 2-chloro-N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM imidazole pH 7.0, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.56 Å R-free 0.241
5VQU Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide (JLJ683), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9JP N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-2-fluoro-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.60 Å R-free 0.263
5VQV Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacrylamide (JLJ684), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9J1 N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylpropanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.58 Å R-free 0.258
5VQW Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acrylamide (JLJ685), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9KD N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)prop-2-enamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.50 Å R-free 0.257
5VQX Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with 2-chloro-N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide (JLJ686), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 9HY N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.40 Å R-free 0.262
5VQY Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N, Y181C) Variant in Complex with N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacrylamide (JLJ684), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, K103N, Y181C 突变：C280S 9J1 N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylpropanamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 16% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.35 Å R-free 0.256
5VQZ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (K103N, Y181C) Variant in Complex with 2-chloro-N-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide (JLJ686), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2017-05-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, K103N, Y181C 突变：C280S 9HY N-(6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)-N-methylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM imidazole pH 6.8, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.23 Å R-free 0.259
6AMO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.0 提交 2017-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：I63C, C280S 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS (tris(hydroxymethyl)aminomethane), MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.217
6AMO STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.0 提交 2017-08-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：I63C, C280S 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS (tris(hydroxymethyl)aminomethane), MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.217
6AN2 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.5 提交 2017-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.216
6AN2 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 7.5 提交 2017-08-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.70 Å R-free 0.216
6AN8 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.0 提交 2017-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.217
6AN8 STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.0 提交 2017-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.217
6ANQ STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.5 提交 2017-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.59 Å R-free 0.219
6ANQ STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 8.5 提交 2017-08-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.59 Å R-free 0.219
6AOC Crystal Structure of an N-Hydroxythienopyrimidine-2,4-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 168-722
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 168-595
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 ZW2 6-benzyl-3-hydroxythieno[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 33 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
6AOC Crystal Structure of an N-Hydroxythienopyrimidine-2,4-dione RNase H Active Site Inhibitor with Multiple Binding Modes to HIV Reverse Transcriptase 提交 2017-08-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain residues 168-722
链 D 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain residues 168-595
突变：C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 ZW2 6-benzyl-3-hydroxythieno[2,3-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 35 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；291 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, ETHYLENE GLYCOL, TRIS
分辨率 1.80 Å R-free 0.226
6ASW STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.0 提交 2017-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.220
6ASW STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.0 提交 2017-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.220
6AVM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO SECOND BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.229
6AVM STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO SECOND BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.50 Å R-free 0.229
6AVT STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO FIRST BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.211
6AVT STRUCTURE OF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE (RT) TERNARY COMPLEX WITH A DOUBLE STRANDED DNA AND AN INCOMING D4TTP AT PH 9.5 WITH CROSS-LINKING TO FIRST BASE TEMPLATE OVERHANG 提交 2017-09-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, I63C 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 2 D4T 2',3'-DEHYDRO-2',3'-DEOXY-THYMIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；PEG 8000, NaCl, CHES (N-Cyclohexyl-2-aminoethanesulfonic acid), TRIS, MgCl2, d4T triphosphate
分辨率 2.60 Å R-free 0.211
6B19 Architecture of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core 提交 2017-09-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa） 片段：UNP residues 600-1159
链 B 600–1039（440 aa） 片段：UNP residues 600-1039
突变：Q260C, C282S, E480Q 突变：C282S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3.5 sec before plunging into liquid ethane.
分辨率 4.50 Å
6C0J Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.92 Å R-free 0.226
6C0K Crystal structure of HIV-1 K103N mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 SO4 SULFATE ION × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 30 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.96 Å R-free 0.219
6C0L Crystal structure of HIV-1 E138K mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：E138K, C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 26 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.95 Å R-free 0.219
6C0N Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 22 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.00 Å R-free 0.222
6C0O Crystal structure of HIV-1 K103N mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.90 Å R-free 0.209
6C0P Crystal structure of HIV-1 E138K mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：E138K, C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 27 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.05 Å R-free 0.215
6C0R Crystal structure of HIV-1 K103N/Y181C mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, K172A, K173A, Y181C, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 31 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.05 Å R-free 0.212
6CGF Crystal structure of HIV-1 Y188L mutant reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor K-5a2 提交 2018-02-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 subunit, residues 600-1027
突变：K172A, K173A, Y188L, C280S 突变：C280S K5A 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 23 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.94 Å R-free 0.232
6DTW HIV-1 Reverse Transcriptase Y181C Mutant in complex with JLJ 578 提交 2018-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C282S, K175A, K174A, Y181C 突变：C280S H9Y 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；MES, PEG 8000, spermine, magnesium sulfate, ammonium sulfate, rilpivirine
分辨率 2.74 Å R-free 0.284
6DTX Wildtype HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with JLJ 578 提交 2018-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K175A, K174A, Y181C 突变：C280S H9Y 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, ammonium sulfate, magnesium sulfate, spermine, MES (pH 6), rilpivirine.
分辨率 3.33 Å R-free 0.237
6DUF Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase V106A/F227L mutant in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：residues 600-1027
突变：V106A, K172A, K173A, F227L, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 18 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 1.96 Å R-free 0.228
6DUG Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase K101P mutant in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：residues 600-1027
突变：K101P, K172A, K173A, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.23 Å R-free 0.233
6DUH Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase Y181I mutant in complex with non-nucleoside inhibitor 25a 提交 2018-06-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：residues 168-722
链 B 600–1027（428 aa） 片段：residues 600-1027
突变：K172A, K173A, Y181I, C280S 突变：C280S K5C 4-({4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]piperidin-1-yl}methyl)benzene-1-sulfonamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 28 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；50 mM MES buffer (pH 6.0-6.6), 10% (v/v) polyethylene glycol (PEG) 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 10 mM spermine
分辨率 2.00 Å R-free 0.223
6ECL Crystal Structure of a 1,2,4-Triazole Allosteric RNase H Inhibitor in Complex with HIV Reverse Transcriptase 提交 2018-08-08 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 domain
链 B 600–1027（428 aa） 片段：p51 domain
突变：C879S 突变：C879S MN MANGANESE (II) ION × 2 T90 1-[4-methoxy-3-[[5-methyl-4-(phenylmethyl)-1,2,4-triazol-3-yl]sulfanylmethyl]phenyl]ethanone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；277 K；PEG 3350, SODIUM POTASSIUM PHOSPHATE, BIS TRIS PROPANE
分辨率 2.38 Å R-free 0.229
6ELI Structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with rilpivirine and an RNase H inhibitor XZ462 提交 2017-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 BA5 methyl 4-azanyl-1-oxidanyl-2-oxidanylidene-1,8-naphthyridine-3-carboxylate × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, IMIDAZOLE
分辨率 2.20 Å R-free 0.221
6HAK Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with a double stranded RNA represents the RT transcription initiation complex prior to nucleotide incorporation 提交 2018-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 3.95 Å R-free 0.329
6HAK Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with a double stranded RNA represents the RT transcription initiation complex prior to nucleotide incorporation 提交 2018-08-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S, D498N 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 8000, AMMONIUM SULFATE, MGCL2, GLYCEROL, SUCROSE
分辨率 3.95 Å R-free 0.329
6O9E Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA and INDOPY-1 提交 2019-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 4 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 IY1 5-methyl-1-(4-nitrophenyl)-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrido[3,2-b]indole-3-carbonitrile × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.40 Å R-free 0.242
6O9E Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA and INDOPY-1 提交 2019-03-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 2 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 IY1 5-methyl-1-(4-nitrophenyl)-2-oxo-2,5-dihydro-1H-pyrido[3,2-b]indole-3-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.40 Å R-free 0.242
6OE3 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ635), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2019-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S, C258Q 突变：C280S M9A 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
6OUN Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (RT) in complex with dsDNA and (-)3TC-TP 提交 2019-05-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1157（558 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：C280S, Q258C 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 1RZ Lamivudine Triphosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；3-6% (w/v) PEG 8000, 15 mM magnesium sulfate, and 50 mM MES adjusted at pH 6.0
分辨率 2.66 Å R-free 0.259
6PRF HIV-1 Protease multiple drug resistant clinical isolate mutant PR20 with GRL-14213A 提交 2019-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 501–599（99 aa）
链 B 501–599（99 aa）
突变：Q7K, L10F, I13V, I15V, D30N, V32I, L33F, E35D, M36I, S37N, I47V, I54L, Q58E, I62V, L63P, C67A, A71V, I84V, N88D, L89T, L90M, C95A 突变：Q7K, L10F, I13V, I15V, D30N, V32I, L33F, E35D, M36I, S37N, I47V, I54L, Q58E, I62V, L63P, C67A, A71V, I84V, N88D, L89T, L90M, C95A Y1 YTTRIUM ION × 9 7OA (3S,3aR,5R,7aS,8S)-hexahydro-4H-3,5-methanofuro[2,3-b]pyran-8-yl [(2S,3R)-4-[{[2-(cyclopropylamino)-1,3-benzothiazol-6-yl]sulfonyl}(2-methylpropyl)amino]-1-(3,5-difluorophenyl)-3-hydroxybutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；1.8 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate pH 5.5, 0.01M yittrium chloride
分辨率 1.21 Å R-free 0.190
6UL5 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]-2-fluorobenzonitrile (24b), a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2019-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S QAG 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}thieno[3,2-d]pyrimidin-2-yl)amino]-2-fluorobenzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.23 Å R-free 0.245
6VUG Diabody bound to a Reverse Transcriptase Aptamer Complex 提交 2020-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：pentameric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：p66 subunit, residues 600-1154
未记录 SO4 SULFATE ION × 11 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4 M Ammonium Sulfate 0.1 M HEPES pH 7.8 0.1 M NaCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.255
6WAZ +1 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 1.5s blot.
分辨率 4.10 Å
6WB0 +3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (pre-translocation state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 突变：C879S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 2.5s blot.
分辨率 4.20 Å
6WB1 +3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (intermediate state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 2.5s blot.
分辨率 4.70 Å
6WB2 +3 extended HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core (displaced state) 提交 2020-03-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q 突变：C879S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；Full complex was prepared 5-8 hours before freezing. Beta-OG was added just prior to freezing.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 microliters applied, 2s pre-blot, 2.5s blot.
分辨率 4.50 Å
6X47 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ649), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7AX 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.77 Å R-free 0.267
6X49 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ649), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 7AX 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.75 Å R-free 0.251
6X4A Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ651), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S 7AY 5-chloro-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.54 Å R-free 0.269
6X4B Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-5-fluoro-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ655), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UMY 7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-5-fluoro-8-methylnaphthalene-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.50 Å R-free 0.259
6X4C Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-5,8-dimethyl-2-naphthonitrile (JLJ658), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UNS 7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-5,8-dimethylnaphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.86 Å R-free 0.258
6X4D Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(cyclopropylmethyl)-7-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-8-methyl-2-naphthonitrile (JLJ678), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UO4 5-(cyclopropylmethyl)-7-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-8-methylnaphthalene-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.65 Å R-free 0.258
6X4E Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with methyl 2-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate (JLJ681), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A 突变：C280S UMV methyl (6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.60 Å R-free 0.259
6X4F Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) Variant in Complex with methyl 2-(6-cyano-3-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate (JLJ681), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2020-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, K172A, K173A, Y181C 突变：C280S UMV methyl (6-cyano-3-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-4-methylnaphthalen-1-yl)acetate × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.72 Å R-free 0.252
7AHX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 REK D-Aspartate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.73 Å R-free 0.254
7AHX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 REK D-Aspartate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.73 Å R-free 0.254
7AID HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR 提交 2020-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
7AID HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND D-ASPARTATE TENOFOVIR 提交 2020-09-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S REK D-Aspartate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 3.15 Å R-free 0.250
7AIF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RE5 L-Glutamate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.75 Å R-free 0.249
7AIF HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RE5 L-Glutamate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.75 Å R-free 0.249
7AIG HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
7AIG HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-GLUTAMATE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S RE5 L-Glutamate Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.257
7AII HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RFE L-Methionine Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.255
7AII HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR WITH BOUND MANGANESE 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S MN MANGANESE (II) ION × 2 RFE L-Methionine Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.62 Å R-free 0.255
7AIJ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.263
7AIJ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND L-METHIONINE TENOFOVIR 提交 2020-09-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Q258C, C280S 突变：C280S RFE L-Methionine Tenofovir × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% v/v PEG Smear Broad, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl
分辨率 2.95 Å R-free 0.263
7KJV Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core 提交 2020-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 1 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7KJW Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with efavirenz 提交 2020-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 1 EFZ (-)-6-CHLORO-4-CYCLOPROPYLETHYNYL-4-TRIFLUOROMETHYL-1,4-DIHYDRO-2H-3,1-BENZOXAZIN-2-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7KJX Structure of HIV-1 reverse transcriptase initiation complex core with nevirapine 提交 2020-10-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1159（560 aa）
链 B 600–1039（440 aa）
突变：Q258C, E478Q MG MAGNESIUM ION × 1 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7KRC Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-4-(3-chloro-5-(2-cyanovinyl)phenoxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ709) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2J 4-{3-chloro-5-[(E)-2-cyanoethenyl]phenoxy}-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.65 Å R-free 0.265
7KRD Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 4-(3-chloro-5-cyanophenoxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ702) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2S 4-(3-chloro-5-cyanophenoxy)-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
7KRE Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 4-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ704) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2V 4-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.73 Å R-free 0.261
7KRF Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-4-(3-(2-cyanovinyl)-5-fluorophenoxy)-3-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenyl sulfurofluoridate (JLJ710) 提交 2020-11-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 X2G 4-{3-[(E)-2-cyanoethenyl]-5-fluorophenoxy}-3-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenyl sulfurofluoridate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM imidazole pH 6.5, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.60 Å R-free 0.265
7KWU Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with 16c (K07-15) 提交 2020-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 K7F 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)-5-(pyridin-4-yl)pyrimidin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3-6.6, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.02 Å R-free 0.259
7LPW Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with NBD-14189 提交 2021-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3 YBA ~{N}-[(1~{S})-2-azanyl-1-[4-(hydroxymethyl)-1,3-thiazol-2-yl]ethyl]-5-[3-fluoranyl-4-(trifluoromethyl)phenyl]-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10% PEG 8,000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6,10 mM spermine, 15 mM MgSO4,100 mM (NH4)2SO4, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine(TCEP)
分辨率 2.32 Å R-free 0.248
7LPX Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with NBD-14270 提交 2021-02-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 4 YB7 ~{N}-[(1~{S})-2-azanyl-1-[5-(hydroxymethyl)-1,3-thiazol-2-yl]ethyl]-3-methyl-5-[5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10% PEG 8,000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6,10 mM spermine, 15 mM MgSO4,100 mM (NH4)2SO4, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine(TCEP)
分辨率 2.45 Å R-free 0.250
7LQU Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with NBD-14075 提交 2021-02-15 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S YBD ~{N}-[(1~{R})-2-azanyl-1-[5-(hydroxymethyl)-1,3-thiazol-2-yl]ethyl]-5-(4-chloranyl-3-fluoranyl-phenyl)-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；277 K；10% PEG 8,000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6,10 mM spermine, 15 mM MgSO4,100 mM (NH4)2SO4, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine(TCEP)
分辨率 2.60 Å R-free 0.310
7LRI Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.05 Å R-free 0.244
7LRI Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.05 Å R-free 0.244
7LRM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.14 Å R-free 0.244
7LRM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 6 DCP 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 3.14 Å R-free 0.244
7LRX Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 1S0 4-amino-1-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
7LRX Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dCTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 1S0 4-amino-1-{2-deoxy-5-O-[(R)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}pyrimidin-2(1H)-one × 1 CA CALCIUM ION × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
7LRY Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, (-)FTC-TP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 7 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 1RY [[(2R,5S)-5-(4-azanyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)-1,3-oxathiolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.45 Å R-free 0.222
7LRY Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, (-)FTC-TP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 5 NH4 AMMONIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 1RY [[(2R,5S)-5-(4-azanyl-5-fluoranyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-1-yl)-1,3-oxathiolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.45 Å R-free 0.222
7LSK Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 XRF 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.253
7LSK Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with DNA, L-dTTP, and CA(2+) ion 提交 2021-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C280S, D498N 突变：C280S CA CALCIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 XRF 1-{2-deoxy-5-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-L-erythro-pentofuranosyl}-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；277 K；10-12% PEG 8000, 50 MM BISTRIS-PROPANE PH 7.2, 50 MM AMMONIUM SULFATE, 5% GLYCEROL, 5% SUCROSE
分辨率 2.70 Å R-free 0.253
7OT6 HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND inhibitor RMC-282 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
7OT6 HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND inhibitor RMC-282 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1I4 (R)-N-(1-(6-amino-9H-purin-9-yl)propan-2-yl)-N-(2-phosphonoethyl)glycine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19.5% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.258
7OTA HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-230 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.00 Å R-free 0.269
7OTA HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-230 提交 2021-06-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1I1 ((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)-L-seryl)phosphoramidic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.00 Å R-free 0.269
7OTK HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-233 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 2.95 Å R-free 0.271
7OTK HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-233 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1IA (2~{R})-2-[2-(6-aminopurin-9-yl)ethylamino]-3-phosphono-propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 2.95 Å R-free 0.271
7OTN HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-247 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 1IH (S)-2-((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
7OTN HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-247 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 1 1IH (S)-2-((2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.40 Å R-free 0.254
7OTX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-257 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.45 Å R-free 0.251
7OTX HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-257 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1IK (S)-2-((3-(6-amino-9H-purin-9-yl)propyl)amino)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.45 Å R-free 0.251
7OTZ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-259 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7OTZ HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-259 提交 2021-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1IO (S)-2-(2-(6-amino-9H-purin-9-yl)ethoxy)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.10 Å R-free 0.257
7OUT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-264 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7OUT HIV-1 REVERSE TRANSCRIPTASE COMPLEX WITH DNA AND INHIBITOR RMC-264 提交 2021-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 1KK (S)-2-(3-(6-amino-9H-purin-9-yl)propoxy)-3-phosphonopropanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；16-19% V/V PEG SMEAR BROAD, 0.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M TRIS-HCL
分辨率 3.20 Å R-free 0.265
7OXQ Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 048 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.30 Å R-free 0.296
7OXQ Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 048 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 12 2NU 2-(4-bromanylpyrazol-1-yl)-~{N}-cyclopropyl-~{N}-methyl-ethanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.30 Å R-free 0.296
7OZ2 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA showing a transient P-pocket 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 16 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 2.85 Å R-free 0.257
7OZ2 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA showing a transient P-pocket 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 2.85 Å R-free 0.257
7OZ5 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 166 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.37 Å R-free 0.265
7OZ5 Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase with a double stranded DNA in complex with fragment 166 at the transient P-pocket. 提交 2021-06-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
未记录 CD CADMIUM ION × 9 3IR (1~{R},2~{R})-2-phenyl-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；11-12% v/v PEG Smear Broad, 10% w/v sucrose, 50 mM PIPES-NaOH pH 6.5, 0.1 M (NH4)2SO4, 5 mM MgCl2, 5 mM CdCl2
分辨率 3.37 Å R-free 0.265
7OZW Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with fragment 166 at the transient P-pocket 提交 2021-06-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：P66 subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 3IR (1~{R},2~{R})-2-phenyl-~{N}-(1,3-thiazol-2-yl)cyclopropane-1-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7P15 Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with fragment F04 at the transient P-pocket 提交 2021-07-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa） 片段：P66 subunit
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 4OI (1~{R},2~{R})-~{N}-(1~{H}-pyrazol-4-yl)-2-pyridin-3-yl-cyclopropane-1-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7SEP Cryo-EM Structure of the RT component of the HIV-1 Pol Polyprotein 提交 2021-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
链 B 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
突变：D131A, L765D, F766D 突变：D131A, L765D, F766D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7SIF Crystal Structure of HLA B*3505 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 774–782（9 aa） 片段：UNP residues 774-782
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1M BIS-TRIS, 25% PEG3350
分辨率 1.73 Å R-free 0.230
7SIG Crystal Structure of HLA B*3501 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 774–782（9 aa） 片段：UNP residues 774-782
未记录 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.2M Ammonium Acetate, 20% PEG4000
分辨率 1.74 Å R-free 0.216
7SIH Crystal Structure of HLA B*3503 in complex with NPDIVIYQY, an 9-mer epitope from HIV-I 提交 2021-10-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 774–782（9 aa） 片段：UNP residues 774-782
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M HEPES, 20% PEG8000
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
7SJX Cryo-EM Structure of the PR-RT components of the HIV-1 Pol Polyprotein 提交 2021-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
链 B 479–1447（969 aa） 片段：PR-RT portion, residues 479-1447
突变：D131A, L765D, F766D 突变：D131A, L765D, F766D 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.20 Å
7SNL Disulfide stabilized HIV-1 CA hexamer in complex with capsid inhibitor N-(1-(3-(4-chloro-1-methyl-3-(methylsulfonamido)-1H-indazol-7-yl)-4-oxo-3,4-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl)-2-(3-(trifluoromethyl)-4,5,6,7-tetrahydro-1H-indazol-1-yl)acetamide 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A 9VI N-[(1S)-1-(3-{4-chloro-3-[(methanesulfonyl)amino]-1-methyl-1H-indazol-7-yl}-4-oxo-3,4-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl]-2-[3-(trifluoromethyl)-6,7-dihydro-1H-indazol-1-yl]acetamide × 6 IOD IODIDE ION × 24 CL CHLORIDE ION × 42 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2M NaI, 9% peg 3350, 6% glycerol, 0.1M sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
分辨率 2.39 Å R-free 0.261
7SNN Disulfide stabilized HIV-1 CA hexamer in complex with capsid inhibitor N-(1-(3-(4-chloro-1-methyl-3-(methylsulfonamido)-1H-indazol-7-yl)-4-oxo-3,4-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl)-2-(3-(difluoromethyl)-5,6-dihydrocyclopenta[c]pyrazol-1(4H)-yl)acetamide 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A IOD IODIDE ION × 18 9WW N-[(1S)-1-(3-{4-chloro-3-[(methanesulfonyl)amino]-1-methyl-1H-indazol-7-yl}-4-oxo-3,4-dihydroquinazolin-2-yl)-2-(3,5-difluorophenyl)ethyl]-2-[(3aM)-3-(difluoromethyl)cyclopenta[c]pyrazol-1(2H)-yl]acetamide × 6 CL CHLORIDE ION × 42 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.275M NaI, 7.5% peg 3350, 6% glycerol, 0.1M sodium cacodylate trihydrate pH 6.5
分辨率 2.37 Å R-free 0.233
7SNP Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-3-(3-chloro-5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-(2-morpholinoethoxy)phenoxy)phenyl)acrylonitrile (JLJ530) 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 9UV (2E)-3-(3-chloro-5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-[2-(morpholin-4-yl)ethoxy]phenoxy}phenyl)prop-2-enenitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.89 Å R-free 0.272
7SNQ Hexamer HIV-1 CA in complex with CPSF6 peptide and IP6 ligand 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 133–363（231 aa）
链 B 133–363（231 aa）
链 C 133–363（231 aa）
链 D 133–363（231 aa）
链 E 133–363（231 aa）
链 F 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1M Tris pH 8.2, 8% peg 8000, 5% Glycerol
分辨率 2.81 Å R-free 0.282
7SNQ Hexamer HIV-1 CA in complex with CPSF6 peptide and IP6 ligand 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 G 133–363（231 aa）
链 H 133–363（231 aa）
链 I 133–363（231 aa）
链 J 133–363（231 aa）
链 K 133–363（231 aa）
链 L 133–363（231 aa）
突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A 突变：A14C, E45C, W184A, M185A IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；0.1M Tris pH 8.2, 8% peg 8000, 5% Glycerol
分辨率 2.81 Å R-free 0.282
7SNZ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 6-((2-((4-cyanophenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)-5,7-dimethylindolizine-2-carbonitrile (JLJ604) 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 9WI (4R)-6-{[2-(4-cyanoanilino)pyrimidin-4-yl]amino}-5,7-dimethylindolizine-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 PUT 1,4-DIAMINOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.37 Å R-free 0.245
7SO1 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (E)-4-((4-((4-(2-cyanovinyl)-2,6-dimethylphenyl)amino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ564) 提交 2021-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 9W3 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylanilino}-6-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-1,3,5-triazin-2-yl)amino]benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.73 Å R-free 0.264
7SO2 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase Y181C Variant in Complex with (E)-4-((4-((4-(2-cyanovinyl)-2,6-dimethylphenyl)amino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ564) 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C 9W3 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylanilino}-6-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-1,3,5-triazin-2-yl)amino]benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 3.09 Å R-free 0.282
7SO3 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase K103N/Y181C Variant in Complex with (E)-4-((4-((4-(2-cyanovinyl)-2,6-dimethylphenyl)amino)-6-(3-morpholinopropoxy)-1,3,5-triazin-2-yl)amino)benzonitrile (JLJ564) 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K103N, Y181C 9W3 4-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylanilino}-6-[3-(morpholin-4-yl)propoxy]-1,3,5-triazin-2-yl)amino]benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277.15 K；18% (w/v) PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, 5 mM spermine, and 50 mM citric acid, pH 7.5
分辨率 2.77 Å R-free 0.272
7SO4 Crystal Structure of HIV-1 Y181C mutant Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ635), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C M9A 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.95 Å R-free 0.274
7SO6 Crystal Structure of HIV-1 K103N, Y181C mutant Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ635), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2021-10-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
未记录 M9A 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；0 mM MES pH 6.0, 18% PEG 8,000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.79 Å R-free 0.275
7TAZ Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase (RT) in complex with VM-1500A, a non-nucleoside RT inhibitor 提交 2021-12-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C180S 突变：C280S VM5 2-[4-bromo-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)-2-fluorophenyl]-N-(2-chloro-4-sulfamoylphenyl)acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；PEG 8,000, ammonium sulfate, Bis tris propane, ethylene glycol
分辨率 2.40 Å R-free 0.279
7U5Z Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with JLJ353 提交 2022-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S 突变：C879S LE8 2-chloro-4-({5-[(2,6-difluorophenyl)methyl]-1,3-oxazol-2-yl}amino)benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277.15 K；50 mM imidazole pH 6.4, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.30 Å R-free 0.280
7Z24 Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with nevirapine 提交 2022-02-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
7Z29 Cryo-EM structure of NNRTI resistant M184I/E138K mutant HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with nevirapine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M184I 突变：E138K NVP 11-CYCLOPROPYL-5,11-DIHYDRO-4-METHYL-6H-DIPYRIDO[3,2-B:2',3'-E][1,4]DIAZEPIN-6-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7Z2D Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with rilpivirine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
7Z2E Cryo-EM structure of NNRTI resistant M184I/E138K mutant HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with rilpivirine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M184I 突变：E138K T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.45 Å
7Z2G Cryo-EM structure of HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with doravirine 提交 2022-02-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa） 片段：P51 subunit
未记录 2KW 3-chloro-5-({1-[(4-methyl-5-oxo-4,5-dihydro-1H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,2-dihydropyridin-3-yl}oxy)benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
7Z2H Cryo-EM structure of NNRTI resistant M184I/E138K mutant HIV-1 reverse transcriptase with a DNA aptamer in complex with doravirine 提交 2022-02-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：M184I 突变：E138K 2KW 3-chloro-5-({1-[(4-methyl-5-oxo-4,5-dihydro-1H-1,2,4-triazol-3-yl)methyl]-2-oxo-4-(trifluoromethyl)-1,2-dihydropyridin-3-yl}oxy)benzonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
8DX2 HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-amino-3-bromopyridine at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 V06 3-bromopyridin-4-amine × 4 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.00 Å R-free 0.243
8DX3 HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 3-bromobenzylamine in the thumb subdomain 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 4JH 1-(3-bromophenyl)methanamine × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.06 Å R-free 0.228
8DX8 HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 2-chloro-6-fluorophenethylamine at the 415 site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S W15 2-(2-chloro-6-fluorophenyl)ethan-1-amine × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.85 Å R-free 0.223
8DXB HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 5-fluoroindole-2-carboxylic acid at the NNRTI Adjacent site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K174A, K175A, C282S 突变：C280S FIC 5-fluoroindole-2-carboxylic acid × 2 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；PISPIETVPVKLKPGMDGPKVKQWPLTEEKIKALVEICTEMEKEGKISKIGPENPYNTPVFAIKKKDSTKWRKLVDFREL NKRTQDFWEVQLGIPHPAGLKKKKSVTVLDVGDAYFSVPLDEDFRKYTAFTIPSINNETPGIRYQYNVLPQGWKGSPAIF QSSMTKILEPFKKQNPDIVIYQYMDDLYVGSDLEIGQHRTKIEELRQHLLRWGLTTPDKKHQKEPPFLWMGYELHPDKWT VQPIVLPEKDSWTVNDIQKLVGKLNWASQIYPGIKVRQLSKLLRGTKALTEVIPLTEEAELELAENREILKEPVHGVYYD PSKDLIAEIQKQGQGQWTYQIYQEPFKNLKTGKYARMRGAHTNDVKQLTEAVQKITTESIVIWGKTPKFKLPIQKETWET WWTEYWQATWIPEWEFVNTPPLVKLWYQ
分辨率 2.10 Å R-free 0.235
8DXE HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 2-amino-6-fluorobenzonitrile at the NNRTI adjacent site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S 0IF 2-amino-6-fluorobenzonitrile × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.85 Å R-free 0.217
8DXG HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 5-(trifluoromethyl)pyridin-2-ol at W24 site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S U4D 5-(trifluoromethyl)pyridin-2-one × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.10 Å R-free 0.225
8DXH HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 5-fluoroquinazolin-4-ol at W266 site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S JBQ 5-fluoranyl-3,4-dihydroquinazolin-4-ol × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 12 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.80 Å R-free 0.213
8DXI HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment [1-(4-fluorophenyl)-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl]methanol at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K174A, K175A, C282S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 FMQ [1-(4-fluorophenyl)-5-methyl-1H-pyrazol-4-yl]methanol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.95 Å R-free 0.218
8DXJ HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 1-N-methyl-4-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine at the NNRTI adjacent site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 U43 N~1~-methyl-4-(trifluoromethyl)benzene-1,2-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.80 Å R-free 0.207
8DXK HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-bromopyrazole at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 BYZ 4-bromo-1H-pyrazole × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.00 Å R-free 0.215
8DXL HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-iodopyrazole at multiple sites 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 4 PYZ 4-IODOPYRAZOLE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 2.25 Å R-free 0.208
8DXM HIV-1 reverse transcriptase/rilpivirine with bound fragment 4-bromophenol at the Knuckles site 提交 2022-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S BML 4-BROMOPHENOL × 1 T27 4-{[4-({4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenyl}amino)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；10-12% PEG 8000, 4% PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.4-6.6, 15 mM MgSO4, 100 mM amm sulfate, 5 mM TCEP
分辨率 1.99 Å R-free 0.208
8FE8 Crystal Structure of HIV-1 RT in Complex with the non-nucleoside inhibitor 18b1 提交 2022-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S XRB 5-[(4-{4-[(E)-2-cyanoethenyl]-2,6-dimethylphenoxy}pyrimidin-2-yl)amino]-2-[4-(methanesulfonyl)piperazin-1-yl]benzonitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3-6.6, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.50 Å R-free 0.277
8FFX Crystal structure of HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 19980 提交 2022-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 XU9 ethyl (8S)-4-(cyclopropylethynyl)pyrazolo[1,5-a]pyridine-3-carboxylate × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10%(v/v) PEG 8000, 4%(v/v) PEG 400, 100 mM imidazole pH 6.6, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.42 Å R-free 0.266
8STP Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) varient in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C280S, Y181C, K172A, K173A 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；50 mM HEPES pH 7.5, 12% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 3.09 Å R-free 0.252
8STQ Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM MES pH 7.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.96 Å R-free 0.278
8STR Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM MES/Imidazole/HEPES pH 6.0-7.0, 16-20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.77 Å R-free 0.268
8STS Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1155（556 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 3.02 Å R-free 0.285
8STS Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-7-fluoro-2-naphthonitrile (JLJ636), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1155（556 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S 7N1 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-7-fluoronaphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 3.02 Å R-free 0.285
8STT Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1155（556 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, Y181C, V106A, K172A, K173A 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 1 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.62 Å R-free 0.291
8STT Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) varient in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ555), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1155（556 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C879S, Y181C, V106A, K172A, K173A 突变：C879S MG MAGNESIUM ION × 1 29T 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.62 Å R-free 0.291
8STU Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) variant in Complex with 8-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)-4-fluorophenoxy)-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile (JLJ578), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S MG MAGNESIUM ION × 1 H9Y 8-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]-4-fluorophenoxy}-6-fluoroindolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；277 K；50 mM MES pH 6.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.76 Å R-free 0.280
8STV Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) variant in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1155（556 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 16% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.78 Å R-free 0.276
8STV Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase (Y181C, V106A) variant in Complex with 5-(2-(2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ600), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-05-11 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1155（556 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：Y181C, V106A, C280S, K172A, K173A 突变：C280S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 3LQ 5-{2-[2-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 16% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.78 Å R-free 0.276
8U69 Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-chloro-5-(4-chloro-2-(2-(5-chloro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy)phenoxy)benzonitrile (JLJ334), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VQ0 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(5-chloro-2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.45 Å R-free 0.260
8U6A Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with (JLJ729), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VQK N-(3-{2-[5-chloro-2-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy]ethyl}phenyl)prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.37 Å R-free 0.271
8U6B Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenethyl)acrylamide (JLJ731), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A VTN N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenyl]ethyl}prop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 21.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.35 Å R-free 0.264
8U6C Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 2-chloro-N-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenethyl)acetamide (JLJ732), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VWU 2-chloro-N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenyl]ethyl}acetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.70 Å R-free 0.268
8U6D Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ736), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VTS N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy]ethyl}-N-methylprop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.33 Å R-free 0.266
8U6E Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenethyl)-N-methylacrylamide (JLJ738), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VTV N-{2-[4-chloro-3-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenyl]ethyl}-N-methylprop-2-enamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM Imidazole pH 6.0, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.31 Å R-free 0.293
8U6F Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(5-chloro-2-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ742), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1151（552 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VU8 N-{2-[5-chloro-2-(3-chloro-5-cyanophenoxy)phenoxy]ethyl}-N-methylprop-2-enamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM Imidazole pH 6.5, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.69 Å R-free 0.284
8U6G Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)-4-chlorophenoxy)-5-chlorobenzonitrile (JLJ744), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1152（553 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVE 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2-oxo-3-propanoyl-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM Imidazole pH 6.8, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.77 Å R-free 0.270
8U6H Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)-4-chlorophenoxy)-5-chlorobenzonitrile (JLJ744), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVE 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2-oxo-3-propanoyl-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.99 Å R-free 0.279
8U6H Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)-4-chlorophenoxy)-5-chlorobenzonitrile (JLJ744), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 600–1153（554 aa）
链 D 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVE 3-chloro-5-{4-chloro-2-[2-(2-oxo-3-propanoyl-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl)ethoxy]phenoxy}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 14% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.99 Å R-free 0.279
8U6I Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ745), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VVN N-[2-(2-{[(4R)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-N-methylpropanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.46 Å R-free 0.278
8U6J Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(5-chloro-2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ746), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VR9 N-[2-(5-chloro-2-{[(4R)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-N-methylpropanamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.64 Å R-free 0.274
8U6K Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(2-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ747), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VRF N-(2-{2-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]phenoxy}ethyl)-N-methylprop-2-enamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；50 mM MES pH 5.0, 11% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.72 Å R-free 0.276
8U6L Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(5-chloro-2-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ748), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VRQ N-(2-{5-chloro-2-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]phenoxy}ethyl)-N-methylprop-2-enamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 11% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.49 Å R-free 0.267
8U6M Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with N-(2-(2-((6-chloro-2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)ethyl)-N-methylacrylamide (JLJ751), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VW2 N-[2-(2-{[(4R)-6-chloro-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)ethyl]-N-methylpropanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；50 mM HEPES pH 7.0, 22.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.62 Å R-free 0.266
8U6N Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-((6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy)phenoxy)-N,N-dimethylpropanamide (JLJ752), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1136（537 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VWK 3-{2-[(6-cyanonaphthalen-1-yl)oxy]phenoxy}-N,N-dimethylpropanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM Tris pH 7.5, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.74 Å R-free 0.291
8U6O Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with5-(2-(3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ753), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VWB 5-{2-[3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.48 Å R-free 0.269
8U6P Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)-N,N-dimethylpropanamide (JLJ754), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VOI 3-(2-{[(4S)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)-N,N-dimethylpropanamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；50 mM MES pH 5.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.81 Å R-free 0.260
8U6Q Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 8-(2-(3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ755), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VOU (4S)-8-{2-[3-oxo-3-(pyrrolidin-1-yl)propoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.3；277 K；50 mM Imidazole pH 6.3, 20% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.55 Å R-free 0.270
8U6R Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 3-(2-((2-cyanoindolizin-8-yl)oxy)phenoxy)-N-(2,2-difluoroethyl)propanamide (JLJ756), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1151（552 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VP2 3-(2-{[(4R)-2-cyanoindolizin-8-yl]oxy}phenoxy)-N-(2,2-difluoroethyl)propanamide × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM Imidazole pH 6.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.87 Å R-free 0.261
8U6S Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 8-(2-(3-morpholino-3-oxopropoxy)phenoxy)indolizine-2-carbonitrile (JLJ757), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1151（552 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VPB (4S)-8-{2-[3-(morpholin-4-yl)-3-oxopropoxy]phenoxy}indolizine-2-carbonitrile × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；277 K；50 mM Imidazole pH 6.8, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.99 Å R-free 0.299
8U6T Crystal Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-(2-(2-(3-acryloyl-2-oxo-2,3-dihydro-1H-benzo[d]imidazol-1-yl)ethoxy)phenoxy)-2-naphthonitrile (JLJ758), a non-nucleoside inhibitor 提交 2023-09-13 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：C879S, K172A, K173A 突变：C879S VO8 5-(2-{2-[2-oxo-3-(prop-2-enoyl)-2,3-dihydro-1H-benzimidazol-1-yl]ethoxy}phenoxy)naphthalene-2-carbonitrile × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM MES pH 5.5, 17.5% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.25 Å R-free 0.287
8VB6 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VB7 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 1 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VB8 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8VB9 Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VBC Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VBD Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N MG MAGNESIUM ION × 2 DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VBE Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8VBF Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8VBG Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N F2A 2'-deoxy-5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]adenosine × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8VBH Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.20 Å
8VBI Kinetic intermediate states of HIV-1 RT DNA synthesis captured by cryo-EM 提交 2023-12-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric
链 A 600–1154（555 aa） 片段：UNP residues 600-1154
链 B 600–1027（428 aa） 片段：UNP residues 600-1027
突变：C280S D498N DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8VU9 Crystal structure of wild-type HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5i3 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1153（554 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S WB3 (2E)-3-[4-({2-[(1-{[4-(methanesulfonyl)phenyl]methyl}piperidin-4-yl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)-3,5-dimethylphenyl]prop-2-enenitrile × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES, pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 1.99 Å R-free 0.244
8VUB Crystal structure of wild-type HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5e2 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S 突变：C280S PKX 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)-6,7-dimethoxyquinazolin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzamide × 1 SO4 SULFATE ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.18 Å R-free 0.242
8VUF Crystal structure of GH9 (K101P, K103N, V108I) HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5i3 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S, K101P, K103N, V108I 突变：C280S SO4 SULFATE ION × 8 WB3 (2E)-3-[4-({2-[(1-{[4-(methanesulfonyl)phenyl]methyl}piperidin-4-yl)amino]pyrido[2,3-d]pyrimidin-4-yl}oxy)-3,5-dimethylphenyl]prop-2-enenitrile × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.36 Å R-free 0.247
8VUM Crystal structure of GH9 (K101P, K103N, V108I) HIV-1 reverse transcriptase in complex with non-nucleoside inhibitor 5e2 提交 2024-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
突变：K172A, K173A, C280S, K101P, K103N, V108I 突变：C280S EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 SO4 SULFATE ION × 7 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PKX 4-[(4-{[4-(4-cyano-2,6-dimethylphenoxy)-6,7-dimethoxyquinazolin-2-yl]amino}piperidin-1-yl)methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10% (v/v) poly(ethylene glycol) (PEG) 8000, 4% (v/v) PEG 400, 100 mM MES pH 6.3, 10 mM spermine, 15 mM MgSO4, 100 mM ammonium sulfate, and 5 mM tris(2-carboxyethyl)phosphine
分辨率 2.15 Å R-free 0.265
9MXB Crystal Structure of WT HIV-1 Reverse Transcriptase in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy] phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile (JLJ648), a non-nucleoside inhibitor 提交 2025-01-17 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1027（428 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） CL CHLORIDE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；50 mM Citric Acid pH 5.5, 15% PEG 8000, 100 mM ammonium sulfate, 15 mM magnesium sulfate, and 5 mM spermine
分辨率 2.37 Å R-free 0.275
9MXQ Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 Homodimer 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.85 Å
9MXR Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 Homodimer in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy] phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile (JLJ648), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
未记录 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
9MXS Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 Homodimer in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy] phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile, a Non-nucleoside Inhibitor, with an Additional Pocket of Density 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
未记录 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9MXT Cryo-EM Structure of HIV-1 Reverse Transcriptase p66 tetramer in Complex with 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile (JLJ648), a Non-nucleoside Inhibitor 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 600–1154（555 aa）
链 B 600–1154（555 aa）
链 C 600–1154（555 aa）
链 D 600–1154（555 aa）
未记录 A1BTU 5-{2-[2-(2-oxo-4-sulfanylidene-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)ethoxy]phenoxy}naphthalene-2-carbonitrile × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；50mM Tris pH 7.0, 25mM NaCl, 5% Glycerol, 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.43 Å
9NW9 CA117v2v8 Fab bound to HLA-E-RL9HIV 提交 2025-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 275–283（9 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M magnesium chloride, 20% PEG 3350
分辨率 2.30 Å R-free 0.239

共 383 个其他 PDB 条目、469 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POL_HV1B1
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 3–557； UniProt 600–1154 作者链 B； PDB构建体 2–429； UniProt 600–1027

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4ig0

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4ig0
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4ig0
沉积日期 deposition_date2012-12-15
结构标题 titleHIV-1 reverse transcriptase with bound fragment at the 507 site
关键词 keywords;RNA-DIRECTED DNA POLYMERASE, DNA POLYMERASE, ENDONUCLEASE, HYDROLASE, MULTIFUNCTIONAL ENZYME, transferase-transferase inhibitor complex ;; transferase/transferase inhibitor
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier35.50 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron34.77 Å
零角强度 I(0) i0178156000.00
分子量 molecular_weight113430.0 kDa
排除体积 excluded_volume144630 ų
包络体积 envelope_volume193960 ų
水化壳体积 shell_volume46378 ų
包络直径 envelope_diameter122.2 Å
壳层 Rg shell_rg41.44 Å
包络 Rg envelope_rg34.37 Å
形状 Rg shape_rg34.73 Å
总 Rg total_rg35.47 Å
总原子数 total_atoms8025
残基数 n_residues971
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax111.9 Å
Rg (实空间) rg_real35.46 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.94 Å
I(0) (实空间) i0_real1.7820e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.9900e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal35.49 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal178200000.0000
解质量估计 total_estimate0.8699
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary42.3 Å
偏度 Skewness skewness0.265
峰度 Kurtosis kurtosis-0.428
角度范围 angular_range— – 0.2250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha26950000.0000
实空间数据点数 n_real_points46
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.949; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.458
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 13 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd4ig0a1
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.2 — Reverse transcriptase
结构域编号 domain_idd4ig0a2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.3 — Ribonuclease H-like
家族 Family familyc.55.3.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd4ig0a3
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4ig0b_
类 Class classe — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold folde.8 — DNA/RNA polymerases
超家族 Superfamily superfamilye.8.1 — DNA/RNA polymerases
家族 Family familye.8.1.2 — Reverse transcriptase

CATH v4.4 (9 domains)

结构域编号 domain_id4ig0A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase, subunit A, domain 1
结构域编号 domain_id4ig0A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4ig0A03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4ig0A04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4ig0A05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H
结构域编号 domain_id4ig0B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — HIV Type 1 Reverse Transcriptase, subunit A, domain 1
结构域编号 domain_id4ig0B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4ig0B03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
结构域编号 domain_id4ig0B04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)