Calmodulin, Calcineurin subunit B type 1, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform
Rattus norvegicus
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–149 | 未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 5.6;293 K;PEG 3350, 1-Propanol, Citric acid, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K | 分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 2 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 B; UniProt 1–149 | 未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 5.6;293 K;PEG 3350, 1-Propanol, Citric acid, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K | 分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 3 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 C; UniProt 1–149 | 未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 5.6;293 K;PEG 3350, 1-Propanol, Citric acid, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K | 分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 4 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 D; UniProt 1–149 | 未记录 | CA CALCIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 5.6;293 K;PEG 3350, 1-Propanol, Citric acid, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K | 分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 4IL1 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1G4Y 1.60 A CRYSTAL STRUCTURE OF THE GATING DOMAIN FROM SMALL CONDUCTANCE POTASSIUM CHANNEL COMPLEXED WITH CALCIUM-CALMODULIN 提交 2001-01-07 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 R
2–149(148 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;ammonium sulphate, lithium sulphate, citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.251 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 G
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–149(148 aa)
链 C
2–149(148 aa)
链 E
2–149(148 aa)
链 G
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 16 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
2–149(148 aa)
链 C
2–149(148 aa)
链 E
2–149(148 aa)
链 G
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 16 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
2–149(148 aa)
链 G
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1NIW Crystal structure of endothelial nitric oxide synthase peptide bound to calmodulin 提交 2002-12-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–149(148 aa)
链 E
2–149(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 8 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5;298 K;Polyethylene glycol, ammonium sulfate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 1QX5 Crystal structure of apoCalmodulin 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1–148(148 aa)
链 Y
1–148(148 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, 150 mM NaCl, Hepes , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.277 |
| 1QX5 Crystal structure of apoCalmodulin 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 I
1–148(148 aa)
链 R
1–148(148 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, 150 mM NaCl, Hepes , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.277 |
| 1QX5 Crystal structure of apoCalmodulin 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 J
1–148(148 aa)
链 T
1–148(148 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, 150 mM NaCl, Hepes , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.277 |
| 1QX5 Crystal structure of apoCalmodulin 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–148(148 aa)
链 K
1–148(148 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, 150 mM NaCl, Hepes , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.277 |
| 1QX7 Crystal structure of apoCaM bound to the gating domain of small conductance Ca2+-activated potassium channel 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 I
1–148(148 aa)
链 R
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, NaCl, Hepes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.308 |
| 1QX7 Crystal structure of apoCaM bound to the gating domain of small conductance Ca2+-activated potassium channel 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–148(148 aa)
链 B
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, NaCl, Hepes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.308 |
| 1QX7 Crystal structure of apoCaM bound to the gating domain of small conductance Ca2+-activated potassium channel 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 M
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, NaCl, Hepes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.308 |
| 1QX7 Crystal structure of apoCaM bound to the gating domain of small conductance Ca2+-activated potassium channel 提交 2003-09-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–148(148 aa)
链 B
1–148(148 aa)
链 M
1–148(148 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;Citrate, NaCl, Hepes, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.308 |
| 2HQW Crystal Structure of Ca2+/Calmodulin bound to NMDA Receptor NR1C1 peptide 提交 2006-07-19 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–148(148 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;277.15 K;7% PEG 6000, 5mM CaCl2, 100 mM sodium acetate, pH 4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.248 |
| 2MGU Structure of the complex between calmodulin and the binding domain of HIV-1 matrix protein 提交 2013-11-07 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–149(148 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.3;308 K;离子强度(mmCIF原始值)0.015;压力 ambient
NMR样品组成
0.1-1.2 mM [U-95% 13C; U-95% 15N] calmodulin, 0.1-1.2 mM MA8-43, 5 mM CALCIUM ION, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2PQ3 N-Terminal Calmodulin Zn-Trapped Intermediate 提交 2007-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–77(76 aa)
|
未记录 | CAC CACODYLATE ION × 1 ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;277 K;100mM Na Cacodylate, 5mM Zn Acetate, 16% PEG8000, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.192 |
| 2PQ3 N-Terminal Calmodulin Zn-Trapped Intermediate 提交 2007-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–77(76 aa)
|
未记录 | CAC CACODYLATE ION × 2 ZN ZINC ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;277 K;100mM Na Cacodylate, 5mM Zn Acetate, 16% PEG8000, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.192 |
| 2YGG Complex of CaMBR and CaM 提交 2011-04-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1–149(149 aa)
|
未记录 | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 3 CA CALCIUM ION × 4 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.23 Å R-free 0.232 |
| 3B32 Crystal Structure of Calcium-Saturated Calmodulin N-Terminal Domain Fragment, Residues 1-75 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–76(75 aa)
片段:N-Terminal Domain Fragment, Residues 1-75
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277.15 K;100 mM Na acetate, 0.01% Na azide, 21.25% PEG 8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.269 |
| 3B32 Crystal Structure of Calcium-Saturated Calmodulin N-Terminal Domain Fragment, Residues 1-75 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–76(75 aa)
片段:N-Terminal Domain Fragment, Residues 1-75
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277.15 K;100 mM Na acetate, 0.01% Na azide, 21.25% PEG 8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.269 |
| 3B32 Crystal Structure of Calcium-Saturated Calmodulin N-Terminal Domain Fragment, Residues 1-75 提交 2007-10-19 | 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–76(75 aa)
片段:N-Terminal Domain Fragment, Residues 1-75
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;277.15 K;100 mM Na acetate, 0.01% Na azide, 21.25% PEG 8000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.269 |
| 3BXK Crystal structure of the P/Q-type calcium channel (CaV2.1) IQ domain and CA2+calmodulin complex 提交 2008-01-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–149(148 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.55 Å R-free 0.267 |
| 3BXK Crystal structure of the P/Q-type calcium channel (CaV2.1) IQ domain and CA2+calmodulin complex 提交 2008-01-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
2–149(148 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.55 Å R-free 0.267 |
| 3BXL Crystal structure of the R-type calcium channeL (CaV2.3) IQ domain and CA2+calmodulin complex 提交 2008-01-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–149(148 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 3BXL Crystal structure of the R-type calcium channeL (CaV2.3) IQ domain and CA2+calmodulin complex 提交 2008-01-14 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–149(148 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 8 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.30 Å R-free 0.262 |
| 3IFK Crystal Structure Of Calcium-Saturated Calmodulin N-terminal Domain Fragment, Residues 1-90 提交 2009-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–91(90 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 1-90
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277.15 K;20% PEG8000, 5mM calcium-chloride, 100mM citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.293 |
| 3IFK Crystal Structure Of Calcium-Saturated Calmodulin N-terminal Domain Fragment, Residues 1-90 提交 2009-07-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–91(90 aa)
片段:N-TERMINAL DOMAIN FRAGMENT, RESIDUES 1-90
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277.15 K;20% PEG8000, 5mM calcium-chloride, 100mM citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.293 |
| 3SJQ Crystal structure of a small conductance potassium channel splice variant complexed with calcium-calmodulin 提交 2011-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–149(149 aa)
链 B
1–149(149 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 8 PHU 1-phenylurea × 4 GOL GLYCEROL × 6 SO4 SULFATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4.65;277 K;0.75 M Li2SO4, 0.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M Sodium citrate pH 4.65 and Silver Bullets 22 reagent 70, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.201 |
| 4EHQ Crystal Structure of Calmodulin Binding Domain of Orai1 in Complex with Ca2+/Calmodulin Displays a Unique Binding Mode 提交 2012-04-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–149(148 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 GBL GAMMA-BUTYROLACTONE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;0.1 M Bis-Tris pH 6.0, 40% PPG P400, 14% butyrolactone, 1% n-octyl-beta-D-glucopyranoside, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.216 |
| 4G27 Calcium-calmodulin complexed with the calmodulin binding domain from a small conductance potassium channel splice variant and phenylurea 提交 2012-07-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 R
1–149(149 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 PHU 1-phenylurea × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;1.25 M lithium sulfate, 0.5 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.228 |
| 4G28 Calcium-calmodulin complexed with the calmodulin binding domain from a small conductance potassium channel splice variant and EBIO-1 提交 2012-07-11 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 R
1–149(149 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 0W8 1-ethyl-1,3-dihydro-2H-benzimidazol-2-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;1.25 M lithium sulfate, 0.5 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.63 Å R-free 0.227 |
| 4I2Y Crystal Structure of the genetically encoded calcium indicator RGECO1 提交 2012-11-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–149(147 aa)
|
突变:;Q44N, T46A, T62S, L65M, R68E, V71A, G74S, H77K, A79G, K81R, L89A, V90A, F92V, S94T, I95T, M97K, Y107A, Y109I, S112I, T117V, Y129C, T132A, R174H, T178S, G197A, H198F, N199Q, V201A, V228A, V230I, K240F, K249R, V261I, V262I, T263H, T265N, C274V, F281L, I282R, V284T, S288P, N363D, I366F, K380N, S404G, N414D, E430V ; 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;73mM malonic acid, 10mM ammonium citrate tribasic, 5mM succinic acid, 12mM malic acid, 16mM sodium acetate trihydrate, 20mM sodium formate, 6mM ammonium tartrate dibasic, 12% PEG 3350, pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 4I2Y Crystal Structure of the genetically encoded calcium indicator RGECO1 提交 2012-11-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–149(147 aa)
|
突变:;Q44N, T46A, T62S, L65M, R68E, V71A, G74S, H77K, A79G, K81R, L89A, V90A, F92V, S94T, I95T, M97K, Y107A, Y109I, S112I, T117V, Y129C, T132A, R174H, T178S, G197A, H198F, N199Q, V201A, V228A, V230I, K240F, K249R, V261I, V262I, T263H, T265N, C274V, F281L, I282R, V284T, S288P, N363D, I366F, K380N, S404G, N414D, E430V ; 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;277 K;73mM malonic acid, 10mM ammonium citrate tribasic, 5mM succinic acid, 12mM malic acid, 16mM sodium acetate trihydrate, 20mM sodium formate, 6mM ammonium tartrate dibasic, 12% PEG 3350, pH 5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 4J9Y Calcium-calmodulin complexed with the calmodulin binding domain from a small conductance potassium channel splice variant 提交 2013-02-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 R
1–149(149 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;1.25 M lithium sulfate, 0.5 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.216 |
| 4J9Z Calcium-calmodulin complexed with the calmodulin binding domain from a small conductance potassium channel splice variant and NS309 提交 2013-02-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 R
1–149(149 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 8 1KP (3E)-6,7-dichloro-3-(hydroxyimino)-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 2 CA CALCIUM ION × 4 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;1.25 M lithium sulfate, 0.5 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298.0K
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.221 |
| 4OY4 calcium-free CaMPARI v0.2 提交 2014-02-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–147(145 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277.15 K;0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350, 10 mM EGTA
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.235 |
| 4QNH Calcium-calmodulin (T79D) complexed with the calmodulin binding domain from a small conductance potassium channel SK2-a 提交 2014-06-17 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 R
1–149(149 aa)
|
突变:T79D | SO4 SULFATE ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;277.15 K;1.5 M Li2SO4, 0.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.15K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.234 |
| 4QNH Calcium-calmodulin (T79D) complexed with the calmodulin binding domain from a small conductance potassium channel SK2-a 提交 2014-06-17 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 R
1–149(149 aa)
|
突变:T79D | SO4 SULFATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;277.15 K;1.5 M Li2SO4, 0.5 M (NH4)2SO4, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 277.15K
|
分辨率 2.02 Å R-free 0.234 |
| 4RJD TFP bound in alternate orientations to calcium-saturated Calmodulin C-Domains 提交 2014-10-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
83–148(66 aa)
片段:Calmodulin C-Domian, UNP residues 83-148
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 TFP 10-[3-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YL)-PROPYL]-2-TRIFLUOROMETHYL-10H-PHENOTHIAZINE × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 OXL OXALATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.6;288 K;50 mM HEPES, 100 mM KCl, 1mM MgCl2, 5 mM NTA, 50 uM EGTA, with 500 ul of 200 mM potassium thiocyanate, 20% polyethylene glycol 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
| 4RJD TFP bound in alternate orientations to calcium-saturated Calmodulin C-Domains 提交 2014-10-08 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
83–148(66 aa)
片段:Calmodulin C-Domian, UNP residues 83-148
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 TFP 10-[3-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YL)-PROPYL]-2-TRIFLUOROMETHYL-10H-PHENOTHIAZINE × 2 CL CHLORIDE ION × 1 SCN THIOCYANATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.6;288 K;50 mM HEPES, 100 mM KCl, 1mM MgCl2, 5 mM NTA, 50 uM EGTA, with 500 ul of 200 mM potassium thiocyanate, 20% polyethylene glycol 3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.253 |
共 22 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CALM_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149 作者链 B; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149 作者链 C; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149 作者链 D; PDB构建体 1–149; UniProt 1–149 |