4iz6

Structure of EntE and EntB, an NRPS adenylation-PCP fusion protein with pseudo translational symmetry

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Enterobactin synthase component E, Isochorismatase

Escherichia coli

UniProt P0ADI4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 5'-deoxy-5'-({[2-(2,3-dihydroxyphenyl)ethyl]sulfonyl}amino)adenosine × 2 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ENTB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 561–635; UniProt 211–285 作者链 B; PDB构建体 561–635; UniProt 211–285

Enterobactin synthase component E, Isochorismatase

Escherichia coli

UniProt P10378

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 2 5'-deoxy-5'-({[2-(2,3-dihydroxyphenyl)ethyl]sulfonyl}amino)adenosine × 2 4'-PHOSPHOPANTETHEINE × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ENTE_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 21–556; UniProt 1–536 作者链 B; PDB构建体 21–556; UniProt 1–536

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4iz6
沉积日期 deposition_date2013-01-29
结构标题 titleStructure of EntE and EntB, an NRPS adenylation-PCP fusion protein with pseudo translational symmetry
关键词 keywords;Pseudo-translational symmetry, Adenylate-forming enzymes; ANL Superfamily; Non-ribosomal peptide synthetase; acyl carrier protein; NRPS adenylation domains and acyl carrier protein domain, 4'phosphopantetheinylation cofactor 4'PP, Chimera protein, fusion protein, LIGASE ;; LIGASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4iz6__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4iz6__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4iz6__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)35.17 Å
Rg(电子密度)34.58 Å
总 Rg34.91 Å
原子数9351
残基数1221
排除体积165880 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4iz6__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id4iz6A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12780 — ANL, N-terminal domain
结构域编号 domain_id4iz6A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ANL, C-terminal domain
结构域编号 domain_id4iz6A03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ACP-like
结构域编号 domain_id4iz6B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12780 — ANL, N-terminal domain
结构域编号 domain_id4iz6B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — ANL, C-terminal domain
结构域编号 domain_id4iz6B03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1200 — Non-ribosomal Peptide Synthetase Peptidyl Carrier Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ACP-like
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7. 引用文献 (1)