SAXSdb — 4j2j

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ataxin-1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 562–688	片段：AXH domain, UNP residues 562-688 突变：I580M,I605M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Protein capicua homolog × 1 （Q96RK0）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 562–688	片段：AXH domain, UNP residues 562-688 突变：I580M,I605M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Protein capicua homolog × 1 （Q96RK0）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 562–688	片段：AXH domain, UNP residues 562-688 突变：I580M,I605M 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Protein capicua homolog × 1 （Q96RK0）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4J2J	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1OA8 AXH domain of human spinocerebellar ataxin-1 提交 2003-01-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 563–694（132 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694 链 B 563–694（132 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M TRIS/HCL, PH 7.0, 0.2M AMMONIUM SULPHATE, 5 MM DTT, 15% PEG 4000, 20% GLYCEROL, AT 290K	分辨率 1.70 Å R-free 0.252
1OA8 AXH domain of human spinocerebellar ataxin-1 提交 2003-01-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 563–694（132 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694 链 D 563–694（132 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 562-694	未记录	NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；290 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M TRIS/HCL, PH 7.0, 0.2M AMMONIUM SULPHATE, 5 MM DTT, 15% PEG 4000, 20% GLYCEROL, AT 290K	分辨率 1.70 Å R-free 0.252
2M41 Solution Structure of the AXH domain of Ataxin-1 in complex with ligand peptide from Capicua 提交 2013-01-28	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 566–688（123 aa）片段：AXH domain, native residues A567-K689	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4APT The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688 链 B 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.4 M POTASSIUM SODIUM TARTRATE AT ROOM TEMPERATURE.	分辨率 2.50 Å R-free 0.288
4APT The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688 链 D 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688	未记录	NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.4 M POTASSIUM SODIUM TARTRATE AT ROOM TEMPERATURE.	分辨率 2.50 Å R-free 0.288
4AQP The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688 链 B 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688	未记录	NA SODIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.1 M MES, PH 6.5, 10% W/V PWG 20000 AT ROOM TEMPERATURE.	分辨率 2.45 Å R-free 0.267
4AQP The structure of the AXH domain of ataxin-1. 提交 2012-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688 链 D 566–688（123 aa）片段：AXH DOMAIN, RESIDUES 566-688	未记录	NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN SAMPLES AT 20 MG/ML CRYSTALLISED IN 0.1 M MES, PH 6.5, 10% W/V PWG 20000 AT ROOM TEMPERATURE.	分辨率 2.45 Å R-free 0.267
4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 562–688（127 aa）片段：AXH domain, UNP residues 562-688	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04	突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 562–688（127 aa）片段：AXH domain, UNP residues 562-688	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294

共 5 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATX1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–129； UniProt 562–688 作者链 B； PDB构建体 3–129； UniProt 562–688 作者链 C； PDB构建体 3–129； UniProt 562–688

Protein capicua homolog

Homo sapiens

UniProt Q96RK0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 28–48	片段：UNP residues 28-48	Ataxin-1 × 1 （P54253）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 28–48	片段：UNP residues 28-48	Ataxin-1 × 1 （P54253）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
3	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 28–48	片段：UNP residues 28-48	Ataxin-1 × 1 （P54253）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Calcium chloride, 24%(v/v) PEG3350, 4%(v/v) pentaerythritol ethoxylate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.270

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4J2J	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2M41 Solution Structure of the AXH domain of Ataxin-1 in complex with ligand peptide from Capicua 提交 2013-01-28	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 34–48（15 aa）片段：Ataxin-1-binding linear motif (UNP 34-48)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.8；310 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] Ataxin-1 AXH domain, 0.6 mM CIC polypeptide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 21–48（28 aa）片段：UNP residues 21-48	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
4J2L Crystal Structure of AXH domain complexed with Capicua 提交 2013-02-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 21–48（28 aa）片段：UNP residues 21-48	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；1.6M NaCl, 3%(v/v) glycerol, 16%(w/v) PEG3350, 1mM L-Glutathione, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.15 Å R-free 0.294
6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 199–276（78 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.334
6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 D 199–276（78 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.334
6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 G 199–276（78 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.334
6JRP Crystal structure of CIC-HMG-ETV5-DNA complex 提交 2019-04-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 J 199–276（78 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Ammonium acetate, PEG3350, Bis-tris pH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.334
6KZG 14-3-3 protein in Complex with CIC S301 phosphorylated peptide 提交 2019-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 298–305（8 aa）链 Q 298–305（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；8% v/v TacsimateTM pH 6.0, 20% w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.231
6KZH 14-3-3 protein in Complex with CIC S173 phosphorylated peptide 提交 2019-09-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 170–177（8 aa）链 Q 170–177（8 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium chloride, 0.1 M HEPES pH 7.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3,350	分辨率 2.65 Å R-free 0.274
7M5W Crystal structure of the HMG-C1 domain of human capicua bound to DNA 提交 2021-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 188–280（93 aa）片段：HMG box domain UNP residues 188-280 fused with C1 domain UNP residues 1457-1527 链 A 1457–1527（71 aa）片段：HMG box domain UNP residues 188-280 fused with C1 domain UNP residues 1457-1527	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；291 K；100 mM MES, 100 mM CaCl2, 100 mM NaCl, and 16% (w/v) PEG 8000	分辨率 2.95 Å R-free 0.243

共 6 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CIC_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–21； UniProt 28–48 作者链 E； PDB构建体 1–21； UniProt 28–48 作者链 F； PDB构建体 1–21； UniProt 28–48

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4j2j
沉积日期 deposition_date	2013-02-04
结构标题 title	Crystal structure of AXH domain complex with Capicua
关键词 keywords	AXH domain, protein-protein interaction, Capicua, TRANSCRIPTION REGULATOR; TRANSCRIPTION REGULATOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.43 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.53 Å
零角强度 I(0) i0	33318700.00
分子量 molecular_weight	44985.0 kDa
排除体积 excluded_volume	56358 Å³
包络体积 envelope_volume	69052 Å³
水化壳体积 shell_volume	23856 Å³
包络直径 envelope_diameter	91.7 Å
壳层 Rg shell_rg	31.14 Å
包络 Rg envelope_rg	25.85 Å
形状 Rg shape_rg	25.51 Å
总 Rg total_rg	26.25 Å
总原子数 total_atoms	3133
残基数 n_residues	392
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	85.3 Å
Rg (实空间) rg_real	26.45 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.71 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.3320e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.6800e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.44 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	33320000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9046
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	27.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.280
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.550
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	4179000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.942; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.948; Smooth: 0.984

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ataxin-1
分子量 formula_weight	14296.7 kDa
突变 mutation	I580M,I605M
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	3161

EFSPAAAPPTLPPYFMKGSMIQLANGELKKVEDLKTEDFIQSAEMSNDLKIDSSTVERIEDSHSPGVAVIQFAVGEHRAQVSVEVLVEYPFFVFGQGWSSCCPERTSQLFDLPCSKLSVGDVCISLTLK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein capicua homolog
分子量 formula_weight	2366.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,E,F

EPRSVAVFPWHSLVPFLAPSQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	28

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d4j2ja_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.145 — AXH domain
超家族 Superfamily superfamily	b.145.1 — AXH domain
家族 Family family	b.145.1.1 — AXH domain

结构域编号 domain_id	d4j2jb_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.145 — AXH domain
超家族 Superfamily superfamily	b.145.1 — AXH domain
家族 Family family	b.145.1.1 — AXH domain

结构域编号 domain_id	d4j2jc_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.145 — AXH domain
超家族 Superfamily superfamily	b.145.1 — AXH domain
家族 Family family	b.145.1.1 — AXH domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	77.722 Å
晶胞边长 b length_b	89.096 Å
晶胞边长 c length_c	132.663 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.500 Å
最低分辨率 resolution_low	43.900 Å
R 因子 r_factor	0.2230
R_work r_work	0.2230
R_free r_free	0.2700

fit	/app/data/saxs_computation/j2/4j2j/4j2j.fit
pddf	/app/data/pr_computation/j2/4j2j/4j2j.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/j2/4j2j/4j2j.dat

Crystal structure of AXH domain complex with Capicua

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ataxin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein capicua homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)