SAXSdb — 4jv4

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	(2R,4aR,6R,7R,7aS)-6-[6-(dipropylamino)-9H-purin-9-yl]tetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinine-2,7-diol 2-oxide × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KAP0_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–285； UniProt 92–379

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4jv4
沉积日期 deposition_date	2013-03-25
结构标题 title	Crystal Structure of RIalpha(91-379) bound to HE33, a N6 di-propyl substituted cAMP analog
关键词 keywords	;cAMP-dependent protein kinase, cyclic nucleotide analogs, isoform selectivity, fluorescence anisotropy, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex ;; TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4jv4__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4jv4__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4jv4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.87 Å
Rg（电子密度）	19.99 Å
总 Rg	20.78 Å
原子数	2021
残基数	261
排除体积	35688 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4jv4__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit
分子量 formula_weight	32493.9 kDa
突变 mutation	deletion mutant
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2021

RRRRGAISAEVYTEEDAASYVRKVIPKDYKTMAALAKAIEKNVLFSHLDDNERSDIFDAMFPVSFIAGETVIQQGDEGDNFYVIDQGEMDVYVNNEWATSVGEGGSFGELALIYGTPRAATVKAKTNVKLWGIDRDSYRRILMGSTLRKRKMYEEFLSKVSILESLDKWERLTVADALEPVQFEDGQKIVVQGEPGDEFFIILEGSAAVLQRRSENEEFVEVGRLGPSDYFGEIALLMNRPRAATVVARGPLKCVKLDRPRFERVLGPCSDILKRNIQQYNSFVSLSV

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	bovine,cow,domestic cattle,domestic cow
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	(2R,4aR,6R,7R,7aS)-6-[6-(dipropylamino)-9H-purin-9-yl]tetrahydro-4H-furo[3,2-d][1,3,2]dioxaphosphinine-2,7-diol 2-oxide
分子量 formula_weight	413.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4jv4a1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.82 — Double-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.82.3 — cAMP-binding domain-like
家族 Family family	b.82.3.2 — cAMP-binding domain

结构域编号 domain_id	d4jv4a2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.82 — Double-stranded beta-helix
超家族 Superfamily superfamily	b.82.3 — cAMP-binding domain-like
家族 Family family	b.82.3.2 — cAMP-binding domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	4jv4A01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Jelly Rolls

结构域编号 domain_id	4jv4A02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Jelly Rolls

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晶胞边长 a length_a	89.830 Å
晶胞边长 b length_b	89.830 Å
晶胞边长 c length_c	185.055 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 65 2 2
空间群编号 int_tables_number	179
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.952 Å
最低分辨率 resolution_low	44.915 Å
R 因子 r_factor	0.2215
R_work r_work	0.2184
R_free r_free	0.2856

Crystal Structure of RIalpha(91-379) bound to HE33, a N6 di-propyl substituted cAMP analog

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4jv4__assembly_1__model_1

4jv4__assembly_1__model_1 | I(q)

4jv4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of RIalpha(91-379) bound to HE33, a N6 di-propyl substituted cAMP analog

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4jv4__assembly_1__model_1

4jv4__assembly_1__model_1 | I(q)

4jv4__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)