4kas

Crystal structure of FDTS from T. maritima mutant (H53D) with FAD and dUMP

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Thymidylate synthase ThyX

Thermotoga maritima

UniProt Q9WYT0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 2'-DEOXYURIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 3 SULFATE ION × 2 FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2 CHLORIDE ION × 1 PHOSPHATE ION × 1 NONAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THYX_THEMA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 13–232; UniProt 1–220 作者链 B; PDB构建体 13–232; UniProt 1–220 作者链 C; PDB构建体 13–232; UniProt 1–220 作者链 D; PDB构建体 13–232; UniProt 1–220

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4kas
沉积日期 deposition_date2013-04-22
结构标题 titleCrystal structure of FDTS from T. maritima mutant (H53D) with FAD and dUMP
关键词 keywordsthyX, FDTS, FAD, dUMP, Novel FDTS fold, Convertion of dUMP to dTMP using Tetrahydrofolate, and NAD(P)Hc, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4kas__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4kas__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4kas__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)29.06 Å
Rg(电子密度)28.53 Å
总 Rg29.33 Å
原子数7427
残基数862
排除体积132400 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4kas__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 11 domains

SCOP 2.08 (7 domains)

结构域编号 domain_idd4kasa1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.207 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
超家族 Superfamily superfamilyd.207.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
家族 Family familyd.207.1.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
结构域编号 domain_idd4kasa2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4kasb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.207 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
超家族 Superfamily superfamilyd.207.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
家族 Family familyd.207.1.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
结构域编号 domain_idd4kasb2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4kasc1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.207 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
超家族 Superfamily superfamilyd.207.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
家族 Family familyd.207.1.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
结构域编号 domain_idd4kasc2
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd4kasd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.207 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
超家族 Superfamily superfamilyd.207.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1
家族 Family familyd.207.1.1 — Thymidylate synthase-complementing protein Thy1

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id4kasA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id4kasB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id4kasC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id4kasD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
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7. 引用文献 (1)