Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ubiquitin thioesterase OTU1 × 1 （P43558） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ubiquitin thioesterase OTU1 × 1 （P43558） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | TERA_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 18–193； UniProt 21–196 作者链 B； PDB构建体 18–193； UniProt 21–196 |
Saccharomyces cerevisiae
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Transitional endoplasmic reticulum ATPase × 1 （P55072） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Transitional endoplasmic reticulum ATPase × 1 （P55072） water × 2 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | OTU1_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 18–90； UniProt 1–73 作者链 D； PDB构建体 18–90； UniProt 1–73 |
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| 条目编号 entry_id | 4kdi |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-04-25 |
| 结构标题 title | Crystal structure of p97/VCP N in complex with OTU1 UBXL |
| 关键词 keywords | AAA ATPase, PROTEIN-PROTEIN COMPLEX, UBX-like domain, PROTEIN BINDING, beta-barrel, beta-grasp, SIGNALING PROTEIN-HYDROLASE complex; SIGNALING PROTEIN/HYDROLASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.39 Å |
| Rg（电子密度） | 18.23 Å |
| 总 Rg | 19.24 Å |
| 原子数 | 1772 |
| 残基数 | 222 |
| 排除体积 | 31790 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d4kdia1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.52 — Double psi beta-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.52.2 — ADC-like |
| 家族 Family family | b.52.2.3 — Cdc48 N-terminal domain-like |
| 结构域编号 domain_id | d4kdia2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.31 — Cdc48 domain 2-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.31.1 — Cdc48 domain 2-like |
| 家族 Family family | d.31.1.1 — Cdc48 domain 2-like |
| 结构域编号 domain_id | d4kdib1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.52 — Double psi beta-barrel |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.52.2 — ADC-like |
| 家族 Family family | b.52.2.3 — Cdc48 N-terminal domain-like |
| 结构域编号 domain_id | d4kdib2 |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.31 — Cdc48 domain 2-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.31.1 — Cdc48 domain 2-like |
| 家族 Family family | d.31.1.1 — Cdc48 domain 2-like |
| 结构域编号 domain_id | 4kdiA01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Barwin-like endoglucanases |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — |
| 结构域编号 domain_id | 4kdiA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 4kdiB01 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Barwin-like endoglucanases |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — |
| 结构域编号 domain_id | 4kdiB02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 330 — Vcp-like ATPase; Chain A, domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 4kdiC00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |
| 结构域编号 domain_id | 4kdiD00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Roll |
| 拓扑 Topology topology | 20 — Ubiquitin-like (UB roll) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 |