Thermus aquaticus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*CP*AP*AP*TP*GP*GP*G)-3') ; × 2 POTASSIUM ION × 5 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*TP*GP*TP*AP*CP*AP*AP*TP*GP*GP*G)-3') ; × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | Q9EZJ8_THEAQ |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–245； UniProt 92–332 作者链 B； PDB构建体 5–245； UniProt 92–332 |
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| 条目编号 entry_id | 4ki2 |
| 沉积日期 deposition_date | 2013-05-01 |
| 结构标题 title | Crystallographic analysis of an RNA-polymerase sigma-subunit fragment complexed with -10 promoter element ssDNA |
| 关键词 keywords | ;ssDNA, G-quartet, G-quadruplex, promoter recognition, promoter opening, transcription initiation, protein-DNA binding, ssDNA-binding, Transcription-DNA complex ;; Transcription/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.72 Å |
| Rg（电子密度） | 20.46 Å |
| 总 Rg | 21.28 Å |
| 原子数 | 2064 |
| 残基数 | 247 |
| 排除体积 | 35637 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4ki2A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1810 — |
| 结构域编号 domain_id | 4ki2B01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1810 — |
| 结构域编号 domain_id | 4ki2B02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain |